<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Nadai (2009)
Title HIV-1 epidemic in the Caribbean is dominated by subtype B.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 67
NumPts 67
Subtype B

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
107732 107732 None None   I50V, V60I, I142V, S162A, T200A, Q207E, R211K  
109795 109795 None None   P4S, D123E, I135T, D177E, Q207E  
129336 129336 None None   K32R, V35T, V60I, D123E, Q174R, D177E, Q207D, R211K  
129389 129389 None None   A98AS, K173KE, T200TA, Q207E, V245VM, E248N, D250DE, A272S, I293V, Q334H, I341V, S379G, T386I, K390R, E399D, A400I, S519N, Q524E, V531I, S553N, A554T, K558R  
129402 129402 None None   T200A, E204D, Q207G  
129412 129412 None None   V106I, K122E, Q207E, E224D  
129431 129431 None None   V60I, I178M, T200A  
129473 129473 None None  V108VI V60I, K122P, D123E, K166R, Q174E, D177E, Q207R, V245T, A272P, K277R, E291ED, I293V, E297A, I329V, Q334N, M357I, K388R, E396D, T403M, K431T, N447S, V467I, H483Y, L503I, K527N, A554T  
129517 129517 None None   K122E, K173KE, Q207EG, F214FL, V245VEKM, S251SN, I293V, K311R, M357T, K366R, A376T, A400T, V435A, N447S, S468P, A554N  
129546 129546 None None   V118I, D123E, F214L  
129559 129559 None None   V35R, T39TA, K122KE, I142IT, G196E, F214FL  
129589 129589 None None   I135V, S162C, Q207A, R211K  
129696 129696 None None   V35T, V60I, K122P, S134SN, I135V, I142V, D177E, T200A, Q207E, L210LF, R211K, E248KQ, D250DE, I293V, I375V, T377L, S379G, T403M, V435I, R448K, S468P, L469F, H483Y, L491S, V548I  
129732 129732 None None   K122E, D177E, T200A, Q207E  
129741 129741 None None  V179D K122P  
129805 129805 None None   V35T, K49R, V60I, E138A, T165I, I178IM, V179I, G196E, T200A, Q207D, L283I, V292I, I293V, Q334N, I341F, R356K, K366R, A371V, I375V, K390R, T397A, V435M, T470P, H483Y, Q524E, V559I  
147691 147691 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53ED, K122E, S162H, D177E, Q207E, V245K, D250E, S251ST, A272P, L283I, P294T, E297D, Q334N, G335D, R356K, R358K, G359S, A371V, I375V, V381I, K390R, E413D, K431T, K454KR, R461K, S468T, L503I, Q509K, Q524E, E529D, L533M  
160884 160884 None None   K49KR, T69TN, A98AS, E169D, Q207E, V245Q, D250E, K277R, L283I, I293V, P294T, G335D, G359S, E404D, V435I, G436E, H483Y, Q509K  
162387 162387 None None   S48T, V60I, K64R, D121C, K122E, S162C, Q174QH, I178L, G196E, T200A, Q207E, V245T, D250E, A272S, K277R, T286A, I293V, G333E, Q334L, A360T, T369A, T377R, S379C, K390R, T403M, E404D, E432D, K512Q, L517I, S519N, A554T, K558R  
163007 163007 None None   K64KR, Q207E, R211K, P243S, V245K, A272G, K281R, I293V, E297A, V317A, R358K, V365I, T377Q, K390R, A400T, K431T, V435A, A437V, T470A, H483Y, I506L, Q520L, K527N, A554N  
18920 18920 None None D67G  K122E, I135T, S162A, F214L S191A 
22731 22731 None None   R83K, I142V, G196E H96R 
CRC08656 CRC08656 None None   V35I, A98S, D123E, I142T, D177E, T200E, Q207N, F214L  
CRC08683 CRC08683 None None   V35I, K122E, I135T, I178IM, T200A, Q207E  
CRC08693 CRC08693 None None   K20R, V35I, V60I, Y144F, D177E, G196E, T200A, Q207E  
CRC08695 CRC08695 None None   K122E, Q174H, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211K E42K, A158V 
CRC08704 CRC08704 None None   K122E, Q174H, D177E, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
CRC08718 CRC08718 None None   A98S, D123G, I135V, D177E, T200A, Q207V, R211K  
CRC08746 CRC08746 None None   V35I, A98S, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
CRC08749 CRC08749 None None   D123E, I180V, R211RK  
CRC08767 CRC08767 None None   V35I, K122Q, K173Q, D177E, T200A, Q207E, V245LM, E248Q, A272P, K277R, T286A, A288S, Q334L, M357T, A376T, A400T, N447S, E449D, H483Y, L491S, K512R, S519N, K527N, V531I, A554S Y56YC 
