Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author von Wyl (2010)
Title HIV-1 reverse transcriptase connection domain mutations: dynamics of emergence and implications for success of combination antiretroviral therapy.
Citation Clin Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 68
NumPts 68
Subtype B, C, F, A, H, CRF02_AG, CRF01_AE, D


Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
10026995 10026995 AZT, DDI None M41L, M184V, T215Y  I135V, S162C, K173E, V245K, A272P, E297A, D324E, G335D, M357R, A371V, A400T  
1256118 1256118 AZT, 3TC None M41ML, M184V, T215TNSY  T39TA, D123E, I135T, I142IV, K166R, I178IM, G196GE, Q197QK, K201KR, K277R, T286TA, A288PS, E291D, I293V, P294PS, E297A, A400AT  
1256760 1256760 AZT, DDI None M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q  T39TS, V60I, V118I, I135T, R211K, D218E, L228H, A288T, V292I, I293V, E297KR, L301M, I329V, G359S, K366R, A376T  
1256808 1256808 AZT, DDC, 3TC None K70R, M184V  T69S, Q174H, Q207R, R211E, F214FL, V245T, I257L, V261I, V317A, S322T, I329L, Q334N, T338S, M357MI, A360V, A376V, T386A, E399ED  
14439342 14439342 AZT, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y, N348I  E28EK, K32KEQ, K43Q, E44D, V118I, D121HY, K122E, I135T, G196GE, T200I, E203K, Q207E, H208Y, R211K, L228H, A272P, A288AT, E297EK, I326IT, P345PQ, R356K, A360V, T377L, S379CG, K390KR  
1479657 1479657 AZT, 3TC None K70R, M184V, N348I  E6D, K64KR, T69S, I135V, K166R, T200I, R211K, F214L, V292I, I293V, D324E, G335S, K353R, R356K, G359GS, K366R, A376T  
1506769 1506769 ABC, AZT, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y, N348I  K43E, E44ED, V60I, V118VI, D123E, D177DE, Q207E, R211K, K249Q, A272P, Q278HN, K281R, T286A, I293V, E297K, K311R, S322T, Q334L, M357T, G359GS, K385R, K390R, E399K, A400T  
1540315 1540315 AZT, 3TC None M41L, K70R, M184V  V60I, T69N, I135T, I142V, T200A, T286A, I293V, E297K, E312EQ, D324E, G359S, A371V, A376T  
1765695 1765695 AZT, DDI, 3TC None D67N, T69DN, K70R, M184V, K219KQ  K20KR, V21VI, V35T, V60I, K101R, K103KR, I135IATV, E138ED, K166R, T200A, Q207QH, F214FL, E248D, D250DN, A272S, A288AT, I293V, K347Q, R356K, G359S, A360T, A376AT, K390R, A400T Q269QH 
1801474 1801474 TDF, AZT, 3TC None   V35T, T39L, V60VI, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E, T286A, E291D, V292VI, I293V, V317I, S322T, E328D, G335D, R356K, M357K, G359S, K366R, A371V, I375V, K390R E89EG 
1801560 1801560 AZT, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215Y  V35T, T39A, K43KE, E44D, V118VI, D123E, I135V, S162C, E169A, K173S, Q174K, G196GE, E203K, Q207D, R211K, V245Q, E248D, A272P, K275R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297T, V317A, R356K, M357I, G359S, T377V, Q394L, K395R, E399D, A400T  
22672149 22672149 AZT, 3TC None M184V  E6D, K11Q, V21I, V35T, T39M, K102KR, D121HY, K122E, D123S, I135T, T139K, S162C, D177E, T200A, E203KQ, Q207D, R211RK, P243A, I244V, V245K, A272P, T286A, E291ED, I293V, V314I, S322A, G333E, G359S, K366R, A371V, A376S, V381VI, T386I, A400T  
2634352 2634352 AZT, 3TC None M41ML, M184V  R83K, I135IT, S162A, G196E, R211K, A272P, K277R, T286A, P294T, E297KR, L310LF, A327AV, A376T, K390R, A400T E203EDKN 
4795287 4795287 AZT, DDI, D4T None T215Y  K166R, I178M, G196E, R211K, K277R, T286A, E297K, I326V, I329IV, Q334QL, R356K, R358K, A376S, K390R, E399D  
