<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Nii-Trebi (2013)
Title HIV-1 drug-resistance surveillance among treatment-experienced and -naive patients after the implementation of antiretroviral therapy in Ghana.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 101
NumPts 101
Subtype CRF02_AG, A, CRF06_cpx, CRF09_cpx, G, B, CRF45_cpx

 

  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 101 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
106977 106977 None None   T7TP, V35T, E36D, V60I, I135V, S162A, K173IT, Q174QK, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211RK, V245Q  
107421 107421 None None   V35T, V60I, I135V, S162A, T165TI, E169ED, K173A, D177E, V179I, G196E, Q207A, F214L, V245K, D250E  
1102 1102 None None A62V  V35T, V90I, I135V, S162A, T165I, K166E, E169K, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, V245Q  
1159 1159 None None   V35T, V60I, K122E, I135V, S162A, K173T, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, F214L, V245Q, E248N, D250E, S251D  
117954 117954 None None   E28K, K32E, V35T, E36N, V60I, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, L228H, V245Q, E248N  
120495 120495 None None   V35T, E36ED, T39R, K43E, V60I, S68G, V90I, V106VI, D121DH, K122E, I135IV, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178MV, T200TA, Q207A, R211S, V245Q  
122081 122081 None None   V35T, E36D, T39R, K49KR, D123E, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, P243S, V245Q, D250E I178T 
1226108 1226108 None None   V21I, V35T, V60I, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, L193LF, T200A, Q207K, R211E, V245Q, E248D, D250DE, S251I, I257IV  
123129 123129 None None   V35T, K49R, V60I, D121H, K122KE, I135V, S162A, E169Q, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
1277 1277 None None   V35T, E36D, T39AE, K122Q, I142V, S162A, Q174E, D177E, T200A, Q207EK, R211K, V245E  
128032 128032 None None   K20R, V35T, T39TM, E40ED, V60I, K102Q, K103KR, K104KR, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245E  
128149 128149 None None  K103KN, G190GS V35T, K49R, V60I, K122I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243H, V245E  
129744 129744 None None   V35T, T39A, A98S, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, E204ED, Q207DN, R211K, V245Q, D250DE  
129888 129888 None None   K20R, V35T, K49KR, K104KR, S162A, K173T, Q174EK, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245Q  
130088 130088 None None   E28K, K32E, V35T, V60I, K64R, K122R, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245EK, K249Q  
131084 131084 None None   V35T, E36D, V60I, K101Q, K103KR, D121H, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178V, T200A, E204Q, Q207E, R211K, F214L, P243AS, V245Q  
132565 132565 None None   E28K, K32E, V35T, E36D, K122KE, S162A, E169Q, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245T  
132838 132838 None None   K20R, V35T, K102Q, K122E, D123E, S162A, K173T, Q174R, D177E, G196GE, T200A, Q207E, R211K, V245EKQ, D250DE  
133000 133000 None None   E28A, V35AT, T39TR, K43KE, K122KE, I135T, Q174D, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, P243T, V245HQ  
133309 133309 None None   V35T, V60I, V90I, K102R, K122E, D123N, I135V, I142V, S162A, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E  
133401 133401 None None   K20KR, V35T, E36D, T39L, K49R, V60VI, K102KR, I135IV, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248N, D250DE  
134251 134251 None None   V35T, E36ED, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K, V245LQ  
134262 134262 None None   V35T, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
