<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Sigaloff (2012)
Title High Prevalence of Transmitted Antiretroviral Drug Resistance Among Newly HIV Type 1 Diagnosed Adults in Mombasa, Kenya.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 72
NumPts 72
Subtype A, D, C

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
KECGP001 KECGP001 None None   V21I, V35T, T39A, E40D, V60I, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174R, D177E, G196E, Q207A, R211S  
KECGP010 KECGP010 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, K166N, T200I, Q207E, R211K, D237N  
KECGP020 KECGP020 None None   V35T, T39K, V60I, K104T, D121Y, K122E, D123E, I135V, I142V, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207V, R211S, F214L  
KECGP022 KECGP022 None None   V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211N  
KECGP027 KECGP027 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, V60I, D123N, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A  
KECGP041 KECGP041 None None   V35T, V60I, K104N, D121H, K122E, I135T, E138A, T139I, K173S, Q174K, V179I, G196E, T200I, Q207A, R211G, F214L  
KECGP051 KECGP051 None None   K20R, I31V, V35T, T39I, E40D, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K  
KECGP053 KECGP053 None None   E6D, I31V, V35T, T39I, V60I, K122E, D123N, I135T, K173A, Q174R, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214L  
KECGP059 KECGP059 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, V179I, T200A, I202V, Q207N, R211K, F214L  
KECGP061 KECGP061 None None   V35T, E40D, K49R, I50V, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, D177E, V179I, Q207A, R211S  
KECGP062 KECGP062 None None   V35T, K49R, V60I, V106I, K122E, D123S, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211S R72S, Q222H 
KEKSN404 KEKSN404 None None   E6D, I31V, V35T, T39I, E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, D123E, D177E, Q207E, R211K  
KEKSN406 KEKSN406 None None   V35T, E40D, V60I, K122E, D123S, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
KEKSN408 KEKSN408 None None  K103N V35T, T39M, S48T, V60I, K122E, I135M, I178M, Q207A, R211K  
KEKSN410 KEKSN410 None None   E28A, V35T, T39A, E40D, K122P, I135M, I142V, D177E, I178V, Q207E, R211K  
KEKSN411 KEKSN411 None None   V35T, E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, I142M, D177E, T200I, Q207G, R211K F130Y, W153G, S156A, F160V 
KEKSN413 KEKSN413 None None   K11A, K20R, V35T, E36D, V60I, D121H, K122E, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
KEKSN414 KEKSN414 None None   K11T, K32R, V35T, T39E, K122E, D123N, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211N  
KEKSN418 KEKSN418 None None   E6D, I31V, V35T, T39I, E40D, K49R, V60I, K122E, D123G, I135T, K173V, D177E, T200A, Q207E, R211K  
KEKSN422 KEKSN422 None None   K11T, V35T, T39K, V60I, D121H, K122E, K173R, D177E, T200I, Q207E, R211K  
KEKSN423 KEKSN423 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, E36A, T39D, K43R, K122E, D123N, A158S, K173S, D177E, T200A, Q207E, R211K  
KELKN201 KELKN201 None None   E6D, I31V, V35T, E40D, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, F214L  
KELKN209 KELKN209 None None  K103N E6D, K11Q, V35T, V60I, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207N, R211G, F214L  
KELKN210 KELKN210 None None   V35T, V60I, K173Q, D177E, I178L, Q207E, R211K  
KELKN211 KELKN211 None None   V35T, E36D, V60I, D123E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
KELKN212 KELKN212 None None   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, V60I, K122E, D123N, K173S, D177E, V179I, E194D, T200V, I202V, Q207E, R211K  
KELKN214 KELKN214 None None   V35T, V60I, R83K, D121H, K122E, D123E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
KELKN215 KELKN215 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, D123E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S E29D 
KELKN216 KELKN216 None None   E6D, K20R, V21I, V35T, T39D, E138A, K173S, Q174K, V179I, T200E, Q207A, R211K, F214L L12*W 
KELKN217 KELKN217 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, D121H, K122E, D123DG, I135T, K173I, Q174K, V179I, Q207A, R211S  
KELKN218 KELKN218 None None   T39A, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S  
KELKN219 KELKN219 None None   P14T, K20R, E28A, V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L  
KELKN220 KELKN220 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48E, K49R, V60I, D123S, I135R, K173A, D177E, T200A, Q207E  
KELKN221 KELKN221 None None   K11E, V35T, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, G196E, T200A, E203D, Q207T, R211K  
KELKN222 KELKN222 None None   K20R, V35M, K49R, V60I, K122E, D123N, I135T, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
KELKN224 KELKN224 None None   E6S, V8I, V35T, V60I, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q197H, Q207E, R211S  
KELKN225 KELKN225 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, K173S, Q174R, D177E, I178L, V179I, T200A, Q207A, R211K  
