Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Karlsson (2012)
Title Low prevalence of transmitted drug resistance in patients newly diagnosed with HIV-1 infection in Sweden 2003-2010.
Citation PLoS ONE
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 208
NumPts 208
Subtype B, CRF01_AE, C, A, CRF02_AG, D, F, G, CRF06_cpx, CRF12_BF, CRF10_CD, CRF24_BG


  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 208 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
SE_10 SE_10 None None   S68G, T69N, K122E, D123N, I135T, T165TI, D177E, G196Q, Q197L, E204D, R211K, V245N  
SE_100 SE_100 None None   E6D, K32I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, E169D, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SE_101 SE_101 None None   E6D, V21I, V35T, T39K, K43KE, V60I, K122E, D123N, I135L, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204KQ, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SE_102 SE_102 None None   E6D, K49R, R83RK, K104N, I135IATV, D177E, T200A, Q207K, R211A, P247Q L246C 
SE_103 SE_103 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
SE_104 SE_104 None None   V35T, D121H, K122E, I135V, S162C, I178L, V245K  
SE_105 SE_105 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, E40D, K122E, D123S, S162SDGN, K166KR, K173IR, Q174K, T200TI, Q207A, L210LF, R211S, V245K, K249Q  
SE_107 SE_107 None None   K22R, V35T, V60I, K104R, D121H, K122E, I135T, D177E, I178M, T200I, Q207EG, R211K, V245K, D250E  
SE_109 SE_109 None None   V8I, V35T, E36A, T39E, S48T, K122KE, D123E, A158S, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V241A, Q242P, V245Q H235HR 
SE_11 SE_11 None None K219R  E6D, R83K, K104N, D177E, T200A, I202V, Q207K, R211A  
SE_110 SE_110 None None   E6D, V8I, V35T, T39K, K43E, K49R, V60I, K122E, D123S, I135IR, K173I, Q174K, D177E, I178IM, V179VI, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SE_111 SE_111 None None   E6D, V8I, V21VI, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123S, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S, V245E K11K*ST 
SE_114 SE_114 None None   V60I, E138A, I142V, R211K  
SE_115 SE_115 None None   V35T, E36D, E40D, D121HY, K122KE, I135V, S162A, K173IT, Q174A, D177E, T200A, Q207E, R211K, P243A, V245Q  
SE_116 SE_116 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123DN, I135T, K173A, G196KN, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, E248N  
SE_118 SE_118 None None   V35VI, D123E, I135T, S162C, E169ED, Q174KR, D177DE, I178M, G196E, T200TA, Q207K, R211A, V245VM, D250E  
SE_119 SE_119 None None   V35I, R83K, K122E, A158S, G196E, Q207E  
SE_12 SE_12 None None   E6D, K32I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, E169D, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SE_121 SE_121 None None   T39A, D123E, I142T, Q174N, T200A, I202V, Q207A, R211K  
SE_122 SE_122 None None   V21I, V35T, T39TILS, V60I, K122E, D123S, I135T, I142V, K173L, Q174K, T200I, I202V, Q207A, R211S, V245E, D250E  
SE_123 SE_123 None None   E6D, K11T, K20KR, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123NS, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SE_124 SE_124 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K49R, S68SG, K122KE, D123S, K173I, Q174K, V179I, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SE_125 SE_125 None None   I50V, I135L, I142M, S162C, D177E, I178M, T200A, Q207E, L228R, V245E  
SE_126 SE_126 None None   K20KR, A98S, D123E, S162N, D177E, I178IM, Q207E  
SE_128 SE_128 None None  K103N D123E, T165I, D177N, Q197E, T200A, Q207E, L210M, R211K, F214L, V245VM  
SE_129 SE_129 None None   K20R, K101Q, I135R, T165I, I178M, T200A  
SE_13 SE_13 None None   K64R, D123E, I135R, S162C, I178L, V179I  
SE_130 SE_130 None None   R83K, V90I, D123E, I135T, I178M, V245M  
SE_132 SE_132 None None   K11T, K20R, V35T, K102Q, K122KAET, D123DN, K173LS, D177E, V179I, T200V, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D  
SE_133 SE_133 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D123E, I135M, S162Y, K173T, D177A, G196K, T200A, Q207E, R211K, I244V, V245Q, D250E  
