<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Charpentier (2011)
Title High prevalence of antiretroviral drug resistance among HIV-1-untreated patients in Guinea-Conakry and in Niger.
Citation Antivir Ther
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 187
NumPts 187
Subtype CRF02_AG, G, A, CRF06_cpx, CRF09_cpx, CRF11_cpx, F, B

 

  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 187 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
patco_17 patco_17 None None   V35T, V60I, S68G, I135V, E138A, S162A, T165TI, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
patco_32 patco_32 None None   V35T, V60I, K101Q, K104KR, K122E, D123NS, K173R, Q174QE, D177E, I178M, T200AV, E203ED, R211K  
patco_60 patco_60 None None   V35T, E36ED, T39A, E40D, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207T, R211K K30KE 
patco_79 patco_79 None None   V35K, E36D, K43KQ, V60I, D123N, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200E, Q207E  
patng_01 patng_01 None None   V35T, V60I, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, V189I, Q207A, R211K, F214L, V245Q E6EV 
patng_02 patng_02 None None   I5IT, E6X, K11KN, V35T, E36D, V60I, D121DN, R125RK, I135V, S162A, K173IT, Q174K, D177EK, I178M, T200TA, Q207EK, V245Q L12L*W, V111VG 
patng_03 patng_03 None None   V60I, K122E, D123N, I135R, S162FY, K173I, Q174K, D177E, G196K, T200AV, Q207A, R211K, V245Q, E248D D192F, R199S, L205LM, R206RG, H208HLQ, L209LIKQ 
patng_04 patng_04 None None   E6N, K11KT, E28A, K32E, V35T, E36T, T39K, K43E, K122E, D123NT, S162HY, K173L, Q174K, D177E, I178IV, V179I, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248N  
patng_05 patng_05 None None   D123E, I135V, S162AT, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245E, E248D, S251H, A272S, K277R, T286A, V292I, I293V  
patng_06 patng_06 None None  K103N V35T, T39TI, V60I, K104KR, K122E, D123S, K173R, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211K, V245Q, E248D, D250E  
patng_07 patng_07 None None Y115YF  V35T, E36A, V60I, K122E, D123S, I135V, S162C, K173R, Q174N, D177E, I178M, I195IT, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D, D250E, K259NS D113DN 
patng_08 patng_08 None None   V35T, E36AD, E40ED, V60I, S68G, V90VI, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
patng_09 patng_09 None None   K20KR, V35T, E36ED, T39K, K43KAET, D123E, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
patng_10 patng_10 None None   E28A, V35T, E40D, K122E, D123N, S162A, K173S, Q174K, N175Y, D177E, I178M, V179L, T200A, Q207D, V245Q  
patng_100 patng_100 None None  K103N V21I, V35T, T39S, V60I, V106I, K122KE, I135V, S162A, K173T, Q174KR, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245M, E248D  
patng_11 patng_11 None None   V21I, V35T, V60I, V106I, I135V, I142V, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, D250E  
patng_12 patng_12 None None   P1L, K20R, V35T, E40D, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
patng_13 patng_13 None None   P1L, V21I, K32R, V35T, E40ED, K49R, V60I, W88WC, K122E, D123N, I135T, S162A, Q174K, G196E, T200A, I202V, Q207D, R211K, V245Q, E248D N175A 
patng_14 patng_14 None None   K20R, V35T, T39Q, V60I, V118I, K122E, D123DN, I135T, T139TAS, I142IT, Q174DGNS, D177E, I178M, T200A, Q207E, F214L, L228Q, V245Q, E248N, D250E R78RK 
patng_15 patng_15 None None   E6D, V35T, T39K, I135L, S162A, K173T, Q174A, D177E, T200AV, Q207E, R211K, V245K  
patng_16 patng_16 None None   K20R, V21I, V35T, T39K, E40D, V60I, K104R, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211K, F214L, H221HY, V245Q K30KE, I31ILPT 
patng_17 patng_17 None None   V35T, E36D, T39S, E40D, S68G, V90I, D121H, K122E, I135R, S162A, K173AITV, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207E, F214FL, V245Q R143RK 
