<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Li (2015)
Title HIV-1 genetic diversity and its impact on baseline CD4+T cells and viral loads among recently infected men who have sex with men in Shanghai, China.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 1265
NumPts 1265
Subtype CRF01_AE, CRF07_BC, B, B + C, CRF55_01B, CRF67_01B, C, CRF68_01B, A, CRF59_01B, B + CRF01_AE, CRF58_01B

 

  Page 1 of 13    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 1265 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
SF090018 SF090018 None None   V35T, T39K, K43E, T69TN, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF090554 SF090554 None None   K122E, D123S, I178M, V189I, I195K, T200A, Q207E, R211K, E248D  
SF090602 SF090602 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF090741 SF090741 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
SF090797 SF090797 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, S251N  
SF090863 SF090863 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
SF090973 SF090973 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43A, D123N, I135V, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245E, S251N  
SF100035 SF100035 None None   I5V, V35I, V60I, K82R, R83K, K122E, I142IT, G196E, T200A, E204K, Q207E  
SF100045 SF100045 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF100163 SF100163 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K103R, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF100167 SF100167 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, E248EK, S251N  
SF100417 SF100417 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, R211S, K238R, V245E Q207I 
SF100443 SF100443 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I142V, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF100609 SF100609 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207T, R211S, F214L, V245K  
SF100685 SF100685 None None   E6D, K11T, K32E, V35T, T39K, K122E, D123S, I135R, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245K, E248EK, D250DN, S251N  
SF101033 SF101033 None None   E6D, V35I, T39E, K122E, D123S, I135R, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, I195L, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF101293 SF101293 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162SC, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF101594 SF101594 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200R, R206K, Q207D, R211K, F214L, K238R, V245N  
SF101748 SF101748 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
SF101791 SF101791 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S105A, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E P4PA 
SF101837 SF101837 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K103R, K122E, D123S, S162C, K173KR, Q174N, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245E, S251N  
SF110087 SF110087 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
SF110283 SF110283 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
SF110315 SF110315 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF110449 SF110449 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, D121DH, K122KE, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, I180L, Q197L, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF110541 SF110541 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
SF110682 SF110682 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, F87FL, K122E, D123S, S162C, K173DGNS, Q174K, D177E, T200I, I202V, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF110777 SF110777 None None  V179D E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
SF111013 SF111013 None None   E28R, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
SF111103 SF111103 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, P176Q, I202V, F214L, V245Q, E248V, K249Q  
SF111151 SF111151 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
SF111156 SF111156 None None   E6D, V8VI, K11T, V35T, T39K, K43E, V60VI, K101R, S105A, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF111208 SF111208 None None   E6D, K20R, T27TS, I135T, T200A, R211K, F214L, V245M, E248Q  
SF111253 SF111253 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, K249Q  
SF111265 SF111265 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, I195L, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF111334X SF111334X None None   V35I, V106I, V118I, I178L, R211K, F214L, V245M  
SF111340 SF111340 None None  V179E E6D, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, I135R, R211K, F214L, V245A  
SF111408 SF111408 None None   E6D, K11T, K32R, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123N, S162C, P170S, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF111426 SF111426 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102R, K104R, D121H, K122E, I167IV, V245Q, E248V, K249Q R172RI 
SF111470 SF111470 None None A62V  E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, I50V, K122E, D123N, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207T, R211S, K238R, V245E  
SF111477 SF111477 None None K219N  E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207V, R211S, K223R, K238R, V245E T216TI 
SF111595 SF111595 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K101R, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
SF120050 SF120050 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K103R, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF120052 SF120052 None None   V60I, I135T, D177E, V189I, I195L, F214L, V245E  
SF120092 SF120092 None None  K101KN I135V, K166R, E169D, Q174G, T200A, R211Q  
SF120271 SF120271 None None   E6D, V35T, E36D, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173N, Q174K, D177E, I178M, Q207T, L210M, R211S, K238R, V245E  
SF120386 SF120386 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123N, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, K201R, Q207T, R211S, K238R, V245E K43KEGR 
SF120827 SF120827 None None  V179E E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF120841 SF120841 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123N, I135T, S162C, E169D, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, S251N  
