<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Yerly (2004)
Title HIV-1 co/super-infection in intravenous drug users
Citation AIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 57
NumPts 53
Subtype B, K, J, CRF02_AG, G


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
152 GE99_152 None None   V35I, K49R, R83K, D123E, I135T, E169D, D177E E29K, Q91QP, G93GR 
161 GE02_161 None None  K103N R83K, D123E, R172K, D177G, I202V, L210F, R211Q  
162 GE98_162 None None   V35I, R83K, K103R, D110X, I135T, Q207A G93R, N137NS 
163 LS01_163 None None   V35I, V60I, D123N, I135T, E194K, R211K D186N 
  LS02_163 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, I135T, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
164 GE01_164 None None   V35T, T39K, K49R, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
166 GE98_166 None None   V60I, I135T  
167 GE98_167 None None M184V K101E, G190A K49R, E53D, K122E, I135T, E169D, T200A L168LPS 
169 GE02_169 None None   V35T, E36K, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
170 GE02_170 None None   K49R, E53D, T200A, R211T, F214L  
172 LS96_172 None None   E53ED, R83K, A158P, T165P, R211RG K49RS, F61FS, I63IM, Q85QH, Q91H, R172RM, W212W* 
  GE98_172 None None M41L, T215Y  D123E, Q207E  
  LS02_172 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, I135T, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
173 GE00_173 None None   V35I, K49R, R83K, D123E, I135T, E169D, D177E  
  LS01_173 None None   V35T, T39M, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L K49RS 
175 GE99_175 None None   K32R, V35T, V60I, K122E, I142V, Q174K, N175V, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, R211K  
176 LS02_176 None None   V35T, T39A, E40D, K49KR, I135T, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
177 LS99_177 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, I135T, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
183 GE01_183 None None   V118I, K122P, E169D, D177E, T200A, F214L  
205 LS00_205 None None   V35T, T39M, K122E, D123N, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
221 LS00_221 None None   V35T, T39M, K49R, V118VI, K122E, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
224 LS00_224 None None   V35T, T39M, K49R, K122E, D123N, I135R, T165P, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L D185DN, L187LW 
237 LS01_237 None None   K49R, I135T, R211K  
265 LS02_265 None None   V35T, T39M, K49R, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
296 LS99_296 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, I135T, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, R211K, F214L N57Y 
600 LS01_600 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, K122KE, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, R211K, F214L  
650 LS01_650 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, R211K, F214L  
668 LS99_668 None None   V35T, T39M, K49R, K122E, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L L120LI 
673 LS99_673 None None   V35T, T39M, K49R, K122E, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
677 LS99_677 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, I135T, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
691 LS00_691 None None M41L, T215D K101KHNQ V60I, K102KR, V106I, I135T Y127YH 
705 LS00_705 None None   V35T, T39M, K49R, K122E, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L L193LS 
753 LS00_753 None None   V35T, T39M, K49R, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
758 LS00_758 None None   V35T, T39M, K49R, K122E, D123N, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
759 LS01_759 None None M41L, T215D  V60I, V106I, I135T  
760 LS00_760 None None   V35T, T39M, K49R, S68G, K122E, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
770 GE01_770 None None M41ML, L210W, T215CNSY  V35I, R83K, D123E, G196E, Q207E, R211K  
772 LS01_772 None None   K49KR, E53D, I178M, T200A, E204D, R211K  
773 LS01_773 None None   K49R, V106I, D123E, I135T, T165I, E169D, K173E, I178L, Q207E, F214L  
782 LS01_782 None None M41L, T215D  V60I, V106I, I135T  
784 LS01_784 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, I135R, M164L, E169D, K173T, D177E, I178IM, Q197K, T200E, I202V, R211K, F214L  
788 LS01_788 None None   V35T, T39L, I135V, I142V, S162A, T165I, K173T, Q174K, D177E, Q197E, T200A, Q207E  
789 LS00_789 None None   V35T, T39AS, E40ED, K49R, I135RT, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, R211K, F214L  
790 LS00_790 None None   V35T, T39AS, E40ED, K49R, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200EQ, I202V, R211K, F214L W153WL, G155GR, F160FL, S191SF 
793 LS01_793 None None   V35T, T39M, K49KR, D121DH, K122KE, I135RT, A158AS, E169ED, K173ST, D177E, Q197QK, T200AE, I202V, Q207DEKN, R211K, F214FL  
799 LS01_799 None None   V35T, T39M, K49R, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
800 LS01_800 None None M41L  R83K, D123E, E203G  
801 LS01_801 None None   V60I, K66KR, S162A, T165TA, Q207E, R211K R143RK 
803 LS01_803 None None   V35T, T39M, K49R, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
804 LS01_804 None None   K49R, E53D, T58TN, I178M, T200A, Q207E, R211K N57NK 
810 LS01_810 None None   K49R, K122E, I142T, A158S, E169D, D177E  
811 LS01_811 None None L210W, T215CY  R83K, D123E, G196E, Q207E, R211K  
813 LS01_813 None None   K49R, R83K, I135T, E194EK  
838 LS02_838 None None   V35T, T39M, K49R, K122E, D123N, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
858 LS02_858 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, I135T, E169D, K173T, D177E, E194K, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
859 LS02_859 None None   V35T, T39M, K49R, I135R, E169D, K173T, D177E, Q197K, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214L  
929 LS99_929 None None   V90I, G196E, T200A, R211K