<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Caron (2012)
Title Prevalence, genetic diversity and antiretroviral drugs resistance-associated mutations among untreated HIV-1-infected pregnant women in Gabon, central Africa.
Citation BMC Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 97
NumPts 97
Subtype CRF02_AG, CRF01_AE, G, A, F, K, H, B, D


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
Gab011078 Gab011078 None None   K11S, V35T, T39N, V60I, K104R, K122E, D123S, I135V, K173A, Q174K, D177E, G196E, Q207E, V245T, E248D  
Gab011110 Gab011110 None None   E6K, K11S, M16L, V35T, K43R, K122E, D123N, K173T, Q174A, D177E, I178V, V179I, T200A, F214L, V245Q, E248D, D250E  
Gab011131 Gab011131 None None   V35T, T39S, I135L, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178V, T200A, E204D, Q207A, R211E  
Gab011156 Gab011156 None None   V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, I135K, S162A, Q174E, D177E, T200A, E204K, Q207E, R211S  
Gab011157 Gab011157 None None   V35T, T39K, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
Gab011175 Gab011175 None None   V35T, T39I, V60I, I135V, D177E, V179I, T200A, K201T, E204K, Q207E, V245K, D250E  
Gab011232 Gab011232 None None   E6K, K11T, V35T, T39R, K43E, D121Y, K122E, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245Q, E248D  
Gab011245 Gab011245 None None   V21I, V35T, T39N, V60I, K102Q, K122E, D123N, T165I, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q K11F 
Gab011248 Gab011248 None None   V21I, V35T, E40D, V118I, I135V, S162A, T165I, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D, D250E  
Gab011304 Gab011304 None None M184L, L210W  K11A, V35T, T39K, K49R, K122E, D123G, E138A, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177K, E194K, R199K, I202L, R206K, Q207A, R211S, F214L I178R, Q182H, G231E 
Gab012028 Gab012028 None None   V35T, E36D, K49R, V60I, K102Q, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
Gab012038 Gab012038 None None   V35T, E36D, K104R, K122E, D123G, I135V, S162A, E169K, R172K, K173T, Q174K, D177K, E194K, G196E, T200A, Q207E, V245Q  
Gab012147 Gab012147 None None   P4H, V35T, K49R, K122E, I135V, S162A, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D E29G 
Gab012188 Gab012188 None None   V35T, T39S, K122E, D123G, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, V179I, L193F, T200A, Q207E  
Gab012222 Gab012222 None None   K11T, T27S, V35T, T39K, K43E, D123S, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245Q, E248D  
Gab012276 Gab012276 None None   K11Q, V35T, T39A, V60I, D121H, K122E, D123G, I135K, T165I, K173S, Q174R, D177E, I178L, Q207A, R211S, F214L, V245T, D250E  
Gab012291 Gab012291 None None   K11T, V21I, V35T, T39K, D121Y, K122E, D123G, E169D, K173A, Q174K, D177E, G196E, Q207N, R211S, V245Q, E248D, D250E  
Gab012292 Gab012292 None None   V35L, E36D, V60I, I135L, S162A, T165I, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
Gab013027 Gab013027 None None   V35T, E36D, T39I, K49R, K122E, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q, E248D  
Gab013058 Gab013058 None None   V35T, E36D, T39R, K43E, K49R, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, I244V, V245Q  
Gab013118 Gab013118 None None   V35K, T39K, V60I, K102Q, K122E, I135R, S162A, K173T, Q174K, T200A, Q207A, R211K, V245Q, E248D, D250E D121W 
Gab013176 Gab013176 None None   V35T, E36D, V90I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I180V, T200A, Q207E, V245Q  
Gab013192 Gab013192 None None   V35K, V60I, A98S, D123E, D177E, E194D, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
Gab013195 Gab013195 None None   V35T, V90I, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
Gab013274 Gab013274 None None   V35T, T39L, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, D250E L34S 
Gab013286 Gab013286 None None   V35T, D123E, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
Gab014006 Gab014006 None None   E6K, K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, V60I, V106I, K122E, D123S, I135L, I142V, S162Y, K173S, D177E, V179I, E194Q, G196E, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
Gab014121 Gab014121 None None   I5T, V35T, S162A, K173T, Q174E, T200A, Q207N, R211K, V245T  
Gab014129 Gab014129 None None   V35T, T39A, E40D, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211N, V245Q, E248D, D250E  
