<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Han (2013)
Title High prevalence of HIV-1 intersubtype BC recombinants among injecting drug users in Dehong, China.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 95
NumPts 95
Subtype C, B, CRF01_AE


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
DHDR19I DHDR19I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162C, S163T, L187F, Q207E, R211K, V245Q, S251N D186G 
LC002I LC002I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, T139A, S162C, V179I, G196E, T200A, K201T, I202V, E204K, Q207E, R211K, V245Q  
LC004I LC004I None None   V35I, T107S, I135V, S162C  
LC005I LC005I None None   V35T, D123E, I135V, S162C, T200A, V245Q  
LC007I LC007I None None   V35T, T39E, S48T, V60I, I135V, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC008I LC008I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC013I LC013I None None   A98S, K122E, D123N, I135V, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245M  
LC015I LC015I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K101R, I135V, E138A, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC016I LC016I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135V, E138A, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC017I LC017I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, V111I, K122E, I135V, E138S, S162C, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC018I LC018I None None   V35T, E36A, T39D, V60I, D121Y, K122E, S162H, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC019I LC019I None None   K102R, D123E, S162C, D177E, R211K, V245Q  
LC021I LC021I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D123E, K166R, K173A, D177E, G196K, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC022I LC022I None None   K101R, I135T, K166R, D177E, I180L, F214L, V245M  
LC026I LC026I None None   V35T, T39N, S48T, V60I, I135V, S162C, K173A, D177E, G196K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, S251N  
LC027I LC027I None None   V35K, T39D, S48T, V60I, S162C, K173A, D177E, G196K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, S251H  
LC028I LC028I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, E194A, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248A  
LC030I LC030I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162H, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC031I LC031I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D123E, I135V, K166R, K173A, D177E, G196K, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC032I LC032I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173A, D177E, Q197K, T200E, Q207E, R211K, V245E  
LC038I LC038I None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135V, E138A, S162C, K166R, K173E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC040I LC040I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, I135V, S162C, K173A, D177E, G196R, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC045I LC045I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162Y, K166R, K173A, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC049I LC049I None None   A98S, I135V, S162C, G196A, R211K, V245E, K249R  
LC051I LC051I None None   I135V, S162C, V245M, D250E  
LC052I LC052I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K101R, D121Y, K122E, I135V, E138A, T139A, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC053I LC053I None None   V35T, T39D, S48T, V60I, I135V, S162C, K166R, K173A, D177E, G196R, T200A, Q207E, R211K, L228Q, V245Q  
LC054I LC054I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162N, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC055I LC055I None None   A98S, I135V, S162C, G196A, R211K, V245E, K249R  
LC216002I LC216002I None None   V35T, E36A, T39DE, S48ST, V60I, D121H, K122E, I135IATV, I142V, S162SHNR, K166KR, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC216003I LC216003I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K101R, K102R, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC216004I LC216004I None None   D123E, I135V, S162C, D177E, G196E, Q207E, R211K, V245Q  
LC216005I LC216005I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135V, T139I, S162C, K173R, T200A, Q207E, R211K, H221Y, V245Q  
LC216017I LC216017I None None  A98G E6K, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102R, D121Y, K122E, S162D, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC216018I LC216018I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K101R, D121Y, K122E, I135V, E138A, T139A, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC216027I LC216027I None None   V35T, E36EA, T39E, S48T, V60I, I135V, K166R, K173A, D177E, G196K, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LC216029I LC216029I None None   K43R, I135V, S162C, L193X, Q207E, V245M  
LC216031I LC216031I None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162C, Q174QR, I195IL, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, D250DE E194KT 
LC216036I LC216036I None None   K104R, S162SC, K173KR, R211X, F214FL, V245M  
LC216038I LC216038I None None   E6D, T107S, K122E, S162C, T200A, Q207E, V245Q  
LC216043I LC216043I None None   I135T, K166R, I180L, F214L, V245M  
LC216053I LC216053I None None   V35T, E36A, T39D, V60I, D121Y, K122E, S162H, K166R, K173A, D177E, T200TAIV, Q207E, R211K, V245Q  
LC216055I LC216055I None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V106I, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245K  
LCDR186I LCDR186I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, V90I, D121Y, K122E, S162Y, V179I, G196R, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LCDR187I LCDR187I None None   I135V, S162C, V241G, V245M Q222QL 
