<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Ndembi (2010)
Title Viral rebound and emergence of drug resistance in the absence of viral load testing: a randomized comparison between zidovudine-lamivudine plus nevirapine and zidovudine-lamivudine plus abacavir.
Citation J Infect Dis
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 90
NumPts 90
Subtype A, D, CRF10_CD, C, CRF01_AE, U

Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
13020D_P1 13020 ABC, AZT, 3TC, D4T None M184V  E6D, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207D, R211K  
13025D_P1 13025 AZT, 3TC NVP D67G, M184V G190A, M230L V35T, T39K, S48T, I50V, V60I, K102Q, K122E, D177E, I178M, T200I, E203G, Q207E, R211K E79V 
13075D_P1 13075 AZT, 3TC NVP M184V V106A V35T, E40D, K49R, T58S, V60I, V90I, D121H, K122E, D177E, I178M, T200M, Q207G, R211K  
13228D_P1 13228 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V, K219Q  I5V, E6D, V35T, V60I, S68SR, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, Q197E, Q207A, R211N, H221Y  
13240D_P1 13240 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V  K20R, V21I, V35T, T39A, V60I, K122E, D123N, I135T, F171L, K173S, Q174K, D177E, V179I, G196E, T200A, Q207A, F214L  
13263D_P1 13263 ABC, AZT, 3TC NVP M184V, T215F Y188L K11T, K20R, V21I, V35T, T39RS, K43KE, K122E, D123N, K173S, D177E, I178L, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K  
13305D_P1 13305 ABC, AZT, 3TC NVP M184V K103N, G190A E6K, K11T, V35T, T39M, V60I, K122E, D123S, I135T, T165I, K173L, Q174K, D177E, V179T, T200I, I202V, Q207E, F214L G15R, L26M 
13306D_P1 13306 ABC, AZT, 3TC None M184V  V35T, V60I, T69S, R83K, K122E, D123S, D177E, I178M, Q207A, R211S  
13325D_P1rt 13325 ABC, AZT, 3TC None K70R, M184V  V35T, T39M, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, S162N, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E  
13327D_P1 13327 AZT, 3TC NVP M184V G190A V35T, K122E, I135M, I142T, I178M, Q207E, R211K  
13354D_P1 13354 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V K103N P4S, V35T, T39M, K122E, D123N, I135T, S162C, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
13734D_P1 13734 ABC, AZT, 3TC None M184V  E6D, V8I, K11IT, E28K, V35T, V60I, D121Y, K122E, D177E, T200I, Q207E, R211K  
13765D_P1 13765 AZT, 3TC NVP   K49R, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135T, S162C, D177E, T200A, Q207E, R211K  
13867D_P1 13867 ABC, AZT, 3TC, TDF NVP D67N, K70R, M184V, T215F, K219Q A98G, M230L P4S, I5V, V35T, V60I, K101Q, K122E, D177E, T200I, Q207E, R211K  
13929D_P1 13929 AZT, 3TC NVP M184V, T215Y Y181C I31L, V35T, V60I, T69TN, D121H, I142V, D177E, Q207A, R211S, H221Y  
14000D_P1 14000 ABC, AZT, 3TC None M184V  V35I, K43E, K49R, D121Y, K122E, D177E, I178M, V179A, T200M, Q207E, R211K  
14006D_P1 14006 ABC, AZT, 3TC None M41L, D67N, M184V, L210W, T215F A98G, G190A E6EK, V35T, E44D, S48E, V60I, K122E, D123N, I135L, K166R, K173S, D177E, V179I, G196E, T200A, E203D, Q207A, R211NS  
14039D_P1 14039 ABC, AZT, 3TC None M184V  E28K, V35T, E36D, K49R, V60I, D121HY, K122E, D123E, D177E, I178M, T200R, Q207E, R211K  
14188D_P1 14188 AZT, 3TC NVP M184V, T215N G190A, M230L V21I, V35T, E44D, V60I, K122E, D123E, D177E, I178M, G196E, T200I, Q207G, R211K  
14275D_P1 14275 ABC, AZT, 3TC None M184V  V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, G196E, T200A, Q207A, R211S  
14318D_P1 14318 AZT, 3TC NVP M184V K103N V35T, T39R, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, S162D, I178M, T200I, Q207E, R211K  
14324D_P1 14324 ABC, AZT, 3TC None M184V E138K K11T, P14S, K20R, V35T, T39G, K122E, D123S, K173S, D177G, Q207A, R211K  
