Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Holguin (2008)
Title Increase of non-B subtypes and recombinants among newly diagnosed HIV-1 native Spaniards and immigrants in Spain.
Citation Curr HIV Res
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 335
NumPts 335
Subtype B, CRF02_AG, A, G, C, D, CRF11_cpx, C + D, CRF06_cpx, F, A + J, H, CRF47_BF, CRF20_BG, CRF12_BF, CRF01_AE

 
  Page 1 of 4    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 335 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
05SP23-00276637 05SP23-00276637 None None   S48E, K102R, S162C, Q197E, E204K, Q207E, R211K, F214L, L228H, V245M  
05SP24-279958 05SP24-279958 None None M184V  I135T, R211RK, F214FL, V292I, I293V, I326IV  
05SP25-262223 05SP25-262223 None None   V35T, E40D, K43R, V60I, A98S, K122E, D123S, I135T, K173IT, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211S, F214FL, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293IV, E297A, D320DE, D324E, I329V, Q334LP  
05SP26-275808 05SP26-275808 None None   S68G, D123E, I135IT, N175H, I178L, G196E, T200A, R211DN L80LF 
SP1-223405 SP1-223405 None None   V35T, T39LS, V60I, A98S, K122A, T139M, Q174R, D177E, T200A, Q207K, R211S, V245T, D250E, A272P, T286A, E291S, V292I, I293V, E297A, V317A, D320E, D324E, I329V, Q334L  
SP10-286604 SP10-286604 None None L74LIV, M184I V179D, G190S V35L, V90I, K104R, I135L, K166IT, I178M, T200A, R211K, I244V, A272P, V292VI, I293V, Q334H  
SP10-320351 SP10-320351 None None   V35T, T39M, V60I, T107S, D121Y, K122E, D123DG, S162Y, T200A, Q207A, V245T, E248DN, A272P, I274V, Q278H, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V K11IMV 
SP11-239318 SP11-239318 None None   K49R, R83K, I293IV, P294S, E297K  
SP11-322971 SP11-322971 None None   K11T, T27S, V35T, T39K, K43E, K49R, D123S, I135M, S162A, K173S, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245Q, E248D, A272S, K281R, E291D, V292I, I293V, K311KR, E312INST, D324DE, K331N  
SP12-246516 SP12-246516 None None   K22KN, S68G, T200A, V245E, E248D, K281R, T286A I94IM 
SP12-331966 SP12-331966 None None   E40D, V60I, D123N, I135V, S162A, K173S, D177E, V179I, G196GE, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
SP122-30612 SP122-30612 None None   E28K, K32KE, V35T, E36D, K104R, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, R211K, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322A, I326V  
SP13-246924 SP13-246924 None None   D123E, I135IT, S162C, D177E, R211K, K277R, A288S, I293V, K311R, Q334L  
SP13-323939 SP13-323939 None None   T39E, D121H, K122E, D123DG, A158S, K166R, K173AITV, Q174KR, D177E, T200A, Q207G, V245Q I180IM 
SP131-285421 SP131-285421 None None   V10X, K11X, L12X, K13X, P14X, G15X, M16X, D17X, G18X, P19X, K20X, V21X, K22X, Q23X, W24X, P25X, L26X, T27X, E28X, I31L, V35AT, E36A, T39E, E40ED, S48T, K49R, D123E, K173AT, P176K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277KR, E291D, V292I, I293V E29K 
SP132-287163 SP132-287163 None None   V35T, V60I, K104KR, V118I, K122E, D123S, T165I, K173T, Q174K, D177E, G196GE, T200A, Q207E, F214L, V245Q, E248D, D250E, A272P, L279I, T286A, E291D, V292I, I293V, K311KR, D324E, I329V W88W*C 
SP15-248266 SP15-248266 None None   A98S, I135V, S163T, T165I, E169D, Q174R, Q207E, R211K, F214L, T286A, E297K, I329L  
SP15-339625 SP15-339625 None None   V35T, E36D, E40D, K43R, K49R, K122E, S162A, E169ED, K173A, Q174EK, D177E, V179I, I195T, T200A, Q207N, R211T, V245Q, E248D, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V  
SP16-249115 SP16-249115 None None   I178L, E204N, R211Q, F214L, V245M, A272P, K277R, T286A, A288T, K311R, I326V  
SP16-320310 SP16-320310 None None   V35T, V60I, S105A, K122E, D123S, I135T, S162T, D177E, T200A, Q207E, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V, K323R  
SP17-340928 SP17-340928 None None   V60VI, K122E, I135T, R211K, V245E, T286P, E291D, I293IV, E297A, I326IV  
SP18-252608 SP18-252608 None None   V60I, S68G, K122E, I135T, S162C, Q207A, R211E, A272P, T286A, E297G, I326V, Q334L  
