<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Lazaro (2011)
Title Molecular characterization of HIV-1 CRF01_AE in Mekong Delta, Vietnam, and impact of T-cell epitope mutations on HLA recognition (ANRS 12159).
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 95
NumPts 95
Subtype CRF01_AE, B


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
AG-M10 AG-M10 None None   V35T, T39N, V106I, K122KE, D123DN, I142V, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
AG-M11 AG-M11 None None   V35T, T39E, G112GA, K122E, D123S, K173I, Q174K, I178IM, V179VI, T200I, I202IV, Q207N, R211S, K238R K30KE 
AG-M12 AG-M12 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, S68SG, T69TN, G112A, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211S, K238R K30KE 
AG-M13 AG-M13 None None   V35T, T39N, V106I, D123N, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
AG-M14 AG-M14 None None   K11T, V35T, T39E, V60I, V111VI, K122E, D123NS, K173T, Q174R, D177E, V179I, G196E, T200I, Q207A, R211S, F214FL K30KE 
AG-M15 AG-M15 None None   V35T, T39N, V60I, K122E, D123S, K166KR, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
AG-M16 AG-M16 None None   V35T, T39K, K43E, S68G, K122E, D123S, I135R, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200L, Q207A, R211S, K238R  
AG-M18 AG-M18 None None   V35T, T39K, K43E, V111VI, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, I202IV, Q207A, R211S, K238R K30KE 
AG-M19 AG-M19 None None   V35T, K122E, D123S, S162Y, K173I, Q174K, D177E, I178IM, T200TA, Q207G, R211S, V245E  
AG-M21 AG-M21 None None   V35T, T39K, K43E, S68SG, D86E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
AG-M23 AG-M23 None None   V35T, T39E, G112A, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I180L, Q207A, R211S K30KE 
AG-M24 AG-M24 None None   V35T, T39E, D121A, K122E, D123S, I142IV, K173T, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R K30KE 
AG-M25 AG-M25 None None   V35T, T39K, K43E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R  
AG-M3 AG-M3 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135IT, S162C, K173IT, Q174K, N175Y, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
AG-M5 AG-M5 None None   K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, K166R, Q174E, D177E, Q207R, R211S, K238R K30KE 
AG-M6 AG-M6 None None   V21I, V35T, T39N, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207G, R211S, K238R  
AG-M7 AG-M7 None None   V35T, T39N, V106I, K122E, D123S, I135IV, S162C, K173IM, Q174K, D177E, I178M, G196GE, E203D, Q207A, R211S, K238R  
AG-M8 AG-M8 None None   V21I, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123NS, K166R, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200TA, I202V, Q207A, R211N K30KE 
AGM9_R AGM9_R None None   V35T, K122KE, S162C, K173V, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
DN-M10 DN-M10 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
DN-M11 DN-M11 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207A, R211S L26LV 
DN-M12 DN-M12 None None   I5IN, V35I, K122E, D123S, S162C, E169ED, K173IMRT, Q174K, D177E, G196E, E203ED, Q207A, L210M, R211S, K238R, V245E E6NY 
DN-M13 DN-M13 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, I202IV, Q207N, R211S, K238R, V245E  
DN-M15 DN-M15 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, I47IM, T69TN, V111I, K122E, D123NS, S162C, K173I, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
DN-M16 DN-M16 None None   E6D, P9PR, V35T, T39K, K43E, I47IM, K122E, D123S, S162A, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R, V245E P1PT 
DN-M18 DN-M18 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, V106VI, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207DN, R211S, K238R, V245E  
DN-M2 DN-M2 None None   T7TP, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, G196E, T200S, Q207G, R211S, K238R, V245E, P247PA, I257V  
DN-M21 DN-M21 None None   V35T, T39KN, K122E, D123S, S162C, S163SC, E169D, K173R, Q174N, D177E, I178ILM, T200A, Q207E, R211RS, K238R K30KE 
DN-M22 DN-M22 None None  V179D V35T, T39K, S68G, T69TN, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TA, Q207GS, R211S  
DN-M23 DN-M23 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, N147ND, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207AV, R211S, K238R N136ND, K154KI, G213GE 
