<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Santos (2011)
Title Primary HIV-1 drug resistance in the C-terminal domains of viral reverse transcriptase among drug-naive patients from southern Brazil
Citation J Clin Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 88
NumPts 88
Subtype B, C, F


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
J114 J114_CN None None   A272P, E291D, V292I, I293V, V317A, I326V, G359T, K366R, T377L, V381I, K390R  
J115 J115_PR_RT None None   V35T, K49R, D123E, S134R, I135V, S162C, E169ED, K173T, Q174K, D177E, Q207E, R211K  
J125 J125_RT None None   R83K, D123E, I178L, T200R, R211RK, A272P, K281R, T286A, P294T, E297K  
J135 J135_PR_RT_CN_RH None None   V35T, T39D, S48T, K49R, V60I, K102R, K122E, D123G, A158S, K173A, D177E, T200A, E204D, Q207E, V245L, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V, G335D, R356K, G359T, K366R, T377Q, K390R, E404D, V435A, E449D, L452Q, R461K, V466VI, D471E, H483Q, L491PS, S519N, K530R, A534S, A554N, K558R G141R 
J136 J136_RT None None  V179VD K122KE, T165TI, T200A, I202V, E204D, Q207K, R211K  
J145 J145_PR_RT_CN_RH None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123N, I142V, K173A, D177E, T200D, Q207E, R211K, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, V317A, G335D, R356K, G359T, K366R, T377L, K390R, E399D, E404D, K424S, L425V, V435A, L452M, D460N, V466I, D471E, T477A, H483Q, L491P, I495V, L517AV, S519N, E529D, K530R, A534S, A554N, K558R  
J146 J146_RT None None   V35A, E36A, T39D, K122E, D123N, I135T, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
J148 J148_RT None None   V35M, R83K, K122E, T165TI, E169D, Q174N, T200TI, I202V  
J150 J150_RT None None D67N, T215V, K219Q  K104N, V118I, K122P, I135T, D177E, G196R, I202V, F214L, T286A, I293V, E297R, L301I  
J151 J151_PR_RT None None   I50V, V60I, R83K, K104R, I135T, D177DG, R211K S105L 
J155 J155_PR_RT None None   V35A, T39D, V60I, K122E, D123N, I142V, K173A, Q174K, Q197QK, T200A, Q207E, R211K  
J159 J159_PR_RT None None   K102Q, K104R, T107S, R211K  
J161 J161_PR_RT_CN_RH None None   V35T, T39L, D123N, I135V, K166R, D177E, F214L, A272S, E297K, I329L, T338S, R356RK, G359S, K366R, T369V, A376T, K385KR, E399D, A400T, V435A, E449D, L452M, V466S, T470N, D471E, Q480H, I482V, H483L, D488E, L491S, A502V, S519N, A534S, A554K K220Q 
J162 J162_PR_RT None None K219KN  V35T, T39D, K122E, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
J163 J163_CN_RH None None   E6EK, V35T, E36A, T39E, K43R, S48T, K122E, A158S, K173A, D177G, T200A, R211K, V245L, N255K, A272P, E291D, V292I, I293V, I329L, Q334QH, G335D, R356K, M357K, G359T, K366R, T377Q, K390R, E404D, V435A, L452K, V466I, D471E, K476Q, H483Q, L491S, S519N, K530KR, A534S, A554N  
J165 J165_PR_RT None None   V60I, K122E, D123N, I135T, K173A, D177G, T200A, Q207E, V245LQ, N255NK, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A  
J176 J176_PR_RT_CN_RH None None   I50V, V60I, K104R, I135T, D177G, R211K, N255K, L264I, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, Q334H, G335D, R356K, M357T, G359T, K366R, T377M, K390R, E404D, V435A, L452M, D460N, V466I, D471E, T477S, H483Q, L491S, Q509T, S519N, K530R, A534S, A554N  
J177 J177_CN_RH None None   K32R, V118I, D123E, I135T, T165I, D177E, I178L, I195L, G196E, T200I, I202V, E204EK, R211K, F214L, V245Q, N255K, A272P, I293V, E297Q, M357V, S379G, T386I, K388R, A400T, E413D, S468P, L469I, L491S, A554S  
J178 J178_PR_RT None None   K49R, I50V, V60I, K104R, I135T, D177G, R211K, N255K H221R 
J181 J181_PR_RT_CN_RH None None   V35T, T39D, K43R, S48T, V60I, K64R, A98S, D123E, I135R, D177E, Q197K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, N255K, A272P, K277R, E291D, I293V, G335D, R356K, G359T, K366R, T377Q, K390R, T403A, E404D, K424S, L425V, W426R, V435I, L452M, V466I, S468P, D471E, H483Q, S519N, K527Q, K530R, A534S, A554S  
