<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Avidor (2013)
Title Transmission patterns of HIV-subtypes A/AE versus B: inferring risk-behavior trends and treatment-efficacy limitations from viral genotypic data obtained prior to and during antiretroviral therapy.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 237
NumPts 237
Subtype A, CRF01_AE, C, CRF03_AB

 

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Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 237 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1129 1129 Unknown Unknown A62V  T39K, V90I, K122E, D123N, A158S, K173L, Q174K, D177E, I178L, Q207A, R211S, V245M  
1135 1135 None None   T39N, D121H, K122E, I142IT, A158AS, K166R, K173S, Q174X, D177E, I178L, Q207A, R211S  
1216_MT 1216_MT Unknown Unknown   T39K, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, V245M N136NY 
1221_MT 1221_MT Unknown Unknown   V118VI, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, Q197QL, T200X, Q207A, R211S  
1257_MT 1257_MT AZT, 3TC EFV M184V K103N, K238N T39N, V60X, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M  
1273 1273 None None   T39K, K122KE, D123X, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q197R, T200I, Q207A, R211S, V245M  
1274_MT 1274_MT Unknown Unknown D67DN, K70KR, M184V, K219Q K101E, G190S T39K, V60VI, V106I, D121H, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F227FS, V245M I167IM 
1306 1306 None None   T39A, E40D, S48T, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245E  
1327 1327 None None   T39K, E40D, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M  
1365_MT 1365_MT Unknown Unknown   T39K, E40D, K122KE, D123X, A158AS, K173L, Q174K, D177E, V179VI, Q207A, R211S, V245M  
1368 1368 None None   T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
1430 1430 AZT, 3TC EFV   T39K, V60I, S68G, D121H, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174T, D177E, T200A, Q207A, R211S  
1501 1501 None None   T39K, K43E, V60I, S68SG, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
1513 1513 None None   K122E, D123X, S162C, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
1529 1529 None None   T39M, K49KR, D123N, A158S, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245I  
1532 1532 None None A62V  T39K, V90I, K122E, D123X, E138EA, T139TS, A158S, K173X, Q174QK, D177DE, T200TA, K201KR, I202IV, Q207A, R211S, V245X  
1570_FT 1570_FT Unknown Unknown   K122E, D123S, T165I, K173S, Q174K, Q207A, R211K, W212L, V245D, L246V F160S, Q161H, H221HP, W239V 
1580 1580 None None   T39K, V60I, S68G, W88WC, D121H, K122E, D123S, K166R, K173X, Q174K, D177E, T200A, Q207X, R211X  
1600 1600 None None A62V  T39K, I50V, K122E, D123N, A158S, K173L, Q174K, D177E, T200K, Q207A, R211S, V245M  
1603 1603 None None   K43KR, K46Q, V60I, K102Q, K122E, D123S, T139TA, K166R, F171Y, R172RK, K173A, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211RS, V245Q E44EQ 
1609_FT 1609_FT ABC, 3TC NVP   V60I, K82KR, D121H, K122E, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178IV, V179I, Q207A, R211S, V245Q  
1612_MN 1612_MN TDF, FTC EFV M184V K103N, V108I T39A, E40D, V60I, K102Q, D121H, K122Q, I135T, E138Q, K173A, Q174K, I178L, V179I, Q197L, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245K  
1657 1657 None None   T39N, E40D, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245I  
1678 1678 None None   T39N, D121H, K122E, D123S, K166KR, K173L, Q174K, D177E, I178IV, V179VI, I180IV, G196GE, Q207A  
1728 1728 None None A62V  T39K, K122E, D123N, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K223KR, V245M W229WG 
1756_FN 1756_FN AZT, 3TC None A62V  T39K, V90I, V118VI, K122E, D123X, I135IT, A158S, K173L, Q174K, D177DE, T200A, Q207A, R211S, V245VM  
1778 1778 TDF, FTC EFV L74LI, M184V G190S T39Q, S68G, T69N, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, V179I, Q207A, R211S, V245M  
1785 1785 TDF, 3TC EFV K65R, T69~, M184MV K101E, Y181C, G190S T39E, K122E, D123S, I142T, A158S, K173S, Q174K, Q207A, R211S, L228LR, V245M  
1798_MT 1798_MT TDF, FTC NVP   T39L, K122E, D123S, A158S, K173X, Q174K, D177G, Q207A, R211S, V245K  
1814 1814 None None   T39R, K122E, D123S, I135V, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M  
1863_FN 1863_FN Unknown Unknown   T39M, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245X  
