<!--#if expr="$title" --> <!--#echo var="title" --> <!--#else --> HIV Drug Resistance Database <!--#endif -->
Stanford University HIV Drug Resistance Database - A curated public database designed to represent, store, and analyze the divergent forms of data underlying HIV drug resistance.

References

Author Gonzalez (2010)
Title Short communication: Antiretroviral therapy resistance mutations present in the HIV type 1 subtype C pol and env regions from therapy-naive patients in Zambia.
Citation ARHR
SelectedGene RT
SelectedSpecies HIV1
SelectedGroup M
SelectedType Clinical
NumIsolates 122
NumPts 122
Subtype C

 
  Page 1 of 2    Next >   Last Page Jump to Page   
Back To Query

Page 1   listing Isolate 1 to Isolate 100 from Total 122 Clinical RT Isolates


SubjectIsolateNRTIsNNRTIsNRTI MutNNRTI MutCommonUnusual
1084_M23m 1084_M23m None None   K20R, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K122E, D123N, E138A, T139A, K173T, Q174K, T200A, I202V, Q207A, R211K, F214L, V245Q, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
1087 1087_M00m None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K275Q, K277R, E291D, V292I, I293V  
1229_M00m 1229_M00m None None   V35T, E36V, T39E, S48T, K102R, K122E, D123G, K173N, D177G, T200A, Q207A, V241I, V245Q, A272H, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
1302_M00m 1302_M00m None None   E6D, V8I, V35T, E36A, T39E, S48T, D123N, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V241I, V245K, E248D, D250E, A272S, T286A, A288V, E291D, V292I, I293V  
1315 1315_M00m None None   V35T, E36A, T39E, K122P, D123S, E169K, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, E297A, E312D  
1343_M00m 1343_M00m None None   E6K, K20R, V35T, T39K, E40Q, K43E, K122E, D123S, E138A, I142T, A158S, K173T, Q174K, I178M, T200E, Q207E, F214L, V245L, K249Q, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
137_M36m 137_M36m None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, K104R, D121H, K122E, D123G, T165I, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K, E248D, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, P294T L264I 
1546 1546_M25m None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D121Y, K122E, T139A, K173T, D177E, G196E, T200A, Q207E, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V  
1548_M00m 1548_M00m None None   K11R, K20R, V35T, E36V, T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, I135T, I142V, S162C, K166R, T200A, Q207E, V245Q, E248N, D250E, A272P, K277T, E291D, I293V  
1690_M00m 1690_M00m None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K104R, K122E, D123G, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, R284K, T286A, E291D, V292I, I293V L80R 
1770_M00m 1770_M00m None None   P4S, V35T, T39E, S48T, V118I, K122E, D123S, E138A, T139A, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207N, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V E302G 
1774_M00m 1774_M00m None None   K20R, V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V241I, V245E, K249R, D250E, S251D, A272P, K281R, E291D, V292I, I293V  
1925 1925_M00m None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V  
1928_M00m 1928_M00m None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135V, S162C, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, S251G, A272P, K275R, Q278N, T286A, E291D, V292I, I293V  
1931_M00m 1931_M00m None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173A, Q174K, D177E, G196M, T200A, Q207E, V245Q, E248D, S251I, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E312D  
1994 1994_M00m None None   V35T, T39A, S48T, K122E, K166R, K173T, Q174K, D177E, I178M, T200A, Q207E, P243T, V245Q, D250E, A272S, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
2130_M00m 2130_M00m None None   V8I, V35T, T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173A, Q174R, D177E, I178L, T200A, Q207D, R211K, V245Q, D250E, S251C, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
2175_M00m 2175_M00m None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272S, K277R, E291D, V292I, I293V  
2275_M00m 2275_M00m None None   V8I, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, A158S, K173A, Q174K, D177E, G196M, T200A, Q207E, V245Q, D250E, A272P, K275Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
