<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Zhou (2014)
Title Diverse forms of HIV-1 among Burmese long-distance truck drivers imply their contribution to HIV-1 cross-border transmission.
Citation BMC Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 82
NumPts 82
Subtype CRF01_AE, C, B, A, CRF08_BC, CRF07_BC, B + CRF01_AE

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
08mLDTD001 08mLDTD001 None None   E6D, V21I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, T139V, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245K, T286A, E291D  
08mLDTD002 08mLDTD002 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, A98S, K122E, D123N, I135V, T165I, F171Y, Q174K, D177E, I178M, V179I, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245D, A272P, K277R, T286A  
08mLDTD004 08mLDTD004 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, I178V, Q207A, R211S, K238R, V245E, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V L80F, H198R 
08mLDTD005 08mLDTD005 None None   V8I, V35T, T39K, K43E, K49R, V106I, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245K, V276I, E291D, V292I, I293V  
08mLDTD006 08mLDTD006 None None   E6N, K11T, V35T, K122E, D123S, I135V, I142V, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245K, V276T, T286A, K287R, E291D  
08mLDTD007 08mLDTD007 None None   K101QR, I135V, S162C, Q207A, R211S, V245K, K275Q, T286A E42K, E79K, G262K 
08mLDTD008 08mLDTD008 None None  V179D K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K102R, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D  
08mLDTD010 08mLDTD010 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, I50T, K122E, D123S, I135V, K166R, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211G, F227S, V245K, V276I, K287R, E291D, V292I, I293V  
08mLDTD011 08mLDTD011 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D  
08mLDTD012 08mLDTD012 None None   I5V, E6D, K11S, K20R, V35T, T39K, K43E, D121N, K122E, D123S, S162C, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, P247L, E291D, V292I, I293V, P294T Y144H 
08mLDTD013 08mLDTD013 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K102R, K122E, D123S, T165I, K173R, Q174E, D177E, Q207A, K238R, V245K, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V  
08mLDTD014 08mLDTD014 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
08mLDTD015 08mLDTD015 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, V90I, I135V, I142T, S162A, K166R, K173T, D177E, G196E, T200A, Q207G, R211K, V245E, A272P, K277R, T286A  
08mLDTD016 08mLDTD016 None None   K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D  
08mLDTD017 08mLDTD017 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, I142V, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P  
08mLDTD018 08mLDTD018 None None L74I, V75M, M184V A98G, Y181C E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, V111I, V118C, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, Q207A, R211S, L228R, K238R, V245D, T286A  
08mLDTD019 08mLDTD019 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, I135T, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, G196E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272V, T286A, E291D, V292I, I293V, L295M, E297V D76N 
08mLDTD022 08mLDTD022 None None   E6D, K11S, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, G196E, Q207A, V245K, K249R, A272P, K275R, K281R, T286A, E291D  
08mLDTD023 08mLDTD023 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, S162C, D177E, R211K, K238R, V245E, A272P, E291D, V292I  
08mLDTD024 08mLDTD024 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179VI, Q207A, R211S, K238R, V245Q, I274V, T286A V111VIM 
08mLDTD025 08mLDTD025 None None   V35I, T107S, D121Y, K122E, I135T, S162C, Q207E, A272P  
08mLDTD026 08mLDTD026 None None   D121Y, K122E, S162C, D177E, T200V, Q207E, R211K, A272P, K277R  
08mLDTD027 08mLDTD027 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135R, K166R, K173E, D177E, V179I, T200A, Q207V, R211K, V245Q, D250S, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T  
08mLDTD029 08mLDTD029 None None   E6D, K11A, K20R, V35T, T39K, V60I, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, V245E, K249Q, T286A, E291D  
08mLDTD031 08mLDTD031 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, I135V, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R  
08mLDTD032 08mLDTD032 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, I135V, S162C, T200A, Q278E, T286A  
08mLDTD034 08mLDTD034 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V106I, K122E, D123N, I135T, K173E, Q174K, D177E, V179T, G196R, T200I, Q207A, L210M, R211K, K238R, V245Q, V276I, T286A  
08mLDTD035 08mLDTD035 None None   E6D, V35T, T39K, I135T, S162C, K173A, Q174K, D177E, V179T, I180V, T200A, Q207D, V245E, A272S, T286A  
08mLDTD036 08mLDTD036 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E, L283I  
08mLDTD037 08mLDTD037 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, I135V, S162C, Q174E, D177E, I178M, G196K, T200I, E203D, Q207A, K238R, V245E, A272G, T286A  
08mLDTD038 08mLDTD038 None None  A98G V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, S162Y, K173A, D177E, V179VI, T200A, Q207G, R211K, V245Q, A272P  
08mLDTD040 08mLDTD040 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179T, Q207A, R211S, V245E, A272P, V276I, L283I  
08mLDTD041 08mLDTD041 None None   E6D, K11T, V35T, E36D, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A  
08mLDTD042 08mLDTD042 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200V, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245T, V276I, T286A  
08mLDTD043 08mLDTD043 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K101R, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V189I, Q207A, R211N, K238R, V245E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
08mLDTD044 08mLDTD044 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E, V276I  
09mLDTD001 09mLDTD001 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, K49R, S68G, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245K, V276I, E291D, V292I, I293V I274T 
09mLDTD002 09mLDTD002 None None  Y188H V35T, T39K, K43E, K64R, K65E, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V Q182R 
09mLDTD004 09mLDTD004 None None   K32R, V35T, T39K, K43E, V60I, R83K, V90I, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
09mLDTD006 09mLDTD006 None None   E6N, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, T165A, Q174E, D177E, T200A, I202V, Q207K, R211S, K238R, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V  
