Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author Brennan (2010)
Title Expanded evaluation of blood donors in the United States for human immunodeficiency virus type 1 non-B subtypes and antiretroviral drug-resistant strains: 2005 through 2007.
Citation Transfusion
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 203
NumPts 203
Subtype B, CRF44_BF, A, CRF02_AG, D, CRF43_02G


  Page 1 of 3    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 203 Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
Pat079 ARC-A157 None None   V60I, R83K, S162A, G196E, Q197QK, T200TA, R211K, V276T, Q278E, T286P, E297K, D324E, Q334E  
Pat080 ARC-A156 None None   V35L, R83K, Q207E, R211K, A272P, K281R, E291D, I293V  
Pat081 ARC-A155 None None   K43KM, K173E, D177E, I178L, V179I, R211RK, I244IV, V245VM, E248D, A272P, T286A, E297R, V314VI, G333E, Q334H  
Pat082 ARC-A154 None None   I50IV, R83K, K102KR, D123E, K166KR, D177E, T200AV, E204EK, R211RK, I244IV, V245IMT, K277R, T286TA, K287KR, A288S, I293V, E297K  
Pat083 ARC-A152 None None   D123E, K166KT, I178IM, R211K, V245M, K277R, I293V, E297A, I329V, Q334D  
Pat084 ARC-A151 None None   S48E, K49R, E138A, S162C, G196E, E204Q, R211G, A272P, K277R, T286A, V292I, E297K, L310I, Q334L  
Pat085 ARC-A149 None None   K101KR, K122KE, D123E, I135T, S162SC, T200I, Q207A, R211K, K277R, I293V, E297T, V317VA, S322A, I329L  
Pat086 ARC-A148 None None M41L V179D K22R, T27S, K122E, I135T, D177E, E203D, W212WG, V245T, A272P, K277KR, V292I, K311R, D324E, I329L  
Pat087 ARC-A147 None None   V35I, T200I, Q207E, R211K, I326V, I329V  
Pat088 ARC-A146 None None   K20R, I142V, S162C, R211G, A272P, K281R, T286P, I293V, P294T, T296S, E297A  
Pat089 ARC-A145 None None   V35I, R83K, D121Y, K122E, A158AS, I178L, V245M, K281R, A288S, I293V, E297K  
Pat090 ARC-A144 None None   V35I, R83K, K104R, K122KE, D123DE, F214L, I244IV, K249KQ, A272P, K281R, I293V, E297K  
Pat091 ARC-A143 None None   K20R, V35I, W88CS, K122E, K166R, F171Y, I178IM, G196E, T200A, F214L, K277R, T286A, E297K, I329V, Q334L  
Pat092 ARC-A142 None None   D123E, I142V, I178V, G196E, T200I, Q207H, R211K, K277R, Q278H, T286A, E297K, K311R, Q334L  
Pat093 ARC-A141 None None   V35I, K64R, D123E, D177E, V179I, D192N, R211S, V245M, R284RK, I293V, E312A, I326IV, I329L, Q334N  
Pat094 ARC-A139 None None   G18GD, K20R, V35I, P170PS, V245K, K277R, T286A, E297EA, Q334L  
Pat095 ARC-A138 None None   K122E, T200TI, I202IV, F214L, I293V, I329IV  
Pat096 ARC-A137 None None   T39TA, K101KR, K122KE, I142V, D177E, I178M, T200A, Q207N, R211RK, P243A, V245E, E248D, D250DE, A272P, V276VI, T286TA, V292VI, P294PS, G333E, Q334H  
Pat097 ARC-A136 None None   T39TA, K122KE, I142V, D177E, I178M, T200A, Q207HN, R211RK, P243A, V245E, E248D, D250DE, A272P, V276VI, T286TA, V292VI, G333E, Q334H  
Pat098 ARC-A135 None None   T39TA, K122KE, I142V, D177E, I178M, T200A, Q207HN, R211RK, P243A, V245E, E248D, D250DE, A272P, V276VI, T286TA, V292VI, G333E, Q334H  
Pat099 ARC-A134 None None   K82R, R83K, V90I, I142IT, S162A, Q197E, R211K, E248DN, T286A, I326T, A327V  