Gab014170 Gab014170 None None   V35T, V60I, D123E, I135V, I142V, S162A, K173T, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207K, R211T, V245K, E248D  
Gab014188 Gab014188 None None   V35T, E36D, T39L, K101Q, I135K, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, P243H, V245Q  
Gab014211 Gab014211 None None   V35T, E36A, V60I, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, V245K, D250E  
Gab014256 Gab014256 None None   V35T, K49R, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177G, I195T, T200A, Q207E, R211N, V245Q  
Gab014265 Gab014265 None None   V35T, T39L, V60I, K104R, I135M, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, F214L, V245Q, E248N  
Gab014268 Gab014268 None None   K20R, V35T, T39K, E40D, K122E, D123N, K173S, G196K, T200A, I202V, E204G, Q207A, R211S, V245Q, D250E  
Gab014296 Gab014296 None None   V35T, E36D, T39A, I135V, S162A, K173A, Q174N, D177E, I178M, T200A, Q207E, P243T, V245Q  
Gab021284 Gab021284 None None   V35T, T39E, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, V245Q, E248D  
Gab021293 Gab021293 None None   K20R, V35T, V60I, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, R211N, V245Q  
Gab031006 Gab031006 None None   K11Q, V35T, E36D, K102Q, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E  
Gab031029 Gab031029 None None   V35T, T39L, V90I, I135V, S162A, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K  
Gab031177 Gab031177 None None   K20R, V35T, E36N, V60I, S68G, K102Q, K122P, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, P243T, V245E, E248D  
Gab031217 Gab031217 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, I135V, S162A, E169Q, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248D  
Gab031225 Gab031225 None None   P4S, V35T, E40D, K64R, D123E, I135V, S162A, K173A, Q174K, T200E, E203Q, Q207D, V245K  
Gab031236 Gab031236 None None   E6K, V35L, K104R, K122E, S162C, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, R211K, V245Q, E248D  
Gab031240 Gab031240 None None   V35T, E36D, T39A, I132V, I135V, S162A, K173A, Q174T, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245D  
Gab031245 Gab031245 None None   V35T, E36D, T39L, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, Q197K, T200A, Q207E, F214L, V245Q, E248D  
Gab031261 Gab031261 None None   K11N, K20R, V35T, K122E, D123N, S162A, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, P243S, V245Q  
Gab031275 Gab031275 None None   K11T, V35T, T39R, K122E, D123N, K173S, D177E, Q207A, R211K, V245Q  
Gab041020 Gab041020 None None   V35T, D123E, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207E, R211K, P243A, V245Q, E248D, D250S  
Gab041032 Gab041032 None None   V35T, T39R, K43E, K49R, S68G, K104R, D123N, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207E, R211S, V245Q  
Gab041113 Gab041113 None None   V21I, V35T, T39V, V60I, I135T, T165I, K173T, Q174A, Q207E, R211K, V245H, E248D, D250E  
Gab051004 Gab051004 None None   V21I, V35T, T39K, E40D, V60I, V118I, D121H, K122E, I142V, S162N, K173T, Q174A, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E  
Gab051079 Gab051079 None None   S3I, P4L, V8G, V35T, E40D, D121H, K122E, I135T, S162A, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
Gab051112 Gab051112 None None   V35T, E36D, K103R, D123G, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, K223R, V245Q, E248N  
Gab051118 Gab051118 None None   K11T, V35T, T39G, D121H, K122E, D123N, I135L, I142V, S162C, K173T, Q174R, D177E, I178L, V179I, T200A, Q207A  
Gab052047 Gab052047 None None   V35T, T39A, E40D, I142V, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, P243A, V245Q, E248D, D250S  
Gab052155 Gab052155 None None   V35T, T39L, K102Q, K122E, S162T, E169A, K173T, Q174E, D177E, T200A, E204K, Q207E, V245K  
Gab052188 Gab052188 None None   I5V, E6D, V35T, K122E, D123N, K173T, D177E, I178V, G196R, T200E, I202V, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E  
Gab052227 Gab052227 None None   K22R, V35T, E36A, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, T165I, E169D, K173A, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211K, V245Q, E248D  
Gab052267 Gab052267 None None   K20R, V35T, E40D, D121H, K122E, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248N L12I 
Gab062003 Gab062003 None None   K11T, V35T, K122E, D123G, S162T, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K  
