Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Brown (2009)
Title Phylogenetic reconstruction of transmission events from individuals with acute HIV infection
Citation J Infect Dis
SelectedGene PR
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 165
NumPts 165
Subtype B, CRF02_AG, C, F, CRF12_BF, A, D, G


  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 165 Clinical PR Isolates

CAS_100_1_7725 CAS_100_1_7725 None    T12A, L63PS, V77I, I93L  
CAS_103_1_7756 CAS_103_1_7756 None    I13V, K14R, K20I, E35D, M36I, R41RK, K45KQ, L63P, C67Y, H69K, L89M  
CAS_1069_16_38764 CAS_1069_16_38764 None    L10I, I13V, L63P, C67Y  
CAS_1074_16_38949 CAS_1074_16_38949 None    L63P, V77VI, I93L  
CAS_1079_16_38966 CAS_1079_16_38966 None    E35D, L63P  
CAS_1087_16_20034 CAS_1087_16_20034 None    L33V, E35D, K43R, L63P  
CAS_112_1_7634 CAS_112_1_7634 None    T12TK, M36I, L63T, I64V, I72V  
CAS_11_1_5767 CAS_11_1_5767 None    G16E, M36L, R41K, R57K, I62V, A71T, I93L G40GR 
CAS_121_1_7875 CAS_121_1_7875 None    Q18L, K20R, V77I  
CAS_1270_3_1613 CAS_1270_3_1613 None    T12P, I15V, E35D, M36I, Q61E, L63P, I93L  
CAS_1274_3_1702 CAS_1274_3_1702 None    L19I, E35D, R41K, A71T  
CAS_1294_3_1572 CAS_1294_3_1572 None    L10I, I13V, E35D, R57K, L63S, I64M, H69Q, A71V, I72E  
CAS_1295_3_1580 CAS_1295_3_1580 None    N37S, L63T, E65D, I72T  
CAS_1298_3_1608 CAS_1298_3_1608 None    I15V, E35D, N37D, D60E, Q61E, L63P, I93L  
CAS_1299_3_1611 CAS_1299_3_1611 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, I64L, H69K, K70R, L89M  
CAS_1303_4_1196 CAS_1303_4_1196 None    I15V, N37E  
CAS_1308_4_1202 CAS_1308_4_1202 None    K14R, I15V, N37C  
CAS_1311_4_1208 CAS_1311_4_1208 None    T12R, L19V, R41K, I64V  
CAS_1312_4_1209 CAS_1312_4_1209 None    I13V, I64V, I72IV, V77VI  
CAS_1316_4_1217 CAS_1316_4_1217 None    L19V, L63P, I64L, V77I  
CAS_1319_4_1220 CAS_1319_4_1220 None    L33V, M36I, N37S, Q61E, L63P, I64V, I93L  
CAS_1321_4_1222 CAS_1321_4_1222 None    L63P, I93L  
CAS_1326_4_1228 CAS_1326_4_1228 None    T12A, E35D, N37D, Q61E, L63P, I64L, A71T, V77I, I93L  
CAS_1337_4_1240 CAS_1337_4_1240 None    K14R, V77I, I93L  
CAS_1338_4_1241 CAS_1338_4_1241 None    L10I, I13V, L33V, I62V, L63T, I64V, C67Y, H69R  
CAS_1343_4_1247 CAS_1343_4_1247 None    I15V, G17E, K20R, E35D, M36I, R41K, R57K, Q61N, E65D, I72T  
CAS_1344_4_1248 CAS_1344_4_1248 None    I13V, V77I  
CAS_1348_4_1255 CAS_1348_4_1255 None    R41K, D60E, I62V, L63P, L89IM, I93L  
CAS_1350_4_1257 CAS_1350_4_1257 None    L10V, I15V, M36T, N37K, R41N, H69K, L89M, I93L  
