<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ferradini (2011)
Title High efficacy of lopinavir/r-based second-line antiretroviral treatment after 24 months of follow up at ESTHER/Calmette Hospital in Phnom Penh, Cambodia.
Citation J Int AIDS Soc
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 43
NumPts 43
Subtype CRF01_AE, B

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
10 0080RT D4T, 3TC EFV M184V, T215Y K103N, P225H I31L, V35T, T39E, V90VI, K122E, D123S, E138EG, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S  
11 0123RT AZT, 3TC NVP M184V, L210LW, T215F K101P, G190A E28A, V35T, K122E, D123S, I135T, K173T, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, K238R  
12 0332RT Unknown Unknown D67N, M184V, T215Y, K219N K103N, V108I, M230L V35T, T39E, E44D, V106I, V118I, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207E, L210S, L228H, D237G  
13 0187RT AZT, 3TC NVP V75L, F77L, M184V, T215Y K103N, M230L V35T, T39K, K43E, D86E, K122E, D123N, I135T, K173R, Q174K, I178M, T200A, Q207A, R211S  
14 0116RT AZT, 3TC NVP D67N, M184V A98G, K103N V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R  
15 0030RT AZT, 3TC NVP M41L, K70R, M184V, T215F, K219Q A98G, K101E, V108I, Y181C, G190A L34I, V35T, T39E, T69N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207D, R211K, H221Y, L228R, K238R  
16 0191RT AZT, 3TC EFV M41L, D67N, K70R, L74I, M184V, T215F, K219Q A98G, K101P, K103N V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123N, I142V, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207A, R211S, K238R  
17 0113RT AZT, 3TC NVP M41L, D67N, K70R, V75I, M184V, T215F, K219E A98G, K103N, V108I, M230L V35T, T39K, K43E, W88S, K122E, D123N, Q174R, D177E, Q207A, R211S, K238R  
18 0194RT AZT, 3TC NVP M41L, M184V, T215F K103N V35T, T39K, K43E, S68G, A98S, K122E, D123S, E138Q, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S  
19 0334RT AZT, 3TC EFV M41L, V75M, M184V, L210W, T215Y K103N, V108I, M230L I31IM, V35T, T39E, V60I, V106I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211N, K238R  
20 0330RT AZT, 3TC NVP M41L, D67N, K70R, L74I, M184V, T215F, K219Q A98G, V108VI, G190A V35T, T39K, K43E, V60VI, K122E, D123S, K173T, Q174K, N175Y, Q197E, Q207A, R211N, D218E, K238R  
21 0365RT D4T, 3TC NVP M41L, D67N, L74I, M184V, L210W, T215Y, K219N V108I, Y181C E40F, K43E, V118I, I135T, G196E, Q207N, R211K  
22 0382RT AZT, 3TC EFV M41L, D67N, K70R, V75M, M184V, T215F, K219Q G190Q V35T, T39N, V60I, K122E, D123S, I135V, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, H221Y, K238R  
23 0497RT Unknown Unknown M41L, D67N, M184V, T215Y Y188L V35T, T39K, K43E, V106VI, K122E, D123S, I142IV, K173V, Q174K, D177E, I178M, V179VI, G196GE, T200I, I202IV, Q207A, R211RS, K238R  
24 0554RT AZT, 3TC EFV M41L, V75M, M184V, L210W, T215Y A98AG, K103N, P225H V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135L, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
25 0656RT D4T, 3TC EFV M41L, D67N, K70R, L74I, M184V, T215F, K219Q A98G, G190S V35T, T39E, V106I, K122E, D123S, S162Y, K173T, Q174K, D177E, I178M, V179I, G196E, E203K, Q207A, H208Y, R211S, K223Q, F227Y, L228H, K238R  
26 0790RT Unknown Unknown M41L, D67N, V75M, F77L, M184I, L210W, T215Y A98G, K101E, G190A E28K, K32E, V35T, E44D, V90I, V118I, K122E, D123S, S162N, K173T, Q174K, D177E, V179I, G196E, E203D, Q207N, R211N  
27 0677RT Unknown Unknown D67G, K70R, M184V, T215I, K219E Y181C, G190A K20R, V35T, T39N, T69N, K122E, D123S, K173T, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q197QL, Q207A, R211S, L228LH, K238R  
28 0424RT D4T, 3TC EFV A62V, K70KN, V75VI, F77L, F116Y, Q151M, M184V K101E, Y181C, G190A, P225H E28K, V35T, T39E, T58TN, V111I, K122E, D123S, M164L, K173I, Q174K, D177E, G196E, Q207G, R211S, K238R  
29 0890RT Unknown Unknown A62AV, V75M, F77FL, F116FY, Q151KM, M184V V108I, G190A V35T, T39E, S68G, K101Q, K122V, D123N, I135M, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, D237DE, K238R  