patng_18 patng_18 None None   V35T, E36D, T39A, E40D, K102R, K122KE, S162A, K173T, Q174R, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E L209LV 
patng_19 patng_19 None None   P1S, V35T, T39A, E40D, K102Q, K122E, D123N, I135K, I142IL, S162H, K173ST, V179I, Q207A, V245Q  
patng_20 patng_20 None None   V60I, I135V, K173A, Q174K, D177E, G196GE, T200A, Q207E, V245Q, E248D  
patng_21 patng_21 None None   V35T, T39TA, V60I, I135V, S162A, K173T, Q174KR, D177E, I178IM, T200A, Q207E, R211K  
patng_22 patng_22 None None   V35T, E36D, T39A, E53D, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211RK, V245E H96HP 
patng_23 patng_23 None None   V35T, D121H, K122E, A158AS, S162A, K173T, Q174K, D177DE, T200A, Q207D, R211RK, V245Q, E248N K126N, Y127DN 
patng_24 patng_24 None None M184V K103N, V108VI V35T, E36D, V60I, D123E, S134SR, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
patng_25 patng_25 None None   P1S, V35T, K122E, S162A, T165I, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
patng_26 patng_26 None None   V35PQ, E36ED, V60I, V90VI, D123DEKN, I135IV, S162A, F171FY, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
patng_28 patng_28 None None   T27S, E28A, V35T, K122E, D123S, R125RK, I135T, E138A, I142V, S162C, K173S, Q174K, D177E, V179I, Q207A, V245Q  
patng_29 patng_29 None None   P1S, V35E, T39A, K122E, D123N, I135T, E138A, T139TI, I142V, S162C, K173AS, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, V245Q  
patng_30 patng_30 None None   V21I, K32R, V35T, V60I, V106I, K122E, D123N, I135V, I142V, K173I, Q174K, D177E, I178L, T200I, Q207G, R211K, V245Q, E248D  
patng_31 patng_31 None None   V35I, T39A, E40D, S68G, V90I, D123E, I135RT, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207G, R211K, V245Q  
patng_32 patng_32 None None   V35T, V60I, S68G, I135V, S162A, E169A, K173AT, Q174E, D177E, I178M, T200A, E203D, Q207K, R211K, V245Q, E248N  
patng_33 patng_33 None None   V35T, V60I, K122E, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178IL, T200A, Q207E, R211K  
patng_34 patng_34 None None   V35T, V60I, S68G, T69TA, K122E, D123NS, K173R, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207E, R211K, P243S  
patng_35 patng_35 None None  Y181YC V35T, V60I, K102KR, D123DE, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q  
patng_36 patng_36 None None   V35T, V60I, K122KE, D123AT, I135V, Q174A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
patng_37 patng_37 None None   K20R, V35T, V60I, K122E, I135R, S162A, K173T, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207S, F214L, V245K H96HP 
patng_38 patng_38 None None   V35T, V60I, R83K, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243S, V245Q  
patng_39 patng_39 None None   V21I, V35T, E40D, V60I, T69S, D121H, K122E, K173R, Q174K, D177E, T200TA, I202V, Q207DN, R211K, P243T, V245K, E248D, D250E K30E, I31P 
patng_40 patng_40 None None   V35T, T39A, E40ED, V90I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178V, G196E, Q197K, T200E, E203A, Q207D, R211K, P243A, V245Q  
patng_41 patng_41 None None   K11Q, V35T, E40D, V60I, S68G, T69N, K122E, D123N, E138A, I142V, S162A, K173S, Q174K, D177EG, V179I, G196E, T200A, Q207AD, V245E  
patng_42 patng_42 None None   V35T, E36D, V90I, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211RK, V245M  
patng_43 patng_43 None None   T27TS, E28A, V35T, K122E, D123S, I135T, E138A, I142V, S162C, K173S, Q174K, D177EK, V179I, Q207A R143RK 
patng_44 patng_44 None None   K20R, E36D, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174E, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, R211K, P243T, V245Q  
