<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Diallo (2015)
Title Viral genetic diversity and polymorphisms in a cohort of HIV-1-infected patients eligible for initiation of antiretroviral therapy in Abuja, Nigeria.
Citation AIDS Res Hum Retroviruses
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 271
NumPts 271
Subtype G, CRF02_AG, CRF06_cpx, A, D, C, B

 

  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 271 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1-1-008 1-1-008 None None   V35T, S48ST, K49R, V60I, A98S, K122E, D123DGNS, E138A, T139A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D  
1-1-012 1-1-012 None None   V35T, E36D, K122KE, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, R211KQ, V245Q, E248D Q207AITV 
1-1-015 1-1-015 None None   E36ED, D123E, F171FY, K173IT, Q174K, D177E, I178M, V189VI, T200A, Q207E, R211K, F214L, P243AS, V245KQ L149LF 
1-1-020 1-1-020 None None   V35T, V60I, K64R, D121H, K122E, D123S, I135T, T165TI, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, I202IV, Q207D, R211K, V245Q, E248N  
1-1-022 1-1-022 None None   V35T, K122E, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178L, T200A, K201R, Q207E, R211RK, V245E  
1-1-023 1-1-023 None None   P4PS, I5IV, E6ED, V8VI, V35T, E36ED, D123E, S162X, T165TI, F171Y, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, E203EG, Q207E, R211K, V245E, P247A, E248ED S48EK 
1-1-025 1-1-025 None None   V35T, V60I, K64R, K122Q, I135V, S162A, E169EQ, K173T, Q174EGKR, D177E, T200A, Q207EK, R211K, F214FL, V245M  
1-1-027 1-1-027 None None   K20R, V35T, E36D, I50V, V60I, I135T, T165I, K173V, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248N  
1-1-030 1-1-030 None None   V35T, K49R, I50V, K122E, I135V, I142V, S162A, T165TI, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
1-1-075 1-1-075 None None   V21I, V35T, T39TK, I50IV, V60I, I135V, S162A, K173A, Q174R, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207A, R211K, F214FL, I244V, V245L  
1-1-078 1-1-078 None None   K32R, V35T, E36D, V60I, D123E, I135V, A158S, S162A, K173A, Q174KNRS, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1-1-081 1-1-081 None None   V35T, I135V, S162A, K173IMR, Q174EK, D177E, T200A, Q207E, V245K, E248D  
1-1-083 1-1-083 None None   V35T, T39K, V60I, S68SG, K122E, D123S, A158AS, T165TI, E169ED, K173RT, Q174KN, D177E, I178M, T200A, I202IV, Q207E, R211K, V245K, E248D  
1-1-084 1-1-084 None None   E6K, V35T, K122E, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200TA, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
1-1-088 1-1-088 None None   V35T, V60I, K122E, K173T, Q174KN, D177E, I178LM, V189I, G196GE, T200A, Q207E, R211RK, F214L, V245H, E248D  
1-1-090 1-1-090 None None   V35T, V60I, K122E, I135T, S162SC, K173A, Q174K, D177E, I178IM, T200A, I202V, Q207DE, R211K, V245Q, E248D  
1-1-093 1-1-093 None None   V35T, T39L, S162A, K173AT, Q174E, D177E, I178IM, T200A, E204EK, Q207QEK, R211RS, V245Q  
1-1-098 1-1-098 None None   V35T, E40ED, S48T, V60I, K122E, D123N, K173T, Q174EK, D177E, I178M, T200A, E204Q, Q207E, R211K, V245Q, E248EDKN  
1-1-103 1-1-103 None None   V35T, E40D, S68SG, S162A, K173T, Q174QK, D177E, T200A, Q207E, R211K, P243H, V245E, E248DN  
1-1-104 1-1-104 None None   P4S, V35T, E36D, D123E, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
1-1-108 1-1-108 None None   V35T, E36D, K102R, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174AEKT, D177EG, T200A, Q207E, V245K  
1-1-110 1-1-110 None None   E6D, V35T, V60I, K104KR, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207A, R211RK, V245Q, E248DN  
