<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Wu (2013)
Title New emerging recombinant HIV-1 strains and close transmission linkage of HIV-1 strains in the Chinese MSM population indicate a new epidemic risk.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 133
NumPts 133
Subtype CRF01_AE, B, C


  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query
Page 1   from Isolate 1 to Isolate 100 from Total 133 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
AQP118 AQP118 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174N, D177E, I178M, T200I, Q207N, R211S, K238R, V245E  
AQP120 AQP120 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102KR, D121Y, K122E, S162C, Q207QHR, R211RK, V245Q, E248V, K249Q  
AQP121 AQP121 None None  G190A E6ED, K11KT, I135V, E169D, T200A, R211S  
AQP23 AQP23 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
AQP24 AQP24 None None L210LW  E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, S68SN, S105A, K122E, D123NS, S162SN, D177E, I178M, V179I, T200A, E204EK, Q207A, R211S, K238R, V245E  
AQP25 AQP25 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, I50V, V60I, D121Y, K122E, Q207QR, L210LS, V245Q, E248V, K249Q  
AQP26 AQP26 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, I50V, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
AQP28 AQP28 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39DE, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173KR, V189VI, T200TI, V245Q, E248V, K249Q  
AQP29 AQP29 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39DE, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173R, V189I, T200I, Q207E, V245Q, E248V, K249Q  
AQP31 AQP31 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135IATV, V245E, K249Q  
AQP32 AQP32 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
ASP129 ASP129 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, E204Q, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BB77Frag1 BB77Frag1 None None  V179E E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, I135R, R211K, F214L, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V, E312T, I326V, I329V, G335D, R356K, M357K, G359S, K366R, A371V, K388R, K390R, A400T, D460N, R461K, H483Y, L491S, S515L, S519N, Q524K, K527D, A554S  
BBP16 BBP16 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174R, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BBP19 BBP19 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135R, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BBP76 BBP76 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123N, S162C, Q174G, D177E, I178M, E203EG, E204EK, Q207A, L210LS, R211S, K238R, V245E  
BBP78 BBP78 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43KE, S68G, T69A, K122E, D123NS, I135R, S162C, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BBP80 BBP80 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135V, S162C, E169ED, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
BBP81 BBP81 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, L210LM, R211S, K238R, V245E  
BBP82 BBP82 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118VI, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, I202IV, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E V111VIM 
BZP60 BZP60 None None   K11R, E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
CZP15 CZP15 None None   E6N, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
FY64 FY64 None None  A98G, V179E E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I135R, R211K, F214L, K275Q, E291D, V292I, I293V, E312T, I326V, I329V, G335D, M357K, G359S, K366R, A371V, K390R, A400T, D460N, R461K, H483Y, L491S, S519N, Q524K, K527D, A554S  
FYP62 FYP62 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122A, D123S, K173IT, Q174K, D177E, V179I, T200I, I202IV, Q207A, R211S, K238R, V245E  
FYP65 FYP65 None None   I135V, S162C, Q174QH, T200AV, R211G, E248D  
FYP66 FYP66 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43KE, K122KE, D123S, K173M, Q174K, D177E, T200I, Q207A, V245E  
FYP67 FYP67 None None   E6D, K11T, K20KR, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E P4PHSY 
HBP130 HBP130 None None   E6D, K11ST, V35T, T39K, K43E, K46KE, K122E, D123S, I135R, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E P59PH, V60VG, S156ST, L168LS, E169E*, W239WG 
HBP132 HBP132 None None  P236L E6D, K11S, K22KR, V35T, T39K, E40EQ, K43E, K122E, D123S, I135T, I142T, S162SC, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HF104 HF104 None None  V179D E28K, K32E, V35T, T39E, S48T, V60I, K102E, K103R, D121Y, K122E, S162C, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, L283I, E291D, V292I, I293V, L310I, P313T, V317A, S322A, I329V, G335D, R356K, G359T, A371V, A376S, T377M, T386I, K390R, E399N, A400T, E404D, V435E, G436R, D460N, R461K, R463K, V467I, S468T, H483L, L491V, S519N, K527R, K530R, A534S, A554S D237H 