09mLDTD007 09mLDTD007 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, V60I, D123N, I135M, K173I, Q174K, D177E, V179I, G196A, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, V276I, T286A  
09mLDTD008 09mLDTD008 None None   K20R, V35I, T107S, D123E, I135V, S162C, T200A, R211K, F214L, K277R, Q278E  
09mLDTD009 09mLDTD009 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, T139V, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245K, T286A  
09mLDTD010 09mLDTD010 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, I142V, K173I, Q174K, G196E, T200I, Q207A, R211T, K238R, V245E, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V P236S 
09mLDTD014 09mLDTD014 None None   E6D, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, A62T, D121H, K122E, I135R, S162H, K166R, K173A, Q197R, T200A, Q207E, R211K, V245Q, S251C, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, I293V  
09mLDTD015 09mLDTD015 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, E40K, K43E, K64R, D123S, K173I, Q174K, I178M, G196E, T200I, Q207A, R211T, K238R, V245E, D250N, K259R, K277R, T286A, E291D E53K, D76N, R78K, D113N, G262E 
09mLDTD016 09mLDTD016 None None   E6D, K11T, K22E, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123N, K166R, K173I, Q174K, D177E, T200A, E204G, Q207D, V245E, A272P, I274V, T286A, E291D, I293V  
09mLDTD017 09mLDTD017 None None   E6D, K11S, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173M, Q174K, D177E, G196E, Q207A, V245K, A272P, K275R, T286A  
09mLDTD018 09mLDTD018 None None   I135V, S162C, V179I, K201R, I202V, R211G, K277R, Q278E  
09mLDTD020 09mLDTD020 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245D, E291D  
09mLDTD022 09mLDTD022 None None L74V, M184V K101P, K103N E6D, K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, D192N, T200A, Q207A, R211S, V245E, V276I, T286A  
09mLDTD023 09mLDTD023 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
09mLDTD024 09mLDTD024 None None   V35T, T39N, V60I, D121H, K122E, S162C, D177E, Q207E, R211K, Q278E  
09mLDTD025 09mLDTD025 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K101Q, K122E, D123S, K154E, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, V245E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297K L80P 
09mLDTD026 09mLDTD026 None None   V106I, S162C, D177E, I178M, R211G, V245K, S251I, Q278E, T286A, A288G D185N 
09mLDTD027 09mLDTD027 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V106I, S162N, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200I, Q207A, R211S, V245K, V276I, T286A, E291D  
09mLDTD028 09mLDTD028 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K101R, K122E, I135L, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207D, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I H221R 
09mLDTD029 09mLDTD029 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K104R, D121Y, K122E, I135T, K173T, I178L, T200A, Q207G, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
09mLDTD030 09mLDTD030 None None   K43E, T107S, I135V, S162C, T200I, R211K, Q278E, I293V D192G 
09mLDTD031 09mLDTD031 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245E, K275Q, K281R, T286A  
09mLDTD033 09mLDTD033 None None  F227L I135V, S162C, K263E, K277R, Q278E, T286A, I293V, E297K Y144H, Q222L 
09mLDTD035 09mLDTD035 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V  
09mLDTD036 09mLDTD036 None None   V35T, E36A, T39N, S48T, V60I, K122E, I135T, K173A, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D  
09mLDTD039 09mLDTD039 None None   V35I, E36A, T39D, S48T, K101R, K122E, D123S, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207N, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V Q145R 
09mLDTD040 09mLDTD040 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, W71*, K102R, K104R, K122E, D123S, I135L, K173R, Q207A, R211S, V245Q, E248D, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V P95S 
09mLDTD041 09mLDTD041 None None   I5V, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173V, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
09mLDTD042 09mLDTD042 None None  Y181H E6D, K11T, T27A, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123N, K173L, Q174K, I178M, Q207A, R211K, V245E, E248D, E291D, V292I, I293V  
09mLDTD043 09mLDTD043 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135R, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207E, V245E, A272P, K277R, T286A  
09mLDTD044 09mLDTD044 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
09mLDTD045 09mLDTD045 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, K101R, K122E, D123S, K173IL, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200I, Q207A, R211N, K238R, V245E, E248D, V276I, T286A  
09mLDTD046 09mLDTD046 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K166R, K173V, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, V276I, K277R, K281R, T286A  
10mLDTD002 10mLDTD002 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K104R, D121Y, K122E, S162C, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V D110G, I167L 
10mLDTD003 10mLDTD003 None None   E6D, V35I, I135V, S162C, V245L, A272P, K277R, Q278E, L283I  
10mLDTD004 10mLDTD004 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
10mLDTD005 10mLDTD005 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I135R, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207E, V245E, A272P, K277R, T286A  
10mLDTD006 10mLDTD006 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K166R, K173V, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, V276I, K277R, K281R  
10mLDTD007 10mLDTD007 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, I142V, K166R, K173V, Q174EK, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, A272P  
10mLDTD008 10mLDTD008 None None   M16MV, K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K101R, V111I, K166R, K173A, D177E, I180IL, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286V  
10mLDTD009 10mLDTD009 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178IM, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, K275Q, T286A  
10mLDTD010 10mLDTD010 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, S68G, K101R, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179T, T200I, Q207A, R211S, V245T, V276I, T286A  
10mLDTD013 10mLDTD013 None None   E6D, V8I, K20R, V35T, T39K, K43E, K103KR, K122E, D123N, I135T, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E, L283I, E291D, V292I, I293V, P294T  
10mLDTD015 10mLDTD015 None None   S162C, Q207E, V245I, A272P, Q278E