<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Huruy (2015)
Title Limited increase in primary HIV-1C drug resistance mutations in treatment nave individuals in Ethiopia.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 83
NumPts 83
Subtype C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
G001 G001 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177EK, G196E, T200A, Q207E, V245KQ, A272P, V292VI, I293V, P294A, E298A, L301V, K311R V111VG, Y144N, A299E, E300L, Y318YN 
G002 G002 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, K122E, D123G, K173V, D177E, T200A, E204D, Q207E, R211G, V245Q, E248D, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, V314I, E328K  
G003 G003 None None   K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K173A, Q174K, D177E, I195L, T200A, E203D, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, V317A, E328K  
G004 G004 None None  Y181YF V35T, E36A, T39D, K49R, I50V, K122E, D123G, I142V, A158S, T165I, K173A, D177E, G196K, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, L310I  
G005 G005 None None   V35T, E36A, T39D, K122E, I142V, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K, A272P, I274V, E291D, V292I, E328K  
G006 G006 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K102Q, K122E, D123S, K166R, K173A, D177E, Q207E, R211K, V245Q, I257IV, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, P294PQ, E328K D256DN, L260LM 
G007 G007 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200AE, R211RK, F214FL, V245Q, E248ED, D250E, A272P, K277R, R284RK, E291D, V292VI, I293V  
G008 G008 None None   V21VI, T27S, V35T, E36A, T39E, K122E, D123DN, A158S, K173A, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207E, P243S, V245Q, A272P, K277KR, E291D, V292I, I293V  
G012 G012 None None   V35T, T39E, S48T, K49KR, E53ED, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, D177E, I195L, T200A, Q207E, V245Q, D250E, I257L, A272P, K281KR, T286A, E291D, V292VI, I293V, P294PT  
G013 G013 None None   V35K, T39E, S48T, K122E, D123S, S162Y, E169EK, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, I293V, E328K, I329K  
G014 G014 None None  G190A V35T, T39A, S48T, K122E, D123GS, K173A, Q174K, D177E, V179VI, T200A, Q207K, R211Q, V245Q, A272P, K277R, L283I, E291D, V292I, I293V, P294T, E328K  
G017 G017 None None   V35T, T39A, E40D, S48T, K122E, D123S, I135T, K173A, D177E, I178M, T200A, I202V, E204EK, Q207D, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, V317A, D320N V90A 
G018 G018 None None   V35T, E36A, T39E, A98S, K102Q, K122E, D123G, A158S, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R, E328K  
G019 G019 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, A158S, I159IV, T165TI, K173T, D177E, T200A, I202V, Q207N, V245Q, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, P294T  
G020 G020 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, I135V, T139TI, I142R, K173A, Q174K, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
G021 G021 None None   V35T, E36A, T39D, K122E, T139K, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K, A272P, E291D, V292I, Y319F  
G024 G024 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, V60I, A98S, K122E, D123G, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, K238R, V245E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R  
G025 G025 None None M184I Y181I T27S, V35T, E36A, T39E, K46Q, S48T, K82R, K122E, T139TK, Q145C, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, V292I, I293V, E297D, K311R Q174Q* 
G034 G034 None None   V35T, E36A, T39E, K102Q, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, P294T, L301LI, E328K, I329K  
G036 G036 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, I142IT, K173A, Q174K, D177E, I178IL, T200A, Q207EK, V245Q, E248D, D250E, A272P, L279M, T286A, E291D, V292I, I293V, E328K, Q330H  
G043 G043 None None   V35T, E36A, T39E, K43R, K122E, D123S, K173A, Q174R, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245KQ, K249Q, A272P, K277T, T286A, E291D, I293V  
G052 G052 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39A, S48E, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V, P294T, E297A, L310I Y319N 
G063 G063 None None  Y181YF T27A, V35K, E36A, T39E, K122E, D123N, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K275Q, T286A, E291D, V292I, I293V, E312D  
G070 G070 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60VI, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174QK, D177E, I178IL, I195IL, G196K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E328K  
G072 G072 None None   K11KQ, V35T, T39E, S48T, V60VI, K122E, D123N, I135R, K173A, Q174K, T200A, I202V, Q207E, R211K, L228LF, V245Q, E248D, D256E, A272P, K275KR, L283I, V292I, I293V, V317A  
G076 G076 None None   S3C, V35T, E36A, T39E, E40D, K43KR, K49KR, A158S, K173A, Q174K, Q207E, R211K, V245Q, E248ED, K249Q, I257V, A272P, E291D, V292I, I293V, K311R, E328K  
G079 G079 None None   V35I, T39D, A98S, K122E, D123G, I142T, D177E, I178L, G196E, Q207A, V245EK, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, V317T  