SF120913 SF120913 None None T215S Y188L V35VI, Q197E, R211K  
SF120948 SF120948 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, R211K, V245Q, E248V, K249Q  
SF120974 SF120974 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, E204D, R211K, V245Q, E248V, K249Q, D250N  
SF120990 SF120990 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K104N, D121H, K122E, D123S, S162C, D177E, E203D, Q207A, R211S, V245E  
SF120996 SF120996 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, S105A, K122E, D123S, D177E, I178M, V179I, T200A, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF121608 SF121608 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF121616 SF121616 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64KR, K122KE, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, S251N  
SF121701 SF121701 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, V189I, Q207A, R211S, V245Q, E248V, K249Q  
SF121758 SF121758 None None   V35K, K122KE, I135T, T165I, D177E, I178M, R211K, F214L, V245Q, D250E  
SF121774 SF121774 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102R, K122E, D123N, I135IT, S162C, K173R, Q174R, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF121804 SF121804 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245Q, E248V, K249Q  
SF121805 SF121805 None None  V179D E6D, K11T, E28K, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF121811 SF121811 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D177G, V245Q, E248V, K249Q  
SF121821 SF121821 None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
SF121871 SF121871 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, E169D, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF121925 SF121925 None None   E6D, K11KT, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207T, R211S, K238R, V245E  
SF130055 SF130055 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, V118I, K122E, D123N, I135T, K173T, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L  
SF130056 SF130056 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123N, I135T, S162C, E169EK, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF130066 SF130066 None None   E6D, K11T, V35M, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF130080 SF130080 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, Q174E, D177E, V179I, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF130083 SF130083 None None   E28K, K32E, V35T, T39K, S48T, V60I, D121Y, K122E, D177E, V245Q, E248V, K249Q  
SF130128 SF130128 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102KR, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174R, D177E, I178M, Q207T, L210M, R211S, K238R, V245E  
SF130224 SF130224 None None   V8I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, R211K, V245Q, E248V, K249Q  
SF130291 SF130291 None None   D123E, I135V, D177E, R211Q  
SF130561 SF130561 None None   E6D, V8VI, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF130946 SF130946 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123DGNS, I135R, I202V, R211K, F214L, V245A  
SF131464 SF131464 None None   E6N, V8I, K11T, V35T, T39K, K102R, V111I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, G196A, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
SF131641 SF131641 None None   E6K, V8I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, Q197K, T200A, K223KR, V245Q, K249Q  
SF132068 SF132068 None None  K238T K103R, T200A, Q207E, F214L, V245I  
SF13G016 SF13G016 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF13G028 SF13G028 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174N, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, S251N  
SF13G042 SF13G042 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102R, K122E, D123N, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, V245E, K249Q  
SF13G049 SF13G049 None None  V179E E6D, V35T, T39K, V111I, K122E, D123N, I135R, Q197R, I202V, E203K, R211K, F214L, V245A  
SF13G065 SF13G065 None None   E6D, K11T, V35I, T39K, K43E, D123G, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211N, K238R, V245E, S251N  
SF13G086 SF13G086 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200I, V245Q, E248V, K249Q  
SF13G100 SF13G100 None None   E6N, K11I, V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, I142V, S162W, D177E, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF13G103 SF13G103 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF13G127 SF13G127 None None   V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, V189I, Q207A, R211S, V245E  
SF13G128 SF13G128 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, V179I, V189I, Q207A, L210F, R211S, K238R, V245E  
SF13G149 SF13G149 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39KN, S48T, V60I, D121Y, K122E, T200TA, V245Q, E248V, K249Q  
SF13G152 SF13G152 None None   E6D, T7P, V8VI, K11T, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E, D250E, S251C  
SF13G180 SF13G180 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, R211G, V245Q, E248V, K249Q  
SF13G184 SF13G184 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, V179I, V245Q, E248V, K249Q  
SF13G231 SF13G231 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102M, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177G, I178M, T200A, E203D, Q207G, R211S, K238R, V245E  
SF13G361 SF13G361 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, D177DEKN, V245Q, E248V, K249Q  
SF13G394 SF13G394 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, T69S, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245K  
SF13G407 SF13G407 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248I, K249Q  
SF13G432 SF13G432 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K43E, T69I, K122E, D123S, I135R, R211K, F214L, V245A  
SF13G446 SF13G446 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S105A, K122E, D123NS, I135T, S162C, Q174R, D177E, I178M, V189VI, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SF13G503 SF13G503 None None   E6D, K11T, V35T, E36A, T39D, K103R, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, F214FL, I244V, V245E  
SF13G511 SF13G511 None None   V60I, K64R, K122E, D123S, K166R, I178M, I195K, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245E, E248D