J182 J182_PR_RT_CN_RH None None   K32KN, I135RT, S162C, T200TA, N255K, A272P, K277R, T286A, E297K, V317A, S322T, M357I, A376S, T377S, K390R, V435A, D460N, H483Y, A554ST, K558R  
J183 J183_PR_RT_CN_RH None None A62AV  V35T, E36A, T39E, K43R, S48T, K122E, A158S, K173A, D177EG, V189VA, T200A, R211K, V245Q, N255K, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, I329L, R356K, G359T, K366R, T377L, K390R, K395R, T403I, E404D, K424S, L425V, V435A, L452M, V466I, S468Q, D471E, H483Q, L491S, S519N, K530R, A534S, A554K, K558R  
J184 J184_PR_RT_CN_RH None None   V35M, R83K, D123E, K166R, D177E, I178V, T200I, N255K, A272P, K281R, E297K, G333E, G335S, R356K, K366R, T369A, A371V, I375V, A376T, T386I, A400T, V435I, L452M, R461K, V466I, A554T  
J185 J185_RT None None   V35I, W88R, I135T, D177G, G196E, R211Q, F214L  
J186 J186_PR_RT None None   E36EA, T39A, K49R, I50V, V60I, K104R, I135T, D177G, R211K, N255K  
J197 J197_PR_RT None None   V35T, E40D, K49R, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207A, R211K  
J198 J198_PR_RT None None   T39D, S48T, V60I, K122E, D123N, I135T, K173A, D177G, V179I, T200A, Q207E, V245Q  
J202 J202_PR_RT_CN_RH None None   V35VA, T39A, K49R, V60I, S68G, K104KR, D123E, I135T, K173KT, Q174QK, T200A, Q207R, R211K, V245Q, L246V, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, I329V, K374T, T377R, K390R, E399D, A400T, K431T, V435A, A446S, L452K, R461K, V466A, D471E, T477A, Q480Y, L491S, E492K, S519N, K527N, L533M, A534S, V559I  
J203 J203_PR_RT_CN None None   V35M, R83K, K122E, D123E, T165I, E169D, Q174K, G196E, T200I, I202V, A272P, K277R, A288S, I293V, Q334H, K390R, T403I  
J205 J205_RT_CN None None   K49R, I50V, V60I, S68G, K104R, I135T, D177G, T200A, R211K, N255K, L283I, I293V, Q334L, T338S, T386I, K390R, T403V N54D 
J206 J206_RT_CN None None   K49R, I50V, V60I, S68G, K104R, I135T, D177G, T200A, R211K, N255K, A272P, E297K, V317A, I326V, I329V, Q334E, G359S, T369A, A376T, A400T, Y405H, V435I  
J231 J231_RT None None   K101R, D123E, I135T, K166R, E169D, G196E, I202V, Q207K, F214L  
J240 J240_RT_CN_RH None None   K11R, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, G335D, R356K, M357K, G359T, K366R, T377M, T386I, K390R, E404D, L452M, D460N, V466I, D471E, H483Q, L491P, E514D, L517I, S519N, K530R, A534S, V548I, A554N  
J241 J241_RT None None   K49R, I50V, V60I, K104R, I135T, K173A, D177G, T200A, E203G, R211K  
J242 J242_RT None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, I142T, A158S, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
J248 J248_RT_CN_RH None None   K11R, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207K, R211Q, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, I329L, G335D, R356K, G359T, K366R, A376S, T377M, K390R, E404D, V435A, E449D, L452M, V466I, T470P, D471E, H483Q, L491P, S519N, K530R, A534S, A554Q  
J253 J253_RT None None   T39A, V118I, K122E, I135T, K173E, Q174N, Q197K, T200E, R211E, F214L R172~, N175D 
J257 J257_RT_CN_RH None None   K32KR, D123E, A158S, D177E, T200R, Q207E, R211K, F214L, V245M, A272P, R284K, A288S, I293V, E297K, Q334L, M357T, A360AT, A376T, T386I, A400T, T403V, S468P, K530R, A554T  
J258 J258_RT_CN_RH None None   V35I, K122E, I135T, I202V, E204EA, R211K, F214L, A272P, E297K, V317A, I326V, I329V, Q334E, G359S, T369A, A376T, A400T, Y405H, V435I, L452M, R461K, V466I, V467I, S468T, T470A, A554S  
J259 J259_RT_CN_RH None None   V60I, R83K, K104R, D123E, I178L, T200I, I244V, A272P, K277R, I293V, E297K, G333E, Q334H, T386I, K390R, E399D, A400T, K431T, V435A, L452M, V466I, T470N, D471E, T477A, H483Q, V493A, S519T, K530R, A534S, V548I, A554S  
J262 J262_CN_RH None None   E6D, V35M, E53D, R83K, D123E, T200I, R211K, L260LV, A272P, K277R, V292I, E297R, L301M, A304E, D324E, A376T, K390R, Q394L, A400I, K431T, V435A, L452IM, V466I, D471E, H483Q, L491S, S519T, A534S, V548I, A554S G93GR 