4795302 4795302 DDC, AZT, D4T, 3TC None   K122KE, I142IT, R211K, I293IV, E297AV, K311KR, G333DE, Q334QH, G359S, A376T, K390R, A400T  
4795387 4795387 AZT, DDI None K70KR, L210LW, T215TFIS  R83K, K104KR, I135T, Q174K, G196E, K201I, R211K, V245K, K287KR, I293IV, R358K, G359S, T386I, K390R  
4795447 4795447 AZT, DDI, 3TC None M41L, D67DN, M184MV, L210LW, T215Y  K49R, A158AS, K166R, E169KR, K173E, I178IL, G196E, T200TI, I202V, Q207K, R211A, V245T, I293V, P294PT, E297EA, K311KR, I329L, Q334D, G359GS, A360AT, V365VI, T386I  
4795687 4795687 AZT, 3TC None M184V, N348I  V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123DN, S162A, K166KR, K173A, D177E, T200A, Q207E, P243T, V245Q, D250DE, A272P, T286TA, E291D, V292I, I293V, Q334H, G335D, R356K, G359T, K366R, A376AS, T377M, T386TA, K390R, A400T  
4795747 4795747 AZT, DDI, DDC, D4T, 3TC None M41L, D67DN, L74I, M184MI, T215Y, K219R  V35VI, K43Q, E44D, V118I, K122E, D123N, I135T, S162C, Q207E, L210LS, R211K, D218E, V245K, K277R, T286TA, I293V, E297Q, I329V, A360AT, K390R, A400T  
4795792 4795792 AZT, DDI, D4T, 3TC None M41L, M184V, L210LW, T215Y  K64KR, D123E, I135M, S162SDGN, K166KR, Q197E, R211K, A272P, K277R, T286TA, E297K, Q334H, R358K, G359S, T369V, A371T, A376T, T377LQ, A400T  
4795867 4795867 AZT, DDI, 3TC, D4T None M41L, M184V, L210LW, T215Y  E6D, I135IV, Q197K, R211RK, R284K, I293V, P294Q, G359NS, A400T  
4795897 4795897 DDC, AZT, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  E6D, D123E, K166R, D177E, R211K, R358K, G359GS  
4796137 4796137 AZT, 3TC None M184V, N348I  V35M, T39TA, K49KR, V60VI, R83K, K101R, D123DE, I135T, E169D, D250N, A272P, I293V, E297A, T338TS, P345Q, M357I, R358K, G359S, K366R, I375V, T386I  
4796564 4796564 AZT, DDC, DDI, 3TC None M41L, L210W, T215Y  V35L, R83K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, I293V, V317A, S322ST, Q334L, G359S, A371AV, K390R, A400T  
4796609 4796609 AZT, DDI None   K49R, R83K, T165I, K277R, I293V, E297A, R307RK, M357T, G359S, K366R, A376T, K390R, A400T W24W*, T128TA 
4796685 4796685 DDI, DDC, AZT, 3TC None M41L, D67DN, K70KR, L210W, T215Y  P14PS, I50IV, R83K, V118VI, T165I, I202V, R211K, H221HY, A272P, K277R, Q278QR, V292I, I293V, E297R, L301I, V317A, G335GS, R358RK, G359S, A371V, A376T, K390R, A400T  
4796701 4796701 AZT, 3TC None M184V K101KE I135T, V245E, A272P, K277R, A288S, I293V, E297A, V314VI, A360T, V365I, S379G, T386I  
4796717 4796717 AZT, 3TC, D4T None M184V, N348I  A98S, K101KQ, K102KQ, K122E, D123DN, E138A, I142V, S162C, R211RK, A272S, T286A, K311R, D324E, R358K, G359GS, T377R, K385R  
4796734 4796734 AZT, 3TC None M41L, D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219E  V35T, V60I, K101R, K122E, D123N, I135T, K166R, D177E, E203K, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, Q334D, Y342F, M357A, T369A, S379G, K385R, K390R, K395R, A400T  
4796879 4796879 AZT, DDI None   V35I, K82R, R83K, D123E, S162C, D177E, R211K, V245L, A272P, K277R, D324DE, V365I, K390R, A400T E53EA 
4796895 4796895 AZT, 3TC None M184V  V118I, D123N, D177E, F214L, A272P, I293V, E297K, K311R, G333E, F346Y, G359S, A371V, A376T, K390KR, E399ED, A400T  
4796910 4796910 AZT, DDI None   V106I, D123E, S162A, R211K, V245M, R284K, T286A, I293V, T296TS, E297K, I329L, M357I, T369A, A376V, K390R, K395R, E399D  
