<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ong (2013)
Title Molecular diversity of HIV-1 and surveillance of transmitted drug resistance variants among treatment naive patients, 5 years after active introduction of HAART in Kuala Lumpur, Malaysia.
Citation J Med Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 100
NumPts 100
Subtype CRF01_AE, B, C, G


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
08MYKL002 08MYKL002 None None   E6D, K11S, V35T, T39K, K43E, V111I, K122E, D123N, K166R, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
08MYKL004 08MYKL004 None None   K11T, K122E, D123S, S162C, E203D, V245L  
08MYKL005 08MYKL005 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211N  
08MYKL007 08MYKL007 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
08MYKL009 08MYKL009 None None   K20R, V35I, K122E, I135R, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211N, K238R, V245E  
08MYKL010 08MYKL010 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245E  
08MYKL011 08MYKL011 None None   V106I, K122E, I135V, S162C, K238R, V245E, D250E  
08MYKL020 08MYKL020 None None   E6D, V35T, T39D, K102Q, K122E, D123N, I142V, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
08MYKL022 08MYKL022 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, W88C, D121H, K166R, K173I, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207D, R211S, K238R, I244V, V245E  
08MYKL023 08MYKL023 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K101Q, K122E, D123S, I135L, E138G, S162T, K173I, Q174K, D177E, T200E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
08MYKL025 08MYKL025 None None   I135V, S162C, Q207K, V245G  
08MYKL026 08MYKL026 None None   V21I, V35T, E36D, V60I, V90I, K122E, I135V, K173T, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, S251D  
08MYKL027 08MYKL027 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, Q207A, K238R, V245A  
08MYKL028 08MYKL028 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, I202V, Q207K, R211S, V245D  
08MYKL029 08MYKL029 None None   E6D, K11A, V35T, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207DN, R211RS, K238R, V245E, E248D  
08MYKL030 08MYKL030 None None   K20R, V35I, A98S, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211N, K238R, V245E  
08MYKL031 08MYKL031 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E I244R 
08MYKL032 08MYKL032 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, R83K, D86DE, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178V, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245K  
08MYKL033 08MYKL033 None None   K122E, D123S, I135T, T165I, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, I202V, Q207A, R211N, V245E S3N 
08MYKL034 08MYKL034 None None   E6D, T27S, V35T, T39K, K43E, S68G, V90I, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
08MYKL037 08MYKL037 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, E36D, T39K, K43E, K66R, D121H, K122E, D123DGNS, K173IT, Q174K, D177E, I178V, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245E  
08MYKL039 08MYKL039 None None   E6D, K20R, V60I, I135T, T200I  
08MYKL041 08MYKL041 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245E  
08MYKL042 08MYKL042 None None   V60I, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211N, K238R, V245E  
08MYKL043 08MYKL043 None None   V35T, S105A, D123E, I135V, S162C, R211G, E248D  
08MYKL044 08MYKL044 None None   E40D, K122E, S162C, K238R, V245E  
08MYKL045 08MYKL045 None None   E6D, V35M, T39A, R83K, K166R, V179I, T200A, I202V, Q207E T107I 
08MYKL046 08MYKL046 None None   V35I, I135L, S162C, S163T, E194K, I195L, G196E, Q207K Y183N, D185E 
08MYKL048 08MYKL048 None None   E6D, K11T, K32N, V35I, T39A, S68N, K122E, D123S, I135R, K173T, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
08MYKL049 08MYKL049 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V111I, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, L210S, R211S, K238R, V245E  
08MYKL051 08MYKL051 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K102Q, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
08MYKL055 08MYKL055 None None   I135V, S162C, V245E  
08MYKL057 08MYKL057 None None   V35I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211N, K238R, V245E  
08MYKL058 08MYKL058 None None   E6D, V35I, T39K, K43E, S68G, V106I, D121H, K122E, T139A, S163T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
09MYKL001 09MYKL001 None None   K32Q, T107S, K122E, D123N, I135IR, S162SN, K173I, Q174K, I178M, Q207A, R211S, V245E  
09MYKL009 09MYKL009 None None   E6D, V35I, E36A, T39K, K43E, A98S, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
09MYKL014 09MYKL014 None None   I5V, E6D, V8I, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200K, Q207A, R211S, K238R, V245Q  
09MYKL017 09MYKL017 None None   K20R, V35I, T39A, E44K, R83K, D123E, S162C, F171Y, I178L, R211K, V245E  
09MYKL018 09MYKL018 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, K238R, V245D  
09MYKL019 09MYKL019 None None   V35I, R83K, D123E, S162A, D177E, T200A, Q207E, V245E, E248D, D250E  