J263 J263_RT_CN_RH None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, G335D, R356K, G359T, K366R, T377Q, K390R, E404D, V435A, T450S, L452M, V466I, D471E, H483Q, L491S, S519N, K527N, K530R, A534S, A554S  
J264 J264_PR_RT None None   E6K, K20R, V35VI, K64R, K122E, T139I, N175H, Q197K, T200A, Q207H, R211Q  
J265 J265_PR_RT_CN_RH None None  K103N V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, D123N, I135T, E138G, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, A272P, K281R, P294S, G359S, A371V, A376S, T377V, K390R, E404D, V435A, A437V, L452M, V466I, S468P, D471E, H483Q, L491LASV, L517I, S519N, K527KN, K530R, A534S, A554NS  
J268 J268_PR_RT None None   V35I, I50V, R83K, D123E, I135L, K166R, D177E  
J274 J274_RT None None   V35I, I135T, V179I, I202V, R211K, F214L, A272P, K277R  
J275 J275_PR_RT None None   R83K, K122E, D123E, G196GE, A272P, L283I, I293V  
J318 J318_RT_CN_RH None None   D123E, I135T, D177E, G196E, R211S, V245M, I293V, I329V, Q334E, M357N, K366R, T386I, K390R, K395R, T403M, K431X, L452S, G453X, V458X, S468P, L491LS, Q524QE  
J320 J320_RT_CN_RH None None  Y181C E169D, I195R, R199G, T200I, I202V, E203K, E204Q, Q207K, F214L, A272P, E291D, I293V, P294Q, V317A, G335D, R356K, M357T, G359T, K366R, T377M, K390R, E404D, V435A, L452I, D460N, V466I, V467I, D471E, H483Q, L491S, S519N, K530R, A534S, A554S, K558R E194V, H198P, R206C 
J326 J326_PR_RT None None   V35T, E36A, T39D, S48T, T69A, V118I, K122E, D123N, I135T, T165I, K173A, Q197L, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, P294T  
J327 J327_CN_RH None None   T200I, I202V, R211K, V245Q, A272P, K275R, T286TA, V292I, V314I, H315F, D324E, I326V, Q334Y, M357V, T377V, T403M, V435A, K451R, L452E, S468P, Q520K, K527S, Q547K  
J330 J330_PR_RT_CN_RH None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D123E, K166R, E169K, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, P243Q, V245Q, N255K, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, L310I, I329IL, G335D, R356K, G359T, K366R, T377Q, V381I, K395R, A400T, E404D, V435I, L452M, V466I, V467I, S468P, D471E R125S 
J332 J332_PR_RT None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123N, K173T, D177G, T200A, Q207G, R211K, V245Q, N255K  
J335 J335_PR_RT_CN None None   V35T, T39N, K43R, S48T, V60I, K82R, K122E, I135T, S162C, T200A, Q207N, R211K, F214L, V245Q, D250E, N255K, A272P, E291D, V292I, I293V, P294T, S322T, D324DE, R356K, G359T, K366R, T377L, K390R, E399D, E404D, V435A, V466I, D471E  
J340 J340_PR_RT_CN_RH None None   V35T, T39D, S48T, D123E, K173T, D177E, T200A, Q207EG, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, G335D, P345Q, R356K, G359T, K366R, T377Q, K390R, E404D, L452M, V466I, S468P, D471E, H483Y, L491S, S519N, K530R, A534S, A554S  
J341 J341_PR_RT_CN None None   V35T, E40D, K49R, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, I178L, Q207E, R211K, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, P321Q, I329V, Q334N, K390R, E399D, A400T, K431T, V435A, L452Q, V466A, D471E, T477A, Q480E  
J342 J342_PR_RT_CN_RH None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, A158S, T165I, E169ED, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245M, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, G335D, R356K, G359T, K366R, T377Q, S379C, K390R, A400T, E404D, V435A, F440Y, L452K, S468T, D471E, H483Q, L491S, S519N, K527S, K530R, A554N  
J344 J344_PR_RT_CN None None   V35I, I135T, I202V, Q207E, R211K, F214L, A272P, K281R, E297K, V317A, I329V, Q334E, G359S, T369A, A376T, T377A, A400T, Y405H, V435I, L452M, R461K, V466I, V467I, S468T, T470D V189C 
J348 J348_PR_RT None None   V35T, I50V, A98S, K104KR, K122E, D123E, I135V, I142V, T200A, F214L, A272P, K281R, E297K G285GE 