4796973 4796973 AZT, DDI None M41L, L210LW, T215Y, N348NI  E6EK, K11Q, K104N, K122E, D123N, I135T, S162C, T200I, I293IV, K311KR, I326V, R358RK, V365I, T386I, K390R E53EK, S379SR 
4797102 4797102 AZT, DDI None T215SY  K102Q, D123E, K166R, I178IM, I180IV, G196GE, A272P, T286TA, E297R, D324DE, A360T, A376T, A400T E79E* 
4797270 4797270 AZT, 3TC None M184V, T215Y  K20R, I31IV, E44D, K49R, V60I, R83K, I178M, Q197E, E204Q, R211K, V245K, A272P, Q278HN, S322T, I329IL, G359S, A371AV, A376S, A400T  
4797331 4797331 AZT, DDI None K70KR  K20R, K49KR, K122E, D123DEKN, I135T, T200I, R211K, V245E, D250DE, I293V, E297A, L303LM, V317A, I375V, T386I, K390R, A400AT  
4797649 4797649 AZT, DDI, D4T, 3TC None M41L, M184V, T215Y  E36K, A98S, D121H, K122E, I135T, S162C, I178L, E203D, A272P, K277R, I293V, A371T, K388R, A400T E29K, R72K 
4798588 4798588 AZT, DDC, DDI, 3TC None   I5IV, E6D, K11AT, V35T, T39K, K43AE, D121Y, K122E, D123G, K166KR, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211NS, K238KR, V245E, T286TA, E291D, V292I, I293V, P294T, E312NT, S322SA, I326IV, G335D, M357K, G359S, K366R, T369TA, E370ED, A371V, I375MV, A376T, K390R, K395R, A400T  
4798897 4798897 AZT, DDI, 3TC None M184V  V35I, R83K, K166R, I195T, G196E, L210F, K277R, T286A, E297K, V317A, S322T, G333GE, A376V, T386A, K390R, A400T  
4799002 4799002 AZT, DDC None M41L, M184V, T215Y  D123E, S162C, D177E, G196E, E203EK, Q207G, R211K, D237E, V245MT, A272P, K277R, I293V, Q373H, K390R, A400V  
4813290 4813290 AZT, DDI, D4T, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  V35R, K43N, V118I, K122E, I135V, G196E, Q207K, R211A, A272P, I293V, R356K, A376T, T397M  
4814739 4814739 AZT, DDI None V75I, F77L, Y115F, F116Y, Q151M  V35I, S68SG, D123E, I135R, K173KQ, A272P, K281KR, T286P, E297K, K311KR, V317A, Q334R, M357T, T369A, I375V, A376T, T377L, A400T  
4814754 4814754 AZT, DDI, DDC None   V35T, E36A, T39D, S48T, K166KR, K173A, Q174K, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248N, D250DE, S251SN, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R, Q334D, G335D, R356K, G359T, K366R, A376T, T377L, K390R, A400T  
4814789 4814789 AZT, DDC, 3TC None D67N, K70R, M184V, T215FY, K219Q  D123E, D177E, Q207E, R211K, D218E, T286A, A288S, E297K, K311KR, I326V, Q334LPS, M357T, A360V, T369A, V372A, A376T, S379C, A400T  
4814991 4814991 D4T, 3TC None M184V, N348NI  T39A, K102Q, K122E, D123G, I142V, S162Y, T200A, V245M, E248ED, D250E, K277R, Q278E, T286TA, I293V, E297K, F346FL, G359GS, K366R, A376T  
4815011 4815011 AZT, 3TC None M41L, D67DE, M184MV, L210W, T215Y  A98S, K102KQ, K122KE, T139K, V179VI, A272S, L283I, I293V, D324E, A355T, R356RK, G359S, A376N, K390R  
4815086 4815086 D4T, DDI None M41L, T215F  K11T, K20R, V35T, T39G, K173S, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K, V245K, T286A, A288AT, E291D, V292I, I293V, P294T, E312D, V317VA, G335D, M357K, G359S, T369TA, A371V, I375V, A376V, T377M, E396D, A400T  
4929830 4929830 AZT, DDI None M41L, D67N, K70R, T215Y  R83K, I135IV, Q207QH, R211Q, A272P, I274IV, K277KR, P294T, I329V, A371AV, T377S, V381VI, E399D  
4930139 4930139 AZT, DDI, DDC, 3TC, D4T None M41L, D67DN, M184V, L210LW, T215Y  K20KR, V35IT, E44EA, R83K, K102KR, V118VI, D123E, I135T, S162Y, Q174QH, G196E, T200S, Q207X, R211K, T286A, E291D, E297D, E312EQ, S322T, R356K, K366R, A371AV, A376S, A400T  
