Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.


Author El Annaz (2011)
Title Presence of drug resistance mutations among drug-naive patients in Morocco.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 82
NumPts 82
Subtype B, CRF02_AG, A, C, F, CRF25_cpx, CRF49_cpx, A + G


Clinical RT Isolates

SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
10306 10306 None None   V35I, S48T, I135T, S162C, T200I, Q207K, R211Q  
10345 10345 None None   V35I, K49R, K64R, K102Q, D123E, I135T, S162C, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E  
10375 10375 None None   V35T, E36EA, T39K, K43E, E53ED, V60I, K64R, K102KQ, V118I, D121H, K122E, I135T, I142V, S162H, K173T, Q174QK, D177E, V179I, I195L, G196GE, T200TA, Q207A, F214L, V245Q K30KN, N54NY 
10402 10402 None None   V35VI, I135T, S162C, G196E, Q207E  
10458 10458 None None   V35T, E36D, V60I, K122E, I135L, S162A, E169Q, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, R211K, V245Q  
10559 10559 None None   K122E, K173E, Q207K, R211K, V245Q  
10621 10621 None None   P1S, V35I, R83K, K102Q, T200E, R211K  
10741 10741 None None   K122KE, Q174K, I178IM, G196GE, T200I, R211K  
10744 10744 None None  V179D K82KN, K101R, V118I, K122I, I135T, E169ED, Q174N, D177E, T200A, F214L P55PR, R83RI 
11178 11178 None None   V35T, T39N, E40D, V60I, K64R, I135T, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E  
11509 11509 None None   V106VI, V118I, Q174E, T200A, Q207E, R211K, F214L, L228H, V245E, E248K  
11511 11511 None None   V60VI, Q207E, R211K, E224D, V245Q  
11830 11830 None None M184T  V35E, E36K, P52A, K122E, I135T K103KI, D185DV 
12087 12087 None None   I31IL, V35T, E36D, T39R, L100F, D121Y, K122E, A158S, S163T, E169D, K173A, Q174K, D177E, G196E, T200A, Q207A, R211S G15R, K20N, K30KE 
13253 13253 None None   K64KR, K102Q, V106VI, D123E, S162C, D177E, Q207E, R211RK, H235Q  
14107 14107 None None  V179D V35I, A98S, K122E, I135T, S162C, T200A, Q207E, F214L, V245E  
1432 1432 None None   P1S, V35T, K122E, I135V, S162C, F171FY, K173T, Q174R, Q207E, R211K P4R 
14432 14432 None None   K11T, E36D, C38S, T39K, K46R, S48T, K64R, V118I, D121H, K122E, I135T, I142V, S162H, K173T, D177E, V179I, I195L, Q207A, F214L, L228F, V245Q K30E, L34S, V35D, I37M, E42EV, I47M, F61C 
1490 1490 None None   Q174K, I178M, T200I, R211K L26~ 
1492 1492 None None  P225H V35I, V60I, S68G, K122E, D123N, I135T  
14988 14988 None None   V35IL, T39A, S48T, K102Q, D123E, I142IT, S162SC, T200A, E204A, Q207D, V245E  
15113 15113 None None  V179D V60VI, V118I, K122I, I135T, Q174N, D177E, T200A, R211K, F214L  
15115 15115 None None   K122E, I142T, K166R, K173Q, V189VI, Q207E  
1516 1516 None None   V35T, K49R, I50V, V60I, K102KQ, K122E, D123E, I135T, I142V, R211S  
15206 15206 None None D67N, K219Q  P14AT, T39A, V118I, I135IT, Q174R, N175H, I178L, V179I, R211K, F214L, V245M  
15443 15443 None None  V179D I5M, V60VI, V118I, K122I, I135T, Q174N, D177E, T200A, R211K, F214L  
15737 15737 None None   K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, I135R, S162A, K173T, D177E, G196E, T200A, Q207K, R211K, V245Q, D250E  
1595 1595 None None   K32T, V35I, E36D, T39R, K122E, D123S, I142V, S162A, E169R, K173T, Q174E, V189I, T200A, R211K, F214L G15R 
1633 1633 None None  F227L K122E, D123S, I135T, I142V, S162A, K173T, Q174E, D177G, V189I, T200A, F214L, K238R, V245Q T107TR, P150S, H208R 
1662 1662 None None D67N, K219Q  P14A, T39A, V118I, Q174R, N175H, I178L, V179I, R211K, F214L, V245M K201KE 
17322 17322 None None   V35T, E36D, T39K, V60I, D123E, I135T, I142V, S162A, K173T, Q174E, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q E169L 
1822 1822 None None   V35I, K122E, D123S, E138A, I142V, S162A, K173T, Q174K, T200A, Q207E, F214L, V245Q  
2611 2611 None None M184V  K102R, V118I, K122E, Q174E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245E  
291 291 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, K64R, V118I, D121H, K122E, I135T, I142V, S162H, K173T, D177E, V179I, I195L, T200A, Q207A, F214L  
3230 3230 None None   P1S, T7A, V35VI, D123DE, I135T, R211K  
3497 3497 None None   V35I, K101R, K122E, I135T, S162C, Q207E, D218DN, V245Q  