J349 J349_PR_RT None None   K20R, V21I, V35T, T39M, S68G, D123E, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200I, Q207A, R211K, V245Q, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T  
J350 J350_PR_RT_CN None None   S134C, D177E, T200A, Q207N, R211K, A272P, A288S, E297K, E300D, G333D, V365I, A376T, T386L, K390R, E399D, L452A I135P 
J352 J352_PR_RT None None   V35A, T39A, K49R, D123E, S162C, K173V, Q174K, T200A, Q207K, R211Q, V245Q, E248D, A272P, K275Q, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
J368 J368_PR_RT None None   V35I, R83K, A98S, D123E, I135T, K166R, D177E, I202V, A272P, K281R, T286A, P294S, E297R R72RK, R78RK 
J369 J369_PR_RT_CN_RH None None   V35M, E53D, K104Q, K122E, R211K, H221L, V245E, A288S, I293V, D324DE, R356K, D364E, A376V, T386M, K390R, A400T, T403V, T409N, W410C, R461K, L469I, H483Y, K512R, A554N K220Q 
J374 J374_RT_CN None None   K20R, V35T, V60I, K122E, D123E, I135L, S163C, Q174R, G196E, R211K, V245K, A272P, K277R, L283I, T286A, I293V, E297KR, I341F, A371V, I375M, T386I, K390R, Q394L, E399D, A400T, K431T, V435A, G436E  
J390 J390_PR_RT_CN_RH None None   K122E, F214L, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297G, K311R, G335D, R356K, R358K, G359A, K366R, T377M, K390R, E404D, V435A, A446S, L452M, S468P, D471E, T477A, H483Q, L484I, L491S, S519N, K530R, A534S, A554S, I556V  
J391 J391_RT_CN_RH None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D121H, K122E, I135T, I142T, K173A, I178L, T200A, Q207G, R211K, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, G335D, R356K, R358K, G359N, V365I, K366R, T377L, V381I, K390R, A400T, E404D, V435A, E449D, L452M, V466S, S468P, D471E, H483L, D488E, L491T, S515V, L517I, S519N, K530R, A534S, A554K  
J48 J48_PR_RT None None   Q197K, R211K  
J51 J51_PR_RT None None   V35M, S48A, R83K, K104R, K122E, D123N, I135T, D177N, V179I, I202V, F214L F61L 
J52 J52_PR_RT None None K65R  V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, K122E, D123N, I135T, K173A, D177E, T200A, E204K, Q207E, R211K  
J53 J53_PR_RT None None   V35T, T39A, K49R, D123E, D177E, I178M, T200A, Q207K, R211Q  
J54 J54_PR_RT None None   V35T, K49R, K103R, K122E, T139Q, I142V, K173T, Q174K, F214L  
J57 J57_PR_RT None None   K20R, V35I, S48T, K122E, E169D, T200A, Q207E, F214L  
J59 J59_PR_RT None None   K20R, V35T, E36D, T39D, E40Q, S48T, K122E, D123N, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272R, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
J60 J60_PR_RT None None   V35T, E36A, T39E, K43R, V60I, T107S, K122E, D123S, I135T, I142V, K173A, D177G, T200A, Q207E, R211K  
J62 J62_PR_RT None None   V35T, E36L, T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, K173A, Q197P, T200K, I202V, Q207E  
J63 J63_PR_RT None None M184V K103N V35I, I142V, E169D, G196V, T200K, Q207E, R211K  
J76 J76_PR_RT None None   R83K, K104R, D123E, K166R, T200I  
J79 J79_RT None None   V35T, T39M, K122E, I135T, S162C, I202V, V245VI, A272P, K277R, T286A  
J81 J81_PR_RT None None   V21I, V118I, I135T, I142T, T200A, E204D, R211K, F214L G15W, M16K, P19S 
J83 J83_PR_RT None None   S48T, V118I, K122E, T139K, T165I  
J86 J86_PR_RT None None   V35T, T39D, K43R, S48T, E53D, K122E, D123S, E138A, I142V, A158S, K173A, T200A, Q207D, R211K  
J90 J90_PR_RT None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D123E, T139A, D177E, V179A, T200A, Q207E, R211K  
J91 J91_PR_RT None None   E28G, V35M, R83K, K104R, K122E, D123N, I135T, D177N, V179I, I202V, F214L  
J94 J94_PR_RT None None   V35T, T39D, S48T, V60I, K101R, D123E, I135R, K166R, D177E, T200A, Q207G, R211K  
J95 J95_PR_RT None None   V35T, E36A, T39E, E40D, K43R, S48T, K122E, D123N, S162C, K173A, Q174K, T200A, Q207E  
J96 J96_PR_RT None None   K20R, V35T, E36A, T39D, I142V, A158S, T165I, K173A, D177G, T200A, R211K  
J99 J99_PR_RT None None  K103N V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, I135T, T139A, I202V, R211K, F214L H96Q