14411D_P1 14411 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V  K11T, K20R, V21I, V35T, V90VI, K122E, D123DG, S162A, T165I, K173S, Q174R, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207D, R211K  
14493D_P1 14493 ABC, AZT, 3TC None M184V, T215Y  K11T, K20R, V21I, V35T, T39K, V60I, K122E, D123N, K173S, Q174K, D177G, I178L, V179I, T200A, I202V, Q207A  
14888D_P1 14888 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V, T215I, K219E  I31V, V35T, T39A, E40D, K122E, D123S, K173G, Q174K, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L  
14901D_P1 14901 ABC, AZT, 3TC None M184V  V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123E, T165I, E169D, D177E, I178L, T200I, Q207E, R211K  
15017D_P1 15017 AZT, 3TC NVP M184V K101KE, G190A E6D, V35T, K49R, I50V, V60I, V90I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, I202V, E203D, R206S, Q207D, R211S, Q242E V189D 
15213D_P1 15213 ABC, AZT, 3TC None M184V  E6D, V35T, E36A, T39K, S48T, V118I, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, I178V, Q197K, T200A, Q207E, F214L, L228M K30N 
15460D_P1 15460 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V  E6N, V35T, T39L, V60I, V118I, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200K, Q207A, R211S, F214L  
15545D_P1 15545 AZT, 3TC NVP M184V K103N E6D, E28A, V35T, T39M, V60I, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179I, Q207A, R211S  
15710D_P1 15710 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V  E6S, V35T, V60I, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
15712D_P1 15712 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70KR, M184V  P4S, K11T, K20R, V35T, D123N, K173A, D177E, I178L, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211K  
15730D_P1 15730 ABC, AZT, 3TC None   V35T, V60I, D121H, K122E, Q174R, D177E, I178IM, T200I, Q207E, R211K  
15845D_P1 15845 AZT, 3TC NVP M184V V108I, Y181C, G190GA P4T, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, I135T, D177E, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L, H221Y  
15911D_P1 15911 ABC, AZT, 3TC None   E6D, V35T, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211S, F214L  
16079D_P1 16079 AZT, 3TC NVP   K11T, K20R, V21I, V35T, T39R, K43E, V60VI, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, I178M, V179I, I202V, Q207A, R211S  
16182D_P1 16182 ABC, AZT, 3TC, D4T None M41L, D67N, K70R, L74I, M184V, T215F, K219Q K103N V21I, V35T, T39K, V60I, V90I, K102Q, K122E, D123G, K173S, D177E, T200A, I202V, Q207E  
16233D_05_P1 16233 AZT, 3TC NVP M184V Y181C E6D, K32R, V35T, K49R, V60I, K122E, D123S, I135T, T139R, K173S, Q174K, Q207A, R211K  
16343D_P1 16343 ABC, AZT, 3TC None M184V  T7TA, E28K, V35T, K49R, V60I, K122E, S162C, D177E, I178M, T200M, E203K, Q207E, R211K  
16455D_P1 16455 AZT, 3TC NVP D67N, K70R, M184V, K219Q  K11T, K20R, V35T, K122E, D123N, K173S, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A  
16496D_P1 16496 ABC, AZT, 3TC, D4T None L74V, Y115F, M184V, T215Y K103N V35T, K49R, V60I, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K  
16535D_P1 16535 AZT, 3TC, D4T NVP M184V K103N, Y181C P14PS, K20R, V35T, T39V, K49R, V60I, T69N, K122E, S162H, E169A, D177E, I178M, Q207E, R211K  
16625D_P1 16625 AZT, 3TC NVP  V106A V35T, T39K, E44G, K49R, E53D, V60I, K122E, I142V, I178M, T200I, Q207E, R211K  
16666D_P1 16666 ABC, AZT, 3TC None K65R, M184V  E6G, I31L, V35T, E36D, K43R, V60I, K122E, I135T, I142M, S162H, F171L, I178M, T200M, Q207E, R211K L205S 
16712D_P1 16712 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V, T215Y  K11T, K20R, V21I, V35T, T39N, K122E, D123N, I135T, S162H, K173S, Q174K, D177E, I178L, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S  