1-1-112 1-1-112 None None   K43KN, K49R, V60I, A98S, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207GR, R211K, V245Q, E248D  
1-1-114 1-1-114 None None   V21VI, V35T, T39M, A98AS, K122KE, I135T, S162SACG, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211RK, V245Q, E248DN  
1-1-115 1-1-115 None None   K20R, V35T, T39K, V60I, V106I, K122E, I135T, S162C, K173T, Q174K, D177DE, T200A, Q207QDEH, R211K, F214L, V245Q, E248D  
1-1-116 1-1-116 None None   K20R, V35T, V60I, K104R, K122E, D123S, K166R, K173IT, Q174KR, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245K  
1-1-117 1-1-117 None None   V21VI, V35T, V60VI, D123E, K173T, Q174K, D177E, Q197QK, T200A, Q207E, V245Q, E248N  
1-1-121 1-1-121 None None   V35T, V60I, K122E, D123DGNS, I135V, S162C, K173T, Q174KN, D177E, T200A, Q207DE, R211RK, V245Q, E248D  
1-1-123 1-1-123 None None   K11T, V35T, T39N, V60I, D123N, I142V, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245HQ, K249KQ  
1-1-124 1-1-124 None None   V35T, V60I, K104KR, K122E, D123G, Q174EK, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q, E248D  
1-1-127 1-1-127 None None   V21I, V35T, T39KN, V60I, S162SAGT, T165TI, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207DE, R211K, V245Q, E248D  
1-1-130 1-1-130 None None   K11AT, V35T, T39TS, D123N, I142V, K166R, E169D, K173A, Q174K, D177E, G196E, Q207A, K238KR, P243T, V245Q, E248D  
1-1-132 1-1-132 None None   V35T, E36ED, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, I178IM, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248N  
1-1-134 1-1-134 None None   V35T, E36D, T39TA, E40ED, V60VI, W88WC, K122KE, I135IV, I142IV, S162A, K173X, Q174KR, D177E, I178IM, V179VIM, T200A, I202IV, Q207E, R211AEKT, V245Q, E248ED  
1-1-137 1-1-137 None None   V35T, V60I, S68G, K166R, F171Y, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200V, Q207D, R211K, P243T, V245Q  
1-1-138 1-1-138 None None   E6N, T7TP, K11T, V35T, E36D, K122E, D123N, S162Y, K173S, D177E, V179I, V189VI, I202V, Q207A, R211K, F214L, V245Q  
1-1-141 1-1-141 None None   E6ED, V8VI, K11KT, V35T, E36A, T39K, K43E, S68G, T69N, V106I, A158S, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
1-1-142 1-1-142 None None   V35T, T69TS, K122E, D123E, I135V, I142IV, S162A, K173A, Q174K, D177E, Q207DE, V245VEKM, E248ED  
1-1-146 1-1-146 None None   V35T, K122E, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245Q  
1-1-147 1-1-147 None None   V35T, E40D, V60I, A98S, K101Q, K122E, D123S, S162A, K173T, Q174KR, D177EG, T200A, Q207G, R211K, V245Q, E248D  
1-1-148 1-1-148 None None   V35T, E36A, K49R, I50V, V60I, W88WC, K104R, D121HY, K122E, E169D, K173ST, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D  
1-1-149 1-1-149 None None   V21I, V35T, K49KR, I50IV, V60I, K122E, D123S, I135R, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207DE, V245Q, E248D K104KEGR 
1-1-151 1-1-151 None None   K32R, V35T, T39L, K122KR, S162A, K173Q, Q174E, D177E, I178IM, T200A, Q207E, V245Q, P247A, E248D  
1-1-152 1-1-152 None None   K20R, K32KR, V35T, V60I, K122KE, S162A, K166KR, K173T, Q174R, D177E, I178IM, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
1-1-153 1-1-153 None None   V35T, V60I, K122E, D123DG, I135V, K173T, Q174KR, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248D  
1-1-160 1-1-160 None None   V35T, V60I, K122A, D123S, K173T, Q174QK, D177E, I178IV, G196GE, T200A, I202V, Q207EG, R211K, F214FL, V245Q, E248EDKN  
1-1-163 1-1-163 None None   V35T, V60I, A98AS, D121H, K122E, D123S, K173AT, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207D, V245Q, E248DN  
1-1-171 1-1-171 None None   K20R, V35T, E36EA, T39TI, K122E, D123NS, T165I, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q V10VG 