Pat100 ARC-A133 None None   K20R, V35I, V118I, K122E, I135T, S162C, E169A, K173E, D177E, D192N, T200A, R211K, F214L, V245E, K249KR, A272P, Q334QDEH R83REGK 
Pat101 ARC-A132 None None   P4S, V90VI, A158S, S162SC, K173Q, T200A, R211K, E248D, K277KR, T286A, E297K  
Pat102 ARC-A131 None None   K122E, D123N, K166R, K173E, I178M, G196E, Q197K, Q207E, P243T, A272P, K277R, I293V, E297G  
Pat103 ARC-N25 None None   R83K, S162C, T200A, Q207N, R211K, A272S, K281R, T286A, I329V, G333E, Q334H  
Pat104 ARC-A129 None None   K20R, D123E, S162C, F171Y, K173KR, Q174KR, R211K, I244V, D250E, A272P, V292I, I293V, E297EK, G333E, Q334H  
Pat105 ARC-A126 None None   K20R, K104R, D177E, I178M, V245M, A272P, V292I, K311R, G333E, Q334N  
Pat106 ARC-A125 None None   V35T, E40ED, K49R, D123E, E169D, G196E, Q197K, R211RT, V245E, T286A, E291D, I293IV, P294S, E297N, K311R  
Pat107 ARC-A124 None None   V21VI, I135V, D177DE, I178ILM, V179I, R211RK, W212WG, F214FL, K238R, V245T, E248D, L260V, A272P, K277R, K281R, T286A, I293IV, P294PT, E297K, K311KR  
Pat108 ARC-A123 None None   V35L, K49R, R83K, D123DE, G196E, Q207E, R211RK, V245L, K281R, E297K, Q334H  
Pat109 ARC-A122 None None   K49R, V60I, K122KE, D123E, I142K, S162HY, E169D, V245E, E248D, K277R, I293V, D324E, Q334E  
Pat110 ARC-A121 None None   K20R, K49KR, K102KR, D121Y, K122E, E138A, S162C, V179I, R211REGK, A272P, K277R, K281R, P294Q, I329V  
Pat111 ARC-A120 None None   V21VI, V60I, I202V, R211K, V245E, K277R, T286A, V317A, D324E, I326V, Q334L  
Pat112 ARC-A119 None None   V8I, R83K, K122E, D123E, I135T, S162C, V245E, A272P, D324E, I329L V35G 
Pat113 ARC-A118 None None   K43KE, R83RK, D121DH, K122KE, D123DE, S162C, I178L, G196E, V245Q, E248D, D250DE, A272P, K277R, T286TA, A288AS, T290TA, I293V, E297K  
Pat114 ARC-A117 None None   E6D, K122P, I135T, K166R, T200I, R211K, F214L, A272P, K277R, T286A, E291D, K311R  
Pat115 ARC-A116 None None   D86E, S162C, G196E, T200TA, Q207E, V245K, K281R, I293V, K311KR  
Pat116 ARC-A115 None None   S68G, I135T, T200V, V245EQ, D250DE, A272AP, K277R, T286V, E291D, G333E, Q334H  
Pat117 ARC-A114 None None   K20R, V35VL, K49KR, E53D, D123E, K173T, D177E, V179VI, I195K, G196E, T200A, Q207E, R211K, P243S, V245E, T286TA, V292VI, I293V, E297R  
Pat118 ARC-A113 None None   E6EK, V35M, T69S, R83K, I178M, T200A, R211G, E248D, A272P, V276VI, K277KR, Q334Y  
Pat119 ARC-A112 None None   S162C, I202V, V245K, A272P, K277R, T286A, I326V, Q334E  
Pat120 ARC-A111 None None   K20R, K49R, V60VI, E79ED, D121H, K122E, I135T, S162C, D177E, T200A, R211K, D250E, S251I, I293V, S322T, I329IL  
Pat121 ARC-A110 None None   V21I, V60I, D86E, V90I, I135T, K173R, G196E, Q207H, R211K, E248D, E291D, V292I, P294T, E297EK  
Pat122 ARC-A109 None None   D123N, I142IT, K166KR, D177DE, T200A, R211K, V245K, A272S, K277R, T286A, I329L  
Pat123 ARC-A107 None None   E6A, R83K, D123E, S162A, D177E, R211K, V245E, A272P, V276T, K277R, E297K, D324N, Q334E  
Pat124 ARC-A106 None None   K11R, K49R, R83K, D123E, I135V, D177E, G196E, V245E, K277R, I293V, E297K  