patng_45 patng_45 None None   V35T, T39D, K122E, D123T, I135M, S162A, K173R, Q174K, D177E, I178V, V179VI, G196GE, Q197QK, T200A, Q207E, R211RK, K238KR, V245Q  
patng_46 patng_46 None None   V35T, T39N, E40D, V60I, I135V, S162C, K173KI, Q174EK, D177E, I178M, T200A, E204EK, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
patng_47 patng_47 None None   K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, V106I, D121H, K122E, I142V, A158AS, S162H, K173S, Q174R, D177E, Q207A, F214FL  
patng_48 patng_48 None None   V35T, E40D, V60I, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D  
patng_49 patng_49 None None   P1S, K20R, V35T, E36D, K49R, V60I, K122AE, I135T, S162A, D177E, T200A, Q207A, V245E, E248ED R143RK, K173K*IL 
patng_50 patng_50 None None   V21I, V35T, V60I, K122E, D123DN, S162CG, K173KR, Q174K, D177E, I178LM, T200A, Q207G, R211K, V245Q, E248D V111VG, R143RK 
patng_51 patng_51 None None  V179VE V35I, V60I, K122E, D123S, I135R, K173IMT, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K  
patng_52 patng_52 None None   V35T, E36D, R125RK, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, I178M, V189I, T200A, Q207E, R211K, V245N  
patng_53 patng_53 None None   K20R, V35I, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, L210LV, R211K, F214L, V245Q P225PR 
patng_54 patng_54 None None   P1S, V35T, V60I, D121DN, D123EK, R125RK, I135T, K173T, Q174K, D177E, I195T, T200A, Q207D, R211K, F214L, V245Q, E248D, D250E  
patng_55 patng_55 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, K122E, D123N, I142V, S162Y, K173S, D177E, V179I, G196E, T200A, I202V, Q207A, V245Q  
patng_56 patng_56 None None M41L, D67S, T69A_VG, L74V, M184V, L210W, T215Y A98G, K103N, K238KT K20R, L34I, V35L, I94L, V118VI, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, G196E, T200A, Q207K, R211E, V245Q, E248D S68Q 
patng_57 patng_57 None None   V35T, T39K, V60I, K104R, K122E, D123S, I135IT, K173A, Q174K, D177E, Q207A, F214L, V245Q  
patng_58 patng_58 None None   V35T, E36ED, V60VIL, K101KR, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174KN, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K, K238R, V241I  
patng_59 patng_59 None None   P1L, V35T, E36D, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243T, V245Q  
patng_60 patng_60 None None   V35T, K49R, D123E, I135V, S162A, E169EQ, K173A, Q174EK, D177E, T200A, Q207E, P243S, V245Q  
patng_62 patng_62 None None   V35T, V60I, D121H, K122E, I135V, S162A, D177E, T200A, Q207E  
patng_63 patng_63 None None   V35I, I135L, S162A, K173AITV, Q174K, D177E, T200V, Q207E, R211K, V245Q  
patng_64 patng_64 None None F77FL  E6K, K11T, K32E, V35T, E36A, T39K, K43E, V118VI, K122E, D123N, I135T, S162Y, K173S, Q174R, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211K, F214L, V245Q, E248D E28AITV 
patng_65 patng_65 None None   V35T, V60I, K122E, D123G, I135V, K173RT, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D, D250E, K259S H96HP 
patng_66 patng_66 None None   K11T, V35T, E36D, T39TI, I50V, V60VI, S68T, K102Q, D123DN, R125RK, I135V, S162A, K173AT, Q174K, D177EK, I178M, T200A, Q207E, V245Q  
patng_67 patng_67 None None   P1S, V35R, S162A, K173T, Q174R, D177E, V179I, Q207D, V245Q  
patng_68 patng_68 None None   E6D, V21I, V35T, E36D, T39K, V60I, R83K, K122E, I135T, S162A, K173I, Q174QK, T200A, Q207E, R211K  
patng_69 patng_69 None None   E6N, K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, K122E, D123N, I142V, S162Y, K173S, D177E, V179I, G196E, T200A, I202V, Q207A, V245Q  
patng_70 patng_70 None None   E6N, K11T, V35T, E36A, T39K, K43E, K122E, D123N, I142V, S162Y, K173S, D177E, V179I, G196GEKR, T200A, I202V, Q207A, V245Q, E248N  
patng_71 patng_71 None None   V35KT, I135V, A158AS, S162A, K173AV, Q174KR, D177E, T200A, Q207A, R211RK, V245Q  