16735D_P1 16735 ABC, AZT, 3TC, D4T None K65R, K70R, V75I, F116Y, Q151M, M184V  V35T, K43R, V60I, S68G, D121H, K122E, K173S, Q174K, D177E, I178M, T200M, Q207E, R211K, F214L  
16740D_P1 16740 AZT, 3TC NVP M184V, T215I Y181V V35T, E36A, T39G, S48T, K122E, D123S, A158S, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K  
17219D_P1 17219 ABC, AZT, 3TC, TDF None D67N, K70R, M184V, T215TI  K11T, V35T, K122E, D123S, I135T, T165L, K173A, D177E, I178L, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211N K20L, L26M 
17235D_P1 17235 AZT, 3TC, D4T NVP M184V  V35T, V60I, T69N, K122E, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K I132M 
DT0010_05_P1 10 ABC, AZT, 3TC None   V35T, T39TA, I50V, E53D, V60I, D121H, K122E, N175H, D177E, I178M, K201R, Q207E, R211K  
DT0016_05_P1 16 AZT, 3TC, D4T NVP   E6D, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, E138D, S162C, S163A, E169R, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S G141Y, I142C, R143I, Y144H, N147L, L149Q, P150T, Q151H, G152E, W153T, K154P, S156Y, P157Q, A158V, I159S, F160V, M164S, I167M, L168E, P170I, F171P 
DT0405_05_P1 405 ABC, AZT, 3TC None   V35T, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, T139A, D177E, T200I, Q207E, R211K  
DT0917_05_P1 917 AZT, 3TC NVP  Y188YC V35T, E36D, T39M, E40D, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135T, S162A, E169ED, D177E, Q207E, R211K  
DT0925_05_P1 925 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V  V35T, T39M, K49R, E53D, V60I, D121Y, K122E, D177E, I178M, T200K, E203K, E204D, Q207E, R211K  
DT0971_05_P1 971 ABC, AZT, 3TC, TDF None D67N, K70R, M184V  E6DN, K11H, V35T, V60I, K122E, D123S, I135T, K173S, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S  
DT1188_05_P1 1188 ABC, AZT, 3TC, D4T None K219Q  V35I, V60I, S68G, V90I, D121Y, K122E, R125K, I135L, D177E, I178M, G196GE, T200I, Q207R, R211K  
DT1335_05_P1 1335 ABC, AZT, 3TC None M184V  I5V, V35T, K49R, V60I, D121Y, K122E, S162N, E169D, D177E, I178M, T200I, Q207E, R211K F116S 
DT1515_04_P1 1515 ABC, AZT, 3TC None   K11S, V35T, K49R, V60I, K122E, D123N, I135T, I142V, E169D, K173S, N175H, D177E, V179VI, T200A, Q207A, R211S  
DT1524_05_P1 1524 ABC, AZT, 3TC None M184V K101E, G190A V35T, T39R, K43E, K49R, V60I, K166R, E169D, D177E, T200I, Q207E, R211K, E233V L234LF, P236R 
DT1645_05_P1 1645 ABC, AZT, 3TC, D4T None M184V  E6D, P9S, V35T, V60I, K122E, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207A, R211S  
DT1745_05_P1 1745 AZT, 3TC NVP M184V G190A, K238T P4H, K11A, A33V, V35K, T39A, K122E, D123N, I135T, I142L, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207T, R211S, F214L  
DT2172_05_P1 2172 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V  E6K, K11Q, K20R, T27S, V35T, V60I, K122E, D123N, I135T, K173S, Q174K, D177E, V179T, Q207A, R211S  
DT2295_05_P1 2295 ABC, AZT, 3TC None K70R, M184V  V35T, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, Q197P, T200A, E203K, Q207E, R211K E79EQ 
DT2373_05_P1 2373 ABC, AZT, 3TC None M184V  K11T, K20R, V21I, K32I, V35T, T39R, V60I, S162G, K173S, Q174R, V179I, R199T, I202V, Q207A Q182P, H198R, K220N 
DT2412_05_P1 2412 ABC, AZT, 3TC None M184V  P4R, V8I, V35T, T39A, V60I, K122E, D177E, I178M, V179I, T200I, Q207E, R211K A62G 
DT2626_05_P1 2626 AZT, 3TC NVP M41L, M184V, T215Y K103N P4Q, V35T, K43R, V60I, D121Y, K122E, I135IT, D177E, I178M, Q207E, R211K, L228R  
DT2781_05_P1 2781 AZT, 3TC NVP M184V K103N K22R, V35T, V60I, D121C, K122E, I142M, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K  
DT2794_05_P1 2794 AZT, 3TC, TDF NVP M41L, D67N, K70R, M184V, T215Y  E6D, V35T, V60I, K64R, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174K, D177E, V179T, T200A, E203K, Q207E, R211K  
