<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Melikian (2012)
Title Standardized comparison of the relative impacts of HIV-1 reverse transcriptase (RT) mutations on nucleoside RT inhibitor susceptibility.
Citation AAC
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedType Lab
NumIsolates 51
Lab Parent Strain NL43, HXB2, , Bru

Lab RT Isolates (including Susceptibility Data)


IsolateNRTIDRMsNNRTIDRMsMethodDrugFold Res.
151-184 Q151M, M184V  PhenoSense 3TC >200 
     PhenoSense ABC 21 
     PhenoSense AZT 2.1 
     PhenoSense D4T 2.4 
     PhenoSense DDI 6.8 
     PhenoSense DLV 1.5 
     PhenoSense EFV 1.2 
     PhenoSense NVP 1.5 
16315SDM D67N, K70R K103N PhenoSense 3TC 4.7 
      PhenoSense ABC 2.4 
      PhenoSense AZT 50 
      PhenoSense D4T 2.4 
      PhenoSense DDI 1.5 
      PhenoSense DLV >200 
      PhenoSense EFV 25 
      PhenoSense ETR 1.2 
      PhenoSense FTC 7.0 
      PhenoSense NVP >200 
      PhenoSense RPV 1.4 
      PhenoSense TDF 2.3 
22101SDM M41L, D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q V108I, Y181C PhenoSense 3TC >200 
      PhenoSense ABC 6.9 
      PhenoSense AZT 448 
      PhenoSense D4T 2.8 
      PhenoSense DDI 2.8 
      PhenoSense DLV >200 
      PhenoSense EFV 6.6 
      PhenoSense ETR 5.6 
      PhenoSense FTC >200 
      PhenoSense NVP >200 
      PhenoSense RPV 2.2 
      PhenoSense TDF 2.6 
2318SDM M41L, D67N, T69D, V75T, L210W, T215Y  PhenoSense 3TC 11 
     PhenoSense ABC 4.4 
     PhenoSense AZT 26 
     PhenoSense D4T 4.5 
     PhenoSense DDI 2.4 
     PhenoSense DLV 0.2 
     PhenoSense EFV 0.4 
     PhenoSense ETR 0.3 
     PhenoSense FTC 14 
     PhenoSense NVP 0.4 
     PhenoSense RPV 0.3 
     PhenoSense TDF 2.0 
41-184-215 M41L, M184V, T215Y  PhenoSense 3TC >200 
     PhenoSense ABC 6.9 
     PhenoSense AZT 1.7 
     PhenoSense D4T 1.3 
     PhenoSense DDI 1.3 
     PhenoSense DLV 0.1 
     PhenoSense EFV 0.3 
     PhenoSense NVP 0.4 
4992SDM D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q K103N, V106A PhenoSense 3TC >200 
      PhenoSense ABC 2.9 
      PhenoSense AZT 1.9 
      PhenoSense D4T 1.1 
      PhenoSense DDI 1.3 
      PhenoSense DLV 76 
      PhenoSense EFV 8.4 
      PhenoSense ETR 0.3 
      PhenoSense FTC >200 
      PhenoSense NVP >200 
      PhenoSense RPV 0.6 
      PhenoSense TDF 0.5 
5321SDM M41L, D67G, K70R, L74I, M184V, T215F, K219Q K103N, Y181C PhenoSense 3TC >200 
      PhenoSense ABC 4.4 
      PhenoSense AZT 3.3 
      PhenoSense D4T 2.2 
      PhenoSense DDI 1.9 
      PhenoSense DLV >200 
      PhenoSense EFV 8.1 
      PhenoSense ETR 1.1 
      PhenoSense FTC >200 
      PhenoSense NVP >200 
      PhenoSense RPV 1.1 
      PhenoSense TDF 0.8 
62-69-215 M41L, A62V, T69S_SA, T215Y  PhenoSense 3TC 8.1 
     PhenoSense ABC 9.7 
     PhenoSense AZT >999 
     PhenoSense D4T 8.0 
     PhenoSense DDI 2.6 
     PhenoSense DLV 0.2 
     PhenoSense EFV 0.3 
     PhenoSense NVP 0.6 
65.74.184 K65R, L74V, M184V  PhenoSense 3TC >200 
     PhenoSense ABC 12 
     PhenoSense AZT 0.3 
     PhenoSense D4T 1.2 
     PhenoSense DDC 4.4 
     PhenoSense DDI 6.7 
     PhenoSense TDF 0.9 
65R+70E K65R, K70E  PhenoSense 3TC 8.8 
     PhenoSense ABC 3.1 
     PhenoSense TDF 2.3 
70E K70E  PhenoSense 3TC 3.4 
     PhenoSense ABC 1.4 
     PhenoSense TDF 1.2 
9881SDM D67N, K70R, K219Q  PhenoSense 3TC 1.7 
     PhenoSense ABC 2.0 
     PhenoSense AZT 80 
     PhenoSense D4T 2.0 
     PhenoSense DDI 1.1 
     PhenoSense DLV 1.4 
     PhenoSense EFV 0.8 
     PhenoSense ETR 0.6 
     PhenoSense FTC 3.3 
     PhenoSense NVP 1.1 
     PhenoSense RPV 0.6 
     PhenoSense TDF 2.9 
HX   PhenoSense 3TC 1.0 
    PhenoSense ABC 0.9 
    PhenoSense AZT 0.8 
    PhenoSense D4T 0.8 
    PhenoSense DDC 0.9 
    PhenoSense DDI 0.8 
    PhenoSense TDF 0.9 
HX-115 Y115F  PhenoSense 3TC 1.6 
     PhenoSense ABC 2.8 
     PhenoSense AZT 0.9 
     PhenoSense D4T 0.8 
     PhenoSense DDC 0.6 
     PhenoSense DDI 0.8 
     PhenoSense TDF 1.3 
HX-115.184 Y115F, M184V  PhenoSense 3TC >200 
     PhenoSense ABC 9.8 
     PhenoSense AZT 0.7 
     PhenoSense D4T 0.9 
     PhenoSense DDC 2.0 
     PhenoSense DDI 2.0 
     PhenoSense TDF 0.9 
HX-184 M184V  PhenoSense 3TC >200 
     PhenoSense ABC 3.9 
     PhenoSense AZT 0.3 
     PhenoSense D4T 0.9 
     PhenoSense DDC 2.0 
     PhenoSense DDI 1.4 
     PhenoSense TDF 0.5 
HX-65 K65R  PhenoSense 3TC 9.7 
     PhenoSense ABC 3.0 
     PhenoSense AZT 0.5 
     PhenoSense D4T 1.8 
     PhenoSense DDC 2.6 
     PhenoSense DDI 2.1 
     PhenoSense TDF 2.1 
HX-65.184 K65R, M184V  PhenoSense 3TC >200 
     PhenoSense ABC 10 
     PhenoSense AZT 0.3 
     PhenoSense D4T 1.0 
     PhenoSense DDC 4.6 
     PhenoSense DDI 3.6 
     PhenoSense TDF 1.2 
HX-74 L74V  PhenoSense 3TC 1.6 
     PhenoSense ABC 2.1 
     PhenoSense AZT 0.4 
     PhenoSense D4T 1.1 
     PhenoSense DDC 1.6 
     PhenoSense DDI 1.5 
     PhenoSense TDF 0.6 
HX-74.184 L74V, M184V  PhenoSense 3TC >200 
     PhenoSense ABC 8.5 
     PhenoSense AZT 0.3 
     PhenoSense D4T 0.9 
     PhenoSense DDC 2.5 
     PhenoSense DDI 2.4 
     PhenoSense TDF 0.4 
Lab122803   PhenoSense 3TC 1.1 
    PhenoSense ABC 0.8 
    PhenoSense AZT 0.7 
    PhenoSense D4T 0.9 
    PhenoSense DDI 0.9 
    PhenoSense DLV 0.9 
    PhenoSense EFV 0.9 
    PhenoSense FTC 1.1 
    PhenoSense NVP 0.9 
    PhenoSense TDF 1.1 
MM-01A K65R  PhenoSense 3TC 9.7 
     PhenoSense ABC 2.3 
     PhenoSense AZT 0.4 
     PhenoSense D4T 1.6 
     PhenoSense DDI 1.6 
     PhenoSense TDF 1.7 
MM-01B K65R  PhenoSense 3TC 9.0 
     PhenoSense ABC 2.4 
     PhenoSense AZT 0.6 
     PhenoSense D4T 1.8 
     PhenoSense DDI 1.6 
     PhenoSense TDF 1.9 
MM-01C A62V, K65R  PhenoSense 3TC 6.3 
     PhenoSense ABC 1.6 
     PhenoSense AZT 0.5 
     PhenoSense D4T 1.4 
     PhenoSense DDI 1.3 
     PhenoSense TDF 1.8 
nnrti-1  L100I PhenoSense DLV 30 
     PhenoSense EFV 10 
     PhenoSense NVP 3.1 
nnrti-10  K101E, G190A PhenoSense DLV 2.0 
     PhenoSense EFV 123 
     PhenoSense NVP >200 
nnrti-11  K101E, G190S PhenoSense DLV 1.4 
     PhenoSense EFV >200 
     PhenoSense NVP >200 
nnrti-12  K103N, Y181C PhenoSense DLV >250 
     PhenoSense EFV 31 
     PhenoSense NVP >200 
nnrti-13  K103N, G190A PhenoSense DLV 37 
     PhenoSense EFV >200 
     PhenoSense NVP >200 
nnrti-2  K101E PhenoSense DLV 4.9 
     PhenoSense EFV 5.0 
     PhenoSense NVP 12 
nnrti-3  K103N PhenoSense DLV 52 
     PhenoSense EFV 26 
     PhenoSense NVP 55 
nnrti-4  V106A PhenoSense DLV 5.0 
     PhenoSense EFV 1.7 
     PhenoSense NVP 64 
nnrti-6  Y181C PhenoSense DLV 35 
     PhenoSense EFV 3.0 
     PhenoSense NVP 161 
nnrti-7  Y188L PhenoSense DLV 9.0 
     PhenoSense EFV 109 
     PhenoSense NVP >200 
nnrti-8  G190A PhenoSense DLV 0.5 
     PhenoSense EFV 7.6 
     PhenoSense NVP 75 
nnrti-9  G190S PhenoSense DLV 0.4 
     PhenoSense EFV 47 
     PhenoSense NVP >200 
nnrti5  V108I PhenoSense DLV 1.3 
     PhenoSense EFV 1.7 
     PhenoSense NVP 3.0 
nrti-1 M41L, T215Y  PhenoSense 3TC 2.0 
     PhenoSense ABC 2.6 
     PhenoSense AZT 11 
     PhenoSense D4T 1.5 
     PhenoSense DDC 1.0 
     PhenoSense DDI 0.9 
     PhenoSense DLV 0.3 
     PhenoSense EFV 0.5 
     PhenoSense NVP 1.0 
nrti-10 M41L, A62V, T69S_SA, L210W, T215Y  PhenoSense 3TC 22 
     PhenoSense ABC 16 
     PhenoSense AZT >1,000 
     PhenoSense D4T 13 
     PhenoSense DDC 2.1 
     PhenoSense DDI 3.0 
     PhenoSense DLV 0.2 
     PhenoSense EFV 0.3 
     PhenoSense NVP 0.6 
nrti-11 Q151M  PhenoSense 3TC 1.4 
     PhenoSense ABC 5.7 
     PhenoSense AZT 7.4 
     PhenoSense D4T 2.9 
     PhenoSense DDC 2.2 
     PhenoSense DDI 6.8 
     PhenoSense DLV 2.7 
     PhenoSense EFV 1.9 
     PhenoSense NVP 1.9 
nrti-12 A62V, V75I, F77L, F116Y, Q151M, M184V  PhenoSense 3TC >200 
     PhenoSense ABC 29 
     PhenoSense AZT 307 
     PhenoSense D4T 12 
     PhenoSense DDC 16 
     PhenoSense DDI 18 
nrti-2 M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q  PhenoSense 3TC 3.0 
     PhenoSense ABC 2.8 
     PhenoSense AZT 55 
     PhenoSense D4T 1.9 
     PhenoSense DDC 0.8 
     PhenoSense DDI 0.9 
     PhenoSense DLV 0.5 
     PhenoSense EFV 0.4 
     PhenoSense NVP 0.5 
nrti-3 M184V  PhenoSense 3TC >200 
     PhenoSense ABC 3.8 
     PhenoSense AZT 0.4 
     PhenoSense D4T 0.8 
     PhenoSense DDC 1.4 
     PhenoSense DDI 0.9 
     PhenoSense DLV 0.6 
     PhenoSense EFV 0.6 
     PhenoSense NVP 0.6 
nrti-4 M184I  PhenoSense 3TC >200 
     PhenoSense ABC 3.1 
     PhenoSense AZT 0.3 
     PhenoSense D4T 0.8 
     PhenoSense DDC 1.5 
     PhenoSense DDI 1.2 
nrti-5 M41L, D67N, K70R, M184V, T215Y, K219Q  PhenoSense 3TC >200 
     PhenoSense ABC 3.4 
     PhenoSense AZT 4.8 
     PhenoSense D4T 1.4 
     PhenoSense DDC 1.8 
     PhenoSense DDI 1.4 
     PhenoSense DLV 0.4 
     PhenoSense EFV 0.3 
     PhenoSense NVP 0.3 
nrti-6 M41L, D67N, K70R, T215Y, K219Q Y181C PhenoSense 3TC 1.1 
      PhenoSense ABC 1.0 
      PhenoSense AZT 7.3 
      PhenoSense D4T 1.4 
      PhenoSense DDC 0.4 
      PhenoSense DDI 0.5 
nrti-7 K65R  PhenoSense 3TC 12 
     PhenoSense ABC 2.6 
     PhenoSense AZT 0.4 
     PhenoSense D4T 1.7 
     PhenoSense DDC 2.5 
     PhenoSense DDI 1.8 
     PhenoSense DLV 1.1 
     PhenoSense EFV 0.8 
     PhenoSense NVP 1.0 
nrti-8 L74V  PhenoSense 3TC 2.6 
     PhenoSense AZT 1.1 
     PhenoSense D4T 0.9 
     PhenoSense DDC 1.2 
     PhenoSense DDI 1.8 
nrti-9 V75T  PhenoSense 3TC 3.5 
     PhenoSense AZT 0.6 
     PhenoSense D4T 1.9 
     PhenoSense DDC 1.4 
     PhenoSense DDI 1.2 
s2301rt   PhenoSense 3TC 1.0 
    PhenoSense ABC 0.7 
    PhenoSense AZT 0.7 
    PhenoSense D4T 0.9 
    PhenoSense DDI 0.9 
    PhenoSense DLV 0.5 
    PhenoSense EFV 0.7 
    PhenoSense NVP 0.5 
    PhenoSense TDF 0.9 
s4199rt   PhenoSense 3TC 1.0 
    PhenoSense ABC 0.8 
    PhenoSense AZT 0.7 
    PhenoSense D4T 0.9 
    PhenoSense DDI 0.9 
    PhenoSense DLV 0.5 
    PhenoSense EFV 0.6 
    PhenoSense NVP 0.5 
    PhenoSense TDF 0.9 

Database

Resources

Team