<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Masimba (2013)
Title Prevalence of drug-resistance mutations and HIV-1 subtypes in a HIV-1 infected cohort in rural Tanzania.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 226
NumPts 226
Subtype C, A, D, CRF01_AE, B, F


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Page 1   from Isolate 1 to Isolate 100 from Total 226 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
TZ.ET.19 TZ.ET.19 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123E, K173A, T200A, Q207E  
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TZ.ET.2 TZ.ET.2 None None   V35T, E36A, T39E, E40ED, S48T, V60I, K104R, S134SN, I135V, I142IT, T165I, E169EA, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211K E29R 
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TZ.ET.8 TZ.ET.8 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173T, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L E29R 
TZ.HLM.007 TZ.HLM.007 None None   V35T, T39K, S48T, V60I, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K K154KN 
TZ.HLM.010 TZ.HLM.010 None None   E6EQ, K11Q, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
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TZ.HLM.030 TZ.HLM.030 None None   K20R, V35T, K122E, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
TZ.HLM.031 TZ.HLM.031 None None   V35T, E40ED, K49R, V60I, K122E, D123S, T139V, K173A, D177E, T200E, E204K, Q207D, R211K  
TZ.HLM.035 TZ.HLM.035 None None   V35T, V60I, K122E, D123G, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
TZ.HLM.041 TZ.HLM.041 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, A158S, K173AT, T200A, Q207E  
TZ.HLM.055 TZ.HLM.055 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173A, D177E, G196E, T200A, Q207N  
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TZ.HLM.074 TZ.HLM.074 None None   V35T, E36A, T39A, S48T, K122E, D123S, I142V, K173T, D177E, T200A, Q207E  
TZ.HLM.075 TZ.HLM.075 None None   V35T, E36A, T39E, I47IL, S48T, K122E, D123G, A158S, T165I, K173A, D177E, T200A, I202V, E204EK, Q207EK, R211RK R78RK 
TZ.HLM.076 TZ.HLM.076 None None   V35T, T39R, K122E, D123G, K173S, D177E, V179I, Q197K, T200A, I202V, Q207A, R211S, L234X  
TZ.HLM.080 TZ.HLM.080 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K102KQ, K122E, D123N, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K  
TZ.HLM.087 TZ.HLM.087 None None   V35T, T39M, V60I, D121H, K122E, D123S, I142V, K173S, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207DE, R211K  
TZ.HLM.089 TZ.HLM.089 None None   K49R, V60I, D177E, T200A, Q207E, R211K  
TZ.HLM.092 TZ.HLM.092 None None   V35T, K43KR, K49R, K122E, D123N, A158S, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
TZ.HLM.173 TZ.HLM.173 None None   V35T, T39A, E40D, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, Q207T, R211S  
TZ.HLM.259 TZ.HLM.259 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, D123S, I135R, I142V, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207N, R211K  
TZ.HLM.262 TZ.HLM.262 None None   V35T, V60I, S105A, D121Y, K122E, Q174QK, D177E, I178IM, T200A, Q207E  
TZ.HLM.263 TZ.HLM.263 None None   V35M, E36A, T39E, S48T, D121H, K122E, D123S, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207V, R211K  
TZ.HLM.264 TZ.HLM.264 None None   K122E, S162A, K173A, D177EK, G196GV, T200A, Q207AE, R211K  
TZ.HLM.267 TZ.HLM.267 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K49R, V60I, K122E, D123GS, K173A, Q174R, P176Q, D177E, T200A, Q207E  
TZ1 TZ1 None None   E28K, K32E, V60I, K122E, I135T, D177E, T200A, Q207KN, R211AEKT, V245Q, A272AP, K275R, K277R, T286TA, E291D, V292I, I293V, P294T, V317VI, D324DE, I329L, Q334D, G335D, R356K, M357MV, A360AT, T377Q, S379C, K385KR, K390R, E404D, L452M, V458VI, R461K, S468C, L469M, H483N, L491PS  
TZ10 TZ10 None None   V60I, K122E, D123S, S163T, T165I, E169ED, K173A, D177E, I202V, Q207A, R211S, F214FL  
TZ100 TZ100 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, A158AS, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
TZ101 TZ101 None None  V179VD T39E, K43R, S48ST, T139A, A158S, K173A, Q174K, D177E, I178IV, T200V, I202V, Q207E, R211K, F214L  
TZ102 TZ102 None None   T39E, V60I, D121Y, K122E, I135R, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K  
TZ103 TZ103 None None   T39R, K43E, S68G, D121H, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
TZ105 TZ105 None None   V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, G196E, Q207A, F214L  
TZ107 TZ107 None None M41L  T39E, V60I, K122E, D123S, E138A, I142V, K173Q, T200I, Q207K, R211T  
TZ108 TZ108 None None   S48ST, E53D, V60I, D121H, K122E, I142V, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207E  
TZ110 TZ110 None None   T39G, V118I, E138A, K166R, K173S, D177E, I178V, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, F214L  
TZ114 TZ114 None None   V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211K  
TZ115 TZ115 None None   T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207D  