CAS_1351_4_1260 CAS_1351_4_1260 None    L10V, T12I, I15V, N37D, R57K, I62V, L63P, V77I, I93L  
CAS_137_1_7997 CAS_137_1_7997 None    T12A, M36I, N37D, R41K, D60E, I62V, L63P, I93L  
CAS_139_1_7969 CAS_139_1_7969 None    M36I, N37D, Q61E, L63P, A71T, V77I, I93L  
CAS_141_1_8110 CAS_141_1_8110 None    I15V, E35D, M36I, R41K, I62V, L63P, H69Q  
CAS_142_1_8068 CAS_142_1_8068 None    I13V, I15V, E35D, K45R, R57K, L63A, I64V, V77I  
CAS_143_1_8220 CAS_143_1_8220 None    E35D, N37D, L63P, V77I, I93L  
CAS_146_1_8109 CAS_146_1_8109 None    I15V, G16A, E34EV, E35D  
CAS_148_1_7832 CAS_148_1_7832 None    L63P  
CAS_157_1_7987 CAS_157_1_7987 None    E35D, R57K, L63PS, I64V, C67CY, V77I  
CAS_161_1_8046 CAS_161_1_8046 None    I15V, L19Q, E35D, M36I, R41RK, L63P  
CAS_164_1_8084 CAS_164_1_8084 None   L33I I15V, N37D, P39PS, L63P, A71T, I72M  
CAS_172_11_999169 CAS_172_11_999169 None    R57K, L63P, I64L  
CAS_174_11_150422 CAS_174_11_150422 None    L63P, H69N, V77I  
CAS_175_11_999199 CAS_175_11_999199 None    M36I, I62V, L63P, I93L  
CAS_176_11_151534 CAS_176_11_151534 None   T74P   
CAS_178_11_999047 CAS_178_11_999047 None    E35D, N37D, L63P, A71T, I72V, I93L  
CAS_183_11_999030 CAS_183_11_999030 None    K20R, L63P  
CAS_184_11_150004 CAS_184_11_150004 None    M36I, N37D, K43R, I62V, L63P, V77I, I93L  
CAS_185_11_151207 CAS_185_11_151207 None   T74TP L63P, H69N, V77I  
CAS_194_11_999317 CAS_194_11_999317 None    N37S, R41K, R57K, L63P, I93L  
CAS_210_11_999237 CAS_210_11_999237 None    N37D, R57K, L63P, I93L  
CAS_213_11_999369 CAS_213_11_999369 None    Q7QH, T12I, I15IV, N37D, L63P, I64V, H69N, Q92QK, I93IL  
CAS_215_11_999261 CAS_215_11_999261 None    T31P  
CAS_218_11_999370 CAS_218_11_999370 None    T12A, I13V, K14R, K20I, E35Q, M36I, R41K, R57K, I62V, L63P, C67E, H69K, V82I, L89M  
CAS_232_4_1181 CAS_232_4_1181 None    L19I, E35D, M36I, N37D, L63P, I72IV  
CAS_233_4_1183 CAS_233_4_1183 None    M36I, R57K, I62V, L63A, I72M  
CAS_236_4_1187 CAS_236_4_1187 None    N37NS  
CAS_249_4_18042 CAS_249_4_18042 None    I13V, G17D, L63P, K70R  
CAS_255_4_18050 CAS_255_4_18050 None    M36I, R41K, I62V, L63S  
CAS_260_4_7191 CAS_260_4_7191 None    N37D, L63P, K70R  
CAS_264_4_7241 CAS_264_4_7241 None    L10I, I13IV, L63S, I64M  
CAS_266_4_7258 CAS_266_4_7258 None    I15V  
CAS_281_4_7465 CAS_281_4_7465 None    D60E, I62V, L63P, I72E  
CAS_351_3_899 CAS_351_3_899 None    I13V, K14R, G17E, K20I, E35D, M36I, R41K, I64M, H69K, L89M  
CAS_362_3_1598 CAS_362_3_1598 None    D60E, I62V, I72V, T74S, V77I, L89M  
CAS_368_3_1620 CAS_368_3_1620 None    T12S, E35D, R41K, L63P, I93L  
