<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Carvalho (2011)
Title Moderate prevalence of transmitted drug resistance and interiorization of HIV type 1 subtype C in the inland north state of Tocantins, Brazil.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 52
NumPts 52
Subtype B, F, C

 

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
O01-43 O01-43 None None   K11S, I135V, S162C, E169D, K173T, Q174K, T200A, Q207E, F214L  
O01-83 O01-83 None None   K20R, K122E, D123N, I135T, T200I  
O02-43 O02-43 None None   K122E, D123E, I135T, K173D, Q174K, R211M  
O02-83 O02-83 None None  Y181YC V35Q, T39A, S48T, E53D, A98AS, K122E, D123N, I135IT, K166R, G196E, T200TA, L228K  
O0266 O0266 None None   V35I, K64R, I142T, I178M, E204Q, Q207E  
O03-43 O03-43 None None   V35K, K49R, V60I, I135V, S162C, E169D, K173I, Q174K, I178L, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
O03-83 O03-83 None None   V35R, E53D, I135T, E169D, D177E, G196E, R211K, F214L, L228N  
O0366 O0366 None None   S48T, K101Q, K122E, D123N, Q174H, D177E, V179I  
O04-43 O04-43 None None   I135T, Q207E  
O04-83 O04-83 None None   V8I, V35T, T39E, E40D, K43R, S48T, V60I, K122E, D123S, I135M, K173A, D177E, T200V, Q207G, R211K, V245Q  
O0466 O0466 None None   V118I, D123E, I135T, P176S, T200A, R211K, F214L  
O05-43 O05-43 None None   V35T, E40D, K122E, I135T, S162Y, K173I, Q174K, T200A, R211K, F214L  
O05-83 O05-83 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, I135V, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K  
O0566 O0566 None None   K32R, K122E, D123N, D177E, V179I, E194A, G196E, R211K  
O06-43 O06-43 None None   V60I, I135L, I178M, T200K Q174QP 
O06-83 O06-83 None None  V179VD K20R, D177E, Q207E, K219T  
O0666 O0666 None None   K122E, D123DN, S162C, I178IM, T200A, R211K  
O07-83 O07-83 None None   K20R, V35T, T39L, K66KR, I135L, S162C, K173T, Q174K, T200A, I202IV, Q207V, R211K K122MR 
O0766 O0766 None None   E6D, V35I, K49R, I135L, S162C, E169D, K173A, Q174K, Q207E, R211K  
O08-43 O08-43 None None M41L, L210W, T215D  V35T, E40Q, V60I, I135T, I142M, R211K  
O08-83 O08-83 None None   K11S, K20R, D123E, G196A, T200K, Q207R, R211K  
O0866 O0866 None None   S48T, K49R, V60I, K122E, I135T, K166KR, D177E  
O09-83 O09-83 None None   V60I, D123E, I135T, T200A, R211K, E224D  
O0966 O0966 None None   V35T, E40D, K122E, S162Y, K173IL, Q174K, D177DN, T200A, R211RK, F214L  
O10-43 O10-43 None None   S162Y, E169D, F171Y, I178M, T200K, K201R  
O10-83 O10-83 None None   S68G, E79D, K122E, I135T, K173N, Q174K, Q207E  
O1066 O1066 None None   K20R, V35T, K49KR, D123E, I135T, S162A, D177E, Q207E, R211K  
O11-43 O11-43 None None   V60I, I135L, K166R, I178M, T200K, V245M  
O11-83 O11-83 None None   E6D, D121H, K122E, I135T, S162C, D177E, I178L, Q207E  
O1166 O1166 None None  V179VD E6D, S162C, T200E, R211Q  
O12-83 O12-83 None None   D121H, K122E, I135T, I142V, S162C, D177E, G196E, T200A, E204EG, Q207E  
O1266 O1266 None None   V60I, I135V, T200TA, R211K  
O13-83 O13-83 None None D67G, K219E  S68G, K122E, I135IT, T200V, Q207QH  
O1366 O1366 None None  K103N K49E, V90I, A98S, K122E, D123S, I142K, I159V  
O1466 O1466 None None   K122R, D123E, I142IV, I178M, T200I, L210LM, R211K  
O15-83 O15-83 None None   K122E, I135T, S162C, I178L, F214L  
O1566 O1566 None None  V179E E40AD, K43E, V118I, D121Y, K122E, D123E, I135R, T165I, I178L, I195K, G196E, T200A, Q207E, R211K, F214L  
O16-83 O16-83 None None   T39K, V106I, K122E, S162C  
O17-83 O17-83 None None   S48T, K49R, K122E, D123G, I135T, R211G  
O18-83 O18-83 None None   V60I, S68G, K122E, D123N, I135T, T165I, D177E, I178M, Q197E  
O19-83 O19-83 None None   V118VI, K122E, I135T, F214L, E224D  
O20-83 O20-83 None None  V108I, Y181YC K20R, T69TA, K122P, K166R, D177E, V179VI, I202V, R211RG  
O21-83 O21-83 None None   V21I, T27S, V35I, S162C  
O22-83 O22-83 None None   D123E, I135T, D177E, T200E  
O27-43 O27-43 None None   S48T, K101Q, K122E, D177E, V179I  
O28-43 O28-43 None None   V35M, D121Y, K122E, S162C, D177E, T200N, Q207E  
O32-43 O32-43 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, I135T, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K  
O33-43 O33-43 None None   K20R, K122E, S162C, I178L, I202V, F214L  
O35-43 O35-43 None None   D123E, I135T, E169D, K173R, T200I, F214L  
O36-43 O36-43 None None   V60I, I135V, T200A, R211K  
O37-43 O37-43 None None   K173T, I178M, V179I, G196GE, T200EK, R211K E169V 
O40-43 O40-43 None None   K20R, K122E, D123N, I135T, I178M, T200R