<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Arruda (2010)
Title Intermediate prevalence of HIV type 1 primary antiretroviral resistance in Ceara State, Northeast Brazil.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 74
NumPts 74
Subtype B, F, C

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1006 16CE081006R None None   A98S, K122E, D123N, I135T, G196E  
1007 16CE081007 None None M41L, D67N, T215D  V60I, K101Q, I135R, T139I, T200A, I202IV, V245M  
1008 16CE081008 None None   S48T, K122E, I135T, E169D, G196E, T200TS, Q207D, R211K, V245VA  
1009 16CE081009 None None   T39M, D123E, Q174R, I178V, G196E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245L  
1010 16CE081010 None None   K101R, D123E, I135T, D177E, T200E, R211K  
1011 16CE081011 None None   D123E, K166KR, D177DE, R211K  
1012 16CE081012R None None   E44D, V60I, A98S, D121Y, K122E, I135R, S162C, Q174K, D177E, V189I, T200A, Q207E  
1013 16CE081013 None None   T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, D177E, I178L, T200A, I202V, Q207A, V245Q  
1014 16CE081014 None None   V60I, A98S, D121Y, K122E, D177EG, T200A, Q207QE, R211RK, V245L  
1015 16CE081015 None None   T39E, K122E, I135V, T139TI, A158S, K173A, D177E, T200A, I202V, E204EK, R211K, F214L, L228LH, V245Q  
1017 16CE081017 None None   S162C, V245M  
1020 16CE081020 None None   V106I, T200A, R211K, F214L  
1021 16CE081021 None None   V60I, A98S, K104R, D121Y, K122E, I135T, Q174L, T200A, Q207E  
1022 16CE081022R None None  K101E V60I, A98S, D121Y, K122E, I135R, T165I, D177E, I178L, V179I, T200A, Q207E  
1023 16CE081023 None None   A158S, I178IM, G196E, V245I  
1024 16CE081024R None None   T69TS, A98S, I135T, R211K, V245E  
1025 16CE081025 None None   T39S, K43KR, K49R, I135V, S162C, E169D, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q  
1026 16CE081026 None None   S68G, I135T, D177DE, T200I, R211K  
1027 16CE081027 None None   V60VI, A98S, D121H, K122E, I135R, D177E, Q197QR, T200A, Q207A, R211K, V245E  
1028 16CE081028 None None  V179D V106I, K122E, I135T, I202V, R211K, F214L, V245VI  
1029 16CE081029 None None   K49KR, E53D, I135T, D177E, I178M, T200A, Q207E  
1030 16CE081030 None None   K43KQ, K49KR, K103R, I135T, R211K, F214L, V245E  
1032 16CE081032 None None   V10I, P14X, G15X, M16X, D17X, G18X, P19X, K20X, V21X, K22X, Q23X, W24X, P25X, L26X, T27X, E28X, E29X, K30X, I31X, K32X, A33X, L34X, V35X, E36X, I37X, T39A, D123E, I135T, K173N, Q174K, T200A, R211A, F214L, V245E P9D 
1033 16CE081033 None None   I135T, I195K, G196E, Q197E, T200TI, F214L  
1037 16CE081037 None None   K122E, D123S, I135T, S162C, T200A, E203D, R211K  
1038 16CE081038 None None   K122E, D123S, I135V, D177E, I178V, E204EK, V245M D113DN 
1042 16CE081042 None None   T39K, V60I, K104N, K122P, I135V, I142V, D177E, T200I, F214L, V245M  
1043 16CE081043 None None   V60I, V106I, D123E, I135T, T139A, K166R, P176PS, I202V, Q207E, R211K, F214L  
1044 16CE081044 None None   V60I, A98S, D121Y, K122E, D177E, I178IM, T200A, Q207E  
1045 16CE081045 None None   T39TS, S68G, K102Q, D121H, K122E, I135T, S162C, D177E, I178L, V179I, T200A, K201KR, I202IV, R211RK, V245M  
1046 16CE081046 None None   K122E, D123N, I135T, D177E, I202V, F214L  
1047 16CE081047 None None   R83K, K104R, D123E, I135IT, D177E  
1049 16CE081049 None None   K64R, K122KE, I135T, S162C, I178L, V179I, Q197L  
1050 16CE081050 None None T215L  S68SN, K102Q, I135V, S162C, T200TI, R211K, V245Q  