SP18-320770 SP18-320770 None None   V35T, I50V, V60I, K104R, D121Y, K122E, I135M, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178L, I195L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, E297R, K311R, I329V  
SP19-257569 SP19-257569 None None   D86DE, E169D, I178M, T200A, I202V, R211K, A272P, E297Q, A327V, Q334Y E138EAGV 
SP2-290207 SP2-290207 None None   K11T, V35T, E36EAGV, T39K, K43E, V106I, D123N, S162Y, D177E, I178V, V179I, Q207A, R211K, F214L, V245Q, E248D, T286A, E291D, I293V, P294AT, E312D, I326V K173APST 
SP20-276426 SP20-276426 None None   K122E, I142T, Q174R, G196E, Q207E  
SP21-272254 SP21-272254 None None   V35I, S68G, R83K, I135T, E138A, D177E, G196E, T200I, R211G, V245M, A272P, K277R, P294S  
SP22-274335 SP22-274335 None None M41L, T215D K103N S48E, V60VI, K122KR, I135R, K166R, Q207E, K223R R143R*G 
SP22-339826 SP22-339826 None None   P4S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D123E, I135V, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
SP22-353742 SP22-353742 None None   V21I, E28A, V35Q, T39A, V60I, K122E, I135T, I142IT, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, R211K, V245Q, E248D, K277R, T286A, A288AT, V292I, I293IV, E297A, I326V, I329L  
SP25-353037 SP25-353037 None None M184MLV  I5V, V35T, K49R, K122E, D123N, I135T, I142V, K173T, D177E, E194ED, T200AEGV, I202V, Q207K, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, L283I, E291D, V292I, I293V, I329V I257IM 
SP26-346921 SP26-346921 None None M184I  K49R, V60I, V118I, K122A, T139A, T165I, E169D, Q174E, D177E, I178L, V179I P170G, P176G, I180M, Q182EG 
SP27-323135 SP27-323135 None None   I50V, D123E, I135L, I142IT, D177E, R211K, V245M, A272P, K281KR, P294S, E297T  
SP28-292485 SP28-292485 None None  G190GS T39M, E40D, K122E, D123S, A158S, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
SP28-350582 SP28-350582 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K49R, D123E, I135T, Q145C, K173T, P176K, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K281KR, E291D, V292I, I293V  
SP29-268003 SP29-268003 None None   V35I, S68G, R83K, I135T, E138A, D177E, G196E, T200I, R211G, V245M, A272P, K277R, P294S L282LFIV 
SP3-260414 SP3-260414 None None   K32KR, V35T, E36D, T39K, K43E, S68G, R83RK, V90I, S162A, K173T, Q174KR, D177E, T200A, Q207K, R211RKNS, V245Q, T286A, E291D, V292IT, I293V, P294A, E297K, E312D, S322T, I326V  
SP30-278365 SP30-278365 None None   K166KR, D177E, I178IM, G196E, T200AV, R211K, V245M, E248ED, D250E, K277R, Q278H, T286A, I293V, E297V, S322T  
SP31-307955 SP31-307955 None None M41L, D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q K103N, V108I, K238T T39TA, T69N, K102R, D123E, E169D, D177E, G196E, T200TA, E203ED, E204Q, Q207D, H208Y, R211K, V245Q Y56YC 
SP32-273798 SP32-273798 None None   V35I, S68G, T69K, V90VI, D121H, K122E, I135R, D177N, G196E, T200I, I293V, K311KR, I329V  
SP33-249326 SP33-249326 None None   I142IT, I178ILMV, G196GE, T200TI, R211RK, A272P, K277R, T286A, E291ED, V292VI, E297K, K311KR, G333E, Q334H K173K*EQ, I180IFLV 
SP33-299504 SP33-299504 None None  K103N I5V, E6D, E28K, K32E, V35T, T39K, V118I, K122V, I135S, S162H, T200E, I202V, R211K, F214L, V245Q  
SP34-300296 SP34-300296 None None   V60VI, K122E, I135V, S162A, I178IM  
SP35-227448 SP35-227448 None None   V8VI, I135T, T200TI, K281R, T286A, I293V, E297A  
SP36-225357 SP36-225357 None None   I50V, S162C, I178IM, Q207H, R211K, A272P, K277R, P294T, V317A  
SP37-276342 SP37-276342 None None   V60I, D121H, K122E, I135T, E169D, T200A I180IM 
SP37-369601 SP37-369601 None None   V35T, E36D, T39L, S68T, V90I, K122A, I135V, E138A, S162A, K173M, Q174EK, D177E, I178V, T200A, Q207D, R211RK, V245Q, V276I, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, L310I, S322A, I326V  
SP38-245364 SP38-245364 None None  K103KN K122E, I135T, S162X, T200TA, R211RK  
SP39-248661 SP39-248661 None None   V35T, V60I, D121Y, K122E, K173T, Q174K, D177E, T200A, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, I329V  
SP39-367857 SP39-367857 None None   V35T, E36D, V90I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, V276I, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322T  