DN-M24 DN-M24 None None   V35T, T39K, K43E, V60VI, K122E, D123DGNS, K173T, Q174K, D177E, V179VI, I202IV, Q207A, R211S, K238R  
DN-M26 DN-M26 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162SN, K173I, Q174K, D177E, V179VI, T200TA, I202V, Q207AV, R211S, K238KR  
DN-M3 DN-M3 None None  M230MLRW I2IN, E6D, K11R, V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, W212WR, W229X, K238R K30KE, K223KEGR, E224AGPR, G231GR 
DN-M4 DN-M4 None None   V35T, T39N, K122E, D123NS, S162G, K173I, Q174K, D177E, G196E, Q207A, R211S, K238R  
DN-M6 DN-M6 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43Q, V106I, K122E, D123S, S162C, K173AV, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204ED, Q207KN, R211RIS, K238R, V245D  
DN-M7 DN-M7 None None   E6D, V35T, K46KQ, I50IM, K122E, D123S, S162CY, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211NS, K238R, V245E  
DN-M9 DN-M9 None None   E6D, K11KT, V35IT, T39E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173IL, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207GS, R211S, K238R, V245E  
DT-M1 DT-M1 None None   V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123NS, S162C, F171Y, K173AGRT, Q174K, D177E, I178M, T200TI, Q207A, L210M, R211S, K238R K30KE 
DT-M10 DT-M10 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R V111VIM 
DT-M11 DT-M11 None None   V35T, T39K, K43E, V60I, V106VI, K122E, D123NS, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200IM, Q207A, R211S, K238R  
DT-M12 DT-M12 None None  K103KN, G190GA V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207GS, R211S, K238R, V245E  
DT-M13 DT-M13 None None   V35T, T39E, V106I, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R  
DT-M14 DT-M14 None None   K11R, V35T, T39N, E40D, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R K64KQ 
DT-M15 DT-M15 None None M184MV Y181I K20R, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178V, Q207A, R211S, K238R, V245E  
DT-M16 DT-M16 None None   V35T, T39K, K43KE, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
DT-M17 DT-M17 None None   K20R, K32R, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R  
DT-M18 DT-M18 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173V, Q174QK, N175NH, D177E, G196GR, Q207A, R211N, W212R, K238R F160FC, W229G 
DT-M19 DT-M19 None None  A98AG, Y181YC, Y188YC V35T, T39E, V106I, G112GA, K122E, D123S, I135IT, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179VI, T200TA, Q207A, R211S, K238R  
DT-M20 DT-M20 None None   V35T, T39E, K43KR, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R  
DT-M21 DT-M21 None None  Y181YC V35T, T39N, K122E, D123S, K166R, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207GS, R211S  
DT-M22 DT-M22 None None   V35T, T39K, K49R, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R  
DT-M24 DT-M24 None None  A98AG, K103KN V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, I142V, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179VI, T200A, Q207A, R211S  
DT-M25 DT-M25 None None   V35T, T39K, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, Q207N, R211S, K238R  
DT-M3 DT-M3 None None   V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
DT-M4 DT-M4 None None   V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, T165I, K173R, Q174K, D177E, G196GE, T200TA, E203ED, Q207A, R211S K30KE 
DT-M8 DT-M8 None None  Y181YC I31IL, V35T, T39EK, K43KE, K102Q, K104R, D121DH, K122E, I135R, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E K30KE, P55PT 
DT-M9 DT-M9 None None K65R Y181C I31IL, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, I142V, A158T, K173I, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, K238R, V245D L26LW, K30KE 
TG-M1 TG-M1 None None   V21VI, V35T, T39K, K43Q, V60I, K101R, K122E, D123E, S162C, G196E, T200I, Q207H, R211K  
TG-M11 TG-M11 None None   E6D, K11T, E28EA, V35I, V111I, K122E, D123GS, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207AD, R211S, K238R, V245E  
TG-M12 TG-M12 None None   I5T, E6ED, V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, S162C, K173KR, Q174R, D177E, I178M, T200TI, Q207A, R211S, K238R, V245E H96HN 
TG-M14 TG-M14 None None  V179D I31IL, V35T, T39N, V106VI, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E V111VIM 
