<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Nwobegahay (2011)
Title Prevalence of antiretroviral drug resistance mutations and HIV-I subtypes among newly-diagnosed drug-naive persons visiting a voluntary testing and counselling centre in northeastern South Africa.
Citation J Health Popul Nutr
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 54
NumPts 54
Subtype C, CRF11_cpx, B


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
08MB02ZA 08MB02ZA None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207K, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, I329L, Q334D, G335D, R356K, M357K, R358K, G359S, E370D, K374Q, T377R, K390R, E399D, A400T, T403A, E404D, E432D, R448K, E449K  
08MB03ZA 08MB03ZA None None   K20R, V35T, T39E, E40D, V118I, K122E, D123N, I135R, K173A, D177E, G196R, T200A, Q207K, R211K, F214L, V245K, D250E, K275R, T286A, E291D, V292I, I293V  
08MB04ZA 08MB04ZA None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, W88S, K122E, D123G, I142V, T165I, K173A, Q174K, D177E, I178L, G196E, T200A, Q207E, F214L, V245Q, A272S, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, D320N C38W, Y319L 
08MB05ZA 08MB05ZA None None   E28K, K32E, V35T, E36A, T39K, S48T, K122E, D123G, T139A, I142K, K173V, Q174N, D177G, V179I, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272S, K277R, L283I, V292I, I293V, D320N, S322I R143E, Y319L 
08MB07ZA 08MB07ZA None None   V35T, T39A, S48T, K122E, D123G, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248T, A272P, K277R, E291D, I293V, T296N  
08MB08ZA 08MB08ZA None None   K102Q, S162C  
08MB09ZA 08MB09ZA None None   P4S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, S162A, K173A, Q174K, D177E, Q197H, T200A, Q207E, R211K, V245K, K275Q, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
08MB14ZA 08MB14ZA None None M184L  V35T, E36A, T39E, K173E, D177K, R199K, T200G F171I, Y183F 
08MB18ZA 08MB18ZA None None   V35T, T39E, S48T, A98S, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177G, T200A, Q207E, R211K, L228H, V245S, I257L, V261I, A272P, K277R I244Y 
08MB19ZA 08MB19ZA None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123G, K173T, D177E, T200A, Q207E, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
08MB20ZA 08MB20ZA None None   V35T, T39A, S48T, K122E, D123G, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207N  
08MB21ZA 08MB21ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, I135T, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, R211K, V245Q, A272P, T286A  
08MB22ZA 08MB22ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245P, E248N, A272P, K275R, K277R, Q278N, T286A, E291D, V292I, I293V, I329V, Q334H, G335D  
08MB23ZA 08MB23ZA None None  A98G, V179D V35K, T39E, S48T, K173A, Q174H, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K, A272P, K277R, E291D, V292I, P313A  
08MB24ZA 08MB24ZA None None   K32R, V35T, T39Q, S48T, V60I, K122E, D123E, K173A, Q174K, D177E, Q207G, R211K, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V, Q334H, G335D  
08MB25ZA 08MB25ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135V, T139A, T165I, Q174K, T200A, Q207E, F214L  
08MB26ZA 08MB26ZA None None D67G  I5V, E6D, V35T, T39L, T69S, K122E, D123N, K173T, D177G S68Q 
08MB27ZA 08MB27ZA None None T69D  K11Q, V35T, E36A, T39E, S48T, S68G, D121Y, K122E, I135R, S162C, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245P, E248D  
08MB29ZA 08MB29ZA None None T215Y  V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, E203K, Q207N, H208P, R211K, F214I, F227I T216H, P217T 
08MB30ZA 08MB30ZA None None   K32N, V35K, E36A, T39E, S48T, E53D, V60I, K122E, D123S, S162F, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E  
08MB32ZA 08MB32ZA None None   K173T, D177E, T200A, Q207A, P243A, V245Q, A272P, K277R, V292I, I293V, Q334H, G335D, R356K, G359T, T377Q, K390R, A400T, E404D  
08MB34ZA 08MB34ZA None None   V35T, T39E, S48T, E53D, V118I, K122E, D123G, E138A, T139A, I142V, K173A, Q174K, D177Q, V179I, G196E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
08MB37ZA 08MB37ZA None None   L34I, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
08MB38ZA 08MB38ZA None None D67E, K70V  V35T, E36A, T39E, S48T, T69S, K122E, D123N, I142V, S162C, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K I63L, S68P, W71Q 
08MB41ZA 08MB41ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
08MB42ZA 08MB42ZA None None   L34I, V35P, E36A, T39E, E53D, D121H, K122E, I142V, K173A, T200A, Q207E, V245Q, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, E308K  