1053 16CE081053 None None   K64R, S162C, I178L, Q197L, E204ED, R211K, V245VM  
1054 16CE081054 None None   S68G, K122E, I135T, S162C, T200A, V245M  
1055 16CE081055 None None   V60I, A98S, D121Y, K122E, D177E, T200A, E204EK, Q207E, P243S, V245E  
1057 16CE081057 None None   T165TI, D177E, I178L, T200I, R211K, V245K  
1058 16CE081058 None None  K103N T39R, V60I, K122E, I135IT, I142T, S162C, E169D, K173A, Q174K, I178L, Q207D, R211K, V245Q  
1061 16CE081061 None None   K64R, A98S, I142IL, T165TI, K166KR, D177G, Q197P, Q207K, R211Q  
1062 16CE091062R None None   D123E, I142IV, D177DE, P243S, V245T  
1063 16CE091063 None None   V60I, K64R, A98S, D121DY, K122KE, I135R, K166R, D177E, G196E, T200A, Q207E  
1064 16CE091064 None None   I135T, I202V, R211K, V245T  
1065 16CE091065 None None A62V  E138A, K166R, G196GR, T200A, I202V, R211K, V245T  
1067 16CE091067 None None   V60I, K64R, A98S, K104R, D121Y, K122E, D123G, Q174L, D177E, T200A, Q207E  
1069 16CE091069 None None   D121Y, K122E, V179I, T200I  
1070 16CE091070R None None   I135L, S162H, E169D, K173A, Q174K, T200A, Q207K, R211A, V245Q  
1073 16CE091073 None None   K64R, K122E, D123A, K173KR, I178IM, V189I, Q197QR, T200TA, V245L  
1075 16CE091075R None None D67N, T215L, K219Q  W88F, K102E, V118I, K122E, I135T, N175Y, V189VI, T200A, I202V, F214L  
1077 16CE091077 None None   V60I, A98S, D177E, T200A, E204K, Q207E K201E 
1079 16CE091079 None None   S48T, K122E, D123N, I142IT, A158S, K166KR, K173T, D177E, T200A, Q207EK, R211K, V245Q  
1081 16CE091081 None None   K49R, V60I, A98S, D121Y, K122E, Q174QE, T200A, V245K  
1083 16CE091083 None None M41ML  D123E, E169D, K173A, Q174K, G196E, T200I, Q207D, R211K, F214L, V245Q  
1085 16CE091085 None None   D121Y, K122E, I135T, T200E, F214L, V245E  
1090 16CE091090 None None   V60I, K104N, D123E, I135L, T139A, D177E, T200TA  
1101 16CE091101 None None   V60I, D123E, E169D, F171Y, G196E, T200A, Q207E, F214FL  
1103 16CE091103 None None   E169D, D177E, T200E, I202V, E204D, F214L  
1104 16CE091104R None None   V60I, K122E, I135R, K173E, V179I, I202V, Q207E, V245A  
1108 16CE091108R None None   V60I, K64R, A98S, K104R, D121Y, K122E, D123G, Q174L, D177E, T200A, Q207E  
1111 16CE091111 None None   S68G, K122KR, I135T, T200A, Q207QR, V245K  
1113 16CE091113 None None   I135T, I178M, Q207E, R211K T84TA 
112 112 None None   I135T, Q174H, R211K, V245M  
121 16CE090121 None None   K122E, D123S, I135T, S162C, D177DE, I178M, T200A, E204EK, L210LF, R211S, V245E  
16 16 None None   V60I, A98S, D121Y, K122E, I159V, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245E  
230 16CE080230 None None   V60I, K122E, I135T, D177E, I178V, T200TA, I202V, Q207G, R211K, F214L  
244 16CE080244 None None   V60I, A98S, D121Y, K122E, D123E, I135R, G196E, T200A, Q207E  
265 16CE080265R None None   T39K, I142T, S162C, K173I, Q174K, Q207A, R211K, V245Q  
279 16CE080279R None None   K122E, D123NS, D177E, T200A, R211RK, V245M  
302 16CE080302 None None   K102Q, I135T, S162C, D177E, R211RK  
35 16CE090035 None None   D121DH, K122E, D123DE, I135T, D177E, G196K, T200I, R211K, V245K  
39 39 None None   T39D, S48T, K122E, D123N, K173A, D177EG, T200E, R211K, V245Q  
60 16CE090060 None None   V60I, D86E, A98S, D121DY, K122E, D123DN, I135IR, S163T, D177E, V179I, T200AV, Q207K, V245L  
72 16CE090072 None None   K122E, D123DE, I135T, I142IV, D177E, G196E, T200A, Q207K, R211MV, V245VI  
89 16CE090089 None None  K103T V90I, K122E, I135M, E138A, I142V, S162A, D177E, R211K, V245E  

Database

Resources

Team