TG-M15 TG-M15 None None   V35T, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207S, R211S, K238R, V245E L246W 
TG-M16 TG-M16 None None   V35T, T39K, K43E, T69TA, V111VI, K122E, D123NS, S162C, E169D, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, G196GE, T200TA, Q207A, R211S, F214FL, K238R  
TG-M17 TG-M17 None None   V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178IM, Q207S, R211S  
TG-M18 TG-M18 None None   V35T, T39N, V106I, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R  
TG-M19 TG-M19 None None   V35T, T39E, K122E, D123NS, I135R, I142IV, S162C, K173IT, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211K, K238R K30KE 
TG-M2 TG-M2 None None   K11T, V35T, T39K, S68G, D123DN, S162C, K173IV, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
TG-M20 TG-M20 None None   V35T, T39K, K43E, V118VI, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R K30KE 
TG-M21 TG-M21 None None   G18D, K32E, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200TA, Q207S, R211S, W212WR, K238R  
TG-M23 TG-M23 None None   V35T, T39E, K122E, D123N, I142IV, K173IT, Q174K, D177E, G196GE, T200IR, Q207N, R211S, K238R  
TG-M24 TG-M24 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, V179I, Q207A, R211S, K238R P19Q 
TG-M3 TG-M3 None None   E6D, V35T, T39N, T69N, K122E, D123S, I142V, S162C, F171FY, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S, K238S, V245E, D256E  
TG-M4 TG-M4 None None   E6D, K22R, V35T, T39K, K43E, K49KR, T69TN, K102KNRS, K122E, D123S, I135V, S162C, K173I, Q174K, V179VI, Q207A, R211RS, K238R, V245E D110DY 
TG-M5 TG-M5 None None   V35T, T39DN, K122E, D123S, S162CY, S163SC, E169ED, K173AV, Q174K, D177E, Q207NS, R211S, K238R, V245E  
TG-M6 TG-M6 None None   K22R, V35T, T39N, V60I, T107S, K122E, D123S, T165I, K173AT, Q174K, D177DE, G196E, T200ILM, Q207A, R211S, D237DE, K238KR, Q242P, P243A, V245E K201KE, H208HN, Q222QP 
TG-M8 TG-M8 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R, V245Q  
VT-M10 VT-M10 None None   E6D, K11T, K32I, V35T, T39TK, D123NS, K173I, Q174K, D177E, V179VI, G196GE, T200TI, Q207A, R211NS, K238R, V245E  
VT-M12 VT-M12 None None   V35T, T69TS, K122E, D123N, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211S, K238R K30KE 
VT-M13 VT-M13 None None   V35T, K122E, D123S, I135T, S162C, K173IV, Q174K, D177E, T200TA, Q207A, R211S, K238R  
VT-M14 VT-M14 None None   V35T, T39K, K102KQ, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TA, K201KR, Q207KNRS, R211S, V245E  
VT-M15 VT-M15 None None   V35I, T39TAEK, K122E, D123N, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R  
VT-M16 VT-M16 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I142V, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245K K30KE, W239WR 
VT-M17 VT-M17 None None   K22R, V35T, V60I, V106VI, K122E, D123S, S162SC, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TA, Q207A, R211S  
VT-M19 VT-M19 None None   V35T, T39DE, V60VI, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, T200TA, Q207A, R211S, K238R  
VT-M2 VT-M2 None None   V35T, K122KE, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
VT-M20 VT-M20 None None   E6D, K11T, V35T, T39TAEK, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E K30KE, K126M 
VT-M21 VT-M21 None None   E6D, V35T, T39K, K43Q, K122E, D123S, S162C, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245Q  
VT-M22 VT-M22 None None   V35T, T39K, K43E, K122KE, D123NS, K166KN, K173I, Q174KN, D177E, V179I, I202V, Q207A, R211S, K238R  
VT-M23 VT-M23 None None   V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179VI, T200I, Q207A, R211S  
VT-M24 VT-M24 None None   V35T, T39N, K122E, D123S, I142V, S162C, K173I, Q174K, D177E, V179VI, T200A, Q207A, R211S, K238R  
VT-M25 VT-M25 None None   E6D, V35T, T39K, K43Q, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R, T240S, V245Q  
VT-M3 VT-M3 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173RT, Q174K, D177E, T200TA, Q207S, R211S, K238R  
VT-M4 VT-M4 None None  V179VD V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173RT, Q174QK, D177E, Q207S, R211S, K238R T131TS 
VT-M7 VT-M7 None None   I31IT, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R K30KE 
VT-M8 VT-M8 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123NS, I142IV, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E K30KE