<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Manasa (2011)
Title Primary drug resistance in South Africa - data from 20 years of surveys.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 71
NumPts 71
Subtype C, A

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1000155 1000155 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, S162A, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K275Q, K277R, T286TA, E291D, V292I, I293V  
1000191 1000191 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, K166R, K173A, D177E, I178M, T200A, E204Q, Q207D, V245K, A272P, K275Q, K277R, E291D, V292I, I293V  
1000346 1000346 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1001155 1001155 None None   P4S, V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, I135K, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
1001156 1001156 None None   V35T, E36A, T39K, S48T, V60I, K104R, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, T200E, Q207G, R211K, V245Q, A272P, I274V, E291D, V292I  
1001178 1001178 None None   V35K, E36A, T39E, S48T, V60I, K104R, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, T200E, Q207G, R211K, V245Q, A272P, I274V, E291D, V292I Y115H 
1001198 1001198 None None   K20R, V35T, E36A, T39A, S48T, V60I, K122E, D123N, T165I, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K, V245K, A272P, K277T, E291D, V292I, I293V  
1001259 1001259 None None   E6N, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, T165V, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
1001428 1001428 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123G, E138Q, T139V, S162C, K173A, T200A, Q207G, R211K, F214L, V245Q, A272S, K277R, E291D, V292I, I293V  
1001440 1001440 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135R, S162C, K173A, D177E, V179I, G196E, T200A, E204K, Q207E, R211A, V245Q, A272P, Q278H, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1001513 1001513 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V  
1001517 1001517 None None   P4S, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123G, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200E, Q207R, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1001518 1001518 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245K, T286A, V292I, I293V  
1001533 1001533 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, S162SC, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207A, V245Q, D250N, T286A, E291D, V292I, I293V  
1001552 1001552 None None   V35T, T39E, E40D, S48T, V60I, S68G, K102Q, K122E, D123G, K173A, D177E, I178L, T200A, Q207G, R211K, V245Q, A272P, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1001562 1001562 None None   E6P, E28A, V35S, T39E, S48T, K122E, D123S, I135M, S162C, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I K126T 
1001579 1001579 None None   V21I, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
1001752 1001752 None None   K11R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, T165I, Q174K, D177E, T200V, I202V, Q207A, R211E, V245Q, A272P, Q278R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1001757 1001757 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, E138A, A158S, K173A, Q174A, G196T, T200A, Q207N, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1001763 1001763 None None   V35T, T39K, S48T, V60I, K122E, D123S, I135R, S162C, K173T, D177E, I178V, T200A, Q207AE, R211K, V245Q, A272P, K277G, T286A, E291D, V292I, I293V  
1001860 1001860 None None   E6K, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, E138A, I142V, S162A, K173T, D177G, T200E, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K275Q, Q278H, T286A, E291D, V292I, I293V T253S 
1001882 1001882 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, S48T, V60I, D123E, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207K, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V  
1001890 1001890 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121Y, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K281R, E291D, V292I, I293V, P294S  
1002574 1002574 None None   P4PS, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, I135V, I142IT, S162SC, K173A, D177E, I178IV, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, A272P, K277R, L283LI, E291ED, V292I, I293V  
1002842 1002842 None None   P4S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, E291D, V292I, I293V  
1002867 1002867 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, E138A, K173A, T200A, Q207A, R211K, V245E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1002871 1002871 None None   P4S, V35T, E36A, T39K, K43E, S48T, E53D, V60I, V118I, K122E, T165I, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, I274V, K281R, E291D, V292I, I293V  
1002972 1002972 None None   V35T, T39K, E40D, S48T, K103R, K122E, D123S, I135T, S162C, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1003575 1003575 None None   P4S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, V118I, K122E, D123G, E138A, K173A, T200A, R211K, F214L, V245Q, E291D, V292I, I293V  
1003616 1003616 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173M, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q, A272K, K277R, E291D, V292I, I293V  
1003634 1003634 None None   V21I, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, V60I, K122E, D123G, K166R, K173A, Q174R, T200A, Q207E, R211K, V245Q, K277R, T286A, I293V  
1003640 1003640 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, K173T, D177E, T200A, Q207R, R211K, V245K, A272S, K277R, L283I, T286A, E291D, V292I, I293V  
1003645 1003645 None None   V35T, T39K, S48T, D123E, S162C, K173T, Q174K, D177E, Q197P, T200E, Q207E, R211K, F214L, V245K, E248D, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
1003669 1003669 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, E138A, K173A, I178L, V189I, T200A, Q207A, R211K, V245E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
1003866 1003866 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, W88C, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245K, A272S, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1003888 1003888 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K102R, K122E, D123G, S162C, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