G081 G081 None None   E6K, V35T, T39A, E40D, K122E, D123S, I135T, S162A, K173A, Q174K, D177E, Q207E, F214L, V245Q, A272P, K277R, I293V, P294T  
G086 G086 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, K122E, D123G, I135T, E138A, S162C, K173A, D177G, T200A, Q207A, R211K, V245Q, K249Q, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
G107 G107 None None   V35T, T39E, S48T, A98S, K122E, D123S, I135R, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K275Q, K277R, T286TA, E291D, V292I, I293V, E328K, Q330H  
G113 G113 None None   V35T, T39E, K43R, A98S, K122E, D123S, I135V, I159V, K173A, D177G, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R, A327E  
G114 G114 None None   V35T, E36A, T39D, A98S, D123E, K173A, D177E, I178L, T200A, E204K, Q207E, R211RK, V245Q, D250A, A272P, T286A, E291D, V292I, K311R  
G122 G122 None None   I31L, V35T, E36A, T39D, K49R, A98S, K122E, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245E, L283I, T286V, E291D, V292I, I293V, D324A S156L 
G134 G134 None None   V35T, T39E, K101R, K122E, D123S, K166R, K173AT, D177E, Q197P, T200A, Q207R, R211K, V245Q, A272P, K281R, E291D, V292I, I293V, P294PT T253TN 
G136 G136 None None   V8I, V35T, E36A, T39D, K122E, D123G, I142V, A158S, R172K, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, S322A  
G143 G143 None None   V35T, E36A, T39E, K43R, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200E, Q207K, R211M, P243T, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E328K  
G150 G150 None None   K20KR, V35T, T39E, S48T, V60VI, K122E, D123S, I135V, Q145C, K166KR, K173A, Q174QK, D177E, G196K, Q197QE, T200A, I202IV, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286TA, I293V, E297K, E328K L149LF 
G168 G168 None None   V35T, T39E, S48T, K102Q, K122E, D123S, I135T, I142R, S162Y, F171Y, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, K275Q, K277R, E291D, V292I, I293V, P294T, E312A, E328K, K331R  
G170 G170 None None   V35T, E36A, T39E, A98S, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, L282I, T286A, A288T, E291D, V292I, I293V, P294T  
G173 G173 None None   K20R, E36A, T39E, S48T, K102KR, T107TP, K122E, D123S, T131TP, K173A, Q174K, D177E, Q207N, R211K, V245Q, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V, E297A, E328K H96HP 
G174 G174 None None  G190GE V8I, P9PS, T27S, V35T, E36K, T39E, K122E, D123S, I135R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, V317A M41MI 
G176 G176 None None   V35T, E36A, T39E, K49R, K122E, A158S, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, S251H, A272P, K277R, L283I, K287KR, V292I, I293V, P294AT, E328K D123NSTY, T253S 
G177 G177 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, T286V, E291D, V292I, I293V, P294T  
G183 G183 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, K49R, E53D, K122E, D123S, E138EG, A158S, K173A, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207E, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, I293IV, L310I  
G188 G188 None None   V35T, T39A, A98S, K122E, D123S, I135R, A158S, S162C, K173A, D177E, T200A, I202V, Q207K, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, D320V, P321S, E328K, K331R S48K, Y319Y* 
G202 G202 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, D121H, K122E, A158S, K173T, D177E, I195L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311KR, E328K  
G205 G205 None None   V35T, E36A, T39E, A98S, K122E, D123G, E138A, A158S, E169A, K173E, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, T286A, V292I, P294T, L295M, E312D  
G206 G206 None None   V35I, T39E, A98S, K122E, D123S, I135IM, A158S, K173T, D177E, R199K, T200E, Q207E, R211K, E224K, V245E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E328D K13T 
G208 G208 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, E44D, V60I, S68G, F87L, A98S, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, Q207E, R211K, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E328K  
G209 G209 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, K102Q, K122E, D123S, I159V, K173A, D177E, G196K, I202V, Q207E, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V  
G210 G210 None None   I2IT, V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, R125RK, I135K, K173A, Q174K, D177E, T200E, Q207D, R211RG, V245K, A272P, T286A, V292I, I293V, P294T, A304E, V317A, E328K  
G211 G211 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123G, A158S, K173AT, D177E, I178L, T200E, E204Q, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, D324N  
G214 G214 None None   V35T, E36M, T39E, V60I, A98S, K102Q, K122E, D123S, I142K, A158S, K173A, D177E, I178V, G196E, T200A, K201T, E204K, Q207E, R211M, V245Q, D250E, A272P, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
G217 G217 None None   V35T, E36K, T39E, S48T, A98S, K122E, D123N, R125RK, I135T, S162C, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V D86V 
G221 G221 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, K173A, D177E, V189VI, G196K, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245K, A272P, K275Q, K277R, L279M, T286A, E291D, I293V, I329K  
G224 G224 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E328K  