1-1-174 1-1-174 None None   V35T, E36ED, T39L, E40ED, S48T, V60I, K122E, D123S, E138A, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D  
1-1-182 1-1-182 None None   V35T, V60I, K104R, D121HY, K122E, D123DGNS, I135IV, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248D  
2-1-001 2-1-001 None None  G190GA K20R, V35T, E36D, K122E, D123N, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211RK, P243H, V245E, E248D  
2-1-002 2-1-002 None None   V35T, V60I, K64KR, K122E, D123N, I135V, I142IV, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
2-1-003 2-1-003 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, I135V, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
2-1-004 2-1-004 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K64R, D121H, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, Q197E, T200AE, Q207KN, R211K, V245Q, E248D  
2-1-007 2-1-007 None None   V35T, T39A, E40D, K122E, D123S, K173M, Q174K, D177E, I178M, T200A, R211K, V245Q  
2-1-008 2-1-008 None None V75VM  V35T, V60I, K64KR, K103R, K104R, D121H, K122E, I135V, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248D  
2-1-012 2-1-012 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207DE, R211RK, V245Q, E248D  
2-1-016 2-1-016 None None  K103N K20KR, V35T, V60I, D123E, I135V, S162A, Q174E, D177E, I178M, Q197QE, T200TA, E204K, Q207DE, R211RAGT, F214FL, P243T, V245Q  
2-1-020 2-1-020 None None   V35T, V60I, K104KR, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, I202V, Q207E, V245Q, E248N  
2-1-023 2-1-023 None None   V35T, E36ED, V60I, K122E, D123NS, I135V, I142IV, S162A, K173AT, Q174K, D177E, T200AE, Q207K, R211X, P243T, V245Q  
2-1-025 2-1-025 None None   K20R, V35T, T39TK, V60I, W88WC, K104KR, K122E, I135V, E138EA, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, F214L, V245Q, E248N  
2-1-026 2-1-026 None None   V35T, E36D, I50V, V60I, T69S, K122E, D123N, F171Y, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207N, V245Q, E248D  
2-1-028 2-1-028 None None   V35T, T39K, K43KQ, V60I, K104KR, T107S, K122E, D123S, I142IV, K173A, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207RST, R211K, V245Q, E248D  
2-1-029 2-1-029 None None  V179E V35T, T39E, V60I, K122E, D123S, I135K, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N  
2-1-035 2-1-035 None None   E6D, V35T, V60I, S68G, K104R, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q, E248N  
2-1-037 2-1-037 None None   V35T, D123E, I135T, I142V, S162A, K173S, D177E, V179I, V189I, I202V, Q207QHKN, R211K, V245Q  
2-1-042 2-1-042 None None   V35T, V60I, K122E, D123N, I135V, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248D  
2-1-043 2-1-043 None None   V35T, E36D, T39A, S48E, V60I, K102KQ, D123E, I135T, E138A, S162A, T165TAIV, K173KT, Q174DGNS, D177E, T200A, Q207E, R211RK, F214L, V245Q  
2-1-046 2-1-046 None None   K20R, V35T, T39K, E40D, V60I, F87FL, V118I, I159V, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, K238R, V245Q, E248D  
2-1-048 2-1-048 None None   V35T, E36D, K49R, V60I, K122E, I135V, S162A, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207R, R211KQ, V245Q  
2-1-049 2-1-049 None None   V35T, T39M, V60I, W88C, D121Y, K122E, I135V, Q174E, D177E, I178L, G196E, T200A, E203G, E204K, Q207E, F214L, V245Q, E248ED  
2-1-050 2-1-050 None None   P4PS, V35T, T39KN, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174AE, D177E, T200A, Q207E, V245K  
2-1-053 2-1-053 None None   V35T, E36D, T39M, V60I, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, I202IV, Q207E, V245KPQT, E248HKNQ, K249KQ  
2-1-058 2-1-058 None None   K20R, V35T, V60I, K122E, I135V, T139S, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, F214L, V245Q, E248DN  