SP40-276556 SP40-276556 None None M184MV K103KN T39TA, F87FL, I142V, S162C, E169D, G196E  
SP40-371782 SP40-371782 None None   I5V, E6D, V35IT, D123DGNS, I142V, D177E, I195L, T200E, I202V, Q207N, R211K, V245Q, E248D, D250E, S251C, A272P, K277KR, L283I, E291D, I293V, P294T, E297A, L325I, I326V, I329V K122LPQR 
SP41-347517 SP41-347517 None None   V35M, K49KR, I50IV, V60I, R83K, K122E, D123N, A272P, K277R, I293V K43K*EQ 
SP42-312587 SP42-312587 None None   V35T, V60I, K104KR, D121H, K122E, K173T, Q174R, D177E, I178M, T200A, I202V, Q207A, R211K, P243PS, V245Q, E248D, A272P, K277KR, K281KR, T286TA, E291D, V292I, I293V, I329IV P294PLQR 
SP42-378740 SP42-378740 None None   K11KE, V35T, K122KE, D123N, S162A, Q174N, D177E, G196R, T200A, Q207E, R211RK, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V, S322A, I326V  
SP43-258702 SP43-258702 None None   K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, I142V, S162Y, K173S, D177E, I178L, V179I, Q207A, V245Q, K281KR, T286A, E291D, V292I, I293V, P294PAST, S322T  
SP43-341239 SP43-341239 None None   K22R, K32R, V35T, E36D, S68G, D121H, K122E, D123E, I135V, S162A, E169A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, V245E, E248D, D250E, S251SN, Y271H, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, R307K, S322A  
SP43-364046 SP43-364046 None None   V90VI, K102Q, I135V, S162A, K173T, Q174KR, D177E, I178IM, T200A, Q207E, R211A, P243T, V245K  
SP44-222250 SP44-222250 None None   K11R, D123E, I142V, S162C, I178L, Q278H, T286A, A288S, E297A, Q334H D218DHNY 
SP44-315292 SP44-315292 None None   K49R, I50V, V60I, D121Y, K122E, I135M, S162C, K173T, Q174K, D177DE, I178L, I195L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
SP44-372125 SP44-372125 None None   T39L, V60I, I135V, S162A, F171Y, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
SP45-247257 SP45-247257 None None   V35IM, R83RK, K166KR, T200TI, R211K, K277R, E291D, I293V, E297K, I329L  
SP45-371139 SP45-371139 None None L74LIV, M184V K101E, Y181YC, G190S T39A, E40D, V106I, S162A, K173T, Q174R, G196E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
SP46-221728 SP46-221728 None None   I5V, E6D, E28K, K32E, V35T, E36EAGV, T39X, V118I, K122V, I135S, S162HY, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L, V245Q, E248D, D250E, A272P, K275KR, K281R, E291D, V292I, I293V, P294T, E297A, D324DE, I329V  
SP46-350907 SP46-350907 None None   I5V, V35T, K43Q, K49R, K122KE, D123N, I135T, T165I, K173T, D177E, T200E, I202V, Q207K, F214L, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, L283I, E291D, V292I, I293V, I329V  
SP47-227431 SP47-227431 None None   D123E, I142V, S162A, I178L, Q207E  
SP48-276330 SP48-276330 None None M184V  A98S, D123E, I142V, A158S, I202IM, R211K  
SP49-258702 SP49-258702 None None   K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, D121H, K122E, D123S, I142V, S162Y, K173S, D177E, I178L, V179I, Q207A, V245Q, K281KR, T286A, E291D, V292I, I293V, P294PT, S322T  
SP49-345013 SP49-345013 None None  Y181C V35T, E36ED, E40ED, D123E, I135R, T165I, D177E, I178V, G196E, R211K, H221Y, I293V, E297Q, V317A, S322T  
SP5-283421 SP5-283421 None None   T39L, K122KE, I135T, S162A, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200AEGV, Q207G, R211K, F214L, V245Q K49~, N175NDHY 
SP50-298905 SP50-298905 None None   K101R, K166R, I178L, I202V, R211RK, F214L, V245M, A272P, T286A, E297R, Q334X  
SP51-238269 SP51-238269 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, E36D, K64R, K122P, D123N, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243H, V245E, T286A, E291D, V292I, I293V, S322T  
SP52-240679 SP52-240679 None None M184V  V35R, E36D, V60I, S68G, K102KR, I135IV, E138D, Q145IM, S162A, K173T, D177E, I178M, I195IM, T200A, Q207G, V245Q, D250E, A272P, T286A, A288G, E291D, V292I, I293V, P294T, L295M, E297K, E298ED, K311R, S322T Q174Q*EK 
SP52-367860 SP52-367860 None None   V35T, E36D, V90I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