1880 1880 None None   T39N, K122KE, D123S, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245M  
1884 1884 None None   T39E, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M  
1885 1885 None None   T39M, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245M  
1909 1909 None None  F227FL T39R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245X  
1912 1912 None None   V60I, K102Q, K103X, D121H, K122E, D123S, I135T, E138Q, I142L, K173A, Q174X, D177DE, I178L, V179VI, Q197L, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245K  
1913_MT 1913_MT TDF, FTC None M184V K103KN E40D, V60I, T69TN, K102X, D121H, K122E, E138Q, K173A, Q174K, D177DE, I178L, Q197L, T200A, Q207A, R211S, V245K  
1917_MT 1917_MT TDF, FTC EFV   T39R, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, V179VI, Q207A, R211S, F214FL, V245M  
1919 1919 AZT, 3TC None A62V, M184V  T39N, K101KQ, K122E, D123N, I135T, E138G, A158S, K173LS, Q174K, D177EG, I178IL, T200A, Q207A, R211S  
1921_MT 1921_MT TDF, FTC EFV  G190GS S68G, K122E, D123S, A158S, K173X, Q174K, D177E, Q207X, R211RS, V245M  
1923 1923 None None A62AV  T39K, K43KE, I50IV, K122E, D123N, A158AS, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S T216TS 
1926 1926 None None   T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, V245I  
1927_MT 1927_MT Unknown Unknown   E40D, V60I, K102Q, K122E, D123S, K166R, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q197L, T200A, Q207A, R211S, V245K  
1935 1935 None None   T39N, K122E, D123X, I142L, K173A, Q174X, D177DE, I178L, V179VI, Q197L, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245K  
1937 1937 None None   T39R, E40ED, D121H, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207T, R211S, V245M L234P 
1938 1938 None None A62V  T39X, I50V, V60VI, D123N, A158S, K173V, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207A, R211S, V245M  
1940 1940 None None A62V  T39K, K122E, D123S, I135R, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M  
1941_MT 1941_MT AZT, 3TC None   T39K, K43E, K101R, K122E, D123X, K173L, Q174K, D177A, T200A, Q207A, R211S, V245M W229WR 
1942_MT 1942_MT Unknown Unknown   T39K, E53ED, V60VI, K101KQ, K122E, D123S, E138ED, K173X, Q174K, V179VI, Q197E, Q207A, R211K  
1947 1947 None None   T39K, K122E, D123S, I142V, A158S, K173L, Q174K, D177E, I180V, Q207A, R211S, V245I  
1949 1949 None None   T39M, V60I, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, T200V, Q207A, R211S, V245M  
1950 1950 None None   T39M, K122E, D123X, I135IT, K173L, Q174K, Q207A, R211S, P247PQ  
1951 1951 None None   T39R, V60VI, K122E, D123DN, I135X, A158AS, K173L, Q174K, D177E, V189VI, Q207A, R211X, V245M  
1957 1957 None None   T39K, K122E, D123N, K166KR, K173L, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211X, V245M  
196 196 ABC EFV A62V, K65R, V75I, F77FL, Y115YF, F116Y, Q151M K101EQ, K103KN, Y181C, G190A T39TA, K49KR, E53ED, S68K, V106VI, V111VI, V118I, K122E, D123S, I135IT, K173S, Q174R, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211RS, F214L, H221Y, F227FY, V245T W88WAGS 
1966_MT 1966_MT TDF, 3TC EFV K65KR, M184V K101E, Y181C, G190S T39V, V106I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, L228LR, V245M  
1969 1969 None None F77FL  T39R, K49KR, S68T, K104R, D123N, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245VM P97PQ 
1972 1972 None None   T39K, K104R, K122E, D123S, I142T, A158S, K166R, K173L, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245M  
1974 1974 None None   T39K, K43E, K101KR, K102KR, K122E, D123S, K173X, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211K, K238R, V245Q  
1975 1975 None None   T39K, K43E, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211X, K238R, V245Q  
1976_FT 1976_FT AZT, 3TC EFV A62V  T39K, V90I, K122E, D123X, K173L, Q174K, T200A, Q207A, R211X  
1978_MT 1978_MT AZT, 3TC EFV A62V, M184V K103N, P225H T39K, K122E, D123N, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, L228LH, V245M  
1986_FT 1986_FT AZT, 3TC None   T39M, E42G, K122E, D123S, I135T, A158S, K173S, Q174K, D177DE, T200TA, Q207A, R211S, V245M  
1990_FT 1990_FT AZT, 3TC EFV  K103KN T39K, D121H, K122E, D123N, S162C, K173S, Q174R, D177E, I178L, Q207A, R211S  
1991_MT 1991_MT 3TC, DDI EFV  G190S T39M, K122E, D123S, K173L, Q174K, T200I, E203EK, Q207A, R211S, V245M  
1994 1994 None None   T39X, V60VI, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, D192DN, G196E, T200TA, Q207A, R211S, V245M D186DN 
