<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Yan (2015)
Title Epidemiological and molecular characteristics of HIV infection among money boys and general men who have sex with men in Shanghai, China.
Citation Infect Genet Evol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 52
NumPts 52
Subtype CRF01_AE, CRF07_BC, B, B + C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
SMS_VMB25 SMS_VMB25 None None   E6D, V60I, D123E, I135T, D177E, Q207E, R211K, F214L, A272P, T286A  
SMS_VMB34 SMS_VMB34 None None   I2T, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R  
SMS_VMB48 SMS_VMB48 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K101R, D121Y, K122E, T200A, Q207E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, V276I, K277R  
SMS_VMB54 SMS_VMB54 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K166R, K173I, Q174K, D177E, T200R, Q207D, F214L, K238R, V245D, A272P  
SMS_VMB59 SMS_VMB59 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P  
SMS_VMI01 SMS_VMI01 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R  
SMS_VMI123 SMS_VMI123 None None   E6D, K11T, K32R, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123N, S162C, P170S, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SMS_VMI135 SMS_VMI135 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R  
SMS_VMI136 SMS_VMI136 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245K  
SMS_VMI146 SMS_VMI146 None None   E6D, T200I, R211S, L283I  
SMS_VMI148 SMS_VMI148 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A  
SMS_VMI149 SMS_VMI149 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K64KR, V111I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
SMS_VMI21 SMS_VMI21 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K102R, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SMS_VMI22 SMS_VMI22 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V111I, K122E, D123S, S162C, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, K275R, V276I  
SMS_VMI41 SMS_VMI41 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174R, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245Q  
SMS_VMI53 SMS_VMI53 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, S68G, K104N, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, V276I, R284X  
SMS_VMR10 SMS_VMR10 None None   E6D, V35T, E36A, T39D, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, Q278R  
SMS_VMR101 SMS_VMR101 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, E204Q, Q207A, R211S, V245E, K275R  
SMS_VMR25 SMS_VMR25 None None   V60I, T69A, K102R, V118I, D123E, I135T, D177E, V179I, V189I, I202V, R211Q, F214L, A272P, T286P  
SMS_VMR37 SMS_VMR37 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, S105A, K122E, D123S, D177E, I178M, V179I, T200A, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E, I257L, A272P, T286A, E291D  
SMS_VMR72 SMS_VMR72 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V241I, V245Q, E248V, K249Q, A272S, K277R, T286P  
SMS_VSB03 SMS_VSB03 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A  
SMS_VSB15 SMS_VSB15 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, Q174E, D177E, I178M, T200S, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, K281R  
SMS_VSB24 SMS_VSB24 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123N, I135T, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245A, A272G, T286A  
SMS_VSB35 SMS_VSB35 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135V, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R  
SMS_VSB44 SMS_VSB44 None None   E6D, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SMS_VSB49 SMS_VSB49 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
SMS_VSB55 SMS_VSB55 None None   E28K, K32E, V35I, E36A, T39D, S48T, V60I, A98S, D121Y, K122E, I135T, T200A, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R  
SMS_VSB62 SMS_VSB62 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R  
SMS_VSB63 SMS_VSB63 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102Q, D121H, K122E, K166R, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R  
SMS_VSI02 SMS_VSI02 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, E248D  
SMS_VSI06 SMS_VSI06 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K102R, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, L279M, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V  
SMS_VSI09 SMS_VSI09 None None   I178M, G196E, R211K, V245M, A272P  
SMS_VSI111 SMS_VSI111 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, V276I  
SMS_VSI126 SMS_VSI126 None None   P14T, V21I, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R  
SMS_VSI133 SMS_VSI133 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, P176T, D177N, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R  
SMS_VSI30 SMS_VSI30 None None   S3ST, E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, Q174N, D177E, I178M, Q207K, R211S, K238R, V245E, T286A, E291D  
SMS_VSI32 SMS_VSI32 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245K, A272P  
SMS_VSI34 SMS_VSI34 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R E42Q 
SMS_VSI48 SMS_VSI48 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SMS_VSI53 SMS_VSI53 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K101Q, D121H, K122E, K166R, K173R, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R  
SMS_VSI64 SMS_VSI64 None None   V8I, K11R, V35T, T39E, S48T, V60I, K64R, D121H, K122E, I135T, S162C, Q207E, V245H, A272P, K277R  
SMS_VSI65 SMS_VSI65 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173M, Q174K, D177E, T200R, E204Q, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245D, K275Q, K277R, K281R  
SMS_VSI67 SMS_VSI67 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R  
SMS_VSI80 SMS_VSI80 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102Q, D121H, K122E, K166R, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, E291D, V292I  
SMS_VSI89 SMS_VSI89 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, Q207E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R, T286A  
SMS_VSI90 SMS_VSI90 None None   V60I, T107S, K122E, D123S, K166R, I195K, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245E, E248D, K277R  
SMS_VSI97 SMS_VSI97 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, V245Q, E248V, K249Q, A272P, K277R  
SMS_VSR11 SMS_VSR11 None None   I5V, E6A, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173N, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P, K277R  
SMS_VSR28 SMS_VSR28 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, D123N, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E, K275Q  
SMS_VSR31 SMS_VSR31 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K102R, D121Y, K122E, I135M, T200A, V245Q, K249Q, A272P, K277R  
SMS_VSR32 SMS_VSR32 None None   E6D, K11T, V35T, T39A, E40D, V118I, D121H, K122E, D123S, I135T, T165I, K173M, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, K281R