2357_M12m 2357_M12m None None   P4S, E6D, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173T, D177E, I178M, T200A, Q207E, R211K, V245H, E248D, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297A, P313R L246R 
2919_M30m 2919_M30m None None   E6K, V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, I135V, S162A, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, P247A, A272P, Q278N, T286A, E291D, V292I, I293V, E312G  
341_M00m 341_M00m None None   V35T, E36A, T39E, S48T, D123G, K166R, K173A, Q174H, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, T286V, E291D, V292I, I293V  
342 342_M00m None None   V8I, V35T, S48T, K122E, K173T, Q174R, T200A, Q207E, R211K, V245M, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
505_M30m 505_M30m None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, S162A, K166R, K173T, D177E, T200E, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
575_M00m 575_M00m None None   E28A, K32E, V35T, E36A, T39E, K122E, D123N, I135T, T165I, T200A, E204K, Q207E, R211K, F214L, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, P294T  
590_M36m 590_M36m None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123N, I135R, K173T, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, Q278N, E291D, V292I, I293V, E312G  
770 770_M00m None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, D177E, T200A, Q207E, P243A, V245K, A272P, K277R, T286A, V292I, I293V  
914_M00m 914_M00m None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, K173A, D177E, I195T, T200A, Q207E, R211K, V245H, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, P294S  
924_M00m 924_M00m None None   V35T, T39R, V60I, K104N, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
983_M30m 983_M30m None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, K173A, Q174R, D177E, T200A, E204D, Q207D, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, I293V  
CH1 CH1 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, K173G, Q174K, D177E, I178L, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, E297R, A304E  
CH10 CH10 None None   V35T, T39E, S48T, K104R, K122E, D123N, K173T, Q174K, T200A, Q207E, D250E, S251D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V I270N 
CH2 CH2 None None   V35T, T39E, K122E, K173T, D177E, I178M, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272S, K277R, L283I, R284K, E291D, V292I, I293V, E312N  
CH5 CH5 None None   E6K, T7P, K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, A158S, K173A, G196M, T200A, I202V, E204K, Q207E, R211K, F214L, V245Q, A272P, T286A, K287R, E291D, V292I, I293V G155R 
CH7 CH7 None None   T27S, V35T, T39E, S48T, K122E, S162C, K173T, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q, D250E, A272P, I274V, K277R, Q278N, E291D, V292I, I293V  
CP1 CP1 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, E53D, K122P, S162A, K173T, Q174N, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, E312K  
CP5 CP5 None None   M16T, E28K, K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, S162C, K173T, T200A, Q207A, R211K, D218E, L228Q, V245Q, A272S, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E312N  
CP6 CP6 None None   V35T, E36A, T39D, S48P, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200E, R211K, V245Q, D250E, A272K, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
CP7 CP7 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, I274V, T286A, E291D, V292I, I293V  
CP9 CP9 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, K173A, T200A, Q207D, R211K, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V  
KA1 KA1 None None   V35T, E36A, T39E, K122E, D123G, K173T, D177E, T200A, Q207K, R211K, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V I270N 
KA2 KA2 None None M184V K103N V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123G, K173T, T200A, Q207E, V245E, E248K, A272P, L283I, E291D, V292I, I293V  
KA3 KA3 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, T139A, A158S, K173A, Q174K, D177E, T200A, E203D, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
KA5 KA5 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, W88C, K122E, D123G, E138A, K173T, I178L, T200A, Q207E, R211K, F214L, A272P, K275R, Q278H, K281R, T286A, V292I, I293V, E297K  
KB2 KB2 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, I142T, A158S, T165I, D177E, T200A, R211K, V245Q, S251D, A272S, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E312D A267P 
