<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Trinh (2012)
Title Short communication: Drug resistance mutations in the HIV type 1 protease and reverse transcriptase genes in antiretroviral-naive Vietnamese children.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 75
NumPts 75
Subtype CRF01_AE


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
VN-1 VN-1 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-101 VN-101 None None   E6D, V10I, V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-102 VN-102 None None V75M  E6D, K11T, V35T, T39K, V60I, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207K, R211S, K238R, V245E  
VN-103 VN-103 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
VN-104 VN-104 None None   E6D, V35T, T39E, T69N, K122E, D123S, I135T, S162C, G196R, Q207D, K238R, V245E  
VN-105 VN-105 None None   E6D, V35T, T39K, F87L, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
VN-106 VN-106 None None V75I, M184I G190R E6D, K11R, V35T, T39N, M41I, V60I, W71*, W88*, K102Q, T107S, K122E, D123S, R125K, I142V, W153*, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, V189I, G196K, T200I, Q207A, R211N, W212*, W229*, K238R, W239*, V245E G15R, M16I, G18R, G45R, G51K, E53K, R72K, R78K, E79K, G93R, G99S, G112R, G141R, G152R, G155R, G213K, M230I, G231R 
VN-108 VN-108 None None M184I G190R E6D, V35T, T39E, M41I, W71*, W88*, K122E, D123S, I135T, W153*, S162C, R172K, K173I, Q174K, D177E, G196R, T200A, E203K, Q207A, R211S, W212*, W229*, K238R, V245E, E248K M16I, G18R, G45R, G51K, R72K, G93R, G112K, G141R, G152R, G155R, G213R, M230I, G231R 
VN-109 VN-109 None None   E6D, V21I, V35T, T39E, K122E, D123S, T139A, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E  
VN-110 VN-110 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-111 VN-111 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E E29K 
VN-113 VN-113 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, E169G, K173I, Q174K, D177E, T200P, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-114 VN-114 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-115 VN-115 None None   E6D, V35T, T39K, M41I, K43E, W88*, K122E, D123S, S162N, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, W212*, W229*, K238R, V245E G51R, G93R, A129T, G155R, G213R, G231K 
VN-116 VN-116 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
VN-117 VN-117 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, F171Y, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245A  
VN-12 VN-12 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-13 VN-13 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-14 VN-14 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-15 VN-15 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174N, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-19 VN-19 None None   V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, S162C, Q174R, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-20 VN-20 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, S68G, K122E, D123S, I135T, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-22 VN-22 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173L, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
VN-23 VN-23 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-24 VN-24 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174E, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-25 VN-25 None None  Y181C E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-26 VN-26 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, D123S, K126R, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, I180V, Q207A, R211S, K238R, V245E, K249R N57D 
VN-27 VN-27 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-28 VN-28 None None   E6D, V35T, T39K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245K  
VN-30 VN-30 None None   V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-31 VN-31 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-32 VN-32 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, G196E, Q207A, L210F, R211S, K238R, V245E  
VN-33 VN-33 None None  G190R E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173L, Q174K, D177E, G196R, R199K, Q207A, R211S, W212*, D218N, W229*, K238R, V245E, E248K M230I 
VN-37 VN-37 None None   E6D, V35T, T39A, T69N, K102E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-39 VN-39 None None   E6D, V35T, T39K, T69S, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, W212*, V245E  
VN-41 VN-41 None None   K11R, V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, E169G, K173R, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-42 VN-42 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, I135T, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-44 VN-44 None None   K11T, V35T, T39K, K122E, D123N, S162A, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
VN-45 VN-45 None None  Y181C I2V, E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, T107S, K122E, D123S, S162C, E169D, K173R, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245K  
VN-46 VN-46 None None   K11R, V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173G, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-47 VN-47 None None  V179D E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, D121H, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
VN-49 VN-49 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, I180V, Q207A, R211S, V245E  
VN-50 VN-50 None None   E6D, K11T, K20E, K32G, V35T, T39K, E42G, K43E, K122E, D123S, I135T, S162A, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E  
VN-51 VN-51 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, T69N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, L210S, R211S, K238R, V245E  
VN-52 VN-52 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, T165I, K173A, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, L228H, V245E  
VN-54 VN-54 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, V60I, K66R, S68G, K122E, D123S, I135T, S162Y, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-55 VN-55 None None  V179D E6D, K11T, E28K, K32E, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207N, R211S, V245E  
VN-56 VN-56 None None   E6D, V35T, T39N, K122E, D123S, T139A, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207D, R211K, K238R, V245E  
VN-57 VN-57 None None   E6D, D17N, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174R, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245A K13R 
VN-6 VN-6 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207E, R211S, K238R, V245E  
VN-60 VN-60 None None V75L  E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-61 VN-61 None None   E6D, V35M, T39E, E40D, K122E, D123S, K173V, Q174K, D177E, T200I, Q207A, K238R, V245E  
VN-63 VN-63 None None   E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q207D, K238R, V245E  
VN-65 VN-65 None None   K11R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-66 VN-66 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I159V, K173T, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, V245E R78K 
VN-68 VN-68 None None V75L  E6D, K11T, V35T, T39E, D121Y, K122E, D123G, I142V, K173T, Q174K, D177E, I178M, G196E, Q207A, R211S, V245E, E248D  
VN-70 VN-70 None None   E6D, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E K11M 
VN-71 VN-71 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-73 VN-73 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, E233K, V245E  
VN-75 VN-75 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-76 VN-76 None None   K11R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-77 VN-77 None None   E6D, V35T, T39K, K43Q, V60I, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-78 VN-78 None None   V35T, K66R, W88*, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, G196E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-79 VN-79 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K43E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, V245E  
VN-80 VN-80 None None   T27S, V35T, T39K, K43E, S105A, K122E, D123S, I135T, T139A, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-82 VN-82 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102Q, D121H, K122E, I142T, S162C, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-85 VN-85 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174R, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-87 VN-87 None None V75L  E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, E169D, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-89 VN-89 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-9 VN-9 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-91 VN-91 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-93 VN-93 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, T139A, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-94 VN-94 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-96 VN-96 None None   K11T, V35T, T39E, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
VN-98 VN-98 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E