G239 G239 None None   V35T, T39E, K43R, A98S, K122E, D123S, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207G, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, P294T  
G266 G266 None None  Y181YF K20R, T27A, V35T, E36A, T39E, E40D, K49R, V60I, K122E, D123GS, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E, A272P, E291D, V292I, I293V  
G269 G269 None None   V35T, E36A, T39E, A98S, K102Q, K122E, D123G, A158S, S162G, K173T, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311S  
G277 G277 None None   V35T, E36A, T39E, A98S, K104KR, K122E, D123DG, A158S, K173A, D177G, T200A, I202V, Q207E, V245Q, E248K, A272P, E291D, V292I, I293V, P294T  
G284 G284 None None   V21I, V35T, T39E, I47L, I50V, V60VI, K122E, D123S, A158S, K173A, P176S, D177E, G196K, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245Q, K249Q, A272P, K277R, T286A, A288AS, E291D, V292I, I293V, E297A  
M029 M029 None None   V35T, T39D, K122E, D123G, I142T, A158S, T165I, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q197E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, L283I, V292I, I293V, V317A  
M030 M030 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, K166R, K173AV, Q174QK, D177E, T200A, E204EK, Q207E, V245Q, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V, V314M  
M031 M031 None None   V35I, E36A, T39E, K122E, D123N, A158S, K173A, Q174K, D177E, G196K, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, L279M, T286A, E291D, I293V, Q332K A129G 
M034 M034 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, A98S, K122E, D123N, A158S, K166R, K173E, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277Q, E291D, V292I, I293V, P294T, E297T L209V 
M039 M039 None None   V35T, T39D, K122E, D123G, I142T, A158S, T165I, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q197E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, L283I, V292I, I293V, E328K D113M, A114H 
M042 M042 None None   V35I, E36A, T39K, K122E, D123G, I135T, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, F214L, E224N, V245Q, A272P, A288T, E291D, V292I, I293V, K311R  
M046 M046 None None   V35T, E36AV, T39E, I50V, V118I, D123DN, I142V, A158S, S162SN, K173A, Q174K, D177E, G196GE, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248N, W252WR, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V G45GR 
M054 M054 None None  K238KT V35T, E36A, T39D, A98S, K122E, D123S, E138A, A158S, S162N, K173A, T200A, Q207N, R211K, V245Q, A272P, K281KR, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R  
M055 M055 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, K49R, K102KQ, K122E, D123S, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, K249Q, A272P, V276VI, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
M058 M058 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173A, D177E, G196K, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245K, A272P, K275Q, K277R, L279M, T286A, E291D, I293V, P321S  
M060 M060 None None   V35T, E36A, T39D, K49KR, E53ED, K122E, D123N, I135T, S162A, K173A, D177G, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
M063 M063 None None   E6D, V35T, E36L, T39E, K49R, A98S, T139A, A158S, K173T, D177N, I178L, G196E, T200A, I202V, Q207E, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D  
M065 M065 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, A158S, K173T, D177E, G196K, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, E291D, I293V, H315P K20L, G316R, Y319H 
M071 M071 None None   V35T, T39K, A98S, K122E, D123S, A158S, K173A, Q174K, D177E, I195L, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R  
M072 M072 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, K49KR, I50IV, V60I, K122KE, I142K, K173T, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207D, R211K, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V, E297A, E328K  
M074 M074 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, K166R, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, K249Q, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V, V314M  
M075 M075 None None   V35T, E36A, T39A, K49R, K122E, D123S, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248N, K249Q, D250DE, I274V, T286A, E291D, I293V, P294A  
M079 M079 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K275Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E328K  
M086 M086 None None  G190A V35T, T39E, S48T, K49KR, A98S, K122E, K173A, Q174K, D177EG, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, E291D, V292I, I293V, P294V, L295M, S322AT, E328K  
M090 M090 None None   V8I, V35I, E36A, T39E, S48T, A98S, K122E, D123G, A158S, K173A, Q174K, T200A, Q207E, K238KR, V245E, S251N, A272P, R284K, T286A, E291A, V292I, I293V, P294E, K311R, D320N  
M091 M091 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, I142S, A158S, K173A, Q174K, D177E, I178L, G196K, T200E, Q207A, V245Q, A272P, K275Q, Q278N, E291D, V292I, I293V  
M092 M092 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, I195L, G196K, T200E, Q207E, R211RKQ, F214L, L228LF, V245Q, D250E, A272P, K277R, L279LM, T286A, E291D, I293V