SP53-290843 SP53-290843 None None M184V V106A, V179E, F227L V35I, R83K, K102R, I135T, G196E, T200I, Q207E, T286A, I293V, E297K, P313A, V317A  
SP54-243416 SP54-243416 None None   K49R, I135T, T165I, E169D, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245M, A272P, K277R, T286A, I329L  
SP55-329660 SP55-329660 None None   K20R, V35T, T39K, E40D, V60I, D121H, K122E, D123S, S162Y, K173S, Q174E, D177E, V179I, Q207A, F214FL, V245Q, E248N, D250E, A272P, K281R, T286V, E291D, I293V, P294T, E312D, I326V  
SP56-263135 SP56-263135 None None   V35M, T39A, R83K, I135R, S162W, I195L, R211K, T286P, I293V, Q334E  
SP57-270305 SP57-270305 None None   K64R, K122P, D123N, Q145C, S162A, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E  
SP58-275600 SP58-275600 None None  Y181YC, G190S K20R, V35I, V60I, K122KE, E248N, D250E, A272P, A288S, P294T, G333D  
SP59-282968 SP59-282968 None None  K103KN S48SAPT, K49KR, S68G, T69N, K102Q, K122E, I135T, S162C, E169D, K277R, A288APST, I293V, E297A, V317A K43K*EQ 
SP6-267096 SP6-267096 None None   K20R, V35T, T39N, E40D, V60I, I135V, T139TA, S162A, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207G, R211E, D250DE, A272G, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322T, I326V V245*EKQ 
SP6-310227 SP6-310227 None None   E36X, I37X, C38X, T39X, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207G, V245K K49X_XXXXXXXXXX 
SP60-260758 SP60-260758 None None   T39K, E40D, V60I, K173IT, Q174K, D177DE, V189I, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
SP61-363488 SP61-363488 None None M41L, M184V, T215Y K103S T39A, K43N, T200A, E203D, R211K  
SP62-237401 SP62-237401 None None   D121DHNY, K122KE, I135T, S162SCGR, D177E, Q207E, R211K, K277R  
SP63-224156 SP63-224156 None None   V35I, T39S, K103R, K122E, D123N, I135T, S163SG, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245T, A272P, K277R, A288S, P294S, E297K, S322SL, I329V, Q334D  
SP63-378672 SP63-378672 None None   K20R, E28D, V35T, T39E, V60I, D121H, K122E, I135T, S162H, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245Q, E248D, D250E, A272P, T286A, I293V, P294T, E297K, E312D, D324E  
SP68-384383 SP68-384383 None None   V35T, K43Q, I135V, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P321S, S322T, I326V  
SP69-267096 SP69-267096 None None   K20R, V35T, T39N, E40D, V60I, I135V, T139TA, S162A, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207G, R211E, V245KQ, D250DE, A272G, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322T, I326V  
SP7-311317 SP7-311317 None None   V35T, K64R, V106VI, D123E, I142IV, K166R, K173A, D177E, I178L, Q207APST, R211K, P243T, V245Q, E248ED, A272P, K275R, K277R, Q278H, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, V314I  
SP7-326485 SP7-326485 None None   K20KR, K122E, I178IM, T200A, R211K, K277R, T286P, E297K, S322A, D324DE A98APST 
SP71-372939 SP71-372939 None None   V60I, K122P, I142V, K173S, D177E, V189I, T200A, Q207E, R211K, P243S, V245H  
SP72-400288 SP72-400288 None None   S3R, V35T, T39L, V90I, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245T, D250E, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, K311R, S322A  
SP75-392005 SP75-392005 None None   E40D, K49R, V60I, V118I, K122E, T165I, I178L, V179I, T200A, E204K, Q207E, F214L  
SP78-400723 SP78-400723 None None   V21I, V35T, E40D, V60I, K122P, I135V, S162A, K173E, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, A288T, E291D, I293V, P294L, E297A, A327T  
SP8-240090 SP8-240090 None None   V35M, T39A, R83K, G196E, I202V, E204ED, Q207X, R211K, A272P, V276VI, V292VI, I293V, E297R, K311R, S322SL, G333E T296TAPS 
SP8-315669 SP8-315669 None None   K122E, D123S, S162C, K173A, T200E, I202V, Q207EK, R211K, V245Q  
SP9-231895 SP9-231895 None None   V35I, R83K, V90VI, K122E, D123N, K166KR, I195ILV, R211K, A272S, K277R, A288APST, I293IV, E297K, D324E  
SP9-329233 SP9-329233 None None   V35T, K104R, K122E, D123GS, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, Q197P, T200A, Q207E, R211K, V245Q, L283I, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, S322A, I326V  

Database

Resources

Team