Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Germanaud (2010)
Title Level of viral load and antiretroviral resistance after 6 months of non-nucleoside reverse transcriptase inhibitor first-line treatment in HIV-1-infected children in Mali
Citation AAC
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 30
NumPts 30
Subtype CRF02_AG, A, CRF06_cpx, C, B, CRF09_cpx


Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
5492 5492 AZT, 3TC NVP M184V Y188L V21I, V35T, E36D, T39A, V60I, K122E, D123S, I135V, S162A, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207G, R211K  
5494 5494 AZT, 3TC NVP M184V Y181C V35T, E40D, K49R, K122E, D123N, I135T, T139R, S162A, E169Q, K173D, Q174K, N175Y, D177E, T200A, Q207G, R211K  
5495 5495 AZT, 3TC NVP M184V  V35T, T39L, S48T, V90I, K122E, S162A, K173T, Q174K, D177Q, V189I, T200A, Q207E, R211K  
5505 5505 AZT, 3TC NVP M184V K103N K22N, V35T, V60I, K122E, I135L, E138A, K173N, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211K  
5513 5513 AZT, 3TC NVP   V21I, V35T, T39A, V60I, D121Y, K122E, E138A, I142V, S162Y, K173S, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211K  
5518 5518 AZT, 3TC NVP M184V K103N E28R, K32E, V35T, E36D, T39N, V60I, V90I, D123N, I135V, T139R, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
5519 5519 AZT, 3TC NVP M184V K103N V35T, E36D, V60I, V90I, I135V, E138Q, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K  
5531 5531 AZT, 3TC NVP K70R, M184V Y188L V35T, T39A, V60I, K64R, K102E, D123E, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E  
5533 5533 AZT, 3TC NVP M184V K103N V35T, E36D, K122E, D123N, I135T, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V241I  
5568 5568 AZT, 3TC NVP M184V K101E, Y181C K20R, K22N, V35T, E36D, T39M, K49R, V90I, I135T, S162A, P170L, R172K, K173A, Q174E, D177E, I178M, T200A, K201R, E204K, Q207E, R211K  
5574 5574 AZT, 3TC NVP M184V G190A T27S, V35T, E36D, T39L, V90I, I135M, S162A, E169Q, K173T, Q174E, D177E, T200A, E203K, Q207E, R211K K220R 
5578 5578 AZT, 3TC NVP T215P  V35T, E36A, T39K, K43E, V60I, S68G, K122P, D123N, I135V, E138A, T139A, I142V, S162H, K173S, Q174H, D177E, I178L, V179M, E194Q, T200I, Q207A V106T 
5582 5582 AZT, 3TC NVP M184V K103N, G190A V21I, V35T, T39A, K122E, D123N, I135T, K173T, Q174K, D177E, I195L, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245E, E248D, D250E  
5588 5588 AZT, 3TC NVP M184V V106A, F227L V35T, V60I, I135L, S162A, K173I, Q174K, D177E, I178V, G196E, T200A, E204G, Q207E, V245Q L209LF 
5590 5590 AZT, 3TC NVP   V35T, T39A, E40D, S68G, D123E, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, F214L, V245M G18A, P19Q 
5593 5593 AZT, 3TC NVP M184V K103N, Y181C V35T, K43E, K49R, V90I, K101R, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I180V, T200A, Q207E, V245Q N57H, Q222R 
5597 5597 AZT, 3TC NVP   V21I, V35T, T39M, V60I, D121H, K122E, Q174K, D177E, I178V, T200A, I202V, Q207E, V245Q, E248N  
5599 5599 AZT, 3TC NVP   V35K, E36D, T39A, S68G, K122T, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
5600 5600 AZT, 3TC NVP M184V K103N, Y181C, G190A V35T, E40D, V60I, V90I, K101Q, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, Q207E, V245Q L26W 
5609 5609 AZT, 3TC NVP D67N Y181C V35T, V60I, K122E, D123N, R172K, K173V, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, H221Y, V245Q, D250T K201E 
5621 5621 AZT, 3TC NVP L210W K103N V21G, V35T, E36D, K122P, I135V, E138A, S162A, K173T, Q174N, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211T, V245Q L26W 
5626 5626 AZT, 3TC NVP  K103N V35T, E36A, T39D, D121H, D123S, K173A, Q174K, Q197E, T200A, Q207D, L210F, R211K  
5628 5628 AZT, 3TC NVP D67G  V21I, V35T, T39R, V60I, D121N, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, I195L, T200A, Q207E, P243A, V245Q, E248D V106G 
5630 5630 AZT, 3TC NVP   E28A, V35T, T39K, K43E, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, I142V, S162A, E169D, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
5632 5632 AZT, 3TC NVP M184V A98G, K103N V35T, K49R, D121H, K122E, D123N, I135L, S162A, E169K, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q, E248D, D250E  
5636 5636 AZT, 3TC NVP M184V V106A T7I, E42D, E44K, G45E, V90I, D123E, S162A, Q174E, D177E, T200A K66N 
5653 5653 AZT, 3TC NVP M184I K103N I31L, V35T, E36S, T39A, K43S, S162A, Q174G, T200E, Q207E, R211K, V245Q  
5665 5665 AZT, 3TC NVP M184V V106M, G190A V35T, E36D, V90I, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, E248D  
5674 5674 AZT, 3TC NVP   V35T, E36D, K49R, V60I, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245M  
5676 5676 AZT, 3TC NVP M184V Y188L I5V, K11T, V35T, E36T, T39K, K43E, K102Q, D123N, I142V, S162Y, K173A, D177E, V179I, E194D, I202V, Q207A, R211K, V245Q