<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ssemwanga (2012)
Title Low drug resistance levels among drug-naive individuals with recent HIV-1 infection in a rural clinical cohort in southwestern Uganda.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 72
NumPts 72
Subtype D, A, CRF10_CD, C


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
RCC-TDR-359656 RCC-TDR-359656 None None   E6Q, K20R, V35T, T39R, K122E, D123G, S162A, K173S, V179I, I202V, Q207A, R211S  
RCC-TDR-359822 RCC-TDR-359822 None None   V8VI, K22KR, V35T, K49R, V60I, D121C, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
RCC-TDR-359889 RCC-TDR-359889 None None   E6D, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123E, E138A, I142IV, T165I, E169D, D177E, I178M, R199RK, T200K, Q207E, R211K  
RCC-TDR-480431 RCC-TDR-480431 None None   E28A, V35T, T39A, E40D, V60I, D121Y, K122E, S162C, D177E, I178M, T200I, Q207D, R211K  
RCC-TDR-483664 RCC-TDR-483664 None None   V35T, V60I, D121HY, K122E, D123E, I135T, I178M, T200I, Q207E, R211K L209LF 
RCC-TDR-483673 RCC-TDR-483673 None None   E6D, V35T, V60I, S68G, I135T, D177E, T200A, Q207E  
RCC-TDR-483707 RCC-TDR-483707 None None   K32KR, V35T, S48T, V60I, K122P, D177E, T200I, Q207E, R211K  
RCC_TDR-353759 RCC_TDR-353759 None None   V35T, K43R, V60I, D121Y, K122E, I142V, E169D, D177E, E194D, Q197K, T200I, Q207E, R211K  
RCC_TDR-356779 RCC_TDR-356779 None None   K11T, V21I, V35I, T39K, V60I, D123S, I135T, I142T, K173A, Q174R, V179I, T200A, I202V, Q207V, R211K  
RCC_TDR-480124 RCC_TDR-480124 None None   V35I, G45E, K49R, V60I, D123E, D177E, T200V, Q207G, R211K  
RCC_TDR-480876 RCC_TDR-480876 None None   V35T, E40D, S48T, K49R, V60I, K122E, D123E, F171Y, D177E, I178M, Q207E, R211K  
RCC_TDR-481387 RCC_TDR-481387 None None   K20R, V21I, V35T, K43R, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
RCC_TDR-482974 RCC_TDR-482974 None None   V21I, V35T, E36D, T39R, K43Q, K122E, D123N, K173S, D177G, V179I, T200V, I202V, Q207A  
RCC_TDR-483620 RCC_TDR-483620 None None   P4T, V35T, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, Q207A, R211S  
RCC_TDR-483634 RCC_TDR-483634 None None   K20R, V35T, T39N, V60I, K122E, D123N, K173S, D177G, V179I, T200A, I202V, Q207A  
RCC_TDR-820974 RCC_TDR-820974 None None   K20R, V35T, T39K, V60I, K122E, D123N, Q207E, R211K Q161QP 
RCC_TDR_190330 RCC_TDR_190330 None None   V8I, V35T, E40D, K49R, V60I, K166R, D177E, T200I, Q207E, R211K, F214L  
RCC_TDR_353841 RCC_TDR_353841 None None   P4T, V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, E169D, D177E, T200I, Q207E, R211K  
RCC_TDR_355543 RCC_TDR_355543 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, K122E, D123N, K173S, D177G, T200A, I202V, Q207A, R211K  
RCC_TDR_355927 RCC_TDR_355927 None None   V35T, E40D, E44ED, V60I, K122E, E138A, I142V, I178M, T200I, E204K, Q207E, R211K  
RCC_TDR_356261 RCC_TDR_356261 None None   V35M, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135T, D177E, Q197K, T200E, Q207G, R211K  
RCC_TDR_356789 RCC_TDR_356789 None None   K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123T, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S  
RCC_TDR_356892 RCC_TDR_356892 None None   K11Q, V35T, T39A, E40D, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
RCC_TDR_357030 RCC_TDR_357030 None None   V21I, V35M, T39A, V60I, I142V, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211D  
