<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Wang (2015)
Title HIV-1 prevalence and subtype/recombinant distribution among travelers entering China from Vietnam at the HeKou port in the Yunnan province, China, between 2003 and 2012.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 78
NumPts 78
Subtype CRF01_AE, CRF08_BC, CRF07_BC, C, B + C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
03013 03013 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, A272P, K277R  
03044 03044 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
03068 03068 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
03069 03069 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, T165I, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245E  
03071 03071 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E, K281R  
03073 03073 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K102R, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, K201R, Q207N, R211S, K238R, V245E, A272P, V276I  
03075 03075 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
04008 04008 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
04013 04013 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, V245Q, A272P, K277R  
04014 04014 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, V245Q, A272P, K277R, L283I  
04068 04068 None None  V179D K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, D123E, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
04311 04311 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q197H, Q207S, R211S, K238R, V245E  
05258 05258 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, K201R, Q207N, R211S, K238R, V245E, A272P  
05308 05308 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, K201R, E203K, Q207N, R211N, K238R, V245E, A272P  
05313 05313 None None   V35T, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, D123E, I135V, S162C, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
06006 06006 None None   V8I, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, A272P, K277R  
06140 06140 None None   V35T, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
06148 06148 None None   E6D, K11T, V35M, T39Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207K, R211S, V245E R125I, A129G 
06169 06169 None None   E6D, K11A, K32R, V35T, T39E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E, K277R  
06170 06170 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, K122E, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
06171 06171 None None   E6D, V35K, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, V245Q, A272P, K277R  
06173 06173 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
06174 06174 None None   E6D, K11T, V35M, T39Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207K, R211S, V245E  
06253 06253 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E, K275R, K281R  
06283 06283 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, T39N, V60I, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207D, R211K, K238R, V245E, A272P, K281R  
06351 06351 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K102R, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
06352 06352 None None   E6N, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245A, K281R  
06355 06355 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135V, K173V, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
06357 06357 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E, V276I, K281R  
06358 06358 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, K201R, Q207N, R211S, K238R, V245E, A272P  
06360 06360 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, S68G, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207R, R211S, K238R, V245E, S251I, K281R  
06390 06390 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E, K277R, K281R  
06392 06392 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K122E, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
07035 07035 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207G, R211S, K238R, V245E, K281R G15R 
07036 07036 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207G, R211S, K238R, V245E, S251I, K281R  
07100 07100 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, V245Q, A272P, K277R P59A 
07140 07140 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E, K281R  
07252 07252 None None  F227L E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207N, R211S, K238R, V245E, S251I, K281R  
08142 08142 None None   E6D, V10I, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207N, R211S, K238R, V245E, A272P L12F, K13L, G15Q 
08180 08180 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
08246 08246 None None   V35T, T39D, S48T, E53D, V60I, S162C, R211K, V245Q, A272P, K277R  
08251 08251 None None   E6D, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K101R, D121H, K122E, K166R, I202V, Q207E, V245Q, A272P, K277R  
08253 08253 None None   V10I, V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, K101R, D121Y, K122E, I135R, Q207E, R211K, V245Q, A272P G15Q 
08254 08254 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, D121Y, K122E, I135R, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
08256 08256 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, I202V, R211G, V245Q, A272P, K277R  
08286 08286 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173V, Q174K, D177E, T200I, Q207S, R211S, K238R, V245E, A272S, V276I  
09059 09059 None None  V179D K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, K122E, I135V, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
09070 09070 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, F171Y, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272G V111M 
10009 10009 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, A272P, K277R  
10011 10011 None None   V35T, T39N, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, A272P, K277R  
10012 10012 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K166R, K173A, D177E, I180L, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R  
10016 10016 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
10031 10031 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K101R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, K201R, Q207N, R211S, K238R, V245E, A272P, V276I  
10039 10039 None None   V35T, E36V, T39E, S48T, E53D, V60I, T107S, I135V, S162Y, V179I, Q207E, V245Q, A272P, K277R  
10042 10042 None None   E6D, V35T, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178V, V189I, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
10045 10045 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207S, R211S, K238R, V245E, A272S, K281R  
10048 10048 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, E53D, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, G196E, T200I, Q207A, R211K, K238R, V245E, A272G  
10070 10070 None None   E6D, K11R, V35T, T69S, K122E, D123S, S162C, K173V, Q174K, D177E, Q207N, R211S, K238R, V245E, A272P  
10076 10076 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174R, D177E, I178M, T200I, Q207S, R211S, K238R, V245E, I274V  
10077 10077 None None   V35K, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, D177E, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
10078 10078 None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207N, R211S, K238R, V245Q, A272P, L283I  
10094 10094 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69N, I135V, S162C, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
10097 10097 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, S162C, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
10101 10101 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245E, I274V  
10102 10102 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E, K281R  
10108 10108 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, K122E, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
10109 10109 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
11034 11034 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
11047 11047 None None   V35T, E36A, T39N, S48T, E53D, V60I, T69S, S162C, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
11048 11048 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, E53D, V60I, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
11095 11095 None None   K20R, V35T, E36A, T39N, S48T, E53D, V60I, T69S, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R  
12018 12018 None None   V35T, T39D, S48T, E53D, V60I, I135R, T200A, Q207K, R211K, V245Q, A272P K13N, I274F, K275M 
12074 12074 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, D177G, V245Q, A272P, K277R  
12099 12099 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, G112A, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207S, R211S, K238R, V245E, A272P, K281R K13R 
12100 12100 None None   K22N, V35A, E36A, T39D, S48T, V60I, T69S, D121Y, K122E, S162C, K173I, Q174K, D177E, E203G, Q207K, R211N, V245E, I274V G99E 
12125 12125 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, T69S, K102R, I135L, S162C, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
12164 12164 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, I195L, Q207A, R211S, K238R, V245E, V276I  
12214 12214 None None   K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, K166R, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R