HF115 HF115 None None   E6D, V35T, K122E, D123S, K173N, Q174K, T200I, R211K, F214L, K238R, V245E, A272P, I293V, D324E, I329L, R356K, A376T, T386I, A400T, T403I, E449D, Q507H, A554T  
HFP100 HFP100 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, S105A, K122E, D123S, I167V, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HFP102 HFP102 None None   E28K, K32E, V35T, E36EA, S48T, V60I, D121Y, K122E, I142V, V245Q, E248V, K249Q  
HFP103 HFP103 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245K  
HFP105 HFP105 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, I142T, V245Q, E248V, K249Q  
HFP106 HFP106 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102R, K104R, D121Y, K122E, A158S, V245Q, E248V, K249Q  
HFP108 HFP108 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
HFP109 HFP109 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HFP111 HFP111 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
HFP112 HFP112 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, S105A, K122E, D123N, S162C, Q174K, D177E, I195IV, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E  
HFP113 HFP113 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K49R, K122E, D123S, I135T, S162C, E169D, Q174R, D177E, I178M, V179I, I202V, E203D, E204D, Q207A, R211S, K238R, V245D  
HFP114 HFP114 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, E204K, V245Q, E248V, K249Q  
HFP116 HFP116 None None   K122E, D123S, K166KR, I178M, I195K, G196E, T200A, Q207E, R211K, E248D  
HFP83 HFP83 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122KE, D123NS, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HFP84 HFP84 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
HFP85 HFP85 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, I202V, E203D, Q207A, R211S, V245E  
HFP86 HFP86 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238KR, V245E  
HFP88 HFP88 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39DN, S48T, V60I, D121DY, K122KE, D123DE, Q197QE, V245Q, E248IV, K249Q  
HFP89 HFP89 None None   E6D, K11KT, V35T, T39K, K43E, S105A, K122E, D123S, S162SC, T165TI, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245K  
HFP90 HFP90 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, I195L, G196E, E203G, Q207A, R211S, K238R, V245K  
HFP91 HFP91 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S105A, K122E, D123N, K173R, Q174R, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HFP93 HFP93 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245D  
HFP94 HFP94 None None   E28K, K32E, V35K, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
HFP95 HFP95 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, D177E, V245Q, E248V, K249Q  
HFP96 HFP96 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
HFP98 HFP98 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, S105A, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HNP01 HNP01 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135V, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, I195L, T200I, Q207A, L210S, R211S, K238R, V245E  
HNP02 HNP02 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39R, K43E, K49R, K122E, D123S, I135R, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, K249Q  
HNP04 HNP04 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39KR, K43E, K122E, D123NS, S162C, E169ED, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HNP05 HNP05 None None   I5IV, E6D, K11T, V35T, T39K, K43KE, K122E, D123N, S162C, Q174R, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HNP06 HNP06 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, S162C, F171Y, K173KR, Q174E, D177E, I178M, T200TA, E204K, Q207N, R211S, K238R, V245E  
HNP07 HNP07 None None   K102KR, I135V, I142IV, S162C, G196GE, T200A, R211RGMV, V245R G141GR, M230MI 
HNP08 HNP08 None None   E6D, K11T, K32R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, S162C, Q174AE, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238KR, V245E  
HNP09 HNP09 None None  V179D I5V, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, I135T, S162C, E169D, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HNP10 HNP10 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
HNP12 HNP12 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207T, R211S, K238R, V245E  
HSP35 HSP35 None None   E28K, K32E, V35I, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, V179I, V245Q, E248V, K249Q  
