<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Khairunisa (2014)
Title Appearance of drug resistance-associated mutations in human immunodeficiency virus type 1 protease and reverse transcriptase derived from drug-treated Indonesian patients.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 53
NumPts 53
Subtype CRF01_AE, B, A, CRF02_AG, B + CRF01_AE

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
DT2 DT2 AZT, 3TC NVP   E6D, K11T, V35T, R83K, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245K  
DT3 DT3 AZT, 3TC EFV D67N, T69D, M184V, L210W, T215Y M230L I2V, E6D, V21I, V35T, T39E, E44D, V111I, V118I, D121H, K122E, K173I, Q174K, D177E, I178V, D192N, G196E, Q207E, H208Y, R211K, W212C, H221C, K238R, V245K  
IP12 IP12 AZT, 3TC NVP   E6D, K11T, V35T, T39N, E40D, K122E, D123N, T165I, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I180V, Q207A, R211S, M230I  
IP13 IP13 AZT, 3TC EFV   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207D, R211S, K238R, V245E  
IP14 IP14 AZT, 3TC EFV   E6D, V35T, T39K, R83K, K122E, D123S, R172K, K173T, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245K  
IP2 IP2 AZT, 3TC NVP   E6D, V35T, T39E, E40D, D121H, K122E, I135V, S162C, K173L, Q174K, D177E, I178V, Q207A, R211S, K238R, V245E  
IP5 IP5 AZT, 3TC NVP   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K173L, Q174K, D177E, I178V, V179I, I202V, Q207D, R211S, V245E  
IP6 IP6 AZT, 3TC NVP   E6D, K11T, V35T, T39K, R83K, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211N, K238R, V245E  
TD1 TD1 AZT, 3TC EFV M41L, L74I, M184V, L210W, T215Y A98G, K103N, P225H K11T, V35T, T39K, K43E, E44D, S68G, V111I, K122E, D123N, I142T, K173A, Q174K, D177E, I178M, V189I, G196E, T200A, Q207A, H208Y, R211N, L228V, K238R, V245E  
TD10 TD10 TDF, AZT, 3TC None M41L, L74V, M184V, L210W, T215Y K101E, V108I, Y181C, G190A, M230L E6D, K11T, V35T, T39N, K43Q, T69N, V118I, K122E, D123S, I135V, E138Q, S162C, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, H221Y, K223R, V245E  
TD11 TD11 D4T, 3TC EFV M41L, L74I, M184V, T215Y A98G, K103N, V108I E6D, K11T, V35I, E44D, R83K, V118I, D121Y, K122E, S162N, K173M, Q174K, D177E, I202V, Q207A, L210S, H221Y, K238R, V245K  
TD12 TD12 AZT, 3TC NVP M184V, T215F, K219Q V108I, Y181C E6D, K11T, V35I, T39D, T69N, K122E, D123S, I135V, T139V, I142V, K173I, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, L228R, K238R, V245K  
TD15 TD15 AZT, 3TC EFV   E6D, V35T, T39K, K43E, W88S, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, Q207N, R211S, K238R, V245E  
TD16 TD16 AZT, 3TC NVP   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, T69N, V118I, K122E, D123N, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207N, R211K, V245E, K249R  
TD17 TD17 TDF, 3TC EFV M184V K103N, P225H K20R, V35R, V60I, R83K, V189I, T200A, R211K, F214L, L228I  
TD18 TD18 D4T, 3TC EFV M41L, M184V, T215Y  E6A, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135T, K173I, Q174K, D177E, E194Q, G196E, I202V, Q207A, R211N, K238R, V245K  
TD2 TD2 AZT, 3TC NVP   K20R, V35T, E40D, V60I, K122E, S162A, D177E, E204K, Q207E, V241I, V245Q, D250E  
TD20 TD20 AZT, 3TC EFV   I5V, E6D, K11S, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I142V, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, I244V, V245D, S251N  
TD21 TD21 AZT, 3TC NVP M184V  E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173V, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245K  
TD22 TD22 AZT, 3TC EFV V75L  E6D, V35T, T39K, R83K, V106L, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E F77Y, A98P 
TD23 TD23 D4T, 3TC NVP   E6D, K11T, V35T, T39N, S68G, D86E, K122E, D123N, R172K, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245Q  
TD25 TD25 AZT, 3TC NVP   E6D, V35T, T39K, S68G, K122E, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211K, V245E  
TD26 TD26 AZT, 3TC EFV   E6D, K11T, V21I, V35T, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207N, R211S, V245E  
TD27 TD27 TDF, 3TC EFV   E6D, V35T, T39K, E40Q, K43E, V60I, W88S, K122E, D123N, I142V, K173I, Q174K, D177E, I178L, V179I, I202V, Q207D, R211K, V245E  
TD3 TD3 AZT, 3TC NVP   V35T, D86E, D121Y, K122E, D123E, S162A, K173T, Q174E, T200A, E204Q, Q207E, V245Q  
TD30 TD30 TDF, AZT, 3TC None  K103N E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, I142V, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, I202V, Q207D, R211S, V245E  