134881 134881 None None   V35T, E36D, T39K, K122P, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, F214L, P243A, V245Q  
134914 134914 None None   K11AT, V35T, E36A, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, I142V, S162Y, K173L, Q174K, V179I, G196GE, T200A, Q207A, R211REGK, F214L, V245Q  
135027 135027 None None   E6ED, V35T, E36ED, T39TA, K122E, D123DN, I135V, S162A, K173T, Q174KR, D177E, I178IM, T200A, Q207E, P243PT, V245KQ, P247PQ  
1359 1359 None None   K20R, V35T, V60I, K102Q, K122KE, I135V, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, E224D, V245Q  
136018 136018 None None   K11S, V35T, E36D, K122A, D123N, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207T, R211K, V245Q, V254I  
1375 1375 AZT, 3TC EFV M184V K103N V35T, E36D, T39L, V60I, D121Y, K122E, I135IT, K173N, Q174K, D177E, I195L, G196E, Q207E, R211RK, V245E, D250E  
137834 137834 None None   V35T, K49KR, V60I, K64R, V90I, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I195L, T200A, Q207E, V245K, D250DE  
138609 138609 None None   V35T, E40D, S48T, K49R, V60I, K102KQ, K122V, D123N, S162A, K166R, K173T, Q174S, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245N, D250E  
138911 138911 None None   V35T, K122E, D123N, I135IV, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
139182 139182 None None   V35T, T39A, V60I, R83K, D123E, I135V, S162A, E169ED, K173IM, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207K, R211A, V245Q, E248D  
1434 1434 None None   V35T, K49KR, V60I, K122KI, D123DE, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243PST, V245DEKN, E248EDKN, S251SHNR  
1437 1437 None None   V35T, E36D, T39K, K43E, K102Q, D121H, K122E, I135V, S162A, K173KT, Q174EK, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245HN, D250DE  
1513 1513 None None   K20R, V21I, V35M, T39V, E40D, I50V, V60I, S68G, K101Q, K122Q, T165I, E169D, K173R, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, D250E  
1520 1520 AZT, 3TC NVP M184V G190A E6K, K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, V60I, K122E, D123N, I135V, T139K, I142V, S162Y, F171Y, K173A, D177E, V179I, T200A, Q207A, V245Q, E248H  
1563 1563 None None   V35T, K122KE, D123EG, S162A, K173T, Q174ADNT, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E  
1627 1627 None None   V35T, T39N, V60VI, D123E, I135V, S162A, K166R, K173T, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
1640901 1640901 None None   V35T, E36A, V60I, S68G, V90I, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, S251H  
1640903 1640903 None None   V35T, T39L, D123E, I135T, T165I, K173A, Q174R, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245E, D250E  
1649 1649 None None   V35T, E36D, D123E, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, D250E  
1765 1765 None None   V35T, T39R, K43E, V60I, S68G, V90I, V106I, K122E, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245Q  
None None   V35T, K49R, V60I, K122E, I135V, S162A, K166R, E169A, K173E, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q, D250E, S251N  
23317 23317 None None   V35T, T39A, K64R, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211Q, V245Q, E248ED, S251H  
31550 31550 None None   V35T, E36D, T39L, K102R, I135V, S162A, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
354 354 None None   V35T, E36ED, K49R, I135V, S162A, T165I, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204EQ, Q207G, R211K, P243T, V245Q  
36307 36307 None None   V35T, E36D, V60VI, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211RK, V245E  
None None   K11T, V35T, T39TK, K43KE, D121H, K122E, D123S, I135T, I142V, S162A, K173T, Q174R, D177E, V179I, G196E, Q197K, T200TAEK, Q207ADE, R211K, F214L, V245Q, E248V  
