<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Graf (2011)
Title HIV-1 genetic diversity and drug resistance among treatment naive patients from Southern Brazil: an association of HIV-1 subtypes with exposure categories.
Citation J Clin Virol
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 82
NumPts 82
Subtype C, B, F

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
SC01 SC01 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D121H, K122E, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245N, A272P, K277R, E291D, I293V, G335D  
SC02 SC02 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272S, T286A, E291D, V292I, I293V, E312D, V317A, I326T  
SC03 SC03 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D121H, K122E, I142V, K173T, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, L246M, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, K311R, G335D P52L, P225T 
SC04 SC04 None None   V35T, T39E, S48T, D123E, I135T, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, D324E, I329V, G335D  
SC05 SC05 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, K122E, D123E, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200E, Q207E, R211K, L228F, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I N57T 
SC06 SC06 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D123E, K173A, Q174R, P176S, D177E, I195L, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, T296S N57T, G262R, I274Y 
SC07 SC07 None None   K11Q, V35T, E36A, T39D, K43R, K122E, D123G, I135T, A158S, E169D, K173A, D177E, T200A, Q207R, R211Q, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V V10D, M16I 
SC08 SC08 None None   K20R, D123E, I135V, S162C, D177E, T200S  
SC09 SC09 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K102Q, I135T, S162C, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
SC100 SC100 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K104R, P119T, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
SC101 SC101 None None   K49R, K122A, I135T, T165V, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, T286V, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V, Q334H, G335D G112V, K126I 
SC103 SC103 None None   A98S, K101T, D123E, K173D, P176K, T200A, Q207H, R211K, V245Q, A272P, K281R, A288S, E297K, K311R, Q334L N147Y, T165Y 
SC104 SC104 None None   V35T, E36A, T39D, K122A, I142V, R211K, P243A, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, D324E, G335D  
SC106 SC106 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, K122E, I135T, S162C, K173A, T200A, I202V, Q207A, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, V317A, Q334H, G335D I257K, I274R 
SC107 SC107 None None M41L, T215L A98G, G190A V35T, T39N, K122E, D123N, I135M, K173T, V179I, Q197K, T200E, Q207A, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, E291D, I293V N137S 
SC11 SC11 None None   E6K, I31L, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123E, K173A, P176T, D177E, V179A, I202V, Q207D, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
SC113 SC113 None None   K122E, D123S, I135T, E138A, S162C, T200A, Q207E, V245M, A272P, K277R, V292I, E297A  
SC114 SC114 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D177E, Q197K, T200D, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, G335D Q85H 
SC115 SC115 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V118I, K122E, D123N, I135T, T165I, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V Y56D, N57T, H235N, L295R 
SC116 SC116 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, I135T, A158S, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
SC12 SC12 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V D113E 
SC120 SC120 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123G, K173A, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, V317A, I326V  
SC121 SC121 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, A158S, K173T, D177E, Q207K, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
SC126 SC126 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, K43R, S48T, V60I, D121H, K122E, D123S, I142V, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, P247A E248R 
SC127 SC127 None None   V35M, E36A, T39E, E40D, K43R, S48T, V118I, K122E, I135T, I142T, A158S, T165I, K173T, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q H235N 
SC128 SC128 None None K70N  K20R, I135V, S162C, T200A, Q207H, R211K, V245Q, I257L F171C, N255M 
SC13 SC13 None None  V179D V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, D123E, A158S, E169D, K173A, D177G, T200A, I202V, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
SC130 SC130 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, K122E, D123S, K166R, K173A, T200A, Q207G, L210M, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
SC131 SC131 None None  K103N V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, K122E, D123G, I135T, K173A, Q174L, D177E, R206K, I244V, V245Q, A272P, K277R  
SC132 SC132 None None   V35T, E36A, T39E, K43R, S48T, A158S, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, K249Q  
SC133 SC133 None None   V35T, T39D, S48T, K122E, D123N, I135R, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K, D250E, A272P, K277R, T286V, E291D, V292I, I293V, E308Q  
SC135 SC135 None None   V35T, E36A, T39E, K43R, S48T, K104R, K122E, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A  
SC138 SC138 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122P, E169D, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, K287R, E291D, V292I, I293V, V317G N57T, V314Y 
SC14 SC14 None None   V35T, T39E, K43R, K122E, D123S, A158S, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, V245Q, K277R, E291D, V292I, I293V, G335D  
SC140 SC140 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, E40D, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
SC141 SC141 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K102Q, K122E, D123S, A158S, S162A, K173A, D177E, G196K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, K311R, S322T, G335D  
SC142 SC142 None None   P4S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123G, E169D, I202V, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
SC143 SC143 None None   V8I, K30Q, V35M, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123N, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207K, L210M, R211K, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V D86V, G93W, M230K 
SC15 SC15 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, A158S, I167V, K173A, D177E, G196E, T200A, E204K, Q207E, R211K, E233V, V245Q, E248D, D250E, A272P, K275R, T286A, E291D, V292I, I293V  
