<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Vinogradova (2010)
Title Short communication: Molecular epidemiology of HIV type 1 in the Republic of Dagestan, Russian Federation: Virtually uniform circulation of subtype A, former Soviet Union variant, with predominance of the V77I(PR) subvariant.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
NumIsolates 41
NumPts 41
Subtype A, B


Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
Dag01 Dag01 None None   K11A, V35T, E36D, T39DEKN, K122E, D123S, I135V, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D  
Dag02 Dag02 None None   V35T, T39M, K122E, D123S, I135T, A158S, K173ALSV, Q174K, D177E, I178IM, V179I, Q207A, R211S, V245K, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Dag03 Dag03 None None   K11T, V35I, E36D, T39K, S68N, D121H, K122E, D123S, A158AS, K173L, Q174K, D177E, I178IL, Q207A, R211S  
Dag05 Dag05 None None   V8I, K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I135T, A158S, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, F214L, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V  
Dag06 Dag06 None None A62V  K11T, V35IT, E36D, T39K, I50IV, K122KE, D123S, A158S, K166KR, K173L, Q174K, D177E, I178IV, T200I, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Dag07 Dag07 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, D123N, T139TR, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, L295M  
Dag09 Dag09 None None A62V, D67DG  K11T, V35IM, T39K, V90I, K122E, D123N, A158AS, K173L, Q174K, Q207A, R211S  
Dag10 Dag10 None None A62V  K11T, E28G, V35I, E36D, T39K, K122E, D123N, T139A, A158S, K166R, K173L, Q174K, D177AE, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294I  
Dag11 Dag11 None None   K11T, V35T, E36D, T39R, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q197QR, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, I326V  
Dag17 Dag17 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, K173L, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V  
Dag19 Dag19 None None   K11T, V35I, E36D, T39K, K122E, D123NS, I132V, A158S, S162SN, T165TI, K173LS, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Dag20 Dag20 None None   K11A, V35I, E36D, T39N, K49R, D123N, I135T, A158S, K173S, Q174K, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Dag21 Dag21 None None A62V  K11T, V35L, E36D, T39K, K122E, D123S, I135T, A158S, K173L, Q174K, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Dag23 Dag23 None None   K11T, V35T, E36D, T39N, K122E, D123S, I135V, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V  
Dag24 Dag24 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, V90VI, K102KQ, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V  
Dag25 Dag25 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I135V, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
Dag26 Dag26 None None   K11T, V35T, E36D, T39EK, K122E, D123S, R125RK, I135V, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R  
Dag27 Dag27 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I135V, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Dag28 Dag28 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I135V, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V  
Dag29 Dag29 None None   E6K, K11A, V35T, E36N, T39DN, K49R, V106I, K122E, D123S, I135T, E138G, A158S, K173S, Q174K, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V  
Dag30 Dag30 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K102R, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245K, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V  
Dag32 Dag32 None None   K11AT, V35T, E36D, T39N, K49R, K122E, I135T, E138EG, A158S, S162SC, T165TI, K173S, Q174K, Q207A, R211S D123RS 
Dag35 Dag35 None None   K11T, V35I, E36D, T39K, S68N, K102Q, K122E, D123S, A158S, T165TI, K173I, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245T, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, V317A, I326V, Q332P  
Dag38 Dag38 None None   K11T, V35T, E36D, T39KR, K122E, D123S, I135RT, K173LS, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
Dag40 Dag40 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I135IV, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D  
Dag41 Dag41 None None A62V  K11T, V35T, E36D, T39N, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177E, I178L, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Dag42 Dag42 None None   K11A, V35T, E36D, T39M, K122KE, D123S, I135V, K173S, Q174K, D177E, Q207A, R211S, E248D, A272P, T286A, E291D, I293V, P294T  
Dag45 Dag45 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, K43Q, K101KR, K122E, D123S, I135T, E138EA, K173L, Q174K, D177E, I178V, Q207A, R211S, T240P, V241A, V245M, E248D, S251I, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Dag46 Dag46 None None   K11T, V35T, E36D, T39M, K122E, D123G, A158S, K173L, Q174K, D177E, I178M, V179I, Q207A, R211S, V245K, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V  
Dag51 Dag51 None None A62V  K11T, V35I, E36D, T39K, A98AS, K122E, D123N, K173L, Q174K, D177G, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V  
Dag52 Dag52 None None   K11A, V35T, T39N, K122E, D123S, I135V, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Dag53 Dag53 None None   K11A, V35T, E36D, T39N, K49R, V106I, K122E, D123S, I135T, E138G, A158S, K173S, Q174K, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Dag55 Dag55 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I135V, S162SC, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V  
Dag56 Dag56 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, V60I, K122E, D123S, S134SN, I135V, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
Dag57 Dag57 None None   V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I135V, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Dag59 Dag59 None None   V35T, T39M, V60I, K64R, A98S, K122E, D123DGNS, A158S, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S  
Dag60 Dag60 None None   K11AT, V35T, E36ED, T39N, K82R, K122E, D123S, A158S, K173L, Q174K, D177G, I178IM, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
Dag61 Dag61 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, R125RK, K173L, Q174K, D177E, K201KR, Q207A, R211S, V245M, E248D, A272P, K277R, T286A, V292I, I293V, P294T, I326V E291G 
Dag63 Dag63 None None   K11T, V35T, E36D, T39K, K122E, D123S, I135V, K173L, Q174K, D177E, Q207A, R211S, V245M G213E 
Dag64 Dag64 None None T215S  V35VI, D123E, I135M, D177E, Q207E, R211K, T216S  
Dag66 Dag66 None None   K11T, V35T, E36ED, T39K, K122E, D123S, K173LS, Q174K, D177E, V179VI, Q207A, R211S, V245K, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T, I326V