1995_MT 1995_MT TDF, 3TC EFV   T39K, K64KR, K122E, D123N, I135IV, K173X, Q174K, D177X, Q207A, R211S, V245M  
1996_FT 1996_FT AZT, 3TC EFV M184V K103N, V108I, P225H T39M, K122E, D123S, A158AS, K173L, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207A, R211S, V245M  
1997_MT 1997_MT TDF, AZT, D4T, 3TC None   T39N, T69N, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, L246V V241D 
1998_MT 1998_MT AZT, 3TC None  K103N T39N, K122E, D123S, K173L, Q174X, Q197QL, Q207A, R211S  
1999 1999 ABC, 3TC None   T39M, K122E, D123S, K173L, Q174K, T200I, Q207A, R211S H235HR 
200 200 D4T, DDI None   K49KR, K122E, D123S, I142IV, A158S, K166KR, K173AS, D177E, V179VI, T200A, Q207E, R211K, V245E  
2006 2006 None None  K103N T39TA, E40D, V60I, D121H, K122E, D123S, E138Q, K173A, Q174R, D177E, I178L, Q197L, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245E  
2007_MT 2007_MT AZT, DDI EFV M184V  T39K, K122E, D123S, S162C, F171Y, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245M  
2012 2012 None None   T39N, E42ED, V60VI, K122KE, D123S, A158AS, K173X, Q174K, D177E, V179X, T200TA, Q207A, R211S  
2014 2014 None None A62V  T39S, K122E, D123X, E138X, A158S, K173X, Q174K, D177DE, I178IL, Q207A, R211S  
2017_MT 2017_MT D4T, DDI EFV  G190S T39M, K122E, D123S, K173L, Q174K, T200I, E203EK, Q207A, R211S, V245M  
2036 2036 None None   T39Q, S68G, K122E, D123X, I135T, A158S, K173L, Q174R, D177DE, T200TA, Q207A, R211S, V245VM  
2070_MT 2070_MT Unknown Unknown   T39K, S68G, D123N, A158AS, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245M  
2073 2073 None None   T39E, S68G, V106VI, D123N, K173L, Q174K, D177E, I178L, V179I, G196GE, Q197QK, Q207A, L210S, R211S, V245VM  
2091 2091 None None  K103N E40D, V60I, K102Q, V118I, D121H, K122E, D123S, I135T, E138Q, K166R, R172K, K173A, Q174R, D177E, I178L, Q197L, T200A, Q207D, R211S, F214L, D237N, V245K  
2095_MT 2095_MT Unknown Unknown   T39E, D86G, D177DE, T200A, Q207X, R211RS, V245M  
2112 2112 None None   T39E, V60I, R83K, K122E, D123S, I135IT, R172K, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, F214FL, K238R, V245K T58TA 
2177_FT 2177_FT Unknown Unknown   T39L, K122E, D123S, I135T, E138A, I142IV, S162C, K173S, Q174K, D177E, V179VI, T200TA, Q207A, R211S, V245T  
2179_FT 2179_FT Unknown Unknown  K103KN T39N, V60VI, K122E, D123S, A158AS, K173X, Q174K, D177G, T200A, Q207A, R211S  
276 276 Unknown Unknown   E40D, K43R, K49R, V60I, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
37_MT 37_MT AZT, 3TC None   T39TM, E42EG, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M L120L* 
402 402 None None   T39K, E40ED, K122E, D123X, A158S, S162X, K173L, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211S, V245M, P247PQ  
451 451 AZT, 3TC EFV M184V V108I T39L, V60VI, D121H, K122E, D123S, A158S, K166R, E169D, K173A, Q174R, D177E, V189VI, Q207A, R211S P157Q, F160I 
513 513 None None   T39X, K122E, D123S, I142IV, A158S, K173X, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F227FY  
563 563 AZT, 3TC EFV   T39K, K122E, D123G, A158AS, K166KR, K173LS, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211RIS, V245M G152GR, D185DV, T216TA 
631 631 AZT, 3TC EFV M184V G190S T39N, D121H, K122E, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, L228F, V245IT  
730 730 None None   T39N, R83RK, K122E, D123X, S134G, N147NH, A158S, K173L, Q174X, D177E, Q197K, T200TA, Q207A, R211S, V245X N81ND, T84TP, F160FS, K201KQ 
807 807 ABC, TDF, 3TC EFV  K103N T39M, S68G, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M  
834_MT 834_MT Unknown Unknown D67N, M184V  T39M, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, T200I, E203ED, Q207A, R211S, V245M  
855 855 AZT, 3TC EFV   T39M, T69N, K122E, D123S, I135T, S162C, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
900 900 AZT, 3TC EFV   T39M, K122KE, D123N, A158S, K173S, D177E, G196GE, Q207A, R211NS L100FS, N136Y, R143RK, P150ST 
948_FT 948_FT Unknown Unknown   T39K, E40ED, E42EG, K122E, D123S, A158AS, K173L, Q174K, D177E, I178IM, T200TA, Q207A, R211S, V245M  
951_FT 951_FT AZT, 3TC None M184V  T39N, K43Q, K46KE, K122E, D123S, A158S, K173X, Q174K, T200TI, E203D, Q207A, R211S, F214FL, V245T F61FY 
989_MT 989_MT AZT, 3TC None M184V  T39N, K122E, D123X, I135X, E138A, K173L, Q174K, D177DE, T200TI, I202V, Q207X, R211X Q145Q*