08MB43ZA 08MB43ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, T131P  
08MB45ZA 08MB45ZA None None   V35T, E36A, T39E, A98S, K122E, D123N, K173E, D177E, Q197L, T200A  
08MB46ZA 08MB46ZA None None   V8I, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, R125K, I135V, K173A, Q174K, D177E, Q207K, R211Q  
08MB47ZA 08MB47ZA None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, T200A, E204Q, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, K275Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
08MB48ZA 08MB48ZA None None   V35T, T39E, S162C, K173A, T200A, Q207S, R211K, V245Q  
08MB49ZA 08MB49ZA None None   K20R, V35T, T39K, S48T, V60I, K102Q, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V E204M 
08MB50ZA 08MB50ZA None None   P4S, V35T, T39E, S48T, I50M, V60I, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245A, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V G51R 
08MB51ZA 08MB51ZA None None   E6A, V35T, T39E, S48T, K122E, D123G  
08MB52ZA 08MB52ZA None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123N, K173T, T200A, Q207D, R211K, A272P, E291D, V292I, I293V, A304E, Q334H, G335D  
08MB55ZA 08MB55ZA None None   V35T, E36A, T39E, K82R, W88C, K122E, D123G, K173T, Q174K, T200A, E203D, Q207A, R211K, V245Q, D250E, A272S, K281R, V292I, I293V, S322T, I329L, Q334H, G335D  
08MB56ZA 08MB56ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, K122E, D123S, K173T, Q174K, T200A, Q207A, R211K, V245L, D250E, S251V, A272P, K277R, L283I, T286V, E291D, V292I, I293V, D324E, I329L  
08MB57ZA 08MB57ZA None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, K173N, Q174K, D177E, I178V, G196E, Q207E, V245Q, I257V, A272P, K275R, Q278N, T286A, E291D, V292I, I293V, A304E  
08MB58ZA 08MB58ZA None None   K22R, K32R, V35P, E36A, T39E, S48T, V118I, K122E, D123S, E138A, K173T, I202V, Q207A, R211K, F214L, V245E, A272K, E291D, V292I, I293V, Q334N, G335D L34V 
08MB59ZA 08MB59ZA None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123N, K173A, D177G, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I  
08MB60ZA 08MB60ZA None None   V35T, T39E, S48T, K82R, A98S, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K, V245T, A272P, V292I, I293V R284M, N306I 
08MB61ZA 08MB61ZA None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123N, K173A, G196E, T200A, E204K, Q207E, F214L, V245M, E248N, I257L, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, Q334H, G335D, R356K, G359T  
08MB62ZA 08MB62ZA None None   V35T, E36T, T39E, S48T, V118I, K122E, D123N, T165I, K173T, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, K275Q, K277R, E291D, V292I, I293V  
08MB63ZA 08MB63ZA None None   K20R, V35M, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174N, D177E, G196A, T200A, Q207E, R211K, V245Q, I257V, A272P, Q278H, K281R, E291D, I293V  
08MB64ZA 08MB64ZA None None   P4S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, I135T, T165I, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E  
08MB65ZA 08MB65ZA None None   K20R, V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
08MB66ZA 08MB66ZA None None   V35T, T39D, K122E, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207K, R211K  
08MB67ZA 08MB67ZA None None   P4S, V35T, E36S, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, I135T, S163T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, D250E, A272P, K277R, L279M, T286A, E291D, V292I, I293V  
08MB68ZA 08MB68ZA None None   V35T, E36A, T39E, K122A, D123S, K166R, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248R, D250E L246A, P247Y 
08MB69ZA 08MB69ZA None None   K11R, V35T, T39K, S48T, V60I, K173T, Q174K, D177E, E194Q, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245L, A272P, Q278H, T286A, E291D, V292I, Q334N, G335D  
08MB71ZA 08MB71ZA None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, S162C, E169D, K173R, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V E248C, R307M 
08MB73ZA 08MB73ZA None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, K173A, T200A, Q207E, K238R, V245A, E248D, A272S, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, H315Y, Q334D, G335D  
08MB74ZA 08MB74ZA None None   K20R, V35T, E36A, T39D, V60I, W88C, E138A, K173A, Q174K, T200A, Q207N, R211S, F214L, V245L, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, K311R, Q334N, G335D I244N 
08MB77ZA 08MB77ZA None None   V35K, T39E, K43R, S48T, K122E