<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Kamoto (2008)
Title Surveillance of transmitted HIV drug resistance with the World Health Organization threshold survey method in Lilongwe, Malawi.
Citation Antivir Ther
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 53
NumPts 53
Subtype C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
MW1 MW1 None None   K32R, V35T, T39K, S48T, K122E, D123G, K173A, D177E, T200A, R211K, V245Q  
MW10 MW10 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123NS, A158S, K173A, Q174K, D177E, G196K, T200E, Q207G, R211K, V245Q K220E 
MW14 MW14 None None   V35T, T39K, S48T, V60I, K122E, D123N, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
MW15 MW15 None None   V35K, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, S162C, Q197K, T200A, Q207E, F214L, V245Q, D250E  
MW16 MW16 None None   V8I, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123GS, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, P247A, S251N  
MW18 MW18 None None   V8I, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V118I, K122E, K173T, T200A, Q207G, R211K, F214L, V245Q  
MW2 MW2 None None   V35K, E36A, T39E, S48T, A98S, K122E, D123N, K173T, Q174K, Q197P, T200E, Q207N, V245Q  
MW21 MW21 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K166R, K173T, Q174N, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245E, D250E  
MW22 MW22 None None   V21I, V35T, E36I, T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, D250E  
MW23 MW23 None None   T7TP, V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, K122E, D123S, T165I, K173R, Q174K, I202V, Q207E, R211K, F214L  
MW24 MW24 None None   V35T, T39E, S48T, K49R, K122E, D123N, I135K, Q145H, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q  
MW25 MW25 None None   V35T, E36T, T39E, S48T, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
MW28 MW28 None None   V35M, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, P243S, V245K L205LS 
MW29 MW29 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, K166R, K173A, D177E, Q197H, T200A, Q207N, R211Q, V245Q  
MW3 MW3 None None   V35K, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
MW30 MW30 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K64R, K122E, D123G, K166R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211V, V245Q, D250E  
MW31 MW31 None None   V35M, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, E138A, K173E, D177E, I178V, T200A, I202V, Q207R, R211K, P243A, V245K  
MW32 MW32 None None   V35T, T39A, S48T, E53D, K122E, D123G, T139A, K173T, Q174R, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245L  
MW33 MW33 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, E138A, K173T, D192N, T200A, Q207E  
MW34 MW34 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, K173A, Q174K, D177E, G196T, T200A, Q207A, R211K, V245K, E248D, D250E  
MW36 MW36 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123N, S162H, K166R, K173A, T200A, Q207E, V245Q  
MW37 MW37 None None   E6K, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, A158S, K173A, Q174K, D177E, G196K, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q  
MW38 MW38 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, D250E  
MW39 MW39 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123G, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E  
MW4 MW4 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135V, E138A, S162CY, K166R, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243T, V245Q  
MW40 MW40 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, K173T, T200A, E203D, Q207E, V245Q  
MW41 MW41 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243S, V245E  
MW42 MW42 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, K122E, D123N, K173A, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
MW43 MW43 None None   K20R, V35T, E36AV, T39E, S48T, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
MW44 MW44 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123G, I142V, K173A, Q174K, D177E, T200A, E204D, Q207G, R211K, V245Q  
MW45 MW45 None None   P4S, V35T, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
MW46 MW46 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N  
MW47 MW47 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, T165I, K173A, Q174N, D177E, G196M, T200A, I202V, Q207E, L228Q, V245Q  
MW48 MW48 None None   V35T, T39E, S48T, D123N, S162A, K173E, Q174K, D177E, T200A, R211K, V245Q  
MW49 MW49 None None   V21I, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211M, V245Q, D250E  
MW5 MW5 None None   E6K, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, E53D, K104N, K122E, D123G, S162Y, K173A, E194K, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
MW51 MW51 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, I135V, S162A, K173T, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
MW52 MW52 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, K166R, K173A, Q174K, D177E, G196T, T200A, Q207E, V245K  
MW53 MW53 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, D177G, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
MW54 MW54 None None   V35T, T39K, E40D, S48T, K122E, A158S, K173A, Q174K, D177E, G196M, T200A, I202V, Q207K, V245Q  
MW55 MW55 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, I135IATV, K173E, D177E, Q207E, V241I, V245Q  
MW56 MW56 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, I135A, K173E, D177E, Q207E, V241I, V245Q  
MW57 MW57 None None   V35T, E36EA, T39E, E42D, S48T, E53ED, K122E, D123DG, K166R, K173AV, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, D250E  
MW58 MW58 None None   P4T, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V118I, K122E, T165I, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245L  
MW59 MW59 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, T139A, A158S, K173A, Q174H, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, D250E  
MW6 MW6 None None   P4T, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, A158S, K166R, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q  
MW60 MW60 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K104R, K122E, D123S, I135T, K166R, K173T, T200A, Q207G, R211K, P243S, V245Q  
MW63 MW63 None None   V8I, V35T, E36A, T39D, S48T, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248D  
MW64 MW64 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, K122E, D123G, K173T, Q174K, T200AS, Q207E, R211K, V245N  
MW65 MW65 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, S162A, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245VL, D250E  
MW67 MW67 None None   P4S, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123G, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245H, K249Q  
MW8 MW8 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K102R, K104R, K122E, D123N, K173T, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245E  
MW9 MW9 None None   P4S, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E