<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Selimova (2010)
Title HIV-1 pol gene subtypes isolated from drug-naive individuals in Russia.
Citation Direct Genbank Submission
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 44
NumPts 44
Subtype A, B


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
01MOSR 01MOSR None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V90I, K122E, D123S, I135T, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
02MOSR 02MOSR None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, A272P, T286A, A288T, V292I, I293V, P294T  
03MOSR 03MOSR None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V90I, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
04MOS 04MOS None None   K11T, V35T, E36D, T39M, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
05MOSR 05MOSR None None   D123E, S162C, R211K, K277R, A288S, I293V, P294Q T69L, I94N, P95H 
06MOS 06MOS None None   K20R, T39N, K103R, D123E, I135L, I178M, T200A, R211K, A272P, T286P, I293V  
07MOSR 07MOSR None None   T27P, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, Y146YS, S162C, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245MT, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, L295LR, E312Q  
08MOSR 08MOSR None None   K11Q, T27P, V35I, E36D, T39K, S68G, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
09MOSR 09MOSR None None   K122E, D123E, K166R, T200A, R211K, V245K, A272P  
11MOS 11MOS None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, T200TI, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
12MOS 12MOS None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39E, K49R, K122E, D123N, A158S, K166R, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
13MOS 13MOS None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, D123N, A158S, K173L, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207A, R211S, E248D, S251N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
15MOS 15MOS None None   K11T, V35P, E36D, T39N, K122E, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
17MOS 17MOS None None   T27S, E36D, T39K, S68G, D123N, K173L, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245M, E248D, Y271YF, A272P, V276VI, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, L295M, K311R  
18MOS 18MOS None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V90I, V118I, K122E, D123S, I135T, A158S, K173L, Q174K, D177E, R206RK, Q207A, R211S, F214L, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
19MOSR 19MOSR None None A62V  K11T, V35I, T39KN, V90I, K122E, D123N, A158S, T165P, K173L, Q174K, Q207A, R211S, V245VM, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
20MOS 20MOS None None A62V  K11T, T27P, V35I, E36D, T39E, I50V, D121H, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207A, R211S, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
22MOS 22MOS None None A62V  V35I, E36D, K122E, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
23MOSR 23MOSR None None   K22N, T27P, V35T, E36D, T39R, K122E, D123S, I135L, A158S, S162A, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
24MOSR 24MOSR None None A62V  K11T, K32N, V35I, E36D, T39K, K49R, K122E, D123N, A158S, K173L, Q174K, Q207V, R211A, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T V111VL 
25MOSR 25MOSR None None   K11T, V35T, E36D, T39Q, S68G, D121H, K122E, A158S, K166R, K173S, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
26MOSR 26MOSR None None   K11T, V35I, E36D, T39N, V60VI, K122E, D123S, I132V, I135V, K173S, Q174K, D177E, I178L, Q207A, R211S, W212R, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
27MOSR 27MOSR None None   V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
28MOSR 28MOSR None None   K11P, P14A, K22N, T27P, V35I, E36D, T39K, D121H, K122E, D123S, I132V, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T I5Y 
29MOS 29MOS None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123S, I135T, A158S, K173V, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E300K  
30MOSR 30MOSR None None M184V  K11T, V35T, E36D, T39R, K122E, D123S, A158S, S162C, K173S, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
31MOSR 31MOSR None None   A98S, K122E, V245Q, E248D, S251N, A272P, K277R, T286A, E297K  
33MOSR 33MOSR None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123N, A158S, K173L, Q174K, Q207A, R211S, V245VM, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
34MOS 34MOS None None   D123E, D177E, T200V, R211K, I244V, V245K, A272P, K277R, I293V  
36MOSR 36MOSR None None A62V  K11T, K32N, V35I, E36D, T39K, W88WC, K122E, E138A, K173LS, Q174K, D177E, I195IL, Q207A, R211S, V245MT, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
37MOSR 37MOSR None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123N, A158S, T165I, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, E248D, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, P294T  
38MOS 38MOS None None   V35I, V106I, V118I, I135T, I142M, K173E, Q174K, T200A, F214L, V245N, Y271F, A272P  
39MOSR 39MOSR None None A62V  K11T, T27S, V35I, E36ED, T39K, K122E, D123S, I135T, S162C, K173L, Q174K, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, H315L  
40MOSR 40MOSR None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
41MOS 41MOS None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123N, A158S, K166R, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297V, V317A  
42MOS 42MOS None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39S, K49R, K122E, D123S, A158S, K166R, E169A, K173S, Q174K, I178M, Q207A, L210M, R211K, V245M, E248D, A272P, V276VI, K277KR, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297EK  
43MOS 43MOS None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39S, K49R, D123N, A158AS, K173S, Q174R, I178L, Q207A, L210M, R211K, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
45MOS 45MOS None None  K101E I135R, S162C, R211K, F214L, K277R, A288S, I293V  
46MOS 46MOS None None A62V  K11T, V35I, E36D, V60I, K122E, D123N, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
47MOS 47MOS None None   V35T, E36D, T39M, D121E, D123A, D177E, Q207A, R211S, V245M, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T F130L, R172R_L 
48MOSR 48MOSR None None   K11T, V35M, E36D, T39K, K43E, K49KR, V60I, K122E, D123S, I132V, K173L, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
49MOS 49MOS None None   D123E, S162C, V245M, A272P, K277R, I293V  
51MOS 51MOS None None   V35T, T39M, K122E, D123N, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, E248D, A272P, T286A, E291D, I293V Q161P 
52MOSR 52MOSR None None   K11T, T39N, K122E, D123S, I135T, S162H, K173L, Q174K, D177E, E203D, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E300D, E312K