<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Antoniadou (2013)
Title Molecular epidemiology of HIV type 1 infection in northern Greece (2009-2010): evidence of a transmission cluster of HIV type 1 subtype A1 drug-resistant strains among men who have sex with men.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 98
NumPts 98
Subtype B, A, CRF01_AE, C, K, F, CRF02_AG, G


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
GR013 GR013 None None T215C Y181C T39L, V60I, K122E, D123S, I135T, T139K, K173AS, Q174K, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245Q  
GR015 GR015 None None T215C Y181C T39L, V60I, K122E, D123S, I135T, T139K, K173S, Q174K, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245Q  
GR020 GR020 None None   V60I, S68G, I178M, G196E, Q197K, R211T, T216TA, E224X, V245E P217PRST, D218DEV, K219K*ST, K220KE, H221HNRS, Q222QE, K223KEGR, P225PR 
GR024 GR024 None None   E40D, K102KEGR, K122KE, I135IT, S162H, Q174N, D177E, G196E, R211T  
GR027 GR027 None None  V179D V60I, K122E, D123N, I135T, E138A, T165I, E169D, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211S, F214L, V245E H235Q, D237Y 
GR028 GR028 None None   K102R, S162H, Q174N, D177E, G196E, R211T D186DY 
GR029 GR029 None None   T39L, V60I, K122E, D123S, I135T, E138A, T139I, I142IT, E169D, K173S, Q174K, V179I, T200TA, Q207NS, R211RKNS, F214L, V245K  
GR031 GR031 None None  K101H, G190A E40ED, V60I, R83K, I135T, F171FL, D177E, V179I, R211K, I244V  
GR033 GR033 None None   I135T, T139TA, R211K, F214L, V245M  
GR035 GR035 None None   E40D, K102R, K104R, S162H, Q174N, D177E, G196AE, R211T, V245E R199RS 
GR036 GR036 None None   T39A, A98S, K122E, D123E, I135K, I178IL, T200A, R211K  
GR041 GR041 None None   T39N, K122E, D123N, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, E204D, Q207A, F214L, V245Q  
GR043 GR043 None None   V60I, K122KE, D123E, I135L, S162H, K173T, Q174K, I195IL, T200A, Q207A, R211T, V245HQ  
GR044 GR044 None None   D123E, I142M, K166R, D177E, Q207D, R211K  
GR046 GR046 None None   V90I, S105A, K122P, D123E, I135T, S162Y, K173E, Q174K, V179I, I202IV, E203ED, Q207QE, V245E  
GR048 GR048 None None   E40D, V90VI, K102R, S105SA, K122KPQT, D123DE, I135IT, S162HY, K173E, Q174N, V179I, G196GE, Q207QE, R211RT, V245VE  
GR050 GR050 None None   K64R, V90I, S105A, K122P, D123E, I135T, S162Y, K173E, D177N, V179I, Q207A, R211K  
GR051 GR051 None None   V60I, K64R, K122E, D123N, I135T, E138A, I142T, K166R, K173L, Q174K, T200A, Q207A, R211S, V245K  
GR052 GR052 None None   V60I, K122Q, I135M, S162A, K173I, Q174K, D177E, Q207E, V245E  
GR054 GR054 None None   E40D, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, V245R  
GR055 GR055 None None   E40D, S162H, E169D, Q174K, D177E, G196E, R211K  
GR056 GR056 None None   V118I, D123N, I135T, I142L, D177E, R211K, F214L, V245M  
GR057 GR057 None None  V179D V60I, K122E, D123N, I135T, E138A, T165I, E169D, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211S, F214L, V245K  
GR058 GR058 None None   I135T, I142T, R211K, F214L, V245M  
GR060 GR060 None None  V179D V60I, K122E, D123N, I135T, E138A, T165I, E169D, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211S, F214L, V245K  
GR061 GR061 None None T215C Y181C T39L, V60I, V118I, K122E, D123S, I135T, T139K, K173S, Q174K, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245Q  
GR062 GR062 None None  Y181I T39E, K122E, I135L, I142V, S162SC, K173T, Q174K, D177E, I178L, V179I, I202IV, Q207A, R211K, F214L, H221Y, L228Q, V245Q  
GR063 GR063 None None D67N Y181I T39E, K122E, I135L, I142V, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178L, Q207AT, R211K, F214L, H221Y, L228Q, V245Q  