TD31 TD31 AZT, 3TC NVP   P4T, I5V, E6D, K20R, V35T, T39K, K43E, K49R, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178V, I202V, E203D, Q207A, R211S, V245E  
TD32 TD32 TDF, D4T, 3TC None M184V K103N E6A, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I142T, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
TD33 TD33 D4T, 3TC NVP   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, S68G, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I180L, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
TD34 TD34 TDF, AZT, 3TC None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43A, K122E, D123N, S162C, K173T, D177E, I178L, V179I, I202V, Q207A, V245E  
TD36 TD36 TDF, AZT, 3TC None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, R125K, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245K  
TD37 TD37 TDF, AZT, 3TC None   E6D, V35T, T39N, V60I, R83K, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245K  
TD38 TD38 AZT, 3TC NVP M41L, D67N, K70R, M184V, L210W, T215F, K219E K103N E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, T69N, I94L, A98S, V111I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, I202V, Q207A, R211S, I244V, V245E  
TD39 TD39 TDF, 3TC EFV D67N, K70G, M184V, T215F, K219Q  E6D, K11T, V21I, V35T, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, D218E, K238R, V245K  
TD41 TD41 AZT, 3TC NVP   E6D, K11T, V35T, T39K, R83K, K122E, D123S, I142V, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
TD44 TD44 D4T, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q A98G, K101E, G190A P4T, E6D, K11T, E28K, K32E, V35T, T39R, K43E, T69N, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207D, R211K, V245K  
TD45 TD45 AZT, 3TC EFV   E6D, K11T, V35I, T39E, S68G, T69P, R83K, K122E, D123S, R125K, T131P, S162SN, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, D218N, V245K, E248K R72K, D76N, R78K, E79K 
TD47 TD47 AZT, 3TC NVP   E6D, K11T, E28K, K32E, V35T, T39K, V60I, K122E, D123N, I135T, I142V, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245K  
TD49 TD49 AZT, 3TC NVP   E6D, V35T, T39E, E40D, D121H, K122E, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245K  
TD55 TD55 AZT, 3TC NVP   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, A98S, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207T, R211S, V245E, K249R  
TD58 TD58 AZT, 3TC EFV  Y188L E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, T69N, G112A, K122E, D123N, T139A, K166R, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245E  
TD6 TD6 AZT, 3TC NVP   S3R, E6D, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, S162C, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178L, V179I, T200I, Q207A, R211K, K238R, V245E  
TD63 TD63 AZT, 3TC NVP   E6A, K11T, V35T, T39K, K43E, D86E, V106I, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245K  
TD64 TD64 AZT, 3TC NVP  V179E V35I, R83K, D123E, S162N, I178L, T200E, I202V, E248A  
TD65 TD65 TDF, 3TC EFV   E6D, K11T, E28K, K32E, V35T, T39K, D121H, K122E, E169D, R172K, Q174R, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211N, V245K  
TD66 TD66 TDF, 3TC EFV   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, D121H, K122E, D123N, K166R, R172K, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211N, F214L, V245K  
TD67 TD67 AZT, 3TC NVP   V35I, S68G, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177G, T200I, Q207A, R211S, V245E  
TD68 TD68 AZT, 3TC EFV  V179D E6D, V35T, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, Q207D, K238R, V245E  
TD69 TD69 AZT, 3TC NVP   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, Q207A, R211S, K238R, V245E, K249Q  
TD7 TD7 AZT, 3TC NVP   K11T, V35T, T39E, V106L, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179S, I202V, Q207A, R211S, V245E  
TD71 TD71 D4T, 3TC EFV L74I, M184V A98G, Y181C E6A, K11T, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123N, I135T, K173T, Q174K, D177E, E194Q, G196E, I202V, Q207D, R211S, K238R, V245Q  
TD8 TD8 D4T, 3TC EFV M41L, D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q A98G E6D, K20R, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200A, I202V, E203D, Q207A, R211S, V245E, E248D  
TD9 TD9 AZT, 3TC NVP M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y  E6D, V8I, K11T, V35K, T39E, E44D, V106VIL, V118I, K122E, D123S, S162N, K173T, Q174K, T200A, Q207A, R211N, K238R, V245K