1003957 1003957 None None   E6K, V8I, V35T, E36A, T39E, A98S, K104T, K122E, D123G, S162C, K173A, D177G, T200A, E203D, Q207A, R211K, V245Q, Y271F, A272P, T286A, V292T, I293V, P294S, E297R  
1004903 1004903 None None   T7A, T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, D123G, S162C, F171Y, K173A, Q174K, P176S, D177E, I178M, T200E, Q207A, R211K, P243PS, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
1004909 1004909 None None   V35Q, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, D177E, T200A, Q207R, R211K, V245K, A272S, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1005002 1005002 None None  V179E K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173R, D177G, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245K, D250E, A272P, E291D, V292I, I293V  
1005015 1005015 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, I135V, T165I, K166R, K173V, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207A, R211K, F214L, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V  
1005042 1005042 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135V, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207A, L210F, E224K, V245K, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1005066 1005066 None None   E6K, K11T, K20R, V35T, T39R, K122E, D123N, I135T, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S, V245Q, E248N, L260I, A272P, T286A, E291D, I293V, P294T  
1005091 1005091 None None   V35T, T39E, S48T, E53D, T165I, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, E291D, V292I, I293V  
1005100 1005100 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, T200A, R211K, F214L, V245Q, A272S, E291D, V292I, I293V  
1005127 1005127 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245T, A272S, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1005180 1005180 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, A158S, K173T, D177E, I178M, T200A, E204D, Q207N, D250E, A272S, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1005196 1005196 None None   E6A, K20R, K32R, V35I, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, S162C, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245K, A272P, K277R, Q278H, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1005280 1005280 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, R211K, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, E297K  
1005311 1005311 None None   V21I, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, T139A, K173A, Q174K, D177E, T200E, Q207D, R211K, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V  
1005313 1005313 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K82R, K122E, D123N, I135V, I142T, K173A, Q174K, T200A, R211K, V245K, A272P, K277R, L283I, K287R, V292I, I293V  
1005365 1005365 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121H, K173T, D177E, E194A, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1005371 1005371 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, S162Y, K173A, D177E, T200I, Q207E, V245Q, A272P, L279M, T286A, E291D, V292I, I293V  
1006150 1006150 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248T, T286A, E291D, V292I, I293V  
1008329 1008329 None None   V35M, E36A, T39E, S48T, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207S, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1008486 1008486 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, Q174K, D177E, T200V, Q207G, R211K, V245K, A272P, K281R, T286A, E291D, I293V  
1008973 1008973 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135V, E138A, S162C, K173A, Q174K, T200A, Q207A, R211K, F214L, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V  
1009017 1009017 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, N175H, D177E, T200A, E204K, V245Q, A272P, K275Q, V276T, K277R, Q278H, T286A, E291D, V292I, I293V  
1009062 1009062 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, I135V, S162C, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
1009100 1009100 None None   P9T, V35T, T39E, S48T, K102Q, I159V, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K, A272P, E291D, V292I, I293V  
1009132 1009132 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K102Q, D123S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1009139 1009139 None None   V35T, T39E, E40D, S48T, K122E, D123S, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245K, A272P, K275Q, V276T, K277R, Q278Y, E291D, V292I, I293V  
1009148 1009148 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173V, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207G, R211K, V245K, A272P, K281R, T286A, E291D, I293V  
1009162 1009162 None None   I31M, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, K173A, Q174R, D177G, G196E, T200A, Q207E, V245K, A272P, K275R, Q278H, E291D, V292I, I293V  
1009328 1009328 None None   E28G, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, S162C, K173A, Q174R, T200A, Q207E, V245E, A272P, T286V, E291D, V292I, I293V  
1009357 1009357 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245K, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1009363 1009363 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K173T, D177G, T200A, Q207E, R211RK, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V  
1009517 1009517 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, K122E, D123G, I135T, S162C, K173A, D177E, E194K, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, K281R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1009519 1009519 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, A158S, K173T, D177E, T200A, Q207E, V245K, K277R  
1012606 1012606 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, S162C, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, V245Q, A272P, I274V, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1012654 1012654 None None   V21I, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, K122E, D123G, T165I, K173A, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245T, E291D, V292I, I293V  

Database

Resources

Team