HSP37 HSP37 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K104KR, D121Y, K122E, R211RK, V245Q, E248A, K249Q  
HSP38 HSP38 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, T69S, K122E, D123S, I135V, S162C, K173R, Q174K, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
LAP40 LAP40 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173R, V189I, T200I, Q207QE, V245Q, E248V, K249Q  
LAP41 LAP41 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, A98S, S105A, K122E, D123NS, K173KR, Q174K, D177DE, I178M, V179VI, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MAS127 MAS127 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121HY, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
MASP125 MASP125 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123N, I135IMT, V245Q, E248V, K249Q  
MASP128 MASP128 None None   E6ED, K11T, V35T, T39KR, K43E, K102R, D123N, S162C, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
MASP22 MASP22 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, E204EK, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SZP133 SZP133 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E, S251Q D250R 
SZP136 SZP136 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39R, K43E, K49R, K122E, D123S, I135R, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S  
TLP122 TLP122 None None   E28K, K32E, V35IT, E36A, S48T, V60I, D121Y, K122E, R211RK, V245Q, E248V, K249Q  
TLP123 TLP123 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200TI, Q207A, L210LM, R211S, K238KR, V245E  
TLP124 TLP124 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, S48T, V60I, K102R, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
WH69 WH69 None None   V35T, T39E, V60VI, D121DY, K122E, D123DG, I135IM, D177E, V245Q, E248EV, K249KQ, A272AP, V276VI, K277KR, T286A, E291D, V292I, I293V, I309IL, E312EAKT, V317VAIT, I326IV, G335D, T338S, Y342YF, G359ST, K366KR, A371AV, T377M, K390R, A400T, E404ED, E432D, V435A, A437V, L452IM, Q464K, T470N, D471E, Q480H, H483CY, L491S, K512KR, L517LI, S519SN, K530KR, A534S, A554S L100L* 
WH73 WH73 None None   E6D, V35T, V118I, K122E, D123N, K166R, T200I, R211K, F214L, K238R, V245E, A272P, I293V, H315C, D324E, I329L, A376T, T377TIM, T386I, A400T, T403I, E449D, S468P, Q507H, K512R, S519N  
WHP52 WHP52 None None   E6N, K11T, V35T, T39R, K43E, K102R, K122E, D123S, I135R, S162C, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
WHP53 WHP53 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102Q, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
WHP55 WHP55 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173M, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, V245D  
WHP56 WHP56 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, K102R, K122E, D123S, S162C, F171Y, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, E203ED, Q207ADNT, R211S, K238R, V245E  
WHP57 WHP57 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39R, K43E, S68G, K122E, D123NS, I135T, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, I244V, V245E  
WHP68 WHP68 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123N, S162C, D177E, I178M, T200I, E203D, E204K, Q207A, R211S, K238R, V245E  
WHP70 WHP70 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V118I, K122E, D123S, I135T, K173M, Q174K, D177E, T200R, Q207A, R211S, F214L, V245D  
WHP71 WHP71 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, I135IATV, S162C, K173RS, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
WHP72 WHP72 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173KR, P225S, V245Q, E248V, K249Q  
WHP74 WHP74 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121DY, K122KE, V245Q, E248V, K249Q  
WHP75 WHP75 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K104KR, K122KE, D123N, S162C, F171FY, K173R, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
XCP138 XCP138 None None   K20R, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, S162N, V245P, E248V, K249Q  
XCP42 XCP42 None None   E6D, V21VI, V35T, T39K, K43KE, K66R, K122E, D123S, S162C, Q174K, D177E, I178M, I195L, T200TI, Q207A, R211IN, K238R, V245K  
XCP45 XCP45 None None   I5V, V118I, I135M, F214L, V245I  
XCP47 XCP47 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I178IM, T200A, V245Q, E248V, K249Q  
XCP48 XCP48 None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, V245Q, E248V, K249Q  
XCP49 XCP49 None None  Y181C E6D, K11T, V35T, T39K, T69N, V111I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, F214L, V245E  
XCP51 XCP51 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K101KR, K122E, D123S, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200TA, Q207A, R211S, K238R, V245E V111VIM