SE_135 SE_135 None None   V35T, D121H, K122E, I135V, S162A, K173A, Q174A, D177E, T200A, Q207G, R211RK, V245K  
SE_136 SE_136 None None  E138K K20R, V35T, E36ED, T39TA, V60VI, K101Q, K122E, I135IV, S162A, T165I, K173T, Q174KR, T200V, I202V, Q207D, R211K, V245Q, D250E P243HN 
SE_137 SE_137 None None   E6D, L12*, K49R, R83K, S162C, N175H, T200A, Q207K, R211A  
SE_138 SE_138 None None   T39A, D123E, I142T, T165I, Q174N, D177DE, I178IL, T200A, I202V, Q207A, R211K  
SE_14 SE_14 None None   V35M, D123E, T200A, E204EA, Q207D, R211K  
SE_140 SE_140 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, D121DN, K122E, D123S, I135L, R172K, K173I, Q174K, D177E, I178M, R211H, K238R, V245T E233EK, W239W* 
SE_143 SE_143 None None  V179D K11E, S68G, T69N, D121H, K122E, D123S, I135T, E169ED, G196E, R211AT  
SE_15 SE_15 None None   V35T, V60I, D123E, I135T, S162H, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, E248D, D250E, S251D  
SE_16 SE_16 None None  K103N, K238T D123E, I135L, E138G, Q197R, T200A, Q207E, R211K  
SE_17 SE_17 None None   E6D, K32I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, E169D, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SE_19 SE_19 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, E40D, K122E, D123S, T139A, I142V, K166R, K173AT, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q D250V 
SE_21 SE_21 None None D67DN, K219Q  V35T, T39A, E40D, V60I, V106I, D123E, I135L, E138EG, I142IT, S162Y, K173T, Q174K, D177DE, I178ILV, I195L, T200A, Q207A, R211T, F214L, L228HQ, V245Q, E248D  
SE_22 SE_22 None None   V35T, E36A, T39E, A98S, D121DH, K122EV, D123NS, A158S, K173T, D177E, T200A, E203D, Q207E, R211RK, V245Q  
SE_25 SE_25 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135IT, I142V, K173RT, Q174K, T200V, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
SE_26 SE_26 None None   V35K, E36A, T39E, S48T, E53D, K122E, D123S, K173A, D177E, G196K, T200E, I202V, E204EG, Q207E, L210LS, R211K, V245Q  
SE_28 SE_28 None None   V8I, V35K, T39E, S48T, K49R, V60I, K122E, D123DG, S162C, E169A, K173A, Q174R, D177E, I178L, T200A, I202V, Q207D, R211K, V245Q, E248D  
SE_29 SE_29 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123S, I135T, S162A, K166KR, K173A, G196K, Q197E, T200A, Q207E, V245Q  
SE_30 SE_30 None None   T39A, D123E, I142T, Q174N, T200A, I202V, Q207A, R211K  
SE_31 SE_31 None None   V35T, E36A, K43KE, K122E, D123G, A158AS, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248N, D250E H198HQ 
SE_32 SE_32 None None   V35T, T39R, K43E, K49KR, V60I, K122E, D123S, I135T, I142L, T165I, K173S, Q174K, D177E, I178V, V179IT, Q197L, I202V, Q207A, V245K, D250E  
SE_34 SE_34 None None   E28A, V35T, E40D, K49R, V60I, D121H, K122E, I135T, S162C, K173L, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, V245I, E248D, D250E  
SE_35 SE_35 None None   V21VI, K49R, K101Q, K122E, D123S, I135R, T200I, Q207K, R211E  
SE_37 SE_37 None None   K20R, V35T, V60I, K122E, D123N, I135T, S162SN, K173T, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E, S251N  
SE_38 SE_38 None None   E28A, K32E, V35T, E36A, T39A, S48T, K122E, D123S, I135T, E138A, S162C, E169A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E  
SE_40 SE_40 None None   K122E, Q207E, V245E  
SE_41 SE_41 None None   E6D, R83K, K104N, T165I, D177E, T200A, I202V, Q207K, R211A, E248EK  
SE_42 SE_42 None None   V35T, T39E, E40D, S48T, K122E, D123S, I135T, K173A, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q  
SE_44 SE_44 None None   V35I, V60I, S68G, D123E, I135T, G196GE, H208HY, R211K  
SE_45 SE_45 None None   V60I, S68G, V106I, D123E, I135T, S162A, I178L, I195L, T200A, Q207E, R211K D17DN, W71W*, D76DN 
SE_46 SE_46 None None   K64KR, D123E, I135T, S162C, K173R, Q174H, D177E, I178L, Q207E, R211K, V245VM Y146YC 
SE_48 SE_48 None None   V35T, T39A, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, I142V, K166R, K173A, D177E, I178V, V179I, T200TA, E204Q, Q207D, R211K, V245K, E248Q, D250E  
SE_49 SE_49 None None V75VL  V8VI, V35VI, R83K, D123E, D177E, V245Q  
