<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Wang (2008)
Title Identification of subtype B, multiple circulating recombinant forms and unique recombinants of HIV type 1 in an MSM cohort in China.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 36
NumPts 36
Subtype B, CRF01_AE, CRF07_BC

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
CYM001 CYM001 None None   I5V, K102R, V118I, D121H, K122E, I135M, F214L, V261I, V276VI  
CYM002 CYM002 None None   V35A, K102KN, V106I, D121Y, K122E, I135T, S162C, E169D, V189I, I195IKRT, F214L, V245M, V261I, K277R, T286A, A288S G45GAEV, R143RS, I180IM, H198HQ 
CYM003 CYM003 None None   I5V, V118I, K122E, I135M, F214L, V245I, V261I  
CYM004 CYM004 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, D121H, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, V276I, T286A  
CYM005 CYM005 None None   E6D, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, K277R, T286A  
CYM006 CYM006 None None   K82R, V106VI, V118I, K122E, I135IT, R211K, F214L, V245M, V261I Q161QH 
CYM007 CYM007 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200I, I202V, Q207A, R211S, F214L, K238R, V245E, T286A  
CYM008 CYM008 None None   K11R, K173G, Q174K, T200A, I202V, Q207E, V245M, S251I, L283I  
CYM009 CYM009 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200I, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245K, A272P, K277R, T286A  
CYM010 CYM010 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173N, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A  
CYM011 CYM011 None None   E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, D177E, I178M, Q207A, R211S, K238R, V245E, K281R, T286A  
CYM014 CYM014 None None   I5V, V118I, F214L, V245I, V261I  
CYM015 CYM015 None None   E6D, V35T, T39K, K122E, D123S, S162C, K173R, Q174K, D177E, I178M, I195L, Q207A, R211S, K238R, V245E, K277R, T286A  
CYM016 CYM016 None None   V118I, K122E, I135T, K166R, R211G, F214L, V245M, V261I  
CYM018 CYM018 None None   I5V, V118I, K122E, I135V, F214L, V245I, V261I  
CYM019 CYM019 None None   E6K, K122E, I135T, D177E, I202V, F214L, V245M, V261I, A272P  
CYM020 CYM020 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135T, D192N, V245Q, A272P, K277R, T286V  
CYM022 CYM022 None None  K238N I5V, V118I, I135V, F214L, V245I, V261VI, K277R  
CYM023 CYM023 None None   I5V, V21I, V90I, K101Q, V118I, K122E, I135M, F214L, V245I, V261I, K281R  
CYM024 CYM024 None None   V106I, D121H, K122E, I135T, E169D, F214L, V245M, K277R, T286A, A288S  
CYM025 CYM025 None None   K82R, V106I, V118I, D123E, I135T, K166R, I180V, F214L, V245M, V261I, A272P  
CYM026 CYM026 None None   K103R, K104R, V118I, K122E, I135T, E169D, I180V, F214L, I257L, V261I  
CYM027 CYM027 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, D121H, K122E, I135T, S162C, V245Q, A272P, K277R, T286A  
CYM028 CYM028 None None   E6D, K103R, D123N, I135V, K166R, I202V, F214L  
CYM029 CYM029 None None   E6D, K122E, I135V, L187I, G196E, T200I, Q207E, F214L, V245Q, S251C, T286A  
CYM030 CYM030 None None   K102R, V106I, D121H, K122E, I135T, E169D, I195L, R211T, F214L, V245K, T286A, A288S  
CYM031 CYM031 None None   I5V, V118I, I135M, F214L, V245I, V261I, V276VI  
CYM033 CYM033 None None  V108I E6D, K11T, V35T, T39R, K43E, K122E, D123S, S162C, K173S, Q174K, D177E, I178M, E203D, Q207A, R211S, K238R, V245E, T286A  
CYM034 CYM034 None None   I5V, K102R, V118I, D121H, K122E, I135M, F214L, V261I  
CYM036 CYM036 None None   V35I, V106I, D121Y, K122E, I135T, E169D, I202V, F214L, V245I, V261I, K277R, T286A, A288S  
CYM038 CYM038 None None   E6D, K11T, V35T, T39K, E40D, K43E, K122E, D123S, S162C, K173I, Q174K, D177E, I178M, T200I, Q207A, R211S, K238R, V245E, A272P  
CYM039 CYM039 None None   V106I, D121H, K122E, I135T, E169D, F214L, V245M, V261I, Q278H, T286A, A288S  
CYM040 CYM040 None None   V106I, V118I, K122E, H208L, R211K, F214L, V245I, V261I, K281R  
CYM041 CYM041 None None   I135T, D177E, F214L, V245I, V261I, A272P, K275Q, K277R, Q278H  
CYM042 CYM042 None None   V118I, K122E, I135T, D177E, G196E, Q197K, F214L, V245K, I257L, V261I, A272P, K275R, V276I  
CYM044 CYM044 None None   V35I, K102R, I135T, K173E, Q207E, F214L, V245T, E248K, V261I