09MYKL020 09MYKL020 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, W88C, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
09MYKL021 09MYKL021 None None   V35T, T39E, S48T, E53D, V60I, D121Y, K122E, K166R, Q207K, R211K, V245K  
09MYKL022 09MYKL022 None None   K122E, D123S, I135R, S162C, E169D, K173I, Q174K, T200A, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245E, E248D  
09MYKL026 09MYKL026 None None  V179D K20R, K122E, D123N, I135R, S162C, K173AITV, Q174K, D177E, Q207D, K238R, V245E E53EA, I180IT 
09MYKL027 09MYKL027 None None   V8I, V35I, I135M, T200I, R211K I94IV 
09MYKL030 09MYKL030 None None   K20R, K122E, I135T, S162C, T200A  
09MYKL031 09MYKL031 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135IR, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E M16R, R72RK, D76DN 
09MYKL033 09MYKL033 None None  V179D E6D, S68G, D123E, Q207E  
09MYKL034 09MYKL034 None None   I5V, K11T, K22R, V35T, T39K, K43E, S68G, D123N, S162C, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
09MYKL038 09MYKL038 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, I135V, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, I244V, V245E  
09MYKL041 09MYKL041 None None   E6D, V35M, T39A, R83K, I135V, K166R, K173KT, V179I, T200A, I202V, Q207EK, R211RT T107I 
09MYKL042 09MYKL042 None None   D121H, K122E, D177E, T200A  
09MYKL045 09MYKL045 None None   V60I, V106VI, K122E, I135R, S162HY, K173IT, Q174K, D177E, E194EK, I195IK, Q207N, R211S, K238R I167IM, D186DE, L187LV, S191SFIT 
09MYKL046 09MYKL046 None None   E6D, V35L, A98S, V118I, K122V, I135R, T165I, E169D, G196E, I202V, Q207E, F214L, V245M  
09MYKL048 09MYKL048 None None   E6N, V8I, V35T, T39K, K43E, K64R, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178V, G196E, T200A, Q207A, R211S, V245E  
09MYKL049 09MYKL049 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S, V245E  
09MYKL050 09MYKL050 None None   V60I, E169D, V179I, G196E, I202V  
09MYKL051 09MYKL051 None None   K22R, W88C, S105A, I135V, S162C, R211G, K238R, V245E  
09MYKL052 09MYKL052 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173L, Q174K, I178M, T200A, Q207E, R211K, K238R, V245E  
09MYKL053 09MYKL053 None None   E6D, V35T, T39K, K43A, E53D, V60I, I142T, K173I, Q174K, D177E, V179T, Q207A, R211S, K238R, V245E, E248D  
09MYKL055 09MYKL055 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122EV, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, I202V, Q207A, R211S, V245E L120LF 
09MYKL056 09MYKL056 None None   V35I, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
09MYKL057 09MYKL057 None None   K20KR, D86DE, W88WC, I135V, S162C, R211RG, K238R, V245E  
09MYKL058 09MYKL058 None None   P4H, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123NS, R125RK, I135T, T165I, K173IM, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, K238KR, V245Q  
09MYKL060 09MYKL060 None None   K11T, K122E, D123S, I135R, S162C, Q174R, D177E, I178M, V179I, T200TA, Q207A, R211T, K238R, V245E  
09MYKL066 09MYKL066 None None   V35I, T107S, K122E, D123S, I135R, S162C, K173I, Q174K, I178M, Q207A, R211K, K238R, V245E G93GR 
09MYKL067 09MYKL067 None None   Q207E, R211K, V245M F61L 
09MYKL068 09MYKL068 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, S105A, V106I, K122E, D123S, I135T, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207A, R211S, K238R, V245E  
09MYKL070 09MYKL070 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, I202V, Q207K, R211S  
09MYKL071 09MYKL071 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, A98S, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
09MYKL073 09MYKL073 None None   K20R, D86E, K122E, D123S, I135R, S162Y, K173A, Q174K, D177E, Q207E, K238R, V245E  
09MYKL078 09MYKL078 None None   V35I, K122E, D123S, I135R, R172RK, K173IT, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211K, K238R, V245E  
09MYKL080 09MYKL080 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K102R, K122E, D123S, K173A, D177G, D192DN, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
09MYKL081 09MYKL081 None None   V35VIM, T39TA, T107S, S162C  
09MYKL083 09MYKL083 None None  V179D E6D, V8VI, K11T, V35T, T39K, K43E, S68SG, D121H, K122E, D123S, K173T, Q174N, D177E, T200R, Q207A, R211S, K238R, V245E  
09MYKL084 09MYKL084 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, D121H, K122E, D123S, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211K, K238R, V245K  
09MYKL086 09MYKL086 None None   K20R, K122E, D123NS, T165I, K173I, Q174K, D177DE, Q207A, R211S, V245M  
10MYKL001 10MYKL001 None None   E6D, V8I, K11AT, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, K173IT, Q174N, D177E, T200I, I202IV, Q207A, L210LF, R211S, K238R, V245E  
10MYKL003 10MYKL003 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135IT, T165I, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200EK, I202V, Q207A, R211S  
10MYKL005 10MYKL005 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K173I, Q174K, N175Y, D177E, V179T, G196E, T200A, Q207A, R211S, K238R, P243T, V245E, E248D, K249Q  
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10MYKL089 10MYKL089 None None   S162C, D177E, T200TI, R211Q, V245M