RCC_TDR_358027 RCC_TDR_358027 None None   V35T, E40D, V60I, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, T200I, Q207E, R211K  
RCC_TDR_358497 RCC_TDR_358497 None None   V35A, V60I, D121H, K122I, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211K  
RCC_TDR_358561 RCC_TDR_358561 None None   E6K, K11Q, V35T, T39A, E40D, K122E, D123N, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, E204D, Q207A, F214L  
RCC_TDR_358745 RCC_TDR_358745 None None   K20R, V35T, T39A, E40D, K49R, V60I, K122E, D123E, I142T, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
RCC_TDR_359723 RCC_TDR_359723 None None   K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123T, I135T, E138A, T165I, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S  
RCC_TDR_359881 RCC_TDR_359881 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, I178V, T200Q, Q207D, R211K, F214L  
RCC_TDR_359885 RCC_TDR_359885 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, I178V, T200Q, Q207D, R211K, F214L  
RCC_TDR_359957 RCC_TDR_359957 None None   E6R, V35T, T39I, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123E, D177E, I178M, V179I, E204K, Q207E  
RCC_TDR_359989 RCC_TDR_359989 None None   E6D, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, V179I, I202V, Q207A, R211S  
RCC_TDR_480009 RCC_TDR_480009 None None   P4T, E6D, V8I, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135R, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K, F214L  
RCC_TDR_480013 RCC_TDR_480013 None None   V35T, T39M, K49R, V60I, K122E, I135T, T139TA, Y144F, D177E, I178M, Q207E, R211K  
RCC_TDR_480059 RCC_TDR_480059 None None   P4H, I5V, K20R, V21I, V35T, E36D, T39GR, K49R, V60I, A158S, K173S, D177G, V179I, I202V, Q207A, R211S  
RCC_TDR_480069 RCC_TDR_480069 None None   K11T, V35T, E40D, K49R, V60I, D121Y, K122E, S162C, D177E, I178L, V179I, T200I, Q207D, R211K  
RCC_TDR_480117 RCC_TDR_480117 None None   V35T, E36D, T39S, V60I, K122E, D123G, K173S, Q174K, D177E, I178L, V179I, I195L, G196E, I202V, Q207A, R211K, F214L  
RCC_TDR_480133 RCC_TDR_480133 None None   V8I, V35T, E40D, K49R, V60I, I142V, K166R, D177E, T200I, Q207G, R211K  
RCC_TDR_480146 RCC_TDR_480146 None None   V35M, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135IT, D177E, Q197K, T200E, Q207G, R211K  
RCC_TDR_480245 RCC_TDR_480245 None None   E6D, V35T, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, D177E, Q207A, R211S  
RCC_TDR_480611 RCC_TDR_480611 None None   K11E, K20R, V35T, V60I, D121H, K122E, D123G, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
RCC_TDR_480631 RCC_TDR_480631 None None   V35T, T39A, E40D, K49R, V60I, V118I, K122R, I135T, Q145C, K173L, Q174K, D177E, V179T, Q207A, R211S, F214L  
RCC_TDR_480650 RCC_TDR_480650 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, I142V, D177E, T200I, Q207N, R211K  
RCC_TDR_480977 RCC_TDR_480977 None None   K20R, V35T, T39L, K49R, D121Y, K122E, T139I, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
RCC_TDR_481029 RCC_TDR_481029 None None   V35T, T39I, E40D, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178L, Q207E, R211K  
RCC_TDR_481346 RCC_TDR_481346 None None   P4T, I5V, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, D177E, T200I, Q207G, R211K  
RCC_TDR_481816 RCC_TDR_481816 None None   K20R, V21I, V35T, T39A, E40D, K49R, V60I, D121C, K122E, D177E, I178V, T200I, I202V, Q207G, R211K  