Pat125 ARC-A105 None None   K11KR, E53ED, K64KR, K66KR, K122KE, D123DN, I142T, G196E, T200A, A272P, V292VI, I293IV, E297K, D324E, G333E, Q334N  
Pat126 ARC-A104 None None   V118I, T165I, T200I, R211K, F214L, K277KR, I293V, I329IV  
Pat127 ARC-A103 None None   I5V, R83K, I135T, I159IV, S162C, S163T, I178M, T200A, Q207E, R211K, A272P, K281R, T296S, E297A, V317A, S322SL, I326V, Q334QP P150S 
Pat128 ARC-N24 None None M41L  D123E, S162A, G196E, R211A, V245Q, D250S, K277R, T286A, A288S, K311R, S322T, Q334D  
Pat129 ARC-A102 None None   E6D, K49R, I50V, R83K, T200E, E248D, D250N, K277R, K287R, E297K, Q334Y  
Pat130 ARC-A101 None None   A98S, K103KR, K122KE, D123N, D177E, I178M, S251I, T286A, A288S  
Pat131 ARC-A100 None None   P4Q, K20KR, V21I, V35VL, I135IV, S162C, G196E, E204T, R211KT, I293V, P321PS, I329L G262GR 
Pat132 ARC-A99 None None   K64R, S105A, K122E, D123N, I135IATV, D177E, I178M, V245N, E248D, A272P, K277R, I293V, E297K, K311R  
Pat133 ARC-A98 None None   I5V, K49R, R83K, I135T, S162C, S163T, I178M, T200A, R211T, P247PL, A272P, K281R, T296S, E297A, V317A, I326V  
Pat134 ARC-A97 None None   K20R, V60I, K122E, T139K, I142M, D177E, I178V, T200A, F214L, D250T, A272P, V276VI, K277KR, T286A, E297K  
Pat135 ARC-A96 None None   K104KR, I135V, S162C, E194ED, G196E, R211RK, V245M, A272P, K277R, I293V, Q334E  
Pat136 ARC-N23 None None   K20R, D123E, D177E, T200A, V245K, I293V  
Pat137 ARC-A94 None None   V118I, D123E, A158AS, T165TI, K166R, I178M, Q207E, R211K, F214L, A272P, K277R, I293V, G333D, Q334H  
Pat138 ARC-A93 None None   V60I, R83K, K122E, Q174E, Q207E, A272S, I293V, P294T, Q334N  
Pat139 ARC-A91 None None   E36G, K49R, I50V, K122E, I135T, S162C, T200A, I202V, F214L, T286A, A288S, I293V, Q334E  
Pat140 ARC-A90 None None   V35M, K64R, D123N, I135R, D177E, Q197L, Q207E, E248N, A272P, V276I, I293V  
Pat141 ARC-A89 None None   I135V, S162C, D177E, I195IT, T200A, R211K, A272P, E297T, L325I, I326V  
Pat142 ARC-A88 None None   A98S, D123E, D177E, T200I, R211K, A272P, K275R, Q278H, T286A, A288T, E297A, I329V  
Pat143 ARC-A87 None None   D123E, S162C, E169D, I178L, I202V, R211Q, F214L, A272P, K281KR, V317G  
Pat144 ARC-A86 None None   V35M, K64KR, D121DY, K122KE, K166R, D177DG, T200MR, I202V, Q207AEG, R211RK, K277KR, L283I, I293V, P294T, E312Q, Q334N K102V 
Pat145 ARC-A85 None None   A98S, K122E, Q174QK, T200TA, I202V, Q207E, R211K, I293IV, E312T, Q334L  
Pat146 ARC-A84 None None   V60I, S68G, K122E, I135R, R211K, K277R, T286A, I293IV, E297K, V317A  
Pat147 ARC-A83 None None   I135V, S162C, A272P, I293V, D324E, Q334L  
Pat148 ARC-N22 None None   T200A, Q207E, R211K, V245K, D250E, V276I, L283I, I293V  
Pat149 ARC-A36 None None   R83K, I135IV, R211K, V245L, V276I, V317A  
Pat150 ARC-A79 None None   K122Q, E169D, D177E, R211K, K277R, T286A, I293V  
Pat151 ARC-A78 None None   K20R, K64R, D86E, I142V, I178L, G196E, R211G, V245T, T286P, Q334L  
Pat152 ARC-A77 None None   K64KR, D123DEKN, D177DE, I178M, R211K, A272AP, T286A, I293IV  
Pat153 ARC-A76 None None   I5V, D121Y, K122E, I135T, S162C, D177E, Q207E, V245E, A272P, K277R, I293V, K311R, I326IM  