4040 4040 None None   V35T, E36D, V60I, V90I, I135V, S162A, K173T, Q174KR, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207D, R211K, V245Q  
42489 42489 None None   V35T, V60I, K122E, K173I, Q174R, D177E, T200E, Q207E, R211K, V245Q, E248N  
60390 60390 None None   V35T, V60I, D123DE, I135V, S162A, K173S, D177E, V179I, G196E, Q207A, R211RK, F214L, V245K, D250E  
62034 62034 None None   K11T, V35T, T39K, K102Q, K122E, D123NS, I142V, S162A, K173S, D177E, V179I, T200TA, Q207A, R211K, V245Q, E248EK, D250DE, S251C  
654 654 None None   V35T, E36D, T39TA, E40D, V60I, I135V, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178IM, T200AE, Q207N, R211KQ, V245Q  
667 667 AZT, 3TC NVP M41ML, M184V, T215Y Y181C K20KR, V35T, K49R, V60I, I135T, S162D, K166R, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
775 775 D4T, 3TC EFV M184V K101E, V108I, G190S V35T, E36D, K49R, V106VI, K122P, I135V, S162A, T165I, E169D, K173A, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q K13KN 
80 80 None None   V21I, V35T, E36D, K43E, K49KR, V60I, I135V, S162A, S163T, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
814 814 None None   V35T, E36D, T39K, K43KEQ, V60I, S68G, K122KE, I135V, S162A, K173T, D177E, I178M, T200A, R211K, V245Q  
85587 85587 None None   V35T, S68G, V90I, K122E, D123N, I135V, E138EA, S162A, K173S, V179I, T200TA, Q207A, R211K, P243PS, V245Q, E248D, D250DE  
86373 86373 None None   K20KR, V35T, E36A, T39TS, V60I, I135V, S162A, K173IV, Q174K, D177E, T200AE, R211RS, F214FL, V245Q  
8652 8652 None None   E28A, V35T, E36D, V60I, D123DE, I135V, S162A, K173M, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
894 894 None None   V35T, T39TA, E40D, V60I, D121H, K122E, D123X, I142T, K173G, Q174K, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D  
99525 99525 None None   V35T, E36D, T39M, V60I, K122E, D123S, I135V, S162A, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207G, R211K, V245E, D250E, S251N  
KF102 KF102 D4T, 3TC EFV M41L V179E E6EG, V35K, E53D, V60I, K122E, D123N, K173M, Q174K, D177E, I178M, I195L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248V, D250E  
KF113 KF113 NRTI NNRTI   E6K, K11T, V35T, V106I, K122E, D123G, I135T, I142V, A158S, S162Y, K173S, D177E, V179I, Q207AT, F214L, V245Q  
KF116 KF116 NRTI NNRTI   V35T, E36D, V60I, I135V, S162A, K166KR, K173T, Q174AE, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
KF118 KF118 NRTI NNRTI   V35T, E36D, V60I, K122E, D123DE, I135V, S162A, T165I, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
KF12 KF12 NRTI NNRTI   V35K, E36D, T39A, K43Q, K49R, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, Q207E, R211Q  
KF128 KF128 AZT, 3TC NVP D67N, T69DN, K70R, M184V, T215F, K219Q V108I, Y181C K20R, K32E, V35T, E36A, T39K, K43A, V60I, L109I, D121H, K122E, I135R, T139R, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, L228H, V245Q  
KF131 KF131 AZT, 3TC NVP M184V, T215Y A98G, K103N, K238T V35T, V60I, S68G, D121Y, K122E, D123E, I135V, K173T, Q174K, N175NY, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, V261I  
KF176 KF176 NRTI NNRTI   K22R, V35T, V60I, K64KR, K122E, D123E, I135V, E138EA, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
KF191 KF191 NRTI NNRTI   V35T, T39LS, K122P, S162A, K173N, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245VELQ, E248DN, D250DE  
KF205 KF205 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, T215Y K103N, K238T K20R, V35T, V60I, I135V, S162T, K173M, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
KF21 KF21 NRTI NNRTI   V35T, V60I, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174KNRS, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211K, P243PA, V245KQ  
