<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Duc (2012)
Title Surveillance of transmitted HIV drug resistance using matched plasma and dried blood spot specimens from voluntary counseling and testing sites in Ho Chi Minh City, Vietnam, 2007-2008
Citation Clin Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 73
NumPts 73
Subtype CRF01_AE

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
3708 3708 None None   E6D, V35T, T39K, K43KQ, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174KR, D177E, I178M, V179VI, I195IL, T200TI, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3709 3709 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3710 3710 None None   E6ED, T7TP, K11KR, V35T, T39K, K43KE, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174KN, D177E, I178IM, T200TI, I202IV, Q207A, L210S, R211S, K238KR, V245E L80LF 
3711 3711 None None   E6D, K11T, V35T, T39EK, S68G, T69A, D123N, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, G196GE, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3712 3712 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3713 3713 None None   K11T, V35T, T39K, K43E, V60VI, K122E, D123S, I135T, R172RK, K173I, Q174K, D177E, V179VI, I202V, Q207A, R211S, K238KR, I244IV, V245E  
3714 3714 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K102HQ, K103KR, K104KR, S105SA, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200TA, Q207A, R211S, K238R, V245Q  
3715 3715 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162SC, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V241VI, V245E  
3716 3716 None None   E6D, T27TI, V35T, T39R, K65KE, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178M, V179VI, G196GE, T200TA, Q207NS, R211S, K238R, V245EK  
3717 3717 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173IT, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211S, K238KR, V245X, K249KQ  
3718 3718 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3719 3719 None None   E6ED, V8VI, K11T, V35T, T39N, K122E, D123NS, I135T, I142IT, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3720 3720 None None   E6D, V35T, K122E, D123S, S162C, P170PT, K173R, Q174K, D177E, Q207A, R211K, V245E K238GR 
3721 3721 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K102R, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3722 3722 None None   E6ED, V35T, T39EK, K122E, D123S, S162C, K173IT, Q174K, D177E, I178IM, T200TI, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3723 3723 None None   K11R, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3724 3724 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, V60VI, T69TN, V106VI, K122E, D123S, S162C, K173L, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3725 3725 None None  E138EK K32I, V35T, T39K, K43E, V60I, K102Q, K122E, D123S, I135R, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245K, E248EK  
3726 3726 None None   K11T, V35T, T39K, K122KE, D123NS, I135IT, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3727 3727 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173V, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, V245E  
3728 3728 None None   E6D, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E E42EK 
3729 3729 None None   E6D, K11KT, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173IMT, Q174KR, D177E, Q207A, R211NS, K238R, V245VAIT  
3730 3730 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, F171Y, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, K249R  
3731 3731 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178IM, T200I, E203ED, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3732 3732 None None   E6D, K11A, V21VI, V35T, T39E, K122KE, D123S, I135T, I142V, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3733 3733 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135V, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3734 3734 None None   I5IV, E6D, K11T, V35T, T39EIKV, K122KE, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, V179I, I180IV, G196GE, Q207A, R211NS, K238KR, V245E  
3735 3735 None None   I5V, E6D, K11KT, E28A, V35T, T39E, S68G, V90VI, K122E, D123NS, I135T, T165TI, K166KR, K173IL, Q174K, D177E, I178M, V179I, G196E, T200TA, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3736 3736 None None   E6D, K11T, V35T, T39KQ, K122KE, D123NS, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3737 3737 None None   E6D, K11KT, V35T, T39K, K43KQ, K102KQ, K122E, D123NS, I135IV, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3738 3738 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173IL, Q174K, D177E, T200TI, E203ED, Q207ADE, R211S, K238KR, V245EK G93GE 
3739 3739 None None   E6D, V35T, V60I, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TI, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3740 3740 None None   K11R, V35T, T39K, K43E, K49KR, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200I, Q207A, R211S, F214FL, K238R, V245E  
3741 3741 None None M184MV  E6D, V35T, T39N, V60I, K122E, D123S, I142T, A158S, T165I, K166R, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207D, R211S, K238R, V245K  
3742 3742 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207N, R211S, P225PS, K238R, V245E  
3743 3743 None None   E6D, V35T, T39EK, R83RK, W88WCS, K122E, D123S, S162CY, K173T, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207AD, R211RS, K238KR, V245E  