KB4 KB4 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, D121H, K122E, K173A, D177E, G196K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, T286A, E291N, V292I, E297A Q222R 
KB5 KB5 None None   P4S, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173T, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, A272P, V292I A267P 
KB8 KB8 None None   V35T, E36A, T39D, K122E, K173A, Q174K, I195L, T200A, Q207N, R211K, V245Q, A272P, K275Q, K277R, E291D, I293V  
KLesa10 KLesa10 None None   V35T, E36A, T39E, K43E, S48T, K122E, I135T, K173T, D177E, T200A, Q207E, V245L, D250E, A272H, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
KLesa2 KLesa2 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, K104R, K122E, D123N, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I  
KLesa3 KLesa3 None None   K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, P170H, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248N, A272P, K277R, E291D, I293V  
KLesa4 KLesa4 None None   P4S, V35T, E36A, T39E, S48T, S68N, K122E, K173A, D177E, G196K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248K, K249Q, D250E, A272P, T286A, E291D, V292I  
KLesa5 KLesa5 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173T, Q174K, Q197L, T200A, Q207E, V245Q, D250E, S251H, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E312K  
KLesa7 KLesa7 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245K, A272P, E291D, V292I, I293V  
KLesa9 KLesa9 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, I142V, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, V292I, I293V  
KP3 KP3 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, A158S, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V A272N 
KP4 KP4 None None   V35I, E36A, T39E, S48T, V60I, I135L, K173A, Q174K, T200A, Q207E, K238R, V245Q, S251T, A272S, E291D, V292I  
KP8 KP8 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272S, K277R, E291D, V292I, I293V  
KT1 KT1 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272S, T286A, E291D, V292I, I293V  
KT10 KT10 None None   V35T, T39K, S48T, K122E, D123G, K173T, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V, P294T  
KT3 KT3 None None   V35T, T39E, S48T, V90I, K122E, D123S, I142V, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245N, D250E, A272P, K277R, T286V, E291D, V292I, I293V  
KT4 KT4 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, I142V, S162A, K173T, D177E, T200A, E203D, E204D, Q207A, R211K, V245Q, E248D, A272P, E291D, V292I, I293V, E297G, R307K E305K, E308R 
KT5 KT5 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, S162C, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207E, V245Q, A272P, K275Q, E291D, V292I, I293V L210P 
KT8 KT8 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123G, Q145H, S162C, K166R, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, E291D, V292I, I293V  
KT9 KT9 None None   K32E, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, I135R, K173A, D177E, I178L, G196T, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
KW3 KW3 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, I135T, E138A, T139V, K173T, Q174K, T200A, I202V, Q207N, R211K, F214L, V245Q, D250E, S251N, A272P, K275R, K277R, Q278H, T286A, E291D, V292I, I293V  
KW5 KW5 None None   V35T, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135T, D177N, T200E, Q207E, V245Q, K277R, K281R, E291D, V292I, I293V, E312K  
KZ1 KZ1 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123G, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
KZ10 KZ10 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, K173T, Q207E, V245Q, D250N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
KZ2 KZ2 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, I135T, K173I, Q174K, D177E, T200A, Q207A, R211K, V245Q, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
KZ5 KZ5 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, S162A, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, T286A, E291D, V292I, I293V  
KZ6 KZ6 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123G, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
KZ7 KZ7 None None   E6K, K20R, V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, V118I, K122E, K166R, K173T, Q174N, G196E, T200A, Q207E, F214L, V245Q, D250E, A272P, K281R, E291D, V292I, I293V  
KZ9 KZ9 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, K173A, Q174R, D177E, T200A, Q207K, R211K, V245K, D250E, A272P, K277R, T286A, I293V, E297K  