4930286 4930286 AZT, DDI, 3TC None D67N, K70R, M184V, K219Q  K49R, I50V, V60I, I135T, E204Q, R211K, I329L, M357MI, G359GS  
5158907 5158907 AZT, DDI, 3TC None M41L, M184V, L210W, T215Y  E6D, K49KR, K122E, K166KR, E169ED, T200TA, Q207D, K277R, I293V, K311R, K347Q, A360V, A400T  
6497 6497 3TC None M184V  T39TA, R83K, K102KR, R211RK, T286TA, E297K, I329V, Q334E, F346FY, R356K, A360AT, T377Q, K390KR, A400T, K431KT, D460N, S468SP, T470N, Q480QH, G490GE, L491LS  
6498 6498 3TC None M184V  K49R, K166T, E169A, A272P, K277R, E297K, I326V, Q334L, A360T, A376AV, V381VI, A400T, T403M, S468P, A554T  
6499 6499 3TC None M184V  E6D, T200TI, I202IV, R211K, V245M, E248D, I293IV, E297Q, I326V, Q334E, A360T, K390R, A400AS, Q464E, V467I, S468P, A554AT, V559VI  
6500 6500 3TC None M184V  Q207QE, K277R, I293V, E298EK, A304X, E305X, N306X, R307X, E308X, I309X, L310X, K311X, E312X, P313X, V314X, H315X, G316X, V317X, Y318X, Y319X, D320X, P321X, S322X, K323X, D324X, L325X, I326X, A327X, E328X, I329X, Q330X, K331X, Q332X, G333X, Q334X, G335X, Q336X, W337X, T338X, Y339X, Q340X, I341IFLV, F346FL, M357T, T377M, K388KN, A400T, T403IM, R461RK, V466VF, S468SP, T473TP  
6502 6502 3TC None M184V  K122E, D123DE, I135T, S162C, E169ED, G196E, Q207E, V245M, A272P, K277KR, I293V, D324E, Q334N, R358RK, T450S, R463RK, V466VI, T470TI, Q480QH, H483HY, Q524E, A554N  
6503 6503 3TC None M184V  K122E, T200A, F214L, V245M, I293V, E297AITV, Y342YF, M357V, R358K, A376T, T377K, S379C, T386I, K390R, A400T, T403I, E449D, V458VI, S468P, L491LS, L517I L149LF 
6504 6504 3TC None M184V  K20KR, V35I, E138A, T165I, I202IV, A272AP, K277R, L283I, T286A, P294S, R356K, A376T, V381I, K390R, L469I, T470N, H483Y, G490GE, Q524E, K527KN, A534AS  
6505 6505 3TC None M184V  D123E, Q174K, N175Y, Q207K, R211S, E248ED, A272P, V276I, P294PT, E297K, I326IV, Q334QL, K431T, V435VA, N447NS, D460N, R461K, H483L, Q487QR, A534T Q336QL 
6507 6507 3TC None M184V, K219KE  K122E, I135T, V179VI, I202IV, V245M, I257L, A272P, I293V, E297T, A376T, T386I, K388KR, A400T, E415ED, S468P, H483N, A502V, S519N, K530KR, A554AT N418CS 
6538 6538 3TC None M184V  T200A, R211K, S251H, A272P, V292VI, I293V, E297A, K311R, S322T, R356K, M357V, T403I, E404D, K451R, S468P, T470R, A554T  
6552 6552 3TC None M184V  K20R, T69N, R211K, E248D, A272P, K277R, A376T, A400T, D460N, S468T, H483Y, K512Q, S519N  
697613 697613 AZT, DDI, D4T, 3TC None M184V, L210W, T215F G190A K49R, S68G, S162D, K166R, R211K, V245M, A272P, K277R, T286TA, E297EK, V317A, I326V, I329V, Q334E, M357T, A360V  
697637 697637 AZT, 3TC None   K102Q, S162C, D177E, I178L, V179I, V292I, I293V, E297A, K311R, D324DE, G359S, K390R  
697801 697801 AZT, DDI, DDC None D67N, T69T_T, K70R, K219Q  K64N, K82KR, V90VI, K104R, K173E, P176K, I178L, T200IR, Q207R, D218E, V245E, V317A, Q334L, G359S, A371V  
697949 697949 AZT, 3TC None M184V, N348I  S48T, K122P, D123A, D177E, T200I, Q207E, R211K, F214L, V245E, V276I, T286A, I293V, I341IV, R356K, A360AV, I375V, T377R, K390R, A400T  
697981 697981 D4T None D67N, K70R, K219Q  I135V, K166R, K173Q, D218E, V245M, K275KQ, K277R, I293V, P345T C38CW 
698009 698009 AZT, 3TC, D4T None M41ML, M184V, T215Y  K49R, R83K, D121DY, K122E, D123DN, I135T, R211K, K277R, Q278H, T286A, I293V, E297A, V317VA, Q334E, R358RK, G359S, A360AT, K366R, K390R, E399D, A400T