SC19 SC19 None None   K32R, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D123A, I135K, K173A, D177K, I178V, T200A, E203K, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V D113G, G231R 
SC22 SC22 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, A158S, K173A, D177E, G196E, T200A, Q207G, R211K, W212L, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, G335D F116L, G231R 
SC24 SC24 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D123E, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, A327V, Q334H, G335D  
SC29 SC29 None None K219Q  V35L, S68G, D121H, K122E, E169D, I178L, T200E, V245M, A272P, K277R, I293V  
SC30 SC30 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122P, I135R, E169D, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, K287R, E291D, V292I, I329L, G335D  
SC32 SC32 None None   V35M, T39A, S48T, K122E, I135T, I142V, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
SC33 SC33 None None   E6D, V35T, E36A, T39E, K43R, S48T, I135V, S162C, K173A, T200A, Q207E, V245Q, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
SC34 SC34 None None   K20R, V35M, T39A, K104R, S105A, D123E, E169D, I178M, G196E, I202V, S251I, A272P, K277R, L283I, A288S, I293V, E297A, Q334L, G335D  
SC35 SC35 None None K219Q  D121H, K122E, D123S, I135T, E138A, S162C, T200A, R211K, I244M, V245M, A272P, K277S D218V 
SC37 SC37 None None   V35T, T39K, E40D, K49R, D123E, I135L, S162C, E169D, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245M, A272P, K277R, T286P, E297K, P321S, D324E  
SC38 SC38 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D123G, A158S, K173T, T200A, Q207K, R211Q, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
SC39 SC39 None None   K11R, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123G, I178M, T200I, R211K, V245Q, A272P, K277R, L279M, T286A, E291D, V292I W229G, G262R 
SC40 SC40 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D123G, E138A, K173A, Q174K, D177E, I178V, V179I, T200A, Q207D, F214L, V245Q, A272P, T286A, E291D, I293V  
SC42 SC42 None None   K20R, V35T, T39E, E40D, K43R, S48T, K122E, D123N, I135R, K173T, Q174R, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
SC43 SC43 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, K173T, D177G, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V W229G, W252R, L289V 
SC44 SC44 None None   V35T, K49R, I132V, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207K, R211K, V245Q, E248D W252R 
SC46 SC46 None None V75M  K43R, S48T, V90I, K122E, S162G, G196E, E204K, R211G, F214L, V245I, A272P, K277R  
SC47 SC47 None None T215L K101E, V106M, Y181F, G190A, M230L E28K, K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, K49R, D121H, K122E, S162C, E169Q, K173A, Q174K, D177E, V179I, I195L, T200A, Q207E, R211K, H221Y, L228H, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, I329L, G335D  
SC49 SC49 None None   V8I, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, K122E, I178M, T200E, R211K, V245Q W252S 
SC50 SC50 None None M41L, T215C  V35T, K43R, S48T, V60I, K122E, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q, A272P, K277R  
SC51 SC51 None None   V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, K122E, D123S, I135L, E169K, K173A, D177E, T200A, Q207G, R211K, V245Q N255M 
SC52 SC52 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D121H, K122E, K166R, K173T, D177E, T200A, E204D, Q207K, R211K, V245Q L228S, W252R 
SC53 SC53 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K65E, K66E, K122E, I135K, E169D, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, I257R W252R, G262R 
SC54 SC54 None None   V35T, T39D, K43R, K122E, I135R, E169D, K173A, D177G, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245Q  
SC56 SC56 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, T131P, V148G, A158S, K173T, D177E, T200A, Q207T, R211K, V245Q K49S, N137K, L149C, W252R, G262R 
SC63 SC63 None None   E6K, V35T, E36A, T39D, K43R, S48T, V60I, A98S, K102Q, K104R, V106I, K122E, I178M, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I329L, G335D  
SC65 SC65 None None   D121Y, K122E, I135T, V179I, T200A, I202V, V245M, A272P, K277R  
SC69 SC69 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, A158S, K173A, D177E, T200A, E203D, Q207A, R211K, V245Q, L246I, P247A N81T 
SC70 SC70 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, K166R, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, L283I, T286V, E291D, V292I, I293V, G335D M164V, Q269H 
SC71 SC71 None None   A98S, I135T, R211K E224V 
SC72 SC72 None None   V35T, T39D, S48T, V60I, D123E, K173A, D177E, T200A, E203D, Q207D, R211K, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V, I326V N57T 
SC73 SC73 None None   V35T, E36A, T39D, K122E, D123G, I135V, S162C, K173A, D177E, I178V, T200A, E204K, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, K281R, E291D, V292I, I293V  
SC77 SC77 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D121H, K122E, D123E, I135T, I142V, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, P243S, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, I326V  
SC78 SC78 None None K70I  K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P  
SC82 SC82 None None K219E  V35E, A98S, K122E, I135R, G196E, Q207E, V245M, T286A, I293V, E297Q  
SC83 SC83 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121H, K122E, I135T, A158S, K173I, Q174R, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
SC88 SC88 None None   S68G, T69A, D121H, K122E, I135T, D177E, Q197L, R211K, K277R, A288S, I293V, E297A, I326V  
SC89 SC89 None None   P4S, E28D, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, K173A, P176Q, D177E, T200G, Q207H, H208Y, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, P294L K13Q 
SC91 SC91 None None  V179D V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, I135R, A158S, K173T, D177E, T200A, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
SC93 SC93 None None   K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D123E, I135R, T200I, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, V317A  
SC96 SC96 None None   K32R, V35S, E36A, T39E, K122E, I135T, I142M, A158S, K173T, Q174R, T200A, Q207A, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
SC97 SC97 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135R, I142V, K173A, D177E, T200A, Q207R, V245Q, S251N, A272P, E291D, V292I, I293V F61L 
SC99 SC99 None None   K32E, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, I135R, K173A, D177N, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  

Database

Resources

Team