patng_72 patng_72 None None   K20R, V35T, V60I, K122E, I135V, S162C, K173T, Q174K, N175H, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245E  
patng_73 patng_73 None None M184V K103N, V108VI V35T, E36D, V60I, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
patng_74 patng_74 None None   V35T, K122E, D123S, I135V, S162CY, E169ED, D177E, I195L, G196R, T200E, I202V, Q207K, R211K, F214FL, V245Q, E248D  
patng_75 patng_75 None None   K49KR, V60I, K122E, D123N, I135T, S162CY, K173KI, Q174KN, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
patng_76 patng_76 None None   V35T, T39M, V60I, D121Y, K122E, D123DG, S162D, K166R, E169A, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V, Q207E, R211RK, V245Q, D250E  
patng_77 patng_77 None None   V35T, E40D, D121H, K122E, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K  
patng_78 patng_78 None None   K20R, V35T, V60I, K122E, D123N, I135V, K173I, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D  
patng_79 patng_79 None None  K103KN V35T, E36D, T39A, I50IT, N57X, V60I, K66KR, V106I, D121DN, S134SN, I135V, I142V, A158AP, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K S48S*Y, K49K*NY, I63IV, K64KEGR, S68SPRT, N81NH, Q85QL, V90VD, G93GR, K104KIN, T107TAEK, V118VG, A129A*GS, Y146YNST, K223KN 
patng_80 patng_80 None None   V35T, T39K, A158AS, S162A, S163ST, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q  
patng_81 patng_81 None None K219R  P9S, V35T, K102R, D123E, S162A, K173T, Q174K, G196E, T200A, Q207S, P243A, V245Q  
patng_82 patng_82 None None   E28D, V35T, V60I, K104R, V118I, K122E, D123N, I135R, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, F214L, V245K, D250E  
patng_83 patng_83 None None   V35T, E36D, K101KR, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174KN, D177E, I178MV, T200A, Q207E, R211K, K238R, V241I, V245Q, L246I  
patng_84 patng_84 None None   E28A, V35T, E36D, K122X, D123E, S162A, K173T, Q174KR, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211HKNQ, V245E  
patng_85 patng_85 None None   V35T, T39LS, K122P, I135V, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E  
patng_86 patng_86 None None   E28R, K32E, E36D, D123N, I142V, S162NY, K166KR, K173T, D177E, V179I, E194K, I195L, G196E, T200A, Q207A, V245Q  
patng_87 patng_87 None None   K20KR, V35T, D123E, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207E, P243PT, V245HQ, E248D  
patng_88 patng_88 None None   V35T, E40D, K122P, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207G, R211KQ, P243H, V245Q  
patng_90 patng_90 None None V75VA  V35T, T39K, K102R, K122E, D123N, I135T, S162C, Q174N, D177E, T200E, I202V, Q207E  
patng_91 patng_91 None None   V35T, E40ED, K49R, V60I, K122E, D123NS, I135T, E169D, K173R, Q174K, D177E, I178IM, T200A, Q207DN, R211K, V245Q, E248N, D250E  
patng_92 patng_92 None None   K20R, V35T, E36D, K49R, V60I, K122E, D123DEKN, I135V, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
patng_93 patng_93 None None   V35T, E36D, T39K, V60I, K102E, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211RK, V245Q H96HP 
patng_95 patng_95 None None   V35T, V60I, K122E, D123G, I135V, K173RT, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D, D250E  
patng_96 patng_96 None None   K20R, V35T, E36D, T39I, V60I, D121H, K122E, D123E, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207EK, R211EKQ, F214FL  
patng_97 patng_97 None None   K20R, V35T, E36D, I135R, S162A, K173T, Q174K, D177E, V179I, T200A, E203EG, Q207D, R211K  
patng_98 patng_98 None None   V35T, E36D, T39L, I135V, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, P243S, V245K  
patng_99 patng_99 None None   V21I, K32KR, V35T, E36ED, T39L, V60I, V106I, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, I178L, T200I, Q207E, R211K, V245Q