KF229 KF229 D4T, 3TC EFV M184V Y188L V35T, E36D, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, Y232H, V245Q, E248T  
KF251 KF251 AZT, 3TC NVP  A98AG, K103KN V21I, V35K, E36D, T39A, V60I, I135V, S162A, K173N, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211RK, P243PS, V245T, E248D, K249Q  
KF256 KF256 AZT, 3TC EFV M41L, D67N, K70KR, M184V, L210W, T215Y, K219N A98G, G190A V35T, T39K, K43E, E44D, I94L, D123E, I135M, K173A, Q174K, D177E, V179I, V189VI, T200A, Q207E, H208Y, R211K, V245Q, E248DN  
KF270 KF270 NRTI NNRTI   K20R, V35T, T39K, E40D, D123E, T139A, I142V, S162H, F171Y, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K, V245Q, E248N  
KF271 KF271 NRTI NNRTI   V35T, T39TILP, V60I, D121H, K122E, I135V, S162A, K173AT, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211E, V245Q, E248D  
KF307 KF307 AZT, 3TC None M41ML, M184V, T215Y A98G K20R, V21VI, E28EA, V35T, V60I, V90VI, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
KF327 KF327 D4T, 3TC EFV D67G, K70R, M184V, T215V, K219E K103N, P225H V35T, E36A, V60I, S68G, I135IM, S162A, K173T, Q174K, I178M, Q197E, T200K, K201R, Q207E, V241I, V245T, E248N  
KF347 KF347 D4T, 3TC EFV  K103KN, Y188FL V8I, K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, V60I, K122E, D123N, T139K, S162H, F171Y, K173A, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211RK, V245Q, E248H  
KF357 KF357 NRTI NNRTI   V35T, E36D, V90I, K122E, D123N, I135V, S162A, E169D, K173T, D177E, T200A, Q207N, R211KT, V245Q  
KF365 KF365 NRTI NNRTI   V35T, E36D, T39L, K64R, V90I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174R, T200A, Q207T, R211K, P243S, V245Q  
KF372 KF372 AZT, 3TC EFV M184V K103N, P225H V35T, E40D, K122P, A158S, S162A, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245KLMQ, E248EDKN  
KF375 KF375 AZT, 3TC EFV  V106VA, Y181YC V35K, E36D, E53D, A98S, K122E, D123T, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, I244V, V245Q  
KF40 KF40 NRTI NNRTI   V35T, E36D, V60I, K122R, D123E, I135V, A158S, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211N, V245Q  
KF43 KF43 AZT, 3TC EFV  K103N V35T, V60I, I135V, S162A, K173S, D177E, V179I, G196E, Q207A, R211K, F214L, V245K, D250E  
KF44 KF44 NRTI NNRTI  A98AG V35T, E36D, T39R, K49KR, D123E, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, P243PS, V245Q, D250E  
KF47 KF47 NRTI NNRTI   V35T, T39K, K43E, V60I, I135T, S162A, K173A, Q174E, D177E, T200A, Q207A, F214L, V245Q, E248D  
KF49 KF49 AZT, 3TC NVP M184MV K103N, P225PH, M230ML V35T, V60VI, K122P, D123DE, S162A, E169Q, K173D, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, E248NS S251P 
KF52 KF52 NRTI NNRTI   V35T, E36D, T39A, E40D, K122KE, I135T, S162A, Q174EK, D177E, T200A, Q207E, F214L, V245Q, E248D  
KF56 KF56 NRTI NNRTI   K20KR, V35T, V60I, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245KR  
KF58 KF58 NRTI NNRTI   V35T, E36D, K122R, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, E204EK, Q207QEK, R211K, F214L, V245Q  
KF61 KF61 NRTI NNRTI   V35T, E36D, V60I, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, I195L, T200A, Q207QE, R211K, V245C  
KF64 KF64 NRTI NNRTI   V35T, E36D, V90I, D123E, I135V, S162A, Q174T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
KF66 KF66 NRTI NNRTI   V35T, T39KR, V60I, D123E, I135T, I142T, K166R, K173T, Q174R, D177E, Q207E, R211K, V245Q  
KF7 KF7 NRTI NNRTI   V35T, K43E, K49R, V60I, K102Q, K122E, E138A, Q174E, Q207D, R211K, V245Q, D250E, S251N  
KF90 KF90 NRTI NNRTI   V35K, E36D, T39A, I135V, I159V, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248N  
KF98 KF98 NRTI NNRTI   V35T, K43KR, K122P, I135V, S162A, E169D, K173T, Q174KN, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245HQR, E248ED