Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Huang (2013)
Title Multiple genetic pathways involving amino acid position 143 of HIV-1 integrase are preferentially associated with specific secondary amino acid substitutions and confer resistance to raltegravir and cross-resistance to elvitegravir.
Citation AAC
SelectedGene IN
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Lab
NumIsolates 72
Lab Parent Strain NL43


Lab IN Isolates : Susceptibility Data

IsolateINIMajorDRMsINIMinorDRMsMethodDrugFold Res.
143A,97A,230R,74I  T97A, Y143A, S230R PhenoSense EVG 66 
     PhenoSense RAL >150 
143A,97A,230R,74M  L74M, T97A, Y143A, S230R PhenoSense EVG 61 
     PhenoSense RAL >150 
143C,97A,230R,74I Y143C T97A, S230R PhenoSense EVG 35 
      PhenoSense RAL >150 
143C,97A,230R,74M Y143C L74M, T97A, S230R PhenoSense EVG 33 
      PhenoSense RAL 105 
143G,97A,230R,74I  T97A, Y143G, S230R PhenoSense EVG 55 
     PhenoSense RAL >150 
143G,97A,230R,74M  L74M, T97A, Y143G, S230R PhenoSense EVG 55 
     PhenoSense RAL >150 
143H,97A,230R,74I Y143H T97A, S230R PhenoSense EVG 7.0 
      PhenoSense RAL 20 
143H,97A,230R,74M Y143H L74M, T97A, S230R PhenoSense EVG 9.0 
      PhenoSense RAL 22 
143R,97A,230R,74I Y143R T97A, S230R PhenoSense EVG 34 
      PhenoSense RAL >150 
143R,97A,230R,74M Y143R L74M, T97A, S230R PhenoSense EVG 45 
      PhenoSense RAL >150 
143S,97A,230R,74I  T97A, Y143S, S230R PhenoSense EVG 49 
     PhenoSense RAL >150 
143S,97A,230R,74M  L74M, T97A, Y143S, S230R PhenoSense EVG 50 
     PhenoSense RAL >150 
Y143A  Y143A PhenoSense EVG 2.5 
     PhenoSense RAL 8.0 
Y143A,G163R  Y143A, G163R PhenoSense EVG 4.6 
     PhenoSense RAL 23 
Y143A,L74I  Y143A PhenoSense EVG 4.1 
     PhenoSense RAL 16 
Y143A,L74M  L74M, Y143A PhenoSense EVG 4.0 
     PhenoSense RAL 15 
Y143A,S230R  Y143A, S230R PhenoSense EVG 9.1 
     PhenoSense RAL 39 
Y143A,T97A  T97A, Y143A PhenoSense EVG 7.1 
     PhenoSense RAL 27 
Y143A,T97A,G163R  T97A, Y143A, G163R PhenoSense EVG 18 
     PhenoSense RAL 67 
Y143A,T97A,L74I  T97A, Y143A PhenoSense EVG 9.8 
     PhenoSense RAL 45 
Y143A,T97A,L74M  L74M, T97A, Y143A PhenoSense EVG 8.0 
     PhenoSense RAL 40 
Y143A,T97A,S230R  T97A, Y143A, S230R PhenoSense EVG 53 
     PhenoSense RAL 150 
Y143C Y143C  PhenoSense EVG 1.5 
     PhenoSense RAL 4.4 
Y143C,G163R Y143C G163R PhenoSense EVG 1.6 
      PhenoSense RAL 8.2 
Y143C,L74I Y143C  PhenoSense EVG 2.2 
     PhenoSense RAL 7.3 
Y143C,L74M Y143C L74M PhenoSense EVG 2.2 
      PhenoSense RAL 6.7 
Y143C,S230R Y143C S230R PhenoSense EVG 4.5 
      PhenoSense RAL 15 
Y143C,T97A Y143C T97A PhenoSense EVG 2.8 
      PhenoSense RAL 10 
Y143C,T97A,G163R Y143C T97A, G163R PhenoSense EVG 4.9 
      PhenoSense RAL 28 
Y143C,T97A,L74I Y143C T97A PhenoSense EVG 4.2 
      PhenoSense RAL 21 
Y143C,T97A,L74M Y143C L74M, T97A PhenoSense EVG 2.9 
      PhenoSense RAL 15 
