<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Yang (2011)
Title Global surveillance of transmitted HIV-1 drug resistance in PEPFAR-supported countries using a broadly sensitive genotyping assay
Citation CROI 2011
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 38
NumPts 38
Subtype A, D, B, C, CRF10_CD

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
KEN-11T KEN-11T None None   K30Q, K32G, A33C, L34T, V35L, E36N, I37F, V60I, K122E, I159V, D177E, Q207E, R211K, V245K P157PS 
KEN-32T KEN-32T None None   K30Q, K32G, A33C, L34T, V35L, E36N, I37F, V60I, K122E, I135V, D177E, T200A, E204K, Q207E, V245K  
KEN-34T KEN-34T None None   K30Q, K32G, A33C, L34T, V35L, E36N, I37F, T39R, E40D, K49R, V60I, K122E, I135T, I142T, K173S, Q174K, V179I, T200A, Q207A, R211N, V245E  
KEN-55T KEN-55T None None   K30Q, K32G, A33C, L34T, V35L, E36N, I37F, V60I, K64R, K122E, D123NS, I135T, I142V, K154KE, K173L, Q174K, D177E, V179VI, Q207A, R211S, V245IM  
KEN-57T KEN-57T None None   E36K, I37F, V60I, K122E, D123S, I135T, I142V, A158AS, K173E, Q174R, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245E  
KEN-58T KEN-58T None None   K30Q, K32G, A33C, L34T, V35L, E36N, I37F, V60I, D121HY, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200K, Q207A, R211S, V245M  
KEN-59T KEN-59T None None   E36K, I37F, T39I, V60I, D121H, K122E, I142T, E169D, K173ALSV, Q174K, D177E, Q207A, R211K, V245M  
KEN-68T KEN-68T None None   E36EK, I37F, E40D, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245T C38C* 
KEN-80T KEN-80T None None   E36K, I37F, T39M, V60I, K122KE, D123S, I135T, S162A, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207D, R211K, V245EK  
KN-100 KN-100 None None   K11T, V35T, K43KR, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, S162N, F171Y, K173LS, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
KN-12 KN-12 None None   V35T, K64R, K122E, D123S, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245E, D250E  
KN-14 KN-14 None None   E6D, K11T, K20R, T27S, V35T, T39A, D121H, K122E, K173S, D177E, T200E, Q207A, R211S, V245M, E248D, D250E  
KN-15 KN-15 None None   P4Q, V21I, V35T, T39A, V60I, A98S, D121Y, K122E, E169D, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245E, E248D  
KN-16 KN-16 None None   V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123G, I135T, D177E, I178M, T200A, Q207AV, R211K, V245Q, D250Q  
KN-18 KN-18 None None   E6K, V35T, D121DY, K122E, I135T, A158S, S162A, K173E, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, F214L, P243T, V245E, D250E  
KN-19 KN-19 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, V245E, P247A, E248D, D250E, S251H  
KN-20 KN-20 None None   V21I, V35T, T39I, V60I, K122E, D123S, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245Q, D250E  
KN-33 KN-33 None None   V35T, T39L, D121H, K122E, I142V, A158S, S162H, T200A, Q207E, F214FL  
KN-35 KN-35 None None   E6T, E28A, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, G196R, I202V, Q207D, R211S, P243S, V245K  
KN-36 KN-36 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, D123NS, I135T, I159V, S162H, K173S, Q174K, V179I, I202V, Q207D, V245E, D250E  
KN-38 KN-38 None None   V35T, V60I, V106I, K122E, D123S, I135T, K173L, Q174K, D177DE, V179I, Q207A  
KN-39 KN-39 None None   V8I, V35T, T39M, K49R, V60I, K122E, D123NS, S162N, D177E, I202V, Q207G, R211K, V245Q  
KN-44 KN-44 None None   K20R, V35T, E40D, V60I, D121H, K122E, I135T, T165TI, K173V, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245K  
KN-45 KN-45 None None   K11Q, V35T, V60I, V118I, D121H, K122E, I135R, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L, V245E, D250E  
KN-51 KN-51 None None   E6K, K11T, K20R, V21I, V35T, T39E, A98S, K122E, D123G, I135T, S163ST, K173S, Q174K, D177E, V179T, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248D  
KN-52 KN-52 None None   V35T, T39L, V60I, D121H, K122E, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211RS, F214L, K238R, E248N  
KN-53 KN-53 None None   K11Q, V35T, V60I, D121H, K122E, D123S, I135T, E138A, T165I, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L  
KN-54 KN-54 None None   V21I, V35I, E40D, V60I, D121H, K122E, D123G, I135IR, K173S, Q174K, V179I, Q207A, R211N  
KN-72 KN-72 None None   V35T, T39M, K49R, V60I, D177E, I178M, E204K, Q207E, R211K, V245K, D250E  
KN-73 KN-73 None None   V35T, E36D, V60I, D121HY, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, E248N, D250E  
KN-78 KN-78 None None   E6S, V35T, K43R, S48T, V60I, K122E, D123N, A158AS, K173S, Q174K, V179I, Q207E, R211K, V245T, D250E  
KN-91 KN-91 None None   K11T, K20KR, V35T, V60I, D121Y, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, G196E, Q207E, R211K, V245E, D250E  
KN-93 KN-93 None None   V35T, V60I, K122E, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S, V245E, D250E  
KN-95 KN-95 None None   V35T, V60I, T107S, I135V, K173S, Q174R, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S, V245Q  
KN-96 KN-96 None None   K20R, V21I, V35T, T39A, E40D, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174KR, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S  
KN-97 KN-97 None None   V35T, K49R, V60I, K122E, D123N, I142V, D177E, I178M, Q207A, P243S, V245K, D250E  
KN-98 KN-98 None None   V8I, V35I, T39K, S48T, A158S, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q E42K, R72K 
KN-99 KN-99 None None   V8VI, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123G, I135T, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, K238R, V245Q