2-1-060 2-1-060 None None   V35T, D121H, K122E, I142V, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248N  
2-1-064 2-1-064 None None   V35T, V60I, K122P, D123S, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, P243PS, V245Q, E248D  
2-1-066 2-1-066 None None   V35T, E36D, E40D, K49R, V60I, K122KE, D123DN, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248KN  
2-1-068 2-1-068 None None   V35T, K104KR, K122E, D123N, K166KR, K173I, Q174K, I178M, T200A, Q207E, V245K L193LIM 
2-1-069 2-1-069 None None   V35T, E36D, K122E, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E, E248D  
2-1-070 2-1-070 None None   V35T, T39L, V60I, A98S, K101Q, K103R, K122E, D123NS, I135R, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, E248D  
2-1-071 2-1-071 None None  V179E K20R, T27TS, V35T, T39E, V60I, K122E, D123N, I135KR, K173KR, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N  
2-1-077 2-1-077 None None   V35T, E40D, K49R, I50V, V60I, K122E, D123S, T165I, E169ED, K173KT, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D  
2-1-080 2-1-080 None None   V35T, V60I, I135IV, A158AS, S162A, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211E, V245Q, E248D  
2-1-086 2-1-086 None None  V179E K20R, V35T, T39E, V60I, K122AP, I135R, I142AV, Q145QH, K173R, Q174DN, D177E, T200A, I202IV, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
2-1-088 2-1-088 None None   V35T, V60VI, T69TS, K122E, D123NS, S162CY, F171FY, K173KAET, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, E248D  
2-1-090 2-1-090 None None   V35T, E36ED, K43KR, K49R, I50IV, E53D, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, D177E, T200A, E203D, Q207E, R211K, P243T, V245Q, E248ED  
2-1-093 2-1-093 None None   P4PS, V35T, T39L, V60I, I135T, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, I195L, G196E, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248N  
2-1-100 2-1-100 None None   K20KR, V35T, T39R, E40D, K49R, V60I, V106I, K122P, S162C, E169D, K173T, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D  
2-1-104 2-1-104 None None   V35R, V60I, S68G, T69TN, K122KE, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245EQ  
2-1-110 2-1-110 None None   V35T, D123E, I135T, I142V, S162A, D177E, V179I, T200A, Q207N, R211K, V245Q E29D 
2-1-112 2-1-112 None None   K20R, V35T, E36D, T39N, E40D, V60I, K122E, D123DN, I135T, E138A, I142V, K173T, Q174R, D177E, T200A, I202V, Q207N, R211K, F214L, V245Q, E248ED  
2-1-119 2-1-119 None None   K11KR, V35T, E40ED, V60I, K122E, D123N, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211RK, F214L, V245Q, E248N  
2-1-125 2-1-125 None None   K20R, V35T, V60I, K64KR, K104R, D123S, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, R211K, V245K  
2-1-133 2-1-133 None None   K20R, V35T, V60I, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, I195IL, G196E, T200A, Q207D, V241I, V245Q  
2-1-136 2-1-136 None None   V35T, K49R, E53ED, V60I, K122P, I135T, E169D, D177E, I178V, I202IV, E204K, Q207E, R211K, F214FL, P243PS, V245KQ, E248ED  
2-1-139 2-1-139 None None   V35T, K49R, V60I, K102KQ, V118I, K122KE, I135V, S162A, K166KR, E169R, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
2-1-142 2-1-142 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, Q174N, D177E, T200A, Q207D, V245Q, E248D  
2-1-143 2-1-143 None None   V35T, K64R, K122E, D123N, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211RK, V245E  
2-116 2-1-116 None None   V35T, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207N, V245Q, E248ED  
2-132 2-1-132 None None   K22R, V35T, K122E, D123N, I135V, A158S, S162A, K173T, Q174R, T200A, Q207E, R211K, V245K