SE_5 SE_5 None None   V35I, R83K, D123E, E169D, Q207H, R211K, P243H  
SE_50 SE_50 None None  E138K V35I, K64R, K122Q, S162C, K173KR, R211K  
SE_51 SE_51 None None   E6D, V35T, V60VI, K64KR, K122E, D123GS, T165I, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, V245E  
SE_52 SE_52 None None   V90I, A98S, D123E, I180V, R211Q, E248D, D250E  
SE_53 SE_53 None None   V35T, E36ED, T39AS, E40D, K122E, D123S, I135T, K173A, D177E, V179I, Q207K, R211S, F214L, V245T  
SE_55 SE_55 None None   K22R, I135M, K173T, Q197P, T200A, R211K, F214L, V245M  
SE_56 SE_56 None None   E6D, K11R, V35T, T39K, V60I, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245K  
SE_57 SE_57 None None   V35I, R83K, K122E, I178IV, Q207E, R211K  
SE_58 SE_58 None None   K20R, K101Q, I135R, T165I, Q174H, T200A, R211Q, F214L  
SE_59 SE_59 None None   E6D, K11A, V35T, T39K, K43E, K122E, D123N, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196GE, T200AE, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SE_6 SE_6 None None   E6D, K32I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, E169D, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SE_60 SE_60 None None   V35I, R83K, K122E, G196E, Q207E  
SE_61 SE_61 None None   K11KR, K122E, T200V, V245E  
SE_62 SE_62 None None   E6D, K32I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, E169D, K173A, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
SE_63 SE_63 None None   E6D, R83K, K104N, D177E, T200A, I202V, Q207K, R211A  
SE_65 SE_65 None None   D123E, I142T, Q174N, D177N, T200A, I202V, Q207A, R211K  
SE_69 SE_69 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, E204EK, Q207E, R211K, E248N G18GS 
SE_72 SE_72 None None M41ML, L210W, T215D  V35VAIT, V60I, S68G, V106VI, K122E, D123N, A158S, Q174H, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q Q182QH 
SE_74 SE_74 None None   V35T, T39G, V60I, V90I, V118I, I135T, I142K, S162A, T165I, K173T, Q174S, T200E, Q207E, R211K, F214L, V245K  
SE_77 SE_77 None None   R83K, D123E, I178IM, T200TA, V245E  
SE_79 SE_79 None None   K11T, V35T, E36ED, T39N, K122E, D123S, A158AS, S162C, K173LS, Q174R, D177E, I178L, T200K, Q207A, R211S, V245M, E248D  
SE_8 SE_8 None None   V35I, R83K, K122E, G196E, Q207E  
SE_82 SE_82 None None   K22R, V35T, V60I, D123N, K166R, D177E, T200I, Q207E, R211K, V245E, D250E  
SE_83 SE_83 None None   V35T, E36A, T39E, K43KR, S48T, K122E, D123N, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, F214L, V245Q  
SE_84 SE_84 None None   K32KI, V35K, T39E, A98S, K122E, D123S, I135R, K173AT, D177E, I178IV, T200E, I202V, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
SE_86 SE_86 None None  E138K K20R, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123N, I135T, S162C, K173A, G196K, Q197L, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, E248D G45GR, W71W* 
SE_87 SE_87 None None   K122E, I135T, S162C, T200A, V245M  
SE_88 SE_88 None None  V108I K11KT, V35T, E36A, T39E, K64KR, D123S, K173T, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, P243S, V245Q, K249Q  
SE_89 SE_89 None None   E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, S162CY, K173A, Q174K, N175NY, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D T253TNS 
SE_9 SE_9 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, D123N, I142V, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, F214L, V245T  
SE_90 SE_90 None None   D123E, I135T, D177E, R211Q, V245T  
SE_91 SE_91 None None   V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, V179I, T200TI, I202V, Q207AD, L210LF, R211K, V245E, E248D, D250E  
SE_92 SE_92 None None   E6D, K49R, R83K, I135T, S162C, N175H, T200A, Q207K, R211A  
SE_93 SE_93 None None   I202V, R211K, V245K  
SE_95 SE_95 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K49KR, K122E, D123N, K173S, Q174K, D177E, V179VI, T200A, Q207E, R211KQ, V245Q, E248D, D250S  
SE_96 SE_96 None None   V90VI, A98S, D123E, I180V, R211Q, E248D, D250E  
SE_98 SE_98 None None   R83K, S162H, K166R, E169D, G196E, Q207H, R211K, I244V  
SE_99 SE_99 None None   A98S, V106I, I135V, S162C, I178L, E203ED, R211G