KELKN226 KELKN226 None None   I5V, V8I, K20R, V35T, T39R, K122E, D123S, A158T, K173A, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S  
KELKN227 KELKN227 None None   V35T, T39I, E40D, V60I, K122E, A158S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, F214L  
KELKN228 KELKN228 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, K122E, D123S, E138A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211Q F130Y 
KELKN231 KELKN231 None None   V35T, E40D, V60I, K102Q, D121Y, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211N, F214L  
KELKN234 KELKN234 None None   E6D, K32Q, V35K, V60I, K64R, K122E, I135T, K173L, Q174R, T200A, Q207A, R211S, F214L  
KELKN235 KELKN235 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173T, Q174K, D177E, I178L, V179I, T200A, Q207A, R211S  
KELKN236 KELKN236 None None   E6D, K32Q, V35K, V60I, K64R, K122E, I135T, K173L, Q174R, T200A, Q207A, R211S, F214L  
KELKN239 KELKN239 None None   E6D, V21I, I31V, V35T, T39A, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
KELKN240 KELKN240 None None   K11A, K20R, V35T, T39K, K122E, D123S, T165I, E169D, K173A, Q174K, D177E, G196E, I202V, Q207A, R211S  
KELKN241 KELKN241 None None   V35T, K103R, D121H, K122E, D123S, I142V, K173T, T200A, Q207E, R211N  
KELKN242 KELKN242 None None   E6D, V21I, K32R, V35T, E40D, K49R, V60I, V90I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
KELKN245 KELKN245 None None   V21I, V35T, E53D, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211N I159M 
KELKN246 KELKN246 None None  K101N I5M, E6D, P14S, I31V, K32E, V35A, E40D, K46R, I47L, K49R, V60I, K104E, D121H, K122E, D123S, I135T, E138D, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K I2M, L12S, T27I, K43L, P97Q 
KELKN248 KELKN248 None None   V21VI, V35T, K49R, V60I, K173I, Q174K, D177E, I178L, V179I, Q207A, R211S  
KELKN249 KELKN249 None None   E6K, K20R, K32Q, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, S162H, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S  
KELKN250 KELKN250 None None   E6D, K20R, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174R, D177E, Q207A, R211S, F214L N136T 
KELKN251 KELKN251 None None   E6N, K20R, I31V, V35T, T39I, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, T165I, K173I, Q174E, D177E, I178L, T200I, Q207E, R211K, F214L  
KELKN252 KELKN252 None None K70R  E6D, I31V, T39I, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, I142V, T165I, Q174E, D177E, I178L, T200I, Q207E, R211K, F214L G51R, P55L 
KELKN253 KELKN253 None None   E6D, V35T, E40D, V60I, D121N, K122E, D123S, K173V, Q174K, V179I, T200E, Q207A, R211S  
KELKN256 KELKN256 None None   P4T, E6D, V35T, E40EA, K49R, V60I, K122E, D123G, F124L, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q197K, T200R, Q207A, R211T  
KELKN257 KELKN257 None None   E6D, E28K, V35T, E36A, T39V, E40D, K43R, K49R, K104R, K122E, D123S, K166R, K173A, D177E, I178V, Q197L, T200A, Q207E  
KELKN260 KELKN260 None None  K103N E6D, I31V, V35T, E40D, K102R, K122E, D123N, I142M, K173S, Q174R, D177E, V179I, Q197K, T200A, I202V, Q207A, R211N  
KELKN261 KELKN261 None None   E6D, K20R, V21I, V35T, T39D, E138A, K173S, Q174K, V179I, T200E, Q207A, R211K, F214L L12*W 
KELKN262 KELKN262 None None  K103N E6D, I31V, V35T, E40D, S48T, K49R, K122E, D123N, I135T, I142V, K173T, Q174K, D177E, Q207E, R211K  
KELKN264 KELKN264 None None   V35T, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, S162H, K166Q, K173L, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
KELKN265 KELKN265 None None   K11T, V35T, E36K, K43E, K49R, V60I, D121Y, K122E, S162C, K173L, Q174K, D177E, V189I, Q207A, R211S F160Y 
KELKN266 KELKN266 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
KELKN267 KELKN267 None None  G190R K11E, V35A, E36D, T39A, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, I195M, Q197E, T200A, Q207A, R211S V21D, K22I, E29D, K30I, Y127N, D186E 
KELKN268 KELKN268 None None   K20R, I31V, V35T, T39I, E40D, K49R, V60I, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
KELKN269 KELKN269 None None   V35A, K49R, V60I, D121Y, K122E, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207E, R211K  
KEMGO602 KEMGO602 None None  K103N K11T, K20R, V35T, T39L, D121H, K122E, I135T, S162C, K173L, Q174K, T200A, Q207A, R211S  
KEMGO605 KEMGO605 None None   E6D, K11T, K20R, V21I, V35T, K103R, K122E, D123N, I142V, K173L, Q174R, D177E, V179I, T200I, I202V, Q207D, R211K  
KEMGO611 KEMGO611 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, G196E, Q207A, R211S, F214L  
KEMGO613 KEMGO613 None None   I2T, E6D, K11E, K20R, V35T, T39I, E40D, E42K, V60I, K104E, V118I, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q197K, T200A, Q207D, F214L Q145W, L193I, R199G 
KEMGO614 KEMGO614 None None   V35T, V60I, K64R, K122E, D123G, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  

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