3744 3744 None None   E6D, K11T, E28Q, K32E, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3745 3745 None None   E6D, K11T, V35T, K122E, D123S, I142V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200TA, Q207AT, R211S, K238R, V245E  
3746 3746 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43EQ, K122E, D123S, I135IT, S162C, K173IL, Q174K, D177E, T200TI, I202IV, Q207X, R211S, K238R, V245E  
3747 3747 None None  V179VD E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177DE, I178M, G196E, T200A, Q207S, R211S, K238R  
3748 3748 None None   V35T, T39K, K43E, K102Q, K122E, D123S, I142V, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200V, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3749 3749 None None   I5IV, E6ED, K11T, V35T, T39TAEK, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I202IV, Q207S, R211S, K238KR, V245E  
3750 3750 None None K70T, V75I Y181C, G190A E6D, K11T, V21VI, V35T, T39K, S68N, V111I, K122E, D123S, I135T, T165TI, K173KRT, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, K249KR, S251SN  
3751 3751 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3752 3752 None None   E6D, V8I, K11T, V35T, T39A, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245E, E248Q  
3753 3753 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3754 3754 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173IR, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3755 3755 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, S68G, V118I, K122E, D123S, I135AT, I142IV, S162SC, K173I, Q174KN, D177E, I178IM, T200IL, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3756 3756 None None   E6D, K11KT, V35T, T39AE, K122E, D123S, I135RT, S162C, K173I, Q174K, D177E, T200TI, Q207AGST, R211S, K238R, V245E  
3757 3757 None None  K103KN E6D, K11T, V35T, T39E, K122E, D123S, S162C, K173AITV, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S  
3758 3758 None None   E6D, K11T, V35T, T39E, V90VI, G112GA, K122E, D123S, K173IV, Q174K, D177DE, I178ILM, G196GE, T200TA, Q207A, R211S, V245E V60VIM, V111VIM, R125KT 
3759 3759 None None   E6D, K11KT, V35T, T39E, K64KR, K104KN, K122E, D123S, I135T, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, V179VI, T200TA, Q207AT, R211RS, K238R, V245E  
3760 3760 None None   E6D, K11KT, V35T, T39KR, K43E, K122E, D123S, S162C, K173IT, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3761 3761 None None   E6D, V35T, T39N, E53D, T69TN, K122E, D123NS, T139TA, I142IV, F171FY, K173IT, Q174K, D177E, I178M, T200TA, I202IV, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3762 3762 None None  V108VI E6D, K11T, K20R, V35T, T39K, K102KE, K122E, D123NS, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S  
3763 3763 None None D67N, K70R, M184V, T215F, K219EQ K101E, G190CS E6D, K11KT, E28EK, V35T, T39E, T69TN, V106I, K122E, D123S, E138EQ, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, T200TA, Q207A, R211S, D218DN, K238R, V245E  
3764 3764 None None   E6ED, K11KT, V35T, T39E, K122E, D123S, I159IV, S162CY, S163SC, T165TI, K173T, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R  
3765 3765 None None   E6D, K11T, K20R, V35T, T39E, K122E, D123S, I135V, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3766 3766 None None   I5IV, E6D, K11KT, V35T, T39K, K43E, V118VI, K122E, D123S, I135IATV, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179VI, I202IV, Q207A, R211S, K238R  
3767 3767 None None   E6D, K11KT, V35IKMT, E36ED, T39TAEK, T69TS, K122E, D123S, T139TA, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, V179I, Q207A, R211S, K238KR, V245E  
3768 3768 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3769 3769 None None   V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207AT, R211NS, K238R, V245KQ  
3770 3770 None None   I5V, E6D, K11T, V35T, T39N, K122E, D123S, S162C, K173AITV, Q174K, D177E, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3771 3771 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, V60I, K122E, D123NS, K173I, Q174K, D177E, V179I, T200TIK, I202IV, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3772 3772 None None   I5IV, E6DN, V8VI, K11T, V35T, T39N, V60VI, K122E, D123S, I142IV, K173IT, Q174K, D177E, I202IV, Q207A, R211RKNS, K238R  
3773 3773 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K102KQ, K122E, D123NS, S162C, K173IR, Q174K, D177E, I178IM, T200TA, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3774 3774 None None   E6D, K20KR, V35T, T39N, K122E, D123NS, I142IV, K166KR, R172RK, K173IM, Q174K, D177E, I178IM, V179VI, T200TI, Q207X, R211RKNS, K238KR, V245E  
3775 3775 None None   E6D, K11T, V35T, T39N, V60I, K102Q, V106VI, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200TAIV, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3776 3776 None None   E6D, E28K, K32E, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174R, D177E, Q207D, R211S, K238KR, V245E E203EDKN 
3777 3777 None None   K11KR, V35T, T39K, K43E, V118VI, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178IM, T200IM, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3778 3778 None None   E6D, K11T, V35T, T39KQ, K122KE, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178IM, Q207A, R211S, K238R, V245E  
3779 3779 None None   E6D, K11KT, V35T, T39K, K43E, V60VI, K122E, D123S, I135V, I142IV, K173ILM, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, K238KR, V245K  
3780 3780 None None   V35T, T39K, K43E, K102KQ, K122E, D123NS, I135RT, S162SACG, K173I, Q174K, D177E, I178M, V179VI, G196GE, Q207A, R211S, V245E