LUC2 LUC2 None None   V35T, E36A, T39K, K43E, S48T, K122E, D123S, S162A, K173A, D177E, T200A, I202V, Q207N, R211K, E224D, V245Q, D250E, A272P, K281R, T286A, E291D, V292I  
LUC5 LUC5 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, V60I, K122E, D123S, I135V, K173V, D177E, T200A, Q207E, V245Q, T286A, E291D, V292I  
LUC7 LUC7 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123S, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245K, E291D, V292I, I293V  
LUC8 LUC8 None None   V35K, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, I135T, S162C, D177E, Q197E, T200A, Q207N, R211K, E224G, V245Q, E248D, A272P, Q278K, E291D, V292I, I293V  
LUC9 LUC9 None None   K11Q, V35T, K122E, D123N, T139I, A158S, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V241I, I244V, V245Q, D250E, A272Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
LUK3 LUK3 None None   V35T, S48T, V60I, K122E, D123G, K173A, Q174K, D177E, T200E, Q207E, R211K, V245Q, E248D, D250E, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, A304G  
LUK4 LUK4 None None   T27S, V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173A, D177E, Q197K, T200A, Q207E, R211K, E248D, A272S, K277R, E291D, V292I, I293V  
LUK5 LUK5 None None   P4S, V35T, T39E, S48T, K173A, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, E312D  
LUK6 LUK6 None None   P4S, V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, T69S, K122E, D123S, K173T, D177E, T200A, E204K, Q207E, V245Q, D250E, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
LV1 LV1 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123N, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207E, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
LV4 LV4 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K173A, T200A, Q207R, R211K, V245K, D250S, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
LV7 LV7 None None   V35K, T39E, S48T, V60I, D123E, E138A, Q174H, D177E, V179I, T200A, Q207E, R211K, F214L, K238R, V245Q, A272S, E291D, V292I, I293V  
LV9 LV9 None None   K20R, V35T, E36A, T39D, S48T, V60I, K122E, D123N, K173T, Q174K, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E291D, V292I, I293V  
MA5 MA5 None None   P4S, V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, S162A, K173A, D177E, T200A, Q207D, V245K, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V, E297D, L301F Q151R 
MH6 MH6 None None   V35T, T39R, S48T, K122E, D123N, I135R, S162C, K173T, D177E, T200A, Q207E, R211K, E248N, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
MH9 MH9 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123N, K173T, D177E, T200A, Q207E, P243A, V245Q, A272P, E291D, V292I, P313T  
MO5 MO5 None None   V35K, T39E, S48T, I142T, S162C, K173T, T200A, Q207A, R211K, V245T, E248D, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
MO8 MO8 None None   V35P, T39K, S48T, V60I, K122E, D123S, K173A, Q174K, D177E, T200A, Q207E, R211K, V245K, E248D, A272P, E291D, V292I, I293V  
MO_4 MO_4 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, D123S, K173T, Q174K, T200A, Q207E, V245H, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V  
ND1 ND1 None None   V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123S, S162A, K173T, D177E, T200A, Q207N, R211K, V245Q, A272P, K281R, E291D, V292I, I293V  
ND_8 ND_8 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, S117P, K122E, I142V, K173A, D177E, I178M, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248D, A272P, K277R, E291D, V292I, I293V  
SO6 SO6 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, K173T, Q174K, D177E, T200A, Q207D, R211K, V245Q, E248N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
SO_2 SO_2 None None   V35T, E36A, T39E, E40D, S48T, V60I, K122E, D123N, K173T, Q174K, T200A, Q207E, R211K, V245Q, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E297K  
SO_3 SO_3 None None   T27S, V35T, E36A, T39D, S48T, K122E, D123N, I135T, S162C, K166R, K173A, T200A, Q207E, R211K, V245Q, A272P, E291D, V292I, I293V  
SO_4 SO_4 None None   V35T, E36A, T39E, S48T, K122E, D123S, K166R, K173A, D177E, T200A, Q207E, V245Q, D250N, A272P, T286A, E291D, V292I, I293V  
SO_8 SO_8 None None   V35T, T39E, S48T, K122E, K173A, Q174K, T200A, I202V, Q207E, R211K, V245C, A272P, K277R, T286A, E291D, V292I, I293V, E312D  

Database

Resources

Team