LCDR235I LCDR235I None None M184V V179D, Y181C T7P, V35T, T39D, S48T, V60I, K103KR, D121H, K122E, D123E, I135L, E138A, S162C, T200A, Q207E, R211K, H221Y, V245Q  
LCGA10I LCGA10I None None K219N K103N, Y181C V35L, S162C, Q174R, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LCGA492I LCGA492I None None M184V A98G, K101E, G190A E6K, K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, I135L, E138A, S162C, T200V, Q207D, V245Q  
LCGA494I LCGA494I None None   V35L, S162C, Q174R, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LCGA496I LCGA496I None None L74V, M184V K101E, G190S K11Q, V35T, T39D, S48T, V60I, S68G, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, E203D, Q207A, R211K, V245Q  
LCGA497I LCGA497I None None M184I V108I, Y181C V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121H, K122E, D177E, I178M, T200E, Q207E, V245Q  
LCGA499I LCGA499I None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162C, I178L, Q207E, R211K, V245Q  
LCGA919I LCGA919I None None   E6D, V8I, V35T, T39E, S48T, E53D, V60I, K122E, I135V, K166R, D177E, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
LX047IA LX047IA None None   K11T, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, I202V, Q207E, V245Q, S251I  
LX090IA LX090IA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, I135V, S162D, K166R, K173A, D177E, E194A, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LX133IA LX133IA None None   V35T, T39K, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245R, E248D  
LX219003I LX219003I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135V, S162D, K166R, K173A, D177E, E194A, T200A, Q207E, R211K, V245Q R72K 
LX219006I LX219006I None None   V35T, T39DE, S48T, V60I, S68SG, T165I, K173R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LX219028I LX219028I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, E138A, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
LX219037I LX219037I None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D123E, I135V, K173A, Q174K, D177E, G196K, Q197E, T200A, Q207K, R211KQ, V245Q  
LX219050I LX219050I None None   K122KE, I135V, S162C, D177E, V245I  
LX219051I LX219051I None None   T7P, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207D, R211RK, V245Q  
LX219053I LX219053I None None   K102R, I135V, S162C, P170PS, V189VI, G196GR, T200TA, V245M V111VIM 
LXGA19I LXGA19I None None  K103N V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162H, K166R, K173A, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245M  
RL106I RL106I None None   V35T, E36A, T39D, D121H, K122E, S162C, Q207E, R211K, V245Q  
RL115I RL115I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
RL215005I RL215005I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
RL215009I RL215009I None None  V179VD V35VA, E36EA, T39TA, S48ST, V60VI, T107TS, I135V, S162C, K173KAET, D177DE, T200TA, V245KLMQ  
RL215012I RL215012I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
RL215013I RL215013I None None   K32KR, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207K, R211K, V245Q  
RL215025I RL215025I None None   D121Y, K122E, S162C, Q174H, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
RL215030I RL215030I None None   D121Y, K122E, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
RL215042I RL215042I None None   V35VI, T107S, I135V, V245K P150PS 
RL215050I RL215050I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D177E, T200V, Q207E, R211K, V245Q  
RL215054I RL215054I None None   I135V, S162Y  
RLDR001I RLDR001I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, I135V, S162C, Q207E, R211K, V245Q, K249Q, D250E  
RLDR034I RLDR034I None None   I135V, S162C, Q207E, R211K  
RLDR035I RLDR035I None None   V35I, K122E, I135V, S162C, Q197K, T200A, V245M  
RLDR043I RLDR043I None None D67N, M184V, T215Y, K219KQ K101E, G190A E6D, K11T, E28K, V35T, T39K, K43E, D121H, K122E, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
RLDR07I RLDR07I None None   V35T, E36A, T39D, V60I, K102R, D121Y, K122E, I135R, K166R, K173A, D177E, T200V, Q207E, R211K, V245Q  
RLDR08I RLDR08I None None   V8I, V35T, T39N, S48T, E53D, V60I, K122E, Q207E, V245K  
RLDR09I RLDR09I None None   V35T, E36A, T39D, V60I, T107S, D121Y, K122E, S162C, E169D, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
RLDR17I RLDR17I None None   V35T, E36A, T39E, V60I, T107S, D121Y, K122E, K166R, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
RLDR20I RLDR20I None None   V35T, E36A, T39D, V60I, T107S, D121H, K122E, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
RLDR25I RLDR25I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
YJ217006I YJ217006I None None   S68G, K102KE, T165I, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211NS, V245E  
YJ217010I YJ217010I None None  V179D K11KR, V111I, E169ED, Q174H, D177E, T200I, F214L, V245I  
YJ217013I YJ217013I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, V90I, D121Y, K122E, S162Y, K166R, K173A, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
YJ217016I YJ217016I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, Q207E, R211K, V245Q  
YJ217036I YJ217036I None None   S162C, E169D, D177E, T200A, Q207E, R211K, E224N, V245Q  
YJ217040I YJ217040I None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135K, S162T, K166R, K173A, Q174R, D177E, I178L, I195L, Q197H, T200A, Q207DE, R211K, V245Q  
YJ217055I YJ217055I None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
YJ227203IA YJ227203IA None None   V35T, K122E, I142V, S162C, Q207E, V245Q  
YJGA473I YJGA473I None None   D121Y, K122E, K166Q, E169ED, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K  
YJGA479I YJGA479I None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, V60I, K101R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q