Pat154 ARC-A75 None None   V35M, R83RK, I135T, T200TA, I202V, R211K, V245E, K249R, K277R, T286A, V292VI, E297K, K311R, S322E, D324P, I329L  
Pat155 ARC-A74 None None   K49R, V60I, I142V, T200I, E203D, R211K, V245E, E248D, I274V, T286A, I329L  
Pat156 ARC-N21 None None   K11R, K20R, K122E, D123N, I135T, S162Y, E169D, V179I, T200TA, R211K, F214L, V245M, A272S, I293V, E312Q  
Pat157 ARC-A72 None None   K20KR, V35T, E36ED, T39TK, K122Q, V179I, R211K, V245VM, E248EDKN, A272G, I293V, I329L  
Pat158 ARC-A71 None None   R83RK, D123E, S162SC, T165TI, D177DE, I178IL, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, Q278N, K281R, L283I, I293V, E297KR, I329L  
Pat159 ARC-A70 None None   K20R, K122E, I135V, V245M, E248D, A272T, K281R, A327V, Q334Y S191T 
Pat160 ARC-A66 None None   V35IM, R83K, D121DHY, K122KE, D123X, A158S, S162CFY, I178IM, R211RK, V245E, A272P, K277R, T286TA, V292I, I293V, E297K  
Pat161 ARC-A65 None None   D123E, F171Y, D177E, T200V, R211K, T286A, I293V, I326V, I329L, Q334QHR  
Pat162 ARC-A64 None None   D123E, D177E, T200V, R211K, Q278QH, I293V, I326V, I329L  
Pat163 ARC-A63 None None   V21VI, V35T, A98S, I135V, S162C, D177G, Q207AT, R211K, V245E, E248DN, K281R, T286TA, I293V, E297EK, I326V  
Pat164 ARC-A62 None None   S162C, E169D, R211K, A272P, I274V, K277R, Q278N, A288S, I329L, G333E, Q334Y  
Pat165 ARC-A61 None None   T27S, E44EK, R83RK, K102KR, V245E, A272P, K277R, T286A  
Pat166 ARC-A60 None None   K122V, I178L, H208Y, R211K, F214L, P243S, E248D, T286A, E297K, I329L  
Pat167 ARC-A58 None None   V35M, D123E, I135T, D177E, G196E, R211A, V245Q, E248Q, K277R, T286A, I293V, P294T, K311R, S322T, Q334D  
Pat168 ARC-A57 None None   E44ED, V118I, K122KE, D123DA, I142IT, K173R, Q174K, D177E, G196A, T200TA, E203EK, W212WG, F214L, V245K, A272P, K277R, A288S, I293IV, K331R, Q334Y L80LF 
Pat169 ARC-A56 None None   V35I, K82R, R83K, V118I, D123E, E169ED, Q174E, T200TA, R211K, F214L, V245K, E248ED, D250DE, A272P, T286A, E297K  
Pat170 ARC-A55 None None   R83RK, D121Y, K122E, D123DEG, S162C, D177E, I178M, T200A, R211T, V245M, K277KR, T286A, E291D, S322AT, D324DE A272L 
Pat171 ARC-A54 None None   R83RK, D123E, S162SC, T165TI, D177DE, I178IL, T200TS, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, Q278N, K281KR, L283I, I293V, E297KR, D324DE, I329L  
Pat172 ARC-A53 None None   E6K, K20R, K122E, S162A, G196E, Q207E, V245E, A272P, L283I, T286A, V292I, I293V, P294S, E297T  
Pat173 ARC-A52 None None   A98S, K104R, G196E, V245M, T286A, G333DE, Q334QH  
Pat174 ARC-A51 None None   K20R, K103KR, K122KE, T200A, R211K, E248D, A272S, K277R, E297KT, I329ILV, Q334QH  
Pat175 ARC-A50 None None   K20R, V35I, D123E, I135T, Q174K, D177E, Q197E, D250N, A272S, T286A, V292I, I293V  
Pat176 ARC-A49 None None   R83K, K122P, I135IM, S163T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K, S251I, A272S, K281R, A288S  
Pat177 ARC-A48 None None   K32N, E53D, D123E, I142T, G196Q, T200A, R211K, A272P, K281R, I293V, E297R P97PT 
Pat178 ARC-A47 None None  K101E, E138K I142T, G196E, E204Q, Q207D, F214L, D218DN, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, V292I, I293V, A327V