<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Serrano (2012)
Title Low transmitted drug resistance and high viral genetic diversity of HIV-1 strains circulating in young pregnant women recently diagnosed with HIV-1 infection in Luada, Angola
Citation ASLM 2012
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 39
NumPts 39
Subtype C, G, A, F, H, CRF02_AG, D, CRF45_cpx, B, A + G

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
2010693432 2010693432 None None   K20R, V35T, T39A, K122E, D123G, I142V, Q174E, D177E, T200A, Q207K, R211T, V245Q, E248D, D250E, S251N  
2010693433 2010693433 None None   V35T, E36D, T69I, K122E, I135V, K173T, Q174K, N175Y, T200A, Q207E, V245Q  
2010693434 2010693434 None None   V35T, E40D, K43R, V60I, A98S, K122E, D123T, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q E248Y 
2010693435 2010693435 None None   E6K, K20R, V35T, T39K, V60I, K122E, I135L, K173AT, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245E  
2010693436 2010693436 None None   K20R, V21I, K22R, V35T, V60I, T107S, D121C, K122E, D177E, I178V, G196K, T200E, Q207E, R211RK, F214L, V245T, E248D W24WC, E204HQ 
2010693437 2010693437 None None   V35K, E36A, T39E, S48T, E53D, K122E, D123N, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, F214L, V245Q, D250E  
2010693438 2010693438 None None   V35T, V60I, K102Q, D121Y, K122E, S162SC, K173N, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248N  
2010693439 2010693439 None None   V21VI, V35M, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, I142T, S162A, K173A, Q174K, G196E, E203EG, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
2010693440 2010693440 None None   V35T, K49R, V60I, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, E248D, D250E W71W* 
2010693441 2010693441 None None   E6A, T7P, V8I, K11A, V35T, T39K, E40D, K43Q, K49R, V60I, T107S, K122E, D123G, I135T, E169D, D177E, T200A, Q207A, R211K, I244V, V245K  
2010693442 2010693442 None None  K238KT V35T, T39K, K122E, I135T, K173A, Q174N, D177DE, V179VI, I195K, Q197QP, Q207N, R211K, V245Q, E248N, D250E  
2010693443 2010693443 None None   I5V, E6D, K11M, V21I, V35T, T39K, E40D, K49R, I50V, V60I, W88C, I135T, S163T, K166R, E169D, D177E, I195T, G196K, T200A, Q207D, R211K, P243A, I244V, V245K, E248D, D250E  
2010693444 2010693444 None None   K20R, K32KR, L34I, V35T, T39L, E40D, K49R, V60I, D123E, D177E, I178V, I202IV, E204Q, Q207E, R211K, F214L, I244V, V245IK, D250E  
2010693445 2010693445 None None   P4S, V35T, E36D, T39I, E40D, K49R, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, V179I, T200A, E204K, Q207A, R211K, V245Q P247S 
2010693446 2010693446 None None   P4S, V35T, T39R, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, F214L, V245Q, D250E  
2010693447 2010693447 None None   E6A, V8I, K11T, T27S, V35T, E36D, T39R, K43Q, V60I, S68G, V90I, D121H, K122E, D123S, S162D, S163T, D177E, I178M, Q207A, R211K, I244V, V245K, D250E, S251N E40N 
2010693448 2010693448 None None   K11Q, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, E169D, D177E, I178L, G196E, T200A, I202V, E204K, Q207E, R211K, F214L, P243T, V245T, D250E  
2010693449 2010693449 None None   K11T, V35T, D121H, K122E, D123S, I135IV, K173QR, Q174K, D177E, Q207A, R211S, P243S, V245Q  
2010693450 2010693450 None None   K32R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248D  
2010693451 2010693451 None None   V35T, T39N, E40D, K43R, S162C, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E, E248NT  
2010693452 2010693452 None None   V35T, T39R, V90I, D121H, K122E, K166R, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200E, Q207A, R211N, Q242QR, V245Q, E248N, D250E T58A 
2010693453 2010693453 None None   K20R, V21I, K22R, V35T, V60I, T107S, D121C, K122E, D177E, I178V, G196K, T200E, E204Q, Q207E, F214L, V245T, E248D, D250E  
2010693454 2010693454 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, T139A, A158S, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245L, D250E M16I 
2010693456 2010693456 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123E, I135V, I142V, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, D250E  
2010693457 2010693457 None None   V35T, T39R, D121Y, K122E, I135V, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211N, V245Q, E248D  
2010693458 2010693458 None None   V35T, D123E, I135V, S162C, K173A, Q174K, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248D  
2010693459 2010693459 None None   P4T, K20R, V35T, V60I, K122E, D123N, I142V, A158S, K173R, Q174K, D177E, I178M, E194D, I195L, T200A, R211N, V245Q, E248D, D250E  
2010693462 2010693462 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, K122P, I135V, I142V, K166KR, K173A, D177E, V189VI, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
2010693464 2010693464 None None   V35T, T39K, V60I, K122E, D123N, I142V, F171Y, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207V, R211K, F214L, V245Q, P247A, E248D, D250E  
2010693465 2010693465 None None   K11E, V35T, E36D, V60I, D121H, K122E, D123N, I135V, S162A, K173R, D177E, T200A, E204D, Q207G, R211K, V245Q  
2010693466 2010693466 None None   V35T, K49R, V60I, I135V, S162A, E169G, K173T, Q174R, T200A, I202V, Q207G, R211K, V245Q, E248D  
2010693467 2010693467 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123E, D177E, T200V, Q207E, P243A, V245Q, E248D, D250E  
2010693468 2010693468 None None   K11T, K20R, V35T, K49R, K102R, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, K238R, V245Q, E248D  
2010693470 2010693470 None None   V35T, T39A, E40D, K122E, S162T, K166R, K173M, Q174K, T200V, Q207A, R211K, V245Q, D250E  
2010693471 2010693471 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, P55PS, D121H, K122E, A158S, K173V, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, D250E  
2010693474 2010693474 None None  V179DE P4T, E6K, K11S, V35T, T39N, V60I, K102Q, K122E, D123S, A158S, K173A, D177EG, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D  
2010693475 2010693475 None None   V35T, T39N, D86E, K122E, D123N, I142V, T165I, K173A, Q174K, D177E, I178M, I195T, G196E, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
2010693476 2010693476 None None   P4S, V35T, T39E, S48T, E53D, V60I, K64R, V118I, K122E, I135V, E138A, T139TI, K173A, Q174K, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, D250E  
2010693479 2010693479 None None   V35T, D86E, K104KR, I135V, S162C, K173I, Q174K, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, E248D