RCC_TDR_482054 RCC_TDR_482054 None None   K11T, V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, V106VI, K122E, D123T, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S P4Y 
RCC_TDR_482363 RCC_TDR_482363 None None   V35T, E36D, T39S, V60I, K122E, D123G, K173S, Q174K, D177E, I178L, V179I, I195L, G196E, I202V, Q207A, R211K, F214L  
RCC_TDR_482365 RCC_TDR_482365 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39G, K122E, D123G, K173S, D177G, V179I, T200A, I202V, Q207V  
RCC_TDR_482400 RCC_TDR_482400 None None   V35T, E36D, T39S, V60I, K122E, D123G, K173S, Q174K, D177E, I178L, V179I, I195L, G196E, I202V, Q207A, R211K, F214L  
RCC_TDR_482405 RCC_TDR_482405 None None   V21I, V35IT, E36A, T39E, K122E, D123G, I142T, A158S, T165I, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D  
RCC_TDR_482650 RCC_TDR_482650 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, I159IV, T165TI, D177E, Q207A  
RCC_TDR_482987 RCC_TDR_482987 None None   K20R, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123G, I159V, D177E, T200V, Q207E, R211K  
RCC_TDR_483429 RCC_TDR_483429 None None   E6ED, K11T, K20R, V35T, T39N, K122E, D123NS, I142V, A158S, S162A, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200K, I202V, Q207A, R211N  
RCC_TDR_483451 RCC_TDR_483451 None None   V35T, T39M, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123N, E169D, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
RCC_TDR_483488 RCC_TDR_483488 None None   E6D, V35T, V60I, D121Y, K122E, D123A, I135T, I142V, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L  
RCC_TDR_483515 RCC_TDR_483515 None None   V35T, T39A, E40D, V60I, V118I, I135T, Q145C, K173L, Q174K, D177E, V179T, T200A, Q207A, R211S, F214L  
RCC_TDR_483540 RCC_TDR_483540 None None   P4T, E6G, K20R, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, D177E, T200I, Q207G, R211K  
RCC_TDR_483555 RCC_TDR_483555 None None   V35T, T39M, K49R, V60I, K122E, I135T, T139A, Y144F, D177E, I178M, Q207E, R211K  
RCC_TDR_483644 RCC_TDR_483644 None None   V35T, T39M, K49R, V60I, K122A, I135T, T139A, Y144F, D177E, I178M, Q207E, R211K  
RCC_TDR_483685 RCC_TDR_483685 None None   K11T, V21I, V35T, T39K, V60I, K122E, D123T, I135T, T165I, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200TA, I202V, Q207A, R211S  
RCC_TDR_483689 RCC_TDR_483689 None None   K11S, V35T, T39A, E40D, V60I, K104Q, K122E, D123N, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
RCC_TDR_483771 RCC_TDR_483771 None None   V35T, E40D, K49R, I50V, V60I, D177E, I178M, T200L, Q207E  
RCC_TDR_483861 RCC_TDR_483861 None None   E6D, V35T, K43KR, K49KR, I50IV, V60I, D121H, K122E, D123E, I135T, I142V, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L  
RCC_TDR_483963 RCC_TDR_483963 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, D177E, Q207A, R211S  
RCC_TDR_802510 RCC_TDR_802510 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, D177E, Q207A, R211S  
RCC_TDR_805324 RCC_TDR_805324 None None   V35T, T39R, K43KE, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, T200V, Q207E, R211K, F214L  
RCC_TDR_807857 RCC_TDR_807857 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, I142V, D177E, T200I, Q207D, R211K  
RCC_TDR_817428 RCC_TDR_817428 None None   E6D, V35T, T39I, V60I, K122E, D123N, D177E, Q207A, R211S  
RCC_TDR_828529 RCC_TDR_828529 None None  G190E, P225H E6K, V35T, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, K173R, D177E, R199K, T200M, Q207E, R211K M230I