<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Tran (2012)
Title No Increase of Drug-Resistant HIV Type 1 Prevalence Among Drug-Naive Individuals in Northern Vietnam.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 102
NumPts 102
Subtype CRF01_AE

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Page 1   from Isolate 1 to Isolate 100 from Total 102 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
HPA013 HPA013 None None   K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA015 HPA015 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, E42EK, K122E, D123S, I135T, S162C, K173M, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211S, K238R, V245E  
HPA026 HPA026 None None   E6D, K20R, V35T, T39Q, K122E, D123S, I159V, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HPA028 HPA028 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K46Q, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211S, K238R, V245E  
HPA042 HPA042 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA063 HPA063 None None   E6D, K11T, V35T, T39KN, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207S, R211S, V245E I5IL 
HPA067 HPA067 None None   E6D, V35T, T39D, K122E, D123S, S162C, K173IT, Q174K, D177E, Q207S, R211N, K238R, V245E  
HPA073 HPA073 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA086 HPA086 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA093 HPA093 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, T39K, S68G, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E  
HPA104 HPA104 None None   E6D, K11S, V35T, T39K, G112GA, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207N, R211S, K238R, V245E  
HPA107 HPA107 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207R, R211S, K238R  
HPA108 HPA108 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123NS, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, G196GV, Q207S, R211S, K238R, V245E Q85QR 
HPA125 HPA125 None None   E6D, K11T, V35T, T39LS, K122E, D123K, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200AE, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA149 HPA149 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200L, Q207S, R211N, K238R, V245E  
HPA153 HPA153 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA154 HPA154 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173IL, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA160 HPA160 None None   P4H, E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, Q207GS, R211S, V245E L149LV 
HPA171 HPA171 None None   E6D, V35T, T39K, K43Q, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S, L228LH, K238R, V245E  
HPA176 HPA176 None None   E6D, K11T, V35T, D121Y, K122E, D123G, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207G, R211S, K238KR, V245E, K249R  
HPA177 HPA177 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA184 HPA184 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200TA, Q207D, R211K, K238R, V245N, E248D  
HPA185 HPA185 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA188 HPA188 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200TA, Q207S, R211S, F214L, K238R, V245E  
HPA189 HPA189 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA190 HPA190 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA193 HPA193 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA194 HPA194 None None   E6D, V35T, T39K, K43KE, V60VI, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA195 HPA195 None None   E6D, K11T, V35T, T39DN, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA209 HPA209 None None   K11T, V35T, K122E, D123S, I135T, T139A, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207N, R211S, K238R, V245E, K249R  
HPA212 HPA212 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, S162C, K173I, Q174K, D177E, V189I, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA213 HPA213 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA214 HPA214 None None   E6D, K11T, V21VI, V35T, T39TK, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200TI, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA216 HPA216 None None   V35T, T39K, K43Q, K122E, D123S, S162C, T165I, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S, V245E  
HPA219 HPA219 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162Y, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA222 HPA222 None None   E6D, K11T, V35T, T39DN, K122E, D123K, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S, K238KR, V245E  
HPA225 HPA225 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TI, Q207K, R211S, K238R, V245E  
HPA239 HPA239 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, V60I, T107S, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177G, V179I, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA243 HPA243 None None   E6D, K11T, K20KR, V35IM, K122E, D123S, I142V, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207S, R211S, K238R, V245E, D250N  
HPA246 HPA246 None None   E6D, K11T, V21I, V35T, T39K, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA252 HPA252 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, V111I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA259 HPA259 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K49R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207K  
HPA261 HPA261 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123K, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA262 HPA262 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, E40D, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA264 HPA264 None None   K11T, V35T, T39K, V106I, K122E, D123N, S162C, K173T, Q174K, D177E, I202V, Q207N, R211K, K238R, V245E  
HPA267 HPA267 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA270 HPA270 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K102E, K122E, D123S, S162F, T165I, K173L, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, V245E  
HPA278 HPA278 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K46Q, G112A, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, Q207S, R211S, V245E  
HPA294 HPA294 None None   E6D, K11KT, V35T, T39K, K122E, D123S, I135IV, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA295 HPA295 None None   E6D, V35T, V60VI, K102KQ, K122E, D123N, S162C, E169D, Q174K, D177E, I178IM, G196E, T200I, Q207DE, K238KR, V245E  
HPA307 HPA307 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, Q145M, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA309 HPA309 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA310 HPA310 None None   E6D, K11T, V35T, T39EK, K122E, D123NS, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E, V254VI  
HPA316 HPA316 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA318 HPA318 None None   E6D, K11T, V35T, T39TA, K122E, D123NS, I135RT, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211NS, K238R, V245E  
HPA319 HPA319 None None K70KT V179D E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238KR, V245E  
HPA332 HPA332 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, V60I, T107S, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA334 HPA334 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E, K259R  
HPA340 HPA340 None None   E6D, K11T, V35T, T39Q, K122E, D123K, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA341 HPA341 None None   E6D, K11T, V35T, T39EK, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200TA, I202IV, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA357 HPA357 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43Q, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA358 HPA358 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174KN, D177E, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA401 HPA401 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S, V245E  
HPA402 HPA402 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, I142T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207S, R211S, V245E, K249R  
HPA409 HPA409 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211N  
HPA422 HPA422 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA426 HPA426 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPA443 HPA443 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207NS, R211S, V245E, K249R  
HPA477 HPA477 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TA, E203D, Q207DN, R211KN, K238R, V245E, K249KR  
HPA482 HPA482 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174N, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPC008 HPC008 None None   I5V, V35T, T39N, K122E, D123S, I135R, I142V, S162Y, K173R, Q174K, I178M, G196E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPC017 HPC017 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E, E248D  
HPC022 HPC022 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S  
HPC043 HPC043 None None   V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, Q174KR, D177E, T200I, Q207A, R211S  
HPC045 HPC045 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPC049 HPC049 None None   E6D, K11T, E28K, K32E, V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPC051 HPC051 None None   E6D, K11T, V35T, K102KQ, K122KE, D123NS, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HPC053 HPC053 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207S, R211S  
HPC055 HPC055 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I202V, E203G, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HPC056 HPC056 None None   E6D, K11T, V35T, K122KE, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPC064 HPC064 None None   I5V, E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPV2_062 HPV2_062 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K64R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207N, R211S, V245E, V254I  
HPV2_064 HPV2_064 None None   I5V, E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPV2_077 HPV2_077 None None  V179D E6D, K11T, V35T, T39D, K122E, D123N, I135K, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E K13R 
HPV2_081 HPV2_081 None None   I5V, E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPV2_086 HPV2_086 None None   E6D, V35T, T39N, V60VI, K122E, D123S, E169EK, K173I, Q174K, D177E, T200A  
HPV2_097 HPV2_097 None None   E6D, K11T, K32I, V35T, T39K, K43Q, K122E, D123S, I135R, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPV2_119 HPV2_119 None None   I5V, E6D, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPV2_123 HPV2_123 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123N, I142V, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211S, K238R, V245E  
HPV2_124 HPV2_124 None None  K101E K11T, V35T, T39I, V60I, S68G, K122E, D123S, I135R, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207G, R211S, K238R, V245E  
HPV2_138 HPV2_138 None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPV2_163 HPV2_163 None None   E6D, V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPV2_184 HPV2_184 None None   K11R, V35T, T39K, K102Q, K122E, D123S, I135T, S162C, Q174E, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
HPV2_197 HPV2_197 None None   E6D, K11T, V35T, T39Q, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, V245E  
HPV2_201 HPV2_201 None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E  
HPV2_203 HPV2_203 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245Q  
HPV2_209 HPV2_209 None None  Y181C E6D, K11T, V35T, K122E, D123N, I135R, S162C, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207S, R211S, V245E  
HPV2_211 HPV2_211 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, T107S, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207S, R211S, K223R, V245E  
HPV2_212 HPV2_212 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207R, R211S, K238R, V245E  
HPV2_213 HPV2_213 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43R, K122E, D123N, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207S, R211S, K238R, V245E  

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