Gab062155 Gab062155 None None   I5T, E6D, V35T, E36D, K49R, V90I, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, E204D, Q207D, R211K, V245Q  
Gab062202 Gab062202 None None   K11A, V35T, T39K, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135T, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207A, R211D, V245Q  
Gab071135 Gab071135 None None   V35T, K122E, D123N, I135V, S162T, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, K223R, V245Q  
Gab071245 Gab071245 None None   K32R, V35T, E36D, K122E, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E  
Gab071263 Gab071263 None None   V35T, E36D, E40D, T69S, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200V, Q207N, E248K, D250E  
Gab071285 Gab071285 None None   E6D, V35T, E36D, T39N, K122E, D123G, T165I, K173T, D177E, T200E, I202V, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E E204S 
Gab081016 Gab081016 None None   V35T, E36D, K49R, D123E, S162T, T165I, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q I2F 
Gab081127 Gab081127 None None   P4R, V35T, T39S, I135L, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207D, V245E  
Gab081156 Gab081156 None None   I5T, V35T, E36D, V60I, D123E, I135L, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211Q, V245Q  
Gab081178 Gab081178 None None   V35T, T39N, E40D, K49R, I50V, V60I, K173S, T200A, Q207E, V245Q  
Gab081183 Gab081183 None None   K11A, K32R, V35T, T39R, K43E, D121H, S162C, E169D, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200K, Q207A, R211S, V245Q  
Gab081209 Gab081209 None None   E6D, V35T, V60I, T107S, D121Y, K122E, D123G, S162H, K166R, D177E, T200A, Q207A, R211K, I244V, V245E, D250E  
Gab081270 Gab081270 None None   V35K, V60I, K102E, K104R, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, T200A, I202V, Q207A, R211S, F214L, V245K  
Gab082017 Gab082017 None None A62V  V35T, E36D, T39L, K122E, D123N, K173S, T200A, Q207E, L210M, V245Q, D250G  
Gab082020 Gab082020 None None   V35T, E36D, T39S, K49R, I135V, S162A, F171Y, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243S, V245Q  
Gab082026 Gab082026 None None   V8I, K20R, V35T, E40D, K49R, I50V, V60I, V106I, K122E, D123N, K173S, Q197K, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D  
Gab082079 Gab082079 None None   V35T, K49R, V60I, K122P, I135V, I159V, E169D, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, V245K  
Gab082111 Gab082111 None None   K11T, K20R, V35T, T39K, D121Y, K122E, D123G, I135T, S162C, E169D, K173T, Q174K, D177E, G196E, Q207A, R211S, V245Q, E248D, D250S S191F 
Gab082115 Gab082115 None None   E6D, K11Q, V35T, T39K, V60I, T107S, D121Y, K122E, D123G, I142M, K173L, Q174K, I178L, T200A, Q207D, R211K, P243T, I244V, V245K  
Gab082146 Gab082146 None None   V35T, T39K, V60I, D123E, I135V, S162C, K173T, Q174K, D177E, G196E, Q197K, Q207E, R211T, F214L, V245Q, E248D, D250E  
Gab082180 Gab082180 None None   K11T, V35T, T39K, E40D, K102Q, D123E, I135V, S162A, T200A, Q207N, R211K, V245Q  
Gab082183 Gab082183 None None   V35T, S162C, F171Y, K173A, Q174K, D177E, I178V, Q207A, R211K, P243T, V245Q, D250S  
Gab082217 Gab082217 None None   K20R, V21I, T39A, K122P, S162C, Q174G, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245T  
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Gab091002 Gab091002 None None   E28A, V35T, E36D, T39E, V106I, K122E, I135T, S162H, K173L, D177E, I178V, V179I, T200A, E204K, Q207D, R211K, V245Q  
Gab091015 Gab091015 None None  V179E V21I, V35T, V60I, K102Q, K122E, D123E, I135V, Q174K, E194D, G196E, T200A, R211A, V245Q, E248D, D250K  
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Gab091163 Gab091163 None None   V35T, T39N, E40D, V60I, D121H, K122E, D123G, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
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Gab091211 Gab091211 None None   V35T, K49R, V60I, K122P, I135V, S162A, E169K, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245H  
Gab091232 Gab091232 None None  V179E V21I, V35T, V60I, K102Q, K122E, D123E, I135V, I142V, Q174K, E194D, G196E, T200A, R211A, V245Q, E248D, D250K  
Gab091233 Gab091233 None None   I2L, V21I, V35T, T39L, V60I, D123S, I135T, S162Y, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211N, V245Q  
Gab091257 Gab091257 None None   V35K, E36D, T39A, S68G, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245E