CRC08794 CRC08794 None None   V35I, E40D, K122Q, S162C, E169D, K173Q, Q174K, D177E, T200A, E204D, Q207A, R211RK  
CRC50014 CRC50014 None None   A98S, D123E, I135R, D177E, G196E, T200A, E204K, Q207E, F214L  
CRC50018 CRC50018 None None   E6EK, G18GD, K64R, K122KE, D123E, I135T, S162C, D177E, T200A, Q207E, K277R, A288S, M357T, A400T, T403A, V435A, F440Y, K465R, V467I, H483Q, L491S, S519N, Q524E, A554S  
CRC50022 CRC50022 None None   A98S, I142IT, D177G, I195L, Q207K  
CRC50026 CRC50026 None None   A98S, D123E, I135R, D177E, G196E, T200A, E204K, Q207E, F214L  
CRC50042 CRC50042 None None   A98S, D177G, Q207E H235HR 
CRC50060 CRC50060 None None   K11T, A98S, I142T, D177G, I195IL, Q207EK, V245I, E297K, R356K, G359S, A376T, A400T, N447H, R461K, V467I, L491S, K512Q, S519N, I526V  
CRC50064 CRC50064 None None   A98S, D123E, I135R, D177E, G196E, T200A, E204K, Q207E, F214L  
CRC50069 CRC50069 None None   D123E, I135T, I180V, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245E, K277R, I293V, E297R, L301I, T338S, M357S, K366R, T377G, T386I, A400T, E404D, V435I, R461K, L517I, Q547K, A554S, K558R, V559I Y354YC 
CRC50073 CRC50073 None None   K64R, K122E, D123E, I135T, S162C, D177E, T200A, Q207E  
CRC50077 CRC50077 None None T69TADN  K11KR, A98S, I142IT, D177G, Q207EK, V245I, E297K, R356K, G359S, A376T, A400T, N447H, R461K, R463G, V467I, L491S, K512Q, S519N, I526V, K527Q  
DR140746 DR140746 None None   K104N, K122E, D123N, I142V, R211K  
DR147545 DR147545 None None   S68G, V90I, Q207N, R211RK  
DR147551 DR147551 None None   K49R, K101R, I135M, T165I, K166R, G196E, T200A, Q207E  
DR147662 DR147662 None None   K49R, D123E, I135T, D177G, T200K, Q207E, R211K, F214L  
DR147663 DR147663 None None   K32KN, V35VI, S48T, K122P, Q145E, D177E, T200M, Q207E, R211K  
DR147801 DR147801 None None   V35I, K49R, I50V, V60I, I142V, Q207E, R211K  
DR147896 DR147896 None None   V35L, K43R, G196E, T200I, Q207E, F214L  
DR148422 DR148422 None None  V179D V35T, V60I, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
DR148445 DR148445 None None   V35I, E40D, K103R, K122E, D123DE, T200V, Q207E, R211K, F214L  
DR148582 DR148582 None None   K49R, D123E, S162C, G196E, T200V, Q207A  
DR151077 DR151077 None None   E6G, V35T, T39A, E40D, K49R, K122E, D123N, I135T, S162C, D177E, Q207E  
DR153516 DR153516 None None  K103N D123E, S162C, G196E, Q207G, R211K  
DR155326 DR155326 None None   V35I, A98S, I142V, T200A, Q207G, R211K  
DR161567 DR161567 None None   S48T, V60I, K122P, D177E, T200E, Q207E L205R 
KJ108 KJ108 None None   S162Y, E204Q, Q207A, R211K, V245M, K281R, I293V, I329L, A376S, T377I, S379C, T403M, A446S, L452I, R461K, V467I, H483Y, S519N, K527Q, K530R, A554E, I556V  
TR02359 TR02359 None None   V35L, E138A, F171Y, K173Q, T200E, I202V, Q207E, F214L  
TR02914 TR02914 None None   V8I, A98S, K122E, I178M, T200A, Q207G, L210F, R211K  
TRI00091 TRI00091 None None   V35T, T39R, I135V, S162C, K173Q, Q174K, D177E, T200A, Q207A K122H 
TRI00267 TRI00267 None None   A98S, S162A, K173E, D177E, T200E, Q207G, F214L  
TRI00320 TRI00320 None None T69D  E6K, A98S, K122E, I135T, S162N, D177E, T200I, I202V, Q207D, R211K  
TRI00620 TRI00620 None None   V8I, V35I, S48T, V90I, A98S, A158S, T200A, Q207E  
TRI00945 TRI00945 None None   V35T, V60I, A98S, K122P, I135V, K173Q, T200A, Q207E, L210F, R211K  
TRI01202 TRI01202 None None   V35M, G45E, T69A, K122E, T200A, I202V, Q207E, R211K  
TRI04313 TRI04313 None None   P4S, D123E, I135V, D177E, T200A, Q207A  
TRI06188 TRI06188 None None   P4S, D123E, I135V, D177E, T200A, Q207A  

Database

Resources

Team