DT2829_05_P1 2829 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V, T215I, K219E  V21I, V35T, T69A, K122Q, D123S, E169D, K173S, Q174K, D177E, I178L, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S  
DT2986_05_P1 2986 AZT, 3TC NVP K70R, M184V G190A E6D, K11R, V35T, E40D, V60I, K122E, D123N, I135T, K173L, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S  
DT3165_05_P1 3165 ABC, AZT, 3TC None M184V  E6D, V35T, T39L, V60I, K122E, D123S, I135T, E138A, I142V, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211S, F214L  
DT3211_05_P1 3211 ABC, AZT, 3TC None   V35T, E36D, T39R, I47L, S48T, V60I, K122E, K166R, D177E, I178IM, T200I, Q207E, R211K  
DT3282_05_P1 3282 AZT, 3TC NVP   K20R, V21I, V35T, T39A, E40D, V60I, K173A, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S  
DT3340_05_P1 3340 ABC, AZT, 3TC None M41L, D67DN, K70KR, M184V, T215F  E6D, V35T, V60I, K122E, D123N, I135T, T139K, I142V, K173A, Q174K, D177E, T200E, Q207A, R211K A158E 
DT3441_05_P1 3441 AZT, 3TC NVP   K20R, V35T, T39G, D121N, K122E, D123DG, K173S, Q174K, D177E, V179I, T200A, I202V, Q207A, R211S  
DT3479_05_P1 3479 AZT, 3TC NVP D67N, K70Y, F77L, M184V, T215Y G190S E28K, I31L, V35T, T39I, E40D, S48P, K49R, V60I, K64N, S68N, D86E, K122E, I142V, I159V, K173Q, D177E, T200A, Q207E, R211K I63L, R78K, N81I, Q151P 
DT3482_05_P1 3482 AZT, 3TC, TDF NVP M41L, D67N, K70R, M184V, T215F  V35T, T39K, K122E, K173T, T200A, Q207D, R211K  
DT3504_05_P1 3504 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70T, Y115F, M184V, T215Y  P4T, E6D, V35T, D121H, K122E, I135T, G141A, I142S, D177E, I178M, T200A, E204K, Q207E, R211K  
DT3513_05_P1 3513 ABC, AZT, 3TC None M184V, T215Y  E6D, E28A, V35T, T39E, V60I, V118I, K122E, I135T, T139R, I142T, T165I, K173S, Q174K, V179I, T200A, Q207A, R211S, F214L  
DT3516_05_P1 3516 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V, T215I E138K K20R, V35T, T39A, E40D, V60I, K122E, D123S, I135T, K166I, K173S, Q174K, D177E, Q207N, R211K, F214L N136H 
DT3527_05_P1 3527 ABC, AZT, 3TC None Y115YF, M184V, T215F  E6ED, V8VI, I31V, V35T, T39I, E40D, K49R, V60I, T69TS, K102R, D121DH, K122E, I135IT, A158AS, E169D, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K F160FS 
DT3548_05_P1 3548 ABC, AZT, 3TC, D4T None Y115F, M184V  V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, E53D, V118I, K122E, K173A, Q174K, T200A, Q207N, R211K, F214L, L228Q  
DT3736_05_P1 3736 AZT, 3TC NVP D67N, M184V A98G, K103N V35T, V60I, D121H, K122E, I135T, I142V, K173A, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E  
DT3771_05_P1 3771 ABC, AZT, 3TC None D67N, M184V, T215Y  V35T, V60I, K122E, I135IT, E169D, D177E, I178M, Q207E, R211K  
DT3793_05_P1 3793 ABC, AZT, 3TC None D67N, K70R, M184V  K11T, V21I, V35T, T39R, V60I, K101T, K122E, D123S, I142S, V148G, K173S, Q174K, D177E, I202V, Q207A, R211K G141E, G152D, W153R, I159L, F160I 
DT3951_05_P1 3951 AZT, 3TC NVP  K103N, Y181YC V35I, T39TA, E40D, S48T, K49R, V60I, D121Y, K122E, D123E, I135R, E169D, V189I, T200R, Q207E, R211K  
DT3952_05_P1 3952 AZT, 3TC NVP D67DG, M184V Y181C I31L, V35T, T39I, E40D, V60I, D121Y, K122E, S162A, D177E, Q207E, R211K, L228LR  
DT3994_05_P1 3994 ABC, AZT, 3TC None M41L, D67N, K70R, M184V, L210W, T215Y, K219E  E6D, K11I, V35T, T39K, K43E, K122E, D123S, I135T, S162C, K173T, Q174K, G196E, T200A, Q207A, R211K  
DT4014_05_P1 4014 ABC, AZT, 3TC None M184V  V35T, E44D, K49R, I50V, V60I, K104Q, D121H, K122E, D123T, I135T, I142V, E169D, K173A, Q174K, D177E, V179I, G196E, T200L, Q207A  
DT5712_04_P1 5712 AZT, 3TC NVP M184V K101E, G190A V35T, T39R, K43E, K49R, V60I, I142M, K166R, E169D, D177E, T200I, Q207E, R211K R143K, N147Q, I167M 

Database

Resources

Team