3504 3504 None None   V35I, K102Q, I135T, S162C, Q207E  
3581 3581 None None   I135T, I142IT, S162C, E169D, T200A, R211K  
3743 3743 None None   V35Q, K122E, D123S, I135T, I142V, S162A, K173T, Q174E, D177G, V189I, T200A, Q207K, F214L, V245Q K30E, E36R 
3935 3935 None None   V35M, T39A, E40D, R83K, K102Q, T200A Q151K, F214S 
3937 3937 None None   P1S, V35M, T39A, E40D, R83K, K102Q, K122Q, K166R, D177E, T200A, R211K  
4510 4510 None None   S48T, D121H, K122E, D123E, Q197K, R211K, V245M  
4514 4514 None None   V21I, V35I, K49R, K102Q, K122KE, D123E, I135T, S162C, E169D, D177E, Q207E, R211K  
4746 4746 None None   S48E, D123E, S162A, T200A, L210F  
4758 4758 None None F116FY  V35AT, K122E, D123S, I135T, I142V, S162A, K173T, Q174E, D177G, V189I, T200A, Q207K, F214L, V245Q  
4893 4893 None None   V35VI, V106I, D123E, I135V, S162C, E169D, T200A, R211K K65KI, K66KN 
5044 5044 None None   V35VI, K173R, Q174E, E204Q, Q207EG, R211K, E224D  
5214 5214 None None   V35I, S68G, K122E, D123N, I135T, A158S, R211K K220KI 
5415 5415 None None   V21D, V35R, E36D, T39A, K49R, V60I, S68G, K122E, I135T, I142V, S162A, E169G, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, E233D, D237H, K238I, Q242P, V245L L228G, P236R 
5483 5483 None None   D123E, S162A, T200A, Q207E, R211K E36E* 
5575 5575 None None   D123E, I135T, S162C, Q207E, R211K, V245Q  
5675 5675 None None   P1S, V35VI, K49R, K122KE, I135T, Q174E, Q207E  
5915 5915 None None   V21I, V35I, S48T, V90I, K101R, D123E, S162C, Q174E, Q207E, V245Q P236A 
5946 5946 None None   K122E, I142K, Q207D, R211K, V245E  
5965 5965 None None   K64R, K122E, I142IT, K166R, K173Q, I178M, V189VI, Q207E  
6206 6206 None None   K32E, V35I, K65E, R83K, D123E, I135T, S162C, V189I, T200E, I202V, R211K  
6264 6264 None None   V35T, K122E, I135T, I142T, S162C, E169ED, Q207E  
6325 6325 None None M41ML, T215S  V106VI, V118I, K122E, D123E, I135T, E138A, I142T, K173KE, F214L L210EG 
6599 6599 None None   V35I, E40D, K103R, V118I, K122E, I135T, D177E, V179I, G196E, R211S, F214L  
699 699 None None   V35T, E40D, S162Y, K173T, Q174K, Q207D, R211K, P243T  
7028 7028 None None   K32KR, D123E, A158AT, S162A, Q207E, R211K Q242E 
7089 7089 None None  K101KN V35I, S48ST, K49R, I50V, V60VI, R83K, Q145QH, E169ED, Q174N, T200A, Q207E, R211K, V245M, E248D  
7091 7091 None None   V35T, K122E, D123S, I135T, I142V, S162A, K173T, Q174E, D177G, V189I, T200A, Q207EK, F214L I47M 
7105 7105 None None K70KT  K20R, K122E, I135T, I142T, S162C, E169D, E203ED, R211K  
7320 7320 None None   K32R, V35M, T39A, S48T, K122E, Q174N, D177G, T200A, R211K, V245K  
7350 7350 None None   V35T, T39A, E40D, S68SG, K102Q, K122E, I135T, I142V, S162A, K173T, Q174A, D177E, T200A, Q207N, R211K, F214L, E224EG G15R, K20N, K30KE, E194V, K219P, E233A 
7437 7437 None None  P236L K20R, V35I, T39A, R83K, K101R, K122P, E169D, T200A, R211K, V245E, K249Q  
7473 7473 None None   V35I, S48T, K122E, S162C, Q174H, Q207K, R211Q F160Y 
7603 7603 None None   V118I, I135R, K173E, Q174R, R211K, F214L  
7631 7631 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, S68G, K122E, I135T, S162A, K173M, Q174K, D177E, T200A, Q207G, V245Q  
7720 7720 None None M184V K103KN V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, D121Y, K122E, I135L, E138A, S162A, K173T, V179VI, T200A, Q207A, R211K Q151QR 
8034 8034 None None   E6D, V8VI, S48T K66KN, Q161P 
813 813 None None   V35K, T39A, K43E, K49R, R83K, K173N, D177EG, T200A, E204ED, R211K N137ND, L205LMV 
8249 8249 None None  P236L K11R, K43R, I135T, T200I, R211K, V245K  
8686 8686 None None   K49R, I135T, S162C, Q207K, R211K H235E 
8782 8782 None None   K20R, S68G, K101R, K122E, I135T, T165I, D177N, I178L, G196E, E203ED, R211K  
89 89 None None  V179D V118I, K122I, I135T, Q174N, D177E, T200A, R211K, F214L H208HR 
9205 9205 None None   V35I, S162C, Q174E, Q207K, R211G I142ILPT, D177DY, L205LV 
942 942 None None   V35VI, R83K, Q197P, R211K  
9612 9612 None None F77FL, T215TS  K49KR, I135T, S162C, Q207K, E224D W71WG 
9668 9668 None None   K20R, V35I, S162C, Q174E, Q207K, R211G, V245Q, E248D  
9844 9844 None None M184V, T215I K103N I31L, K32R, V35M, T39A, S48T, K102N, K122E, S163SI, Q174N, D177G, T200A, R211K, V245K