CAS_371_3_1640 CAS_371_3_1640 None    I13IV, A71AV, V77I  
CAS_379_3_1713 CAS_379_3_1713 None    T12P, K14R, L19I, M36I, N37S, I62V, L63P, I72V, I93L  
CAS_392_3_1753 CAS_392_3_1753 None    L10I, T12P, I13V, M36I, N37D, K43R, I62V, L63P, H69N, A71T, I93L  
CAS_403_3_1780 CAS_403_3_1780 None  I54V, V82A  L10I, I15V, L63P, V77I, I93L  
CAS_418_3_1807 CAS_418_3_1807 None    T12N, L19I, R41K, A71T, I93L  
CAS_423_3_1823 CAS_423_3_1823 None    I15V, N37S, R41K  
CAS_429_3_1832 CAS_429_3_1832 None    L10I, I62V, L63S, C67S  
CAS_440_3_1874 CAS_440_3_1874 None    L10I, L63S, I72L  
CAS_456_3_1921 CAS_456_3_1921 None    G16A, K20R, N37A, L63P, H69Q, V77I, I93L  
CAS_487_3_1989 CAS_487_3_1989 None    N37S, I62V, L63A, V77I  
CAS_488_3_1990 CAS_488_3_1990 None    T12K, I15V, Q18L, L19I, K20KR, R41K, H69Q  
CAS_48_1_6528 CAS_48_1_6528 None    K14R, E35D, N37S, R41K, R57K, I62V, L63P, V77I, I93L  
CAS_579_9_322 CAS_579_9_322 None    V11A, T12I, K14R, N37DE, R41K, I62V, L63P, A71V, V77I, I93L  
CAS_690_16_13011 CAS_690_16_13011 None    K43R, Q61G, L63S, V77I, I93L  
CAS_70_1_7172 CAS_70_1_7172 None  L90M  I13V, E35D, L63P, I64V, V77I L89LR 
CAS_710_16_34034 CAS_710_16_34034 None    L10I, M36V, R41K, D60E, L63P, I64V, I93L  
CAS_713_16_1014 CAS_713_16_1014 None    L10I, N37S, R41K, I62V, L63C, I93L  
CAS_717_16_103004 CAS_717_16_103004 None    I13V, I15V, L19S, E35D, N37E, L63A  
CAS_720_16_12177 CAS_720_16_12177 None    E35N, N37D, L63P, V77I, I93L  
CAS_728_16_34037 CAS_728_16_34037 None    R57K, L63P, I64L, E65D  
CAS_732_16_30032 CAS_732_16_30032 None    Q2QH, Q7E, N37NT, R41K, Q61HN, V77VI, I93L  
CAS_73_1_7189 CAS_73_1_7189 None    L19V, E35D, N37NS, I62IV, L63AP, V82VI, L89LM, I93IL  
CAS_749_16_33349 CAS_749_16_33349 None  L90M  T12P, K14R, L19I, E35D, N37E, K43R, L63A, A71T, V77I, I93L  
CAS_770_16_33341 CAS_770_16_33341 None    L33V, N37H, I64V, E65D  
CAS_78_1_7238 CAS_78_1_7238 None    N37S, L63A, I64V, V77I, I93L F99FC 
CAS_795_16_33078 CAS_795_16_33078 None    R41K, I62V, L63P, I93L  
CAS_796_16_36464 CAS_796_16_36464 None    L10I, K43R, R57K, L63P, C67S, I93L  
CAS_799_16_36471 CAS_799_16_36471 None    E35D, N37T, R57K, L63P, I64L  
CAS_807_16_36367 CAS_807_16_36367 None    T4TP, I15V, E35D, N37D, K43R, R57K, D60E, L63P, I93L V11D 
CAS_830_16_32013 CAS_830_16_32013 None    K43R, R57RK, I62IV, L63P, V77VI, I93L  
CAS_971_16_46236 CAS_971_16_46236 None    D60DE, Q61QE, L63P  
CAS_972_16_38957 CAS_972_16_38957 None    I13V, M36IT, N37D, L63P  
CAS_98_1_7668 CAS_98_1_7668 None    L10I, E35D, N37D, L63A, A71T, V77L, I93L  
CAS_99_1_7676 CAS_99_1_7676 None    N37S, L63A