<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Lawrence (2006)
Title Analysis of polymorphism in the protease and reverse transcriptase genes of HIV type 1 CRF02-AG subtypes from drug-naive patients from Saint-Etienne, France.
Citation JAIDS
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 31
NumPts 31
Subtype G

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
00TE14 00TE14 None None   V35T, T39A, E40D, K122E, I135L, S162A, K173A, Q174K, D177E, T200A, I202V  
00TE18 00TE18 None None   K122E, I135L, S162A, K173T, Q174K, N175NY, D177E, L187X, T200A  
01TE05 01TE05 None None   Q23X, V35T, V60I, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E Q182L 
01TE08 01TE08 None None   S162A, K173A, Q174R, D177E, I178M, T200A  
01TE09 01TE09 None None   V60I, I135L, I142T, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A H96HQ 
01TE20 01TE20 None None   V35T, S48T, K49R, K122E, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A  
01TE21 01TE21 None None   V35I, V60I, D121Y, K122E, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, V189I, T200A  
02TE01 02TE01 None None   T27S, V35T, T39A, V60I, K122E, I135L, N147X, S162A, K173T, Q174X, D177E, T200A, I202V  
02TE02 02TE02 None None M41L  E40D, V60I, K122X, I135L, S162A, K173T, Q174K, T200A  
02TE03 02TE03 None None   V60I, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A M41MI, F61FL 
02TE10 02TE10 None None  K103N T39A, V60I, K122E, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, I202V  
02TE13 02TE13 None None   V90I, S162A, K173T, Q174EK, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
02TE16 02TE16 None None   V60I, K103KQ, K122E, I135L, S162A, K173T, D177E, T200A Q182QL 
02TE17 02TE17 None None   K103KQ, I135V, S162A, K166R, K173A, Q174N, D177E, T200A, I202V E42E*AS, I47IM, K49KN, N54NY, K66KT, K73KR 
02TE30 02TE30 None None   E40D, D123E, S162A, K173A, Q174K, D177EK, T200A, I202V  
03TE06 03TE06 None None   V60I, I135L, I142T, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A  
03TE07 03TE07 None None   E40D, M41X, K43X, V60I, D123N, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A F61Y, L80H 
03TE11 03TE11 None None   V60I, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211E, V245Q  
03TE22 03TE22 None None   V35T, T39A, E40D, V60I, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A H198Q, R199Q 
03TE26 03TE26 None None   E40D, V60I, D121Y, K122E, I135L, S162A, K173T, Q174R, D177E, T200A D76N 
03TE29 03TE29 None None   T39K, K104R, V118I, S162A, K173V, Q174K, D177E, T200A  
04TE04 04TE04 None None   T39A, E40D, K49KR, S68G, K104R, I135R, S162A, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211RG, F214L, V245Q  
04TE12 04TE12 None None   V60I, I135L, I142T, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207K, R211E, V245Q  
04TE15 04TE15 None None   V35T, E40ED, V60I, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A Q182QL 
04TE23 04TE23 None None   V35T, E36A, K49R, V60I, K102N, I135V, S162A, K173T, Q174K, D177E, V189I, T200A  
04TE28 04TE28 None None   G45E, K49R, V60I, D123A, I135V, S162A, K173T, Q174K, N175NH, D177E, I178IV, T200TA F61FS, K201KEIV 
04TE31 04TE31 None None   V60I, D123E, I135L, S162A, K173A, Q174K, D177E, I178V, T200A, Q207E, R211K, V245Q  
05TE24 05TE24 None None   V60I, V90VI, K122E, I135V, S162A, K173T, Q174R, I178M, T200A  
05TE25 05TE25 None None   V35T, V60I, K65*, I135L, S162A, K173T, Q174K, N175NY, D177E Q182QL 
05TE27 05TE27 None None   E40D, V60I, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A  
97TE19 97TE19 None None   V35T, V60I, I135L, S162A, K173T, Q174K, D177E, T200A  

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