TZ119 TZ119 None None T215TP  V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, K122E, D123N, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
TZ122 TZ122 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121CY, K122E, D123G, I135T, K173A, T200A, I202V, Q207G, R211K, E233D  
TZ125 TZ125 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, I135T, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
TZ13 TZ13 None None K70KR, L74V, M184V K103N, Y181C T39E, S48T, T69S, K122E, D123S, I135T, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207N, R211K, F214L, H221Y  
TZ134 TZ134 None None   V35T, T39N, K102KR, K103KR, K122E, D123S, I135T, K173AS, Q207A, R211K  
TZ137 TZ137 None None   V35T, K49KR, V60I, D121DH, K122E, I135T, D177EG, Q207E, R211K  
TZ138 TZ138 None None   V35T, V60I, K122P, D123S, I135T, K173ST, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
TZ144 TZ144 None None   V35I, D121Y, K122E, D123E, I135T, S162C, Q174QH, T200IM, Q207G, R211K  
TZ15 TZ15 None None   V60I, K122E, I142T, K173A, Q174K, D177DE, I178L, Q207A, R211K  
TZ151 TZ151 None None   V35T, T39K, K43Q, D121H, K122E, D123S, I135V, I142V, T165I, K173AS, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S  
TZ163 TZ163 None None   S48T, V60I, K122E, D123S, I135V, K173L, Q174K, D177E  
TZ166 TZ166 None None   V35T, T39EG, K122E, D123N, K173A, D177E, V179I, T200I, I202V, Q207ADNT, R211K  
TZ167 TZ167 None None   V35K, T39E, S48T, K122E, D123N, K173T, T200A, Q207E  
TZ174 TZ174 None None   T39E, K122A, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A  
TZ178 TZ178 None None M184V G190A V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, D177G, V179I, T200A, Q207A, R211S  
TZ181 TZ181 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D123E, K173V, D177E, T200A, R206RK, Q207E  
TZ184 TZ184 None None   V35T, E36D, V60I, K102Q, D123E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200TA, Q207T, R211K, E233D  
TZ185 TZ185 None None   K32R, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
TZ189 TZ189 None None   V60I, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
TZ20 TZ20 None None   T39E, S48T, K122E, D123S, A158S, K173A, D177E, G196K, T200A, Q207A, R211K  
TZ21 TZ21 None None   V35T, T39K, K43E, K49R, E53ED, K122E, D123S, A158S, K166R, E169D, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
TZ26 TZ26 None None   V35T, T39A, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, E204K, Q207E  
TZ27 TZ27 None None   V35T, T39E, K122E, D123S, K173T, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211K  
TZ29 TZ29 None None   V35T, T39A, E40D, V60I, K166R, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211K  
TZ3 TZ3 None None   S48T, K122E, D123DN, A158S, K173T, D177E, Q197K, T200A, Q207E  
TZ35 TZ35 None None   S48T, K102Q, S162C, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207E  
TZ37 TZ37 None None   K32KE, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, I135R, A158S, K173A, D177E, Q197K, T200A, Q207N  
TZ40 TZ40 None None   V35T, V60I, K102Q, K122E, D123S, I135T, T165I, K173S, D177E, T200A, Q207A, R211K  
TZ41 TZ41 None None   T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, F214L  
TZ42 TZ42 None None   S48T, K122E, D123S, A158S, K166KR, K173A, D177E, I178V, G196K, T200A, Q207E, R211K  
TZ43 TZ43 None None   S48T, V60I, K103R, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
TZ44 TZ44 None None   T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, K166R, K173S, D177E, T200A, Q207K  
TZ45 TZ45 None None   V60I, K122P, D123S, I135T, K173ST, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
TZ46 TZ46 None None   K122E, D123DG, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, E203D, Q207D  
TZ47 TZ47 None None   T39E, S48T, K122E, K173A, D177E, Q207E, R211K  
TZ51 TZ51 None None   V35I, D121Y, K122E, D123E, I135T, S162C, T200IM, Q207G, R211K  
TZ52 TZ52 None None   T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207D, R211K  
TZ56 TZ56 None None  K103KN V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, S162Y, K173A, D177E, T200A, Q207E  
TZ59 TZ59 None None   V60I, V118I, K122E, D123G, I135T, E138A, K173I, Q174K, D177G, T200A, Q207E, R211K, F214L  
TZ6 TZ6 None None   S48T, V60I, K102KR, K122E, S162A, K173S, Q174K, T200TA, Q207A, R211S  
TZ61 TZ61 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K103R, K122E, D123N, K173A, Q197H, T200A, Q207E, R211K  
TZ78 TZ78 None None   T39L, S48T, V60I, K122E, D123S, I135V, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S  
TZ84 TZ84 None None   V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, T139A, I142V, D177E, I178M, T200I, Q207G, R211K  
TZ85 TZ85 None None   E40D, V60I, K122E, D123S, E138Q, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211N  
TZ88 TZ88 None None   K43KN, V60I, D121H, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
TZ96 TZ96 None None   T39A, E40D, V60I, T107S, D121H, K122E, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S