30 0585RT AZT, 3TC EFV M184V K101E, G190A E28K, V35T, T39A, V111I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238R  
31 0056RT AZT, 3TC EFV M184V Y188L V21I, T27A, V35T, T39K, K43E, V106I, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R K30KE 
32 0146RT AZT, 3TC NVP V75M, M184V, T215F K103N, Y181C K20R, T27A, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, T165L, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200A, Q207A, R211S, L228R, K238R M16I, G18C 
33 0357RT AZT, 3TC NVP M184V Y188L V35T, T39K, K43E, V106I, K122E, D123S, I135M, I142V, K173I, Q174K, D177E, I178L, Q207A, R211S, K238R  
34 0111RT AZT, 3TC EFV M184V K103N V35IT, K122E, D123S, I135L, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R  
35 0176RT AZT, 3TC EFV M184V K103N E28K, V35T, T39K, K43E, V60I, K64R, K122E, D123S, I135T, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200I, Q207A, R211S, K238R  
36 0342RT D4T, 3TC EFV M184V K103N I31L, V35T, T39K, K43E, V106I, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R  
37 0352RT D4T, 3TC EFV M41L, L74V, M184V A98G, Y181C, G190S K20KR, V35T, T39K, T69N, V106I, V111I, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L, K238R  
38 0466RT Unknown Unknown M184V A98G, K101E, G190A V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173M, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, K238R  
39 0553RT AZT, 3TC NVP M184V K103N V35T, T39N, S68G, K122E, D123S, I142V, K173I, Q174K, D177E, Q207E, R211K, K238R  
4 0739RT TDF, 3TC None K65R, K70~, V75M, K219R K103N, Y181C V35T, T39D, S68N, T69N, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207S, R211S, L228R, K238R  
40 0500RT AZT, 3TC EFV K70R, M184V K103N K32N, T69N, K122E, I135T, G196E, I202V, Q207H, R211K, L228R E79V 
41 0039RT AZT, 3TC EFV V75M, M184V K101EQ, V106M, G190A V21I, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, D237X, K238R  
42 0239RT AZT, 3TC NVP D67N, K70R, V75M, M184V, L210W, T215F, K219E A98G, Y181C E28A, V35T, T39E, K101Q, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R  
43 0243RT AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q K101EQ, V106M, G190A V35K, T39E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, V179I, Q207E, F214L, K238R  
44 0011RT AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q A98G, K103N, Y181YC V35T, T39E, K122E, D123S, I135V, S163A, K173R, Q174K, D177E, Q207G, R211S, K238R  
45 0012RT AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, T215I K101P, K103N V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173IL, Q174KR, D177E, I178L, V179I, T200A, Q207A, R211S, K238R  
46 0211RT AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, T215N, K219Q K101EQ, G190A E28K, V35T, K43KR, V60VI, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R  
5 0789RT None None D67G, K70R, K219Q A98G, Y188L V35T, T39K, E40K, K43E, S68G, K122E, D123S, I135T, T165I, R172K, K173I, Q174K, Q207A, R211S, F214L, D218E, K238R Q182H 
6 0245RT AZT, 3TC EFV D67N, K70R, V75M, M184V, T215F, K219E K103N, V108I V35T, T39E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, D218E, K238R  
7 0262RT D4T, 3TC EFV D67N, K70R, M184V, K219Q A98G, K103N, P225H K20R, V35T, T39N, K122E, D123S, S162T, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207S, R211S, L228R, K238R  
8 0323RT AZT, 3TC, DDI None M41ML, D67N, K70KR, L74LI, M184V, T215TFIS, K219Q A98AG, K103KN, Y181YC, G190GA V35T, T39K, K43KE, E53ED, V60VI, K122E, D123NS, K173IV, Q174K, D177E, I178IM, V179VI, T200TA, E203EK, Q207A, R211S, D218DE, K238R  
9 0397RT AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, T215F, K219E A98AG, K101E, V108VI, Y181C, G190A E28A, V35T, V60I, V106I, K122E, D123S, T139K, S162Y, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211S, K238R  

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