Y143C,T97A,S230R Y143C T97A, S230R PhenoSense EVG 25 
      PhenoSense RAL 76 
Y143G  Y143G PhenoSense EVG 2.1 
     PhenoSense RAL 6.2 
Y143G,G163R  Y143G, G163R PhenoSense EVG 3.2 
     PhenoSense RAL 15 
Y143G,L74I  Y143G PhenoSense EVG 3.1 
     PhenoSense RAL 11 
Y143G,L74M  L74M, Y143G PhenoSense EVG 3.0 
     PhenoSense RAL 11 
Y143G,S230R  Y143G, S230R PhenoSense EVG 7.1 
     PhenoSense RAL 24 
Y143G,T97A  T97A, Y143G PhenoSense EVG 4.0 
     PhenoSense RAL 16 
Y143G,T97A,G163R  T97A, Y143G, G163R PhenoSense EVG 9.8 
     PhenoSense RAL 60 
Y143G,T97A,L74I  T97A, Y143G PhenoSense EVG 8.8 
     PhenoSense RAL 39 
Y143G,T97A,L74M  L74M, T97A, Y143G PhenoSense EVG 6.8 
     PhenoSense RAL 33 
Y143G,T97A,S230R  T97A, Y143G, S230R PhenoSense EVG 49 
     PhenoSense RAL 116 
Y143H Y143H  PhenoSense EVG 1.4 
     PhenoSense RAL 2.6 
Y143H,G163R Y143H G163R PhenoSense EVG 1.8 
      PhenoSense RAL 2.7 
Y143H,L74I Y143H  PhenoSense EVG 2.3 
     PhenoSense RAL 4.1 
Y143H,L74M Y143H L74M PhenoSense EVG 1.9 
      PhenoSense RAL 3.2 
Y143H,S230R Y143H S230R PhenoSense EVG 2.5 
      PhenoSense RAL 3.9 
Y143H,T97A Y143H T97A PhenoSense EVG 2.6 
      PhenoSense RAL 6.8 
Y143H,T97A,G163R Y143H T97A, G163R PhenoSense EVG 4.4 
      PhenoSense RAL 13 
Y143H,T97A,L74I Y143H T97A PhenoSense EVG 4.4 
      PhenoSense RAL 11 
Y143H,T97A,L74M Y143H L74M, T97A PhenoSense EVG 3.9 
      PhenoSense RAL 9.9 
Y143H,T97A,S230R Y143H T97A, S230R PhenoSense EVG 5.1 
      PhenoSense RAL 13 
Y143R Y143R  PhenoSense EVG 2.9 
     PhenoSense RAL 20 
Y143R,G163R Y143R G163R PhenoSense EVG 3.0 
      PhenoSense RAL 22 
Y143R,L74I Y143R  PhenoSense EVG 4.3 
     PhenoSense RAL 39 
Y143R,L74M Y143R L74M PhenoSense EVG 4.1 
      PhenoSense RAL 31 
Y143R,S230R Y143R S230R PhenoSense EVG 4.5 
      PhenoSense RAL 24 
Y143R,T97A Y143R T97A PhenoSense EVG 8.0 
      PhenoSense RAL 70 
Y143R,T97A,G163R Y143R T97A, G163R PhenoSense EVG 34 
      PhenoSense RAL >150 
Y143R,T97A,L74I Y143R T97A PhenoSense EVG 29 
      PhenoSense RAL >150 
Y143R,T97A,L74M Y143R L74M, T97A PhenoSense EVG 25 
      PhenoSense RAL >150 
Y143R,T97A,S230R Y143R T97A, S230R PhenoSense EVG 39 
      PhenoSense RAL 136 
Y143S  Y143S PhenoSense EVG 1.7 
     PhenoSense RAL 4.8 
Y143S,G163R  Y143S, G163R PhenoSense EVG 2.4 
     PhenoSense RAL 9.5 
Y143S,L74I  Y143S PhenoSense EVG 3.0 
     PhenoSense RAL 7.7 
Y143S,L74M  L74M, Y143S PhenoSense EVG 2.7 
     PhenoSense RAL 7.1 
Y143S,S230R  Y143S, S230R PhenoSense EVG 5.9 
     PhenoSense RAL 19 
Y143S,T97A  T97A, Y143S PhenoSense EVG 3.5 
     PhenoSense RAL 14 
Y143S,T97A,G163R  T97A, Y143S, G163R PhenoSense EVG 5.2 
     PhenoSense RAL 38 
Y143S,T97A,L74I  T97A, Y143S PhenoSense EVG 5.1 
     PhenoSense RAL 24 
Y143S,T97A,L74M  L74M, T97A, Y143S PhenoSense EVG 5.0 
     PhenoSense RAL 24 
Y143S,T97A,S230R  T97A, Y143S, S230R PhenoSense EVG 26 
     PhenoSense RAL 92