GR064 GR064 None None   T39M, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q197QL, T200A, Q207A, V245K  
GR065 GR065 None None  V179E S48T, D123E, D177G, T200TM, F214L, D237E  
GR066 GR066 None None   T39L, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177G, V179I, Q207A, R211S, V245E  
GR068 GR068 None None  V179E S48T, D123E, I135IATV, D192N, F214L, D237E, V245E  
GR070 GR070 None None   T39E, E40D, S48T, V60I, K122E, D123S, S162H, K166R, K173E, D177E, T200A, Q207E, V245H  
GR073 GR073 None None   E40ED, S162H, Q174N, D177E, G196E, R211T  
GR074 GR074 None None   S162H, Q174N, D177E, G196E, R211T  
GR075 GR075 None None T215C Y181C T39L, V60I, K122E, D123S, I135T, T139K, K173LS, Q174K, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245Q  
GR076 GR076 None None   E40D, S162H, Q174K, D177E, G196E, R211K  
GR079 GR079 None None   V60VI, K122KE, I135RT, S162H, Q174N, D177E, G196E, R211K  
GR080 GR080 None None   E40D, I135IT, S162H, Q174K, D177E, G196E, R211K  
GR083 GR083 None None T215S K103N E40D, V60I, K122E, D123N, I135T, E138EA, I142IT, K173A, Q174K, D177DE, I178IM, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245K  
GR086 GR086 None None   V60I, S68G, I135T, S162H, Q174N, G196E, Q207H, R211K  
GR087 GR087 None None T215S K103N E40D, V60I, K122E, D123N, I135T, S162SC, T165TI, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245K  
GR088 GR088 None None   T39A, E40D, V60I, K122E, D123S, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200TA, Q207A, R211S, F214FL, V245Q  
GR090 GR090 None None   V60I, S68G, D123E, I135T, D177E, I195K, G196E, R211K  
GR091 GR091 None None   V60I, K122PQ, I135T, I142V, S162A, D177E, Q207E, F214FL  
GR092 GR092 None None   K122E, D123N, I135IT, D177E, P243S  
GR093 GR093 None None   T39TA, K49R, K101Q, D123E, I135R, E169D, Q174QH, D177E, I178V, V179I, I202V, R211K  
GR094 GR094 None None   V60I, S68G, I135T, I178M, G196E, Q197K, R211T, V245E  
GR096 GR096 None None   E40ED, V60I, S68G, T69TN, D123E, S162H, Q174N, D177E, G196E, E203ED, Q207H, R211K  
GR097 GR097 None None   V60I, T69S, D121H, K122E, I135T, T200I, I202V, R211K, F214FL, V245T  
GR098 GR098 None None T215S Y181C T39M, E44EG, V60I, K101R, K122E, D123S, I135T, T139K, T165I, K173S, Q174R, V179I, Q207A, R211S  
GR099 GR099 None None T69TADN  V60I, S68G, K122KE, S162H, Q174N, G196E, E203ED, Q207H, R211K  
GR100 GR100 None None   K102KR, S162H, Q174N, D177E, G196E, R211T  
GR101 GR101 None None   T39A, S48E, Q174H, R211K, F214L, V245Q  
GR102 GR102 None None   E53D, D121H, K122E, I135T, I142T, D177E, I178L, V179I, R211K  
GR104 GR104 None None   S48T, V60I, K122P, K166KR, D177E, Q207E  
GR105 GR105 None None T215C Y181C T39M, V60I, K122E, D123S, I135T, T139K, K173S, Q174K, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245E  
GR106 GR106 None None   T39L, K49R, V60I, K102Q, K122E, D123N, I135T, E138A, I142T, T165TI, R172K, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, F214L, V245R  
GR107 GR107 None None  K103N T39M, K122E, D123S, I135T, I142T, K173L, Q174K, D177G, V179M, T200A, R206RK, Q207A, R211S, V245K  
GR108 GR108 None None   I135L, N175H, Q197QK, T200A  
GR109 GR109 None None   V60I, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200TA, I202V, Q207A, R211KN, V245I  
GR110 GR110 None None   I142M, T200I, R211K, V245E  
GR111 GR111 None None   V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200E, Q207T, R211S, F214L, V245K  
GR112 GR112 None None   T39M, K122E, D123S, I135T, S162Y, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M  
GR113 GR113 None None   T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245E  
GR114 GR114 None None   V60I, S68G, D123E, I135T, D177E, I195K, G196E, R211K  
GR115 GR115 None None   T39TA, V60I, I135T, K166KR, F171Y, K173A, Q174K, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245N  
GR116 GR116 None None   D121DY, K122KE, D123DE, I142IM, I178IL, R211K  
GR117 GR117 None None T215C Y181C T39L, V60I, K122E, D123S, I135T, T139K, K173S, Q174K, V179I, T200A, Q207T, R211S, F214L, V245Q  
GR118 GR118 None None   V90I, K101R, S105A, K122P, D123E, I135T, T139TS, S162Y, K173E, Q174R, I178V, V179I, Q207A, R211K  
GR119 GR119 None None   V60I, K101KR, K122P, D123DE, I135T, S162C, F171Y, K173S, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q  
GR120 GR120 None None   K102R, S162H, Q174N, I180V, G196E, R211T  
GR121 GR121 None None   V60I, D121H, K122E, I135T, K166R, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211K, V245K  
GR122 GR122 None None   T200I, Q207R, R211K, V245E  
GR123 GR123 None None   T39A, K43R, I47N, K104R, Q174H, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
GR124 GR124 None None   V60I, K122E, D123N, I135T, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245R  
GR125 GR125 None None   A98S, E138A, K166R, P170H, T200I, R211K, V245E  
GR126 GR126 None None   V60I, D121H, K122E, I135T, K166R, K173IL, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211K, V245M  
GR127 GR127 None None   V60I, S105A, D123S, K173I, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207A, V245Q  
GR128 GR128 None None   T39M, V60I, K122E, D123S, I135T, E138A, T139TI, F171Y, K173AE, Q174K, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245Q  
GR129 GR129 None None   T39L, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, E203D, Q207A, R211S, V245R  
GR130 GR130 None None   T39E, K122E, D123G, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245T  
GR131 GR131 None None   T39A, S48E, I135R, T165I, Q174H, R211K, F214L, V245Q  
GR132 GR132 None None   V60I, K122KE, D123NS, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211N, V245R  
GR133 GR133 None None   E40D, S162H, Q174N, D177E, G196E, R211T  
GR134 GR134 None None   E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, V179I, Q207A, R211K, V245M  
GR135 GR135 None None   K102KR, V106VL, I135T, S162H, Q174N, G196E, R211A  
GR136 GR136 None None  K103N T39M, K122E, D123S, I135T, I142T, K173L, Q174K, V179M, T200A, Q207A, R211S, V245K  
GR137 GR137 None None   T39M, V60I, K122E, D123S, I135T, K173D, Q174K, V179I, Q207A, R211S, V245K  
GR138 GR138 None None   V60I, V118I, D123E, I135T, K166R, D177E, I178V, T200A, R211K, F214L  
GR139 GR139 None None   V60I, D121H, K122E, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245Q  
GR140 GR140 None None   E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, V179I, Q207A, R211K, V245M  
GR141 GR141 None None   E40D, K102KR, K104R, K122KE, S162H, Q174N, D177E, G196E, R211AT, V245E  
GR142 GR142 None None   V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200E, Q207T, R211S, F214L, V245K  
GR143 GR143 None None  K103N T39M, K122E, D123S, I135T, I142T, K173L, Q174K, V179M, T200A, Q207A, R211S, V245K  
GR144 GR144 None None T215C Y181C T39L, V60I, K122E, D123S, I135T, T139K, K173S, Q174K, D177N, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245Q  
GR145 GR145 None None   V60I, K122P, D123E, I135T, S162Y, F171Y, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q  
GR146 GR146 None None T215C Y181C T39L, V60I, K122E, D123S, I135T, T139K, K173S, Q174K, D177N, V179I, Q207A, R211S, F214L, V245Q