<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author De Gascun (2012)
Title Human Immunodeficiency Virus Type 1 in Ireland: Phylogenetic Evidence for Risk Group-Specific Subepidemics.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 824
NumPts 824
Subtype B, C, CRF02_AG, G, A, CRF01_AE, D, F, K, J

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SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
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IRL15052 IRL15052 None None   K49KE, E53EQ, Y146X, S162A, K173T, Q174K, I178IM, L187LS, V189VI, D192DH, T200A, Q207E S117S*, D186DH 
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IRL17304 IRL17304 None None   K102KQ, K122E, D123NS, S162SADY, Q174K, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211NS S156S*PQ, K173*PQS, E194EV 
IRL17582 IRL17582 None None   K49R, D123E, I135V, S162A, E169K, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E G45R 
IRL17724 IRL17724 None None   V60I, K104R, K122E, D123N, I135V, T165TI, K173IT, Q174KT, D177E, I178M, T200A, I202IV, Q207N, R211K  
IRL17746 IRL17746 None None   K43E, K46R, K122E, D123S, I142IT, S162CF, K173KNT, Q174K, D177E, Q207ALPV, R211S R143RS, Q145QL, L168LV, E169E*, L209LGVW, G213GDE, D218DY 
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IRL18332 IRL18332 None None   Q145QH, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K, K223KE, E224EG, L228LF S134SIMR, I135*GLV, R143RI, Y146YF, W229WGR 
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IRL23671 IRL23671 None None   I135L, Q145QH, S162A, K173T, Q174EGKR, T200A, Q207E, R211RT N147NI, P157PS 
IRL24786 IRL24786 None None   E53D, D123E, I135V, S162A, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
IRL25181 IRL25181 None None   K43E, S68G, D121H, K122E, D123S, S134SC, I135T, T139A, Q145QE, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S D76DN, E138E*, R143RS, Y144YH, V148VL 
IRL25637 IRL25637 None None   K122E, D123E, I135V, S162AG, S163SR, M164MI, K173T, Q174EG, P176PS, D177E, I178M, I195IL, T200AE, I202IL, E204K, Q207DE, G213GE, F214FL, L228LP, E233ED L80LF, P170PA, R172R*, R199RS 
IRL26149 IRL26149 None None   K122E, I135R, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E  
IRL27010 IRL27010 None None  K103KN, Y188YH D123E, I135L, S162Y, K173T, Q174K, D177E, I195L, T200A, Q207A, R211K I50IF 
IRL27252 IRL27252 None None   V60I, I135L, I142IM, S162AG, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211RK, F214FL S48S*, R143RIS, Q145Q*, V148VL, W153WLMR, E169E*, V189VL, S191SP, P226PQ 
IRL27388 IRL27388 None None   I135V, S162A, K173T, Q174X, D177DE, I178IM, T200A, Q207EGKR, R211K  
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IRL28471 IRL28471 None None   K49KR, V60I, K122E, D123S, R125RK, I135T, Q145QE, V148VG, D177E, I178MV, V179I, Q207K, R211Q N136NT, L168LS 
IRL28857 IRL28857 None None   K43E, E53D, K104Q, K122E, D123S, S134SN, I135T, S162H, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K A129APT, Y144Y*, Q145QP 
IRL29133 IRL29133 None None   K104R, K122E, D123N, I135L, A158S, S162A, K173T, Q174N, T200A, Q207E  
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IRL31485 IRL31485 None None   S48T, V60I, D123E, I135V, S162A, F171Y, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E  
IRL32818 IRL32818 None None   S68G, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, G196E, Q197K, T200A, Q207E, R211K  
IRL32980 IRL32980 None None   K49R, V60I, K101R, K122E, D123N, I142T, E169D, D177E, Q207E  
IRL32981 IRL32981 None None   K49R, V60I, K101KR, K122E, D123NS, I142T, E169D, D177E, Q207E  
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IRL35870 IRL35870 None None   D123E, I135L, I142V, S162H, K166Q, K173I, Q174K, P176S, I195L, G196E, T200A, Q207E, R211K  
IRL35871 IRL35871 None None   D123E, I135L, I142V, S162H, K166Q, K173I, Q174K, P176PS, D177G, I195L, G196E, T200A, Q207E, R211K  
IRL37602 IRL37602 None None   K102R, K122E, D123S, Q145QK, V148VG, A158S, K173LS, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
IRL38424 IRL38424 None None   S48T, K122E, D123S, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207AG, R211RK  
IRL39082 IRL39082 None None   K43KR, D123N, I135T, S162A, K173S, D177G, I178V, V179I, I202V, Q207A, R211K V148VE, V189VL, R206R*IL, G213GDE, D218DY 
IRL39239 IRL39239 None None   V60I, K64R, K102R, K104R, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211E  
IRL39248 IRL39248 None None   K43E, K122E, D123S, I142IV, Q145QH, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
IRL39742 IRL39742 None None   K43E, V60I, D123S, K173T, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211K  
IRL39771 IRL39771 None None   V60I, D121H, K122E, I135T, I142IL, K173AS, Q174K, D177E, I178IV, V179VI, G196GE, T200TA, Q207A, R211S W153W*G 
IRL40236 IRL40236 None None   K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207AD, R211S  
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IRL46667 IRL46667 None None   K43E, K64R, D121Y, K122E, I135V, I142IL, S162A, T165I, K173IT, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